Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6J3LXI8

Protein Details
Accession A0A6J3LXI8    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
460-483LAEKERIKKREARKRKGENTAGSDBasic
498-519AATPKMTKKELNKKNKENATATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
260-263RKRE
463-476KERIKKREARKRKG
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MSFSMSPPPPAQPPQQFVPPPPPQPAHSPTQTQLAPPYSQTGSPIPQSPYAAPPPAKRQRLSPDPRSPMNAMPQYPQTPQPASQASGYGNPYAQQGHQQPYGNNAYPSPSSQGGFNTPQPYQQPQSPWPAQQQVAPSPSRGTGAASPPTTSQMMPPPPRPVKEEREEKVGVDDINDSLFGSGISLKDEENYFHSMWNNRPAQVSFATNRSTSFASTTISPERSFNLLQSGSSFGEQGSGAFAGTLGQSLTQEEIESEHKRKREAAARAKAERDQHHLNNPFLLGNILRHKIQKQAYEAGVKVEVQGVYERAEPPKVMVNKAGTNGVAALTAAPAQDAAPSKVDVGVPFEQLLSLLSLASGERIRGLVDDAYGLARVRRYGDHGRVVPPEFADLATGEGKQSQITISSTNISGSSWEQSADPDQTTKGAEEAEEASQQTKTISFQGTLNTHFRQLAERDQLAEKERIKKREARKRKGENTAGSDEMTTEGSATDAGDSAATPKMTKKELNKKNKENATATEAQAINSANTTAAMAFMGKKKNKYGWMTGGMGSVQGNRYAKPASAGAAVKSENAAGSSTPASSTANANNAANGTNGPSASTTDSSAEKKTPSWGEWREDGVDGKGIQLRDWVHVLERDGRERKALLQASLKLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.58
3 0.57
4 0.54
5 0.59
6 0.58
7 0.55
8 0.57
9 0.55
10 0.49
11 0.55
12 0.56
13 0.53
14 0.5
15 0.51
16 0.45
17 0.5
18 0.47
19 0.41
20 0.42
21 0.39
22 0.35
23 0.31
24 0.34
25 0.28
26 0.28
27 0.29
28 0.27
29 0.27
30 0.29
31 0.33
32 0.31
33 0.33
34 0.35
35 0.34
36 0.36
37 0.37
38 0.41
39 0.4
40 0.42
41 0.5
42 0.57
43 0.62
44 0.57
45 0.6
46 0.63
47 0.69
48 0.73
49 0.73
50 0.73
51 0.73
52 0.75
53 0.72
54 0.66
55 0.6
56 0.6
57 0.56
58 0.47
59 0.44
60 0.46
61 0.44
62 0.44
63 0.44
64 0.4
65 0.37
66 0.37
67 0.4
68 0.38
69 0.36
70 0.34
71 0.32
72 0.28
73 0.29
74 0.29
75 0.24
76 0.21
77 0.19
78 0.2
79 0.19
80 0.18
81 0.21
82 0.25
83 0.29
84 0.34
85 0.36
86 0.35
87 0.4
88 0.46
89 0.41
90 0.37
91 0.32
92 0.3
93 0.28
94 0.3
95 0.27
96 0.22
97 0.2
98 0.2
99 0.22
100 0.24
101 0.26
102 0.29
103 0.3
104 0.28
105 0.32
106 0.34
107 0.37
108 0.35
109 0.36
110 0.37
111 0.38
112 0.46
113 0.46
114 0.46
115 0.47
116 0.49
117 0.45
118 0.42
119 0.43
120 0.39
121 0.4
122 0.37
123 0.32
124 0.28
125 0.28
126 0.26
127 0.21
128 0.19
129 0.18
130 0.22
131 0.26
132 0.25
133 0.26
134 0.25
135 0.28
136 0.26
137 0.22
138 0.19
139 0.22
140 0.3
141 0.34
142 0.37
143 0.44
144 0.48
145 0.5
146 0.53
147 0.53
148 0.52
149 0.57
150 0.62
151 0.55
152 0.57
153 0.55
154 0.5
155 0.45
156 0.39
157 0.3
158 0.21
159 0.19
160 0.13
161 0.12
162 0.12
163 0.09
164 0.07
165 0.07
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.1
175 0.11
176 0.13
177 0.17
178 0.15
179 0.17
180 0.2
181 0.22
182 0.25
183 0.33
184 0.32
185 0.29
186 0.31
187 0.3
188 0.3
189 0.28
190 0.29
191 0.22
192 0.23
193 0.24
194 0.22
195 0.22
196 0.21
197 0.2
198 0.16
199 0.16
200 0.14
201 0.13
202 0.13
203 0.16
204 0.18
205 0.19
206 0.19
207 0.18
208 0.19
209 0.22
210 0.21
211 0.18
212 0.19
213 0.17
214 0.16
215 0.16
216 0.17
217 0.15
218 0.15
219 0.14
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.07
241 0.11
242 0.15
243 0.18
244 0.22
245 0.23
246 0.25
247 0.27
248 0.31
249 0.35
250 0.41
251 0.48
252 0.53
253 0.58
254 0.59
255 0.59
256 0.57
257 0.54
258 0.47
259 0.43
260 0.4
261 0.37
262 0.43
263 0.45
264 0.42
265 0.36
266 0.34
267 0.28
268 0.21
269 0.19
270 0.11
271 0.1
272 0.13
273 0.14
274 0.15
275 0.17
276 0.18
277 0.24
278 0.28
