Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6J3M6A1

Protein Details
Accession A0A6J3M6A1    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MAEEFQKKRKRQSNGTTATPNKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
405-419TKEAAKASRIAKLRL
425-425K
428-429RR
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MAEEFQKKRKRQSNGTTATPNKKVAIDHHAAAGNVKVTNVIHERGLRPIIASAPGLAPSNIAFKAYCDSKNESNVVLHSSQHPRLDYTALPNTLDSGLSHYIAVFNPQAETLQIVPANYLNLRGSVRAEEQEVEAAARGMTGAKQREELGREFGTKKAKKAIASKTENAITKDSKGKGAITATQTAILESVGTATADQASRQDQERALLAAKPIPPPNLDAANVEDVYPLATLLPPHEAKLVNIKEWQEATISEEEEKKIEFVHSFPAYRVAAIGKAHDSDRLKALRYLNLLLIFHEALSGGRVKKVPPKDKLKEKFSDYPMSLVDSVRRRFTNDSGNELGKFQLDKLYTHICALSLFVDNWSTHITDLKNDLKMDTAVLAKYYQELGCVVRAPSESERAKMKITKEAAKASRIAKLRLPLQFPKVSRRRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.83
3 0.82
4 0.81
5 0.8
6 0.74
7 0.66
8 0.57
9 0.53
10 0.48
11 0.43
12 0.43
13 0.4
14 0.36
15 0.37
16 0.36
17 0.34
18 0.32
19 0.29
20 0.22
21 0.18
22 0.17
23 0.14
24 0.12
25 0.18
26 0.21
27 0.21
28 0.22
29 0.26
30 0.28
31 0.31
32 0.33
33 0.27
34 0.24
35 0.24
36 0.22
37 0.2
38 0.19
39 0.15
40 0.14
41 0.15
42 0.15
43 0.14
44 0.12
45 0.11
46 0.15
47 0.13
48 0.13
49 0.12
50 0.12
51 0.18
52 0.21
53 0.23
54 0.24
55 0.3
56 0.34
57 0.39
58 0.4
59 0.36
60 0.33
61 0.32
62 0.31
63 0.26
64 0.23
65 0.24
66 0.29
67 0.32
68 0.34
69 0.33
70 0.31
71 0.32
72 0.33
73 0.28
74 0.28
75 0.31
76 0.29
77 0.28
78 0.26
79 0.26
80 0.23
81 0.22
82 0.15
83 0.13
84 0.14
85 0.14
86 0.14
87 0.12
88 0.13
89 0.13
90 0.15
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.11
96 0.09
97 0.11
98 0.09
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.13
105 0.11
106 0.13
107 0.1
108 0.11
109 0.12
110 0.12
111 0.13
112 0.14
113 0.16
114 0.15
115 0.16
116 0.15
117 0.15
118 0.15
119 0.13
120 0.11
121 0.09
122 0.08
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.06
128 0.11
129 0.14
130 0.15
131 0.16
132 0.18
133 0.21
134 0.24
135 0.24
136 0.24
137 0.23
138 0.25
139 0.26
140 0.28
141 0.35
142 0.34
143 0.34
144 0.38
145 0.39
146 0.41
147 0.48
148 0.53
149 0.53
150 0.56
151 0.56
152 0.52
153 0.53
154 0.51
155 0.44
156 0.39
157 0.3
158 0.27
159 0.31
160 0.28
161 0.26
162 0.24
163 0.23
164 0.21
165 0.22
166 0.23
167 0.19
168 0.2
169 0.18
170 0.19
171 0.18
172 0.16
173 0.14
174 0.1
175 0.07
176 0.05
177 0.05
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.08
187 0.09
188 0.11
189 0.13
190 0.12
191 0.12
192 0.13
193 0.13
194 0.12
195 0.12
196 0.11
197 0.12
198 0.14
199 0.16
200 0.16
201 0.16
202 0.16
203 0.17
204 0.19
205 0.17
206 0.16
207 0.14
208 0.14
209 0.15
210 0.14
211 0.13
212 0.1
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.21
228 0.22
229 0.2
230 0.22
231 0.23
232 0.22
233 0.22
234 0.22
235 0.14
236 0.13
237 0.14
238 0.13
239 0.13
240 0.12
241 0.13
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.1
246 0.09
247 0.1
248 0.09
249 0.08
250 0.14
251 0.16
252 0.16
253 0.16
254 0.21
255 0.19
256 0.18
257 0.18
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.14
262 0.1
263 0.12
264 0.12
265 0.17
266 0.18
267 0.17
268 0.23
269 0.23
270 0.24
271 0.27
272 0.29
273 0.28
274 0.28
275 0.28
276 0.25
277 0.25
278 0.23
279 0.2
280 0.2
281 0.15
282 0.13
283 0.11
284 0.09
285 0.07
286 0.08
287 0.11
288 0.09
289 0.12
290 0.13
291 0.15
292 0.23
293 0.33
294 0.41
295 0.46
296 0.57
297 0.63
298 0.73
299 0.8
300 0.8
301 0.76
302 0.75
303 0.74
304 0.68
305 0.67
306 0.57
307 0.5
308 0.43
309 0.39
310 0.33
311 0.25
312 0.27
313 0.26
314 0.28
315 0.31
316 0.31
317 0.32
318 0.35
319 0.38
320 0.42
321 0.38
322 0.42
323 0.41
324 0.42
325 0.39
326 0.36
327 0.32
328 0.24
329 0.21
330 0.15
331 0.17
332 0.16
333 0.16
334 0.2
335 0.25
336 0.24
337 0.24
338 0.24
339 0.18
340 0.17
341 0.18
342 0.15
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.13
347 0.13
348 0.14
349 0.15
350 0.14
351 0.12
352 0.16
353 0.16
354 0.17
355 0.24
356 0.27
357 0.29
358 0.29
359 0.29
360 0.27
361 0.27
362 0.24
363 0.2
364 0.17
365 0.14
366 0.14
367 0.14
368 0.12
369 0.14
370 0.16
371 0.13
372 0.12
373 0.13
374 0.14
375 0.16
376 0.18
377 0.16
378 0.17
379 0.18
380 0.22
381 0.23
382 0.31
383 0.31
384 0.32
385 0.37
386 0.36
387 0.41
388 0.41
389 0.41
390 0.42
391 0.46
392 0.51
393 0.51
394 0.59
395 0.57
396 0.56
397 0.58
398 0.52
399 0.53
400 0.49
401 0.46
402 0.42
403 0.45
404 0.48
405 0.49
406 0.54
407 0.53
408 0.57
409 0.61
410 0.59
411 0.63