Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6J3M5E5

Protein Details
Accession A0A6J3M5E5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-41GGGGRSFHKRKRGRDDDDDGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-34RGRNHGGGGGGGGRSFHKRKRGR
46-49PRSR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 11.5, cyto 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR027159  CBP80  
IPR015172  MIF4G-like_typ-1  
IPR015174  MIF4G-like_typ-2  
Gene Ontology GO:0005846  C:nuclear cap binding complex  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF09088  MIF4G_like  
PF09090  MIF4G_like_2  
Amino Acid Sequences MADDDDRRDSHRGRNHGGGGGGGGRSFHKRKRGRDDDDDGEGARHPRSRQEPPPGSRLKRGLLEIAEDHGRLPHEVAANLAKLAADNYGDEYVKNTFITVILKLVVEQPFKIPFVAAVVLYANVEKLEIAQDIITKAGEQTQAALNAGSWREFKLLLRFLACLTRLYETDGIMPILDELFSRAADLQTASSEDSVGLELVKIILLTIPYLLASAADTTKPLEAQRARTTDLEAKVAELLEKTDIIASTSSTLEALVDPYPVSEGSQESRPMACASVISLLQAQLVGEQASEWKLACIPRVFQLSHKTSGQESGTEANANGDSSANDFAKLQFPAIEVPSEIDAGTKPLLPEIYFSLFADQDIESVPSTSNIAASLLRDAVVDTINILDFNRNIVAKFLNEIDCFWAKDTFVKRSTTFDKLRELQEGRPTWKPEDVIIDAVFSQIFQLPQPEHRLVYYHSLITESCKISPAAIAPSLGRAIRFLFRNIDTMDMELMYRFMDWFAHHLSNFEFRWKWTEWIPELIASDLQPRKAFINGVLDKEIRLSFAKRIRETLPPAYHPLIPASKEKDMPDFKFAADETPYAKEGREVLAMLKKKTPEDEVQKVLDSVHEQATSLGVTDPLVPSTDIYMTAILSIGSKSLSHVLSTIDRCKERLLEIGQKSEPARRQIIASVVDFWSDHPGTAVNIVDKLLNYTIITPMSVIQWALQDNISRGRVLASSQIYEMIAITMFKVTNRVRQVLRERNNTNLSFEQRKQIDEALPRERTGMRDLFATIEDTVASVASGAQDQMIERFDGSESENELIMRWGVHWARVWRRKAAVEEAIVGEQVVGPLEEPPAAADTAMENFDEVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.59
3 0.56
4 0.53
5 0.44
6 0.37
7 0.31
8 0.25
9 0.17
10 0.14
11 0.14
12 0.21
13 0.28
14 0.33
15 0.41
16 0.49
17 0.59
18 0.69
19 0.78
20 0.78
21 0.81
22 0.83
23 0.78
24 0.76
25 0.67
26 0.56
27 0.47
28 0.41
29 0.33
30 0.28
31 0.28
32 0.23
33 0.31
34 0.38
35 0.46
36 0.52
37 0.61
38 0.68
39 0.68
40 0.77
41 0.78
42 0.75
43 0.74
44 0.7
45 0.64
46 0.59
47 0.57
48 0.52
49 0.44
50 0.43
51 0.36
52 0.34
53 0.31
54 0.26
55 0.24
56 0.2
57 0.2
58 0.17
59 0.17
60 0.17
61 0.18
62 0.18
63 0.2
64 0.21
65 0.21
66 0.2
67 0.19
68 0.14
69 0.11
70 0.12
71 0.11
72 0.08
73 0.08
74 0.11
75 0.13
76 0.14
77 0.13
78 0.15
79 0.16
80 0.17
81 0.16
82 0.13
83 0.11
84 0.12
85 0.15
86 0.13
87 0.13
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.17
92 0.21
93 0.2
94 0.2
95 0.22
96 0.24
97 0.25
98 0.24
99 0.19
100 0.14
101 0.16
102 0.16
103 0.13
104 0.11
105 0.1
106 0.1
107 0.11
108 0.1
109 0.08
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.12
125 0.13
126 0.11
127 0.13
128 0.15
129 0.16
130 0.16
131 0.16
132 0.13
133 0.15
134 0.16
135 0.16
136 0.14
137 0.14
138 0.15
139 0.16
140 0.18
141 0.23
142 0.26
143 0.27
144 0.27
145 0.26
146 0.26
147 0.3
148 0.28
149 0.21
150 0.19
151 0.19
152 0.18
153 0.22
154 0.22
155 0.18
156 0.19
157 0.18
158 0.17
159 0.14
160 0.14
161 0.1