279 0.29
280 0.28
281 0.31
282 0.32
283 0.33
284 0.32
285 0.26
286 0.23
287 0.18
288 0.15
289 0.12
290 0.1
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.1
296 0.11
297 0.1
298 0.11
299 0.1
300 0.1
301 0.16
302 0.16
303 0.16
304 0.18
305 0.19
306 0.2
307 0.21
308 0.21
309 0.15
310 0.13
311 0.12
312 0.1
313 0.07
314 0.05
315 0.04
316 0.03
317 0.04
318 0.04
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.06
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.1
330 0.08
331 0.12
332 0.12
333 0.12
334 0.11
335 0.11
336 0.1
337 0.1
338 0.1
339 0.05
340 0.04
341 0.04
342 0.03
343 0.04
344 0.04
345 0.05
346 0.05
347 0.04
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.07
353 0.06
354 0.05
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.08
364 0.09
365 0.14
366 0.21
367 0.25
368 0.3
369 0.32
370 0.34
371 0.36
372 0.37
373 0.31
374 0.25
375 0.21
376 0.16
377 0.14
378 0.11
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.07
384 0.07
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.07
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.1
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.1
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.1
405 0.12
406 0.13
407 0.12
408 0.11
409 0.11
410 0.12
411 0.13
412 0.12
413 0.1
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.1
418 0.1
419 0.1
420 0.1
421 0.11
422 0.11
423 0.11
424 0.1
425 0.09
426 0.09
427 0.11
428 0.12
429 0.12
430 0.13
431 0.18
432 0.2
433 0.23
434 0.26
435 0.24
436 0.24
437 0.24
438 0.23
439 0.22
440 0.23
441 0.27
442 0.28
443 0.27
444 0.28
445 0.29
446 0.31
447 0.31
448 0.34
449 0.31
450 0.35
451 0.41
452 0.44
453 0.47
454 0.53
455 0.59
456 0.65
457 0.72
458 0.72
459 0.77
460 0.83
461 0.88
462 0.89
463 0.87
464 0.82
465 0.78
466 0.72
467 0.62
468 0.51
469 0.42
470 0.32
471 0.25
472 0.19
473 0.12
474 0.07
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.05
480 0.04
481 0.05
482 0.04
483 0.05
484 0.06
485 0.08
486 0.09
487 0.09
488 0.13
489 0.17
490 0.2
491 0.26
492 0.35
493 0.43
494 0.54
495 0.64
496 0.71
497 0.77
498 0.83
499 0.85
500 0.81
501 0.74
502 0.68
503 0.64
504 0.58
505 0.5
506 0.46
507 0.39
508 0.33
509 0.31
510 0.28
511 0.2
512 0.16
513 0.15
514 0.09
515 0.08
516 0.09
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.09
522 0.14
523 0.23
524 0.27
525 0.3
526 0.36
527 0.42
528 0.49
529 0.52
530 0.54
531 0.53
532 0.54
533 0.54
534 0.49
535 0.44
536 0.36
537 0.3
538 0.24
539 0.19
540 0.14
541 0.17
542 0.17
543 0.16
544 0.19
545 0.19
546 0.19
547 0.2
548 0.2
549 0.17
550 0.21
551 0.22
552 0.2
553 0.22
554 0.22
555 0.19
556 0.19
557 0.17
558 0.12
559 0.12
560 0.11
561 0.08
562 0.1
563 0.11
564 0.11
565 0.11
566 0.12
567 0.12
568 0.13
569 0.16
570 0.17
571 0.21
572 0.22
573 0.22
574 0.22
575 0.22
576 0.21
577 0.18
578 0.15
579 0.14
580 0.13
581 0.13
582 0.13
583 0.13
584 0.14
585 0.18
586 0.18
587 0.17
588 0.17
589 0.21
590 0.23
591 0.26
592 0.27
593 0.25
594 0.25
595 0.31
596 0.34
597 0.33
598 0.4
599 0.43
600 0.45
601 0.47
602 0.5
603 0.44
604 0.41
605 0.4
606 0.32
607 0.3
608 0.24
609 0.24
610 0.24
611 0.22
612 0.2
613 0.23
614 0.23
615 0.22
616 0.25
617 0.23
618 0.22
619 0.25
620 0.28
621 0.32
622 0.35
623 0.41
624 0.45
625 0.45
626 0.45
627 0.44
628 0.44
629 0.45
630 0.44
631 0.4
632 0.43