Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6J3M5V2

Protein Details
Accession A0A6J3M5V2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-57VAPPPPVSPPRPKRPPSPPHEEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-49AKKATKLVAPPPPVSPPRPKRP
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, cyto 4.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MDSDSDTSSLSSAPEEEIKKLAPIFVRAKKATKLVAPPPPVSPPRPKRPPSPPHEEVLADNPDIAFIVMFRSRFAEAFPGKLAHFGPQDLEFGVVDSHPSPQVENLLCALLALLLNRKKPIERGHHGRALEEAVASHKSQWPHKWAAQNPLHGGKDFYNMTPSQRLDLLRTLILWALTSSDAISTIMKDRYKQNRHADDENQPLSVQPWGNDGDKRRYFLIQGLDDTGFRVYREGNRYTKNAHWWSVAGNIQEVKDLAEKLEKQDGTQAARRLAMKMSNAIPMFEATEEVKYRVPIGVVKRHRREYRQQRRAAFARPEQGFGIYEGRTRGKRMRYTYDEDEDDTSDAGSGRLAGRQQSARSNSAEAGPTITASGRQIRKPRTGDYGEGLLSGNVQDVNGDADGRDVGADSNSRARRSGRSATNGEHHADGRGYQDNDEVASADEWDSDKDDGDDERMPDADDDKEFQADAEDDDDDEEDELANDDEGQPEELSSLVVKLRIPGSGTATTDETPPTSPHVPSEAAACQPQADSTKRLEADGVMPSATLASNANRVSEDQKQVVTTGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.21
4 0.23
5 0.23
6 0.25
7 0.25
8 0.26
9 0.22
10 0.28
11 0.36
12 0.41
13 0.49
14 0.5
15 0.54
16 0.55
17 0.58
18 0.55
19 0.53
20 0.54
21 0.54
22 0.59
23 0.59
24 0.56
25 0.54
26 0.57
27 0.56
28 0.54
29 0.57
30 0.57
31 0.63
32 0.71
33 0.73
34 0.75
35 0.8
36 0.84
37 0.81
38 0.82
39 0.74
40 0.68
41 0.66
42 0.58
43 0.49
44 0.45
45 0.4
46 0.3
47 0.27
48 0.22
49 0.19
50 0.17
51 0.15
52 0.08
53 0.05
54 0.09
55 0.11
56 0.11
57 0.12
58 0.14
59 0.16
60 0.16
61 0.17
62 0.22
63 0.21
64 0.23
65 0.25
66 0.24
67 0.23
68 0.26
69 0.25
70 0.21
71 0.22
72 0.2
73 0.2
74 0.19
75 0.2
76 0.18
77 0.18
78 0.12
79 0.11
80 0.11
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.11
86 0.11
87 0.12
88 0.12
89 0.19
90 0.18
91 0.19
92 0.18
93 0.16
94 0.16
95 0.15
96 0.14
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.13
101 0.16
102 0.18
103 0.21
104 0.22
105 0.23
106 0.29
107 0.38
108 0.41
109 0.47
110 0.54
111 0.59
112 0.64
113 0.62
114 0.56
115 0.49
116 0.41
117 0.32
118 0.23
119 0.15
120 0.12
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.16
125 0.19
126 0.25
127 0.3
128 0.34
129 0.39
130 0.44
131 0.51
132 0.52
133 0.59
134 0.58
135 0.57
136 0.54
137 0.54
138 0.5
139 0.41
140 0.39
141 0.3
142 0.29
143 0.26
144 0.22
145 0.2
146 0.2
147 0.22
148 0.26
149 0.25
150 0.22
151 0.24
152 0.24
153 0.23
154 0.25
155 0.24
156 0.19
157 0.19
158 0.18
159 0.15
160 0.14
161 0.11
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.06
172 0.1
173 0.15
174 0.15
175 0.18
176 0.26
177 0.37
178 0.43
179 0.52
180 0.58
181 0.62
182 0.67
183 0.7
184 0.66
185 0.63
186 0.64
187 0.55
188 0.46
189 0.37
190 0.31
191 0.27
192 0.25
193 0.18
194 0.1
195 0.12
196 0.14
197 0.16
198 0.19
199 0.23
200 0.29
201 0.3
202 0.32
203 0.3
204 0.29
205 0.28
206 0.29
207 0.31
208 0.23
209 0.22
210 0.22
211 0.21
212 0.2
213 0.2
214 0.16
215 0.11
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.14
220 0.19
221 0.23
222 0.28
223 0.31
224 0.33
225 0.36
226 0.38