162 0.08
163 0.08
164 0.05
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.1
173 0.08
174 0.08
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.09
206 0.1
207 0.1
208 0.17
209 0.2
210 0.26
211 0.33
212 0.35
213 0.37
214 0.37
215 0.41
216 0.39
217 0.37
218 0.33
219 0.26
220 0.23
221 0.21
222 0.21
223 0.17
224 0.11
225 0.1
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.06
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.1
252 0.13
253 0.14
254 0.15
255 0.15
256 0.16
257 0.16
258 0.15
259 0.12
260 0.09
261 0.09
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.07
270 0.05
271 0.06
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.08
281 0.09
282 0.13
283 0.13
284 0.14
285 0.17
286 0.21
287 0.22
288 0.23
289 0.31
290 0.32
291 0.34
292 0.34
293 0.31
294 0.28
295 0.31
296 0.28
297 0.2
298 0.17
299 0.15
300 0.15
301 0.14
302 0.13
303 0.1
304 0.1
305 0.09
306 0.08
307 0.07
308 0.06
309 0.07
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.1
315 0.13
316 0.13
317 0.12
318 0.1
319 0.1
320 0.12
321 0.12
322 0.11
323 0.08
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.08
328 0.07
329 0.06
330 0.07
331 0.08
332 0.08
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.08
337 0.09
338 0.1
339 0.12
340 0.11
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.12
346 0.09
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.06
351 0.07
352 0.07
353 0.06
354 0.07
355 0.06
356 0.06
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.04
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.06
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.09
382 0.08
383 0.09
384 0.1
385 0.11
386 0.11
387 0.11
388 0.14
389 0.14
390 0.14
391 0.14
392 0.13
393 0.1
394 0.15
395 0.18
396 0.2
397 0.22
398 0.24
399 0.24
400 0.28
401 0.32
402 0.34
403 0.35
404 0.32
405 0.35
406 0.35
407 0.36
408 0.37
409 0.35
410 0.3
411 0.34
412 0.34
413 0.32
414 0.33
415 0.34
416 0.3
417 0.3
418 0.28
419 0.21
420 0.23
421 0.2
422 0.17
423 0.15
424 0.14
425 0.12
426 0.11
427 0.1
428 0.06
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.07
434 0.08
435 0.1
436 0.16
437 0.16
438 0.16
439 0.16
440 0.17
441 0.16
442 0.21
443 0.2
444 0.15
445 0.14
446 0.15
447 0.14
448 0.16
449 0.18
450 0.14
451 0.13
452 0.14
453 0.14
454 0.13
455 0.14
456 0.12
457 0.1
458 0.09
459 0.1
460 0.08
461 0.09
462 0.1
463 0.1
464 0.09
465 0.07
466 0.08
467 0.11
468 0.13
469 0.13
470 0.16
471 0.16
472 0.19
473 0.19
474 0.19
475 0.16
476 0.15
477 0.14
478 0.11
479 0.1
480 0.07
481 0.07
482 0.05
483 0.05
484 0.04
485 0.04
486 0.05
487 0.05
488 0.08
489 0.11
490 0.13
491 0.13
492 0.13
493 0.15
494 0.18
495 0.18
496 0.2
497 0.17
498 0.16
499 0.21
500 0.22
501 0.22
502 0.21
503 0.26
504 0.24
505 0.27
506 0.27
507 0.23
508 0.22
509 0.2
510 0.17
511 0.12
512 0.17
513 0.15
514 0.17
515 0.16
516 0.16
