FuNGI

F4P1N4

Protein Details

Accession

F4P1N4

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
4-39	ATPKLHRKPQAGPKAERKKANQPNKNAAKNNPRAFT	Hydrophilic
159-189	LTHLDKFKDNKRLRKVKKRLKQRFWTEIYQG	Hydrophilic
1061-1085	AINTIKNDKLQKQKAKQMEKRAEAA	Hydrophilic
1098-1135	MGRERSKEFHREQGKKRAREEAVKARSTGRKPKKSKSD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-32	LHRKPQAGPKAERKKANQPNKNAAK
168-179	NKRLRKVKKRLK
1072-1134	KQKAKQMEKRAEAAKKQAKITEMDRVMGRERSKEFHREQGKKRAREEAVKARSTGRKPKKSKS

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012948 AARP2CN IPR039761 Bms1/Tsr1 IPR037875 Bms1_N IPR007034 BMS1_TSR1_C IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0005634 C:nucleus GO:0005525 F:GTP binding GO:0003924 F:GTPase activity GO:0034511 F:U3 snoRNA binding GO:0000479 P:endonucleolytic cleavage of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF08142 AARP2CN PF04950 RIBIOP_C
CDD	cd01882 BMS1

Amino Acid Sequences

MDIATPKLHRKPQAGPKAERKKANQPNKNAAKNNPRAFTSLSSRNADKAIRRNSEKDQKKLHVPLVDRSPVDAPPFIVAVVGPPKTGKTTLIKSLVKKYTKHNLNEIHGPITVISGKKRRLTFLECNNDVNSMIDIGKETFEFLNILQVHGFPRVMGVLTHLDKFKDNKRLRKVKKRLKQRFWTEIYQGAKLFYLSGIINGRYPKTEILNLSRFISVMKFRPLIWRNTHPYMLADRMEDITDPDVVHSNPKCDRTVTVYGYLRGTNLKKNSKVHIPGVGDQHILNISILDDPCPIPDKVRKKLSDKHKLLYAPMSDVGGILYDKDAVYISVPGAFSKPNHDNGSDEPFVPAGPGEQMVLDLQDAPSTLADRVKSSQMQIFNESQPLLAENSELLLNQSEDEEDQSDYSGMSDENEDEDDDDDDDDDDDDDDEDDQEDVSNSFGHQRRRVARGYATAYAGEDDEADGSDHDSQDDEEDYDAEVGIDADGSLKWKGNLQAKAALNFSKLRRFNLFDHVYNPEKCETAENSTILSHETAFDKQSKGSTTPSNISHEDGWFNVRRHTPKVEISPDLLDMWSEEEFLDSIRDRFVTGVKPKSDENADDMEKADENSDEEVYDDFEDLENPNASENDKTKPVSRSGSGGSAPTKSRSTAGINPDIMDIQSEREANAKRKEELIKKKFDADFEGQGEDEEDDGNLYENAKQQMARQQEMNRAEFENEDAETRALLEGYTAGTYVRIVLECMPCEFVQSFDADYPIIVGGLLSTELSFGFIQVRIKKHRWAKKILKTNDPLIFSLGWRRFQSIPLYSLNTDATRNRMLKYTPEHMHCLATFFGPVTPQNTGFCCFQSVSDKTAAFRISATGVVLAVEKTTEVVKKLKITGTPIKVFKNTAFVKDMFSSSLEVAKFEGASLRTVSGIRGQVKKSISKPEGAFRATFEDKVLMSDIIFLRAWYPVKPKKFYNPVTSLLLSDKLAWMGMRTTGQLRKDLNVQLVHNKDSLYRPIVRPERRFNKLKIPKELQARLPFASKPKLLEKQTEPSFLQRRAVVMEPHERKVATLIQAINTIKNDKLQKQKAKQMEKRAEAAKKQAKITEMDRVMGRERSKEFHREQGKKRAREEAVKARSTGRKPKKSKSD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.75
2	0.76
3	0.8
4	0.84
5	0.85
6	0.84
7	0.8
8	0.8
9	0.82
10	0.84
11	0.82
12	0.81
13	0.84
14	0.86
15	0.88
16	0.84
17	0.83
18	0.83
19	0.84
20	0.82
21	0.76
22	0.68
23	0.61
24	0.58
25	0.55
26	0.52
27	0.5
28	0.48
29	0.49
30	0.48
31	0.47
32	0.47
33	0.46
34	0.46
35	0.47
36	0.51
37	0.55
38	0.6
39	0.63
40	0.69
41	0.75
42	0.76
43	0.76
44	0.75
45	0.73
46	0.76
47	0.78
48	0.74
49	0.7
50	0.64
51	0.63
52	0.62
53	0.61
54	0.52
55	0.48
56	0.43
57	0.39
58	0.39
59	0.32
60	0.24
61	0.2
62	0.2
63	0.17
64	0.15