227 0.41
228 0.39
229 0.36
230 0.31
231 0.28
232 0.28
233 0.28
234 0.26
235 0.18
236 0.15
237 0.15
238 0.14
239 0.14
240 0.13
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.11
246 0.12
247 0.13
248 0.19
249 0.18
250 0.17
251 0.21
252 0.23
253 0.23
254 0.26
255 0.27
256 0.22
257 0.24
258 0.24
259 0.21
260 0.2
261 0.19
262 0.15
263 0.16
264 0.16
265 0.18
266 0.18
267 0.17
268 0.16
269 0.13
270 0.13
271 0.1
272 0.1
273 0.06
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.1
278 0.09
279 0.1
280 0.09
281 0.1
282 0.11
283 0.15
284 0.23
285 0.31
286 0.4
287 0.45
288 0.53
289 0.57
290 0.59
291 0.66
292 0.68
293 0.72
294 0.73
295 0.74
296 0.69
297 0.71
298 0.68
299 0.65
300 0.59
301 0.51
302 0.49
303 0.43
304 0.41
305 0.34
306 0.32
307 0.25
308 0.21
309 0.2
310 0.12
311 0.12
312 0.13
313 0.16
314 0.16
315 0.19
316 0.23
317 0.28
318 0.34
319 0.39
320 0.45
321 0.48
322 0.54
323 0.56
324 0.55
325 0.49
326 0.43
327 0.39
328 0.31
329 0.26
330 0.18
331 0.13
332 0.09
333 0.08
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.07
339 0.08
340 0.09
341 0.12
342 0.15
343 0.17
344 0.23
345 0.26
346 0.28
347 0.28
348 0.28
349 0.26
350 0.25
351 0.24
352 0.17
353 0.15
354 0.12
355 0.11
356 0.1
357 0.09
358 0.08
359 0.09
360 0.16
361 0.18
362 0.23
363 0.31
364 0.36
365 0.44
366 0.47
367 0.49
368 0.5
369 0.49
370 0.46
371 0.41
372 0.39
373 0.3
374 0.27
375 0.24
376 0.16
377 0.12
378 0.1
379 0.08
380 0.05
381 0.05
382 0.04
383 0.04
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.05
392 0.04
393 0.04
394 0.06
395 0.06
396 0.07
397 0.16
398 0.19
399 0.2
400 0.22
401 0.24
402 0.29
403 0.35
404 0.42
405 0.41
406 0.45
407 0.48
408 0.5
409 0.53
410 0.5
411 0.45
412 0.38
413 0.31
414 0.25
415 0.22
416 0.19
417 0.17
418 0.2
419 0.19
420 0.18
421 0.19
422 0.18
423 0.18
424 0.17
425 0.14
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.09
433 0.11
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.11
438 0.11
439 0.14
440 0.16
441 0.15
442 0.15
443 0.15
444 0.16
445 0.15
446 0.16
447 0.15
448 0.14
449 0.15
450 0.15
451 0.15
452 0.14
453 0.14
454 0.14
455 0.12
456 0.12
457 0.11
458 0.1
459 0.09
460 0.1
461 0.11
462 0.09
463 0.09
464 0.08
465 0.06
466 0.06
467 0.07
468 0.07
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.08
473 0.09
474 0.1
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.08
481 0.09
482 0.08
483 0.1
484 0.1
485 0.13
486 0.14
487 0.15
488 0.17
489 0.17
490 0.22
491 0.24
492 0.25
493 0.24
494 0.26
495 0.25
496 0.24
497 0.23
498 0.19
499 0.18
500 0.18
501 0.21
502 0.22
503 0.22
504 0.23
505 0.26
506 0.26
507 0.24
508 0.27
509 0.24
510 0.24
511 0.24
512 0.22
513 0.19
514 0.18
515 0.2
516 0.22
517 0.23
518 0.24
519 0.26
520 0.34
521 0.34
522 0.34
523 0.32
524 0.28
525 0.28
526 0.29
527 0.26
528 0.18
529 0.17
530 0.16
531 0.16
532 0.14
533 0.11
534 0.09
535 0.1
536 0.17
537 0.17
538 0.19
539 0.19
540 0.22
541 0.26
542 0.32
543 0.36
544 0.33
545 0.35
546 0.34