517 0.17
518 0.18
519 0.18
520 0.13
521 0.22
522 0.22
523 0.24
524 0.25
525 0.24
526 0.23
527 0.24
528 0.22
529 0.14
530 0.14
531 0.14
532 0.18
533 0.23
534 0.3
535 0.29
536 0.33
537 0.34
538 0.39
539 0.42
540 0.45
541 0.43
542 0.38
543 0.42
544 0.41
545 0.38
546 0.33
547 0.31
548 0.24
549 0.23
550 0.25
551 0.25
552 0.26
553 0.28
554 0.29
555 0.33
556 0.36
557 0.36
558 0.36
559 0.33
560 0.3
561 0.29
562 0.28
563 0.22
564 0.18
565 0.16
566 0.14
567 0.15
568 0.17
569 0.15
570 0.15
571 0.14
572 0.14
573 0.14
574 0.13
575 0.12
576 0.13
577 0.2
578 0.23
579 0.24
580 0.26
581 0.26
582 0.26
583 0.28
584 0.3
585 0.31
586 0.36
587 0.4
588 0.41
589 0.41
590 0.4
591 0.38
592 0.33
593 0.26
594 0.19
595 0.16
596 0.14
597 0.13
598 0.13
599 0.12
600 0.13
601 0.11
602 0.1
603 0.08
604 0.06
605 0.06
606 0.07
607 0.07
608 0.07
609 0.08
610 0.08
611 0.08
612 0.09
613 0.09
614 0.08
615 0.09
616 0.08
617 0.07
618 0.07
619 0.07
620 0.06
621 0.06
622 0.05
623 0.05
624 0.05
625 0.05
626 0.06
627 0.1
628 0.11
629 0.1
630 0.11
631 0.13
632 0.18
633 0.22
634 0.27
635 0.29
636 0.29
637 0.3
638 0.32
639 0.31
640 0.27
641 0.3
642 0.3
643 0.33
644 0.35
645 0.4
646 0.38
647 0.39
648 0.39
649 0.4
650 0.39
651 0.35
652 0.35
653 0.31
654 0.32
655 0.31
656 0.35
657 0.31
658 0.27
659 0.24
660 0.21
661 0.21
662 0.19
663 0.17
664 0.19
665 0.16
666 0.15
667 0.13
668 0.13
669 0.13
670 0.15
671 0.16
672 0.1
673 0.1
674 0.11
675 0.11
676 0.11
677 0.13
678 0.11
679 0.11
680 0.1
681 0.11
682 0.13
683 0.12
684 0.12
685 0.1
686 0.1
687 0.1
688 0.1
689 0.09
690 0.08
691 0.1
692 0.11
693 0.12
694 0.13
695 0.13
696 0.15
697 0.21
698 0.21
699 0.18
700 0.18
701 0.18
702 0.17
703 0.17
704 0.22
705 0.18
706 0.19
707 0.19
708 0.2
709 0.18
710 0.17
711 0.16
712 0.1
713 0.08
714 0.07
715 0.07
716 0.08
717 0.08
718 0.08
719 0.16
720 0.18
721 0.25
722 0.3
723 0.35
724 0.35
725 0.44
726 0.54
727 0.57
728 0.64
729 0.66
730 0.64
731 0.67
732 0.72
733 0.64
734 0.59
735 0.55
736 0.52
737 0.5
738 0.5
739 0.51
740 0.45
741 0.46
742 0.43
743 0.41
744 0.41
745 0.41
746 0.45
747 0.45
748 0.45
749 0.44
750 0.44
751 0.41
752 0.38
753 0.37
754 0.33
755 0.25
756 0.25
757 0.25
758 0.23
759 0.23
760 0.22
761 0.16
762 0.13
763 0.12
764 0.1
765 0.1
766 0.08
767 0.07
768 0.04
769 0.05
770 0.05
771 0.06
772 0.06
773 0.06
774 0.07
775 0.07
776 0.09
777 0.1
778 0.1
779 0.1
780 0.11
781 0.11
782 0.12
783 0.14
784 0.15
785 0.16
786 0.17
787 0.18
788 0.16
789 0.16
790 0.16
791 0.14
792 0.12
793 0.1
794 0.16
795 0.16
796 0.19
797 0.25
798 0.32
799 0.43
800 0.51
801 0.55
802 0.54
803 0.59
804 0.61
805 0.61
806 0.61
807 0.56
808 0.5
809 0.48
810 0.44
811 0.39
812 0.33
813 0.27
814 0.19
815 0.13
816 0.11
817 0.08
818 0.06
819 0.06
820 0.07
821 0.08
822 0.08
823 0.07
824 0.08
825 0.1
826 0.1
827 0.1
828 0.09
829 0.1
830 0.12
831 0.13
832 0.12