65	0.12
66	0.13
67	0.17
68	0.17
69	0.16
70	0.16
71	0.18
72	0.21
73	0.22
74	0.23
75	0.25
76	0.3
77	0.38
78	0.47
79	0.51
80	0.52
81	0.61
82	0.65
83	0.63
84	0.61
85	0.61
86	0.63
87	0.66
88	0.67
89	0.66
90	0.65
91	0.65
92	0.69
93	0.63
94	0.55
95	0.46
96	0.41
97	0.32
98	0.27
99	0.25
100	0.19
101	0.24
102	0.29
103	0.34
104	0.41
105	0.43
106	0.46
107	0.49
108	0.55
109	0.58
110	0.61
111	0.65
112	0.61
113	0.61
114	0.57
115	0.51
116	0.43
117	0.34
118	0.24
119	0.16
120	0.13
121	0.11
122	0.11
123	0.11
124	0.12
125	0.1
126	0.12
127	0.1
128	0.11
129	0.11
130	0.1
131	0.17
132	0.16
133	0.17
134	0.15
135	0.16
136	0.17
137	0.19
138	0.19
139	0.1
140	0.11
141	0.11
142	0.11
143	0.1
144	0.12
145	0.16
146	0.18
147	0.21
148	0.21
149	0.22
150	0.25
151	0.3
152	0.35
153	0.4
154	0.46
155	0.53
156	0.63
157	0.73
158	0.8
159	0.86
160	0.89
161	0.9
162	0.91
163	0.93
164	0.93
165	0.93
166	0.93
167	0.91
168	0.9
169	0.85
170	0.82
171	0.74
172	0.69
173	0.61
174	0.54
175	0.44
176	0.35
177	0.29
178	0.23
179	0.2
180	0.13
181	0.12
182	0.09
183	0.12
184	0.14
185	0.14
186	0.17
187	0.19
188	0.2
189	0.2
190	0.21
191	0.21
192	0.22
193	0.26
194	0.27
195	0.33
196	0.37
197	0.37
198	0.37
199	0.34
200	0.3
201	0.26
202	0.26
203	0.22
204	0.21
205	0.25
206	0.25
207	0.25
208	0.35
209	0.39
210	0.43
211	0.46
212	0.5
213	0.52
214	0.56
215	0.56
216	0.47
217	0.46
218	0.42
219	0.39
220	0.31
221	0.24
222	0.21
223	0.2
224	0.2
225	0.17
226	0.15
227	0.12
228	0.12
229	0.11
230	0.1
231	0.12
232	0.12
233	0.19
234	0.19
235	0.23
236	0.26
237	0.29
238	0.3
239	0.29
240	0.31
241	0.31
242	0.37
243	0.35
244	0.38
245	0.37
246	0.38
247	0.38
248	0.36
249	0.3
250	0.28
251	0.28
252	0.28
253	0.34
254	0.4
255	0.44
256	0.48
257	0.53
258	0.56
259	0.59
260	0.54
261	0.53
262	0.49
263	0.47
264	0.47
265	0.44
266	0.36
267	0.3
268	0.28
269	0.21
270	0.18
271	0.13
272	0.09
273	0.07
274	0.1
275	0.1
276	0.09
277	0.1
278	0.1
279	0.11
280	0.14
281	0.14
282	0.16
283	0.24
284	0.32
285	0.39
286	0.48
287	0.53
288	0.56
289	0.65
290	0.72
291	0.75
292	0.71
293	0.66
294	0.63
295	0.59
296	0.54
297	0.51
298	0.41
299	0.33
300	0.28
301	0.24
302	0.18
303	0.17
304	0.14
305	0.09
306	0.08
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.06
312	0.06
313	0.05
314	0.06
315	0.07
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.09
321	0.11
322	0.1
323	0.17
324	0.2
325	0.24
326	0.26
327	0.27
328	0.28
329	0.3
330	0.36
331	0.3
332	0.27
333	0.21
334	0.19
335	0.18
336	0.16
337	0.13
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.05
342	0.05
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.07
354	0.07
355	0.09
356	0.1
357	0.12
358	0.14
359	0.17
360	0.18
361	0.19
362	0.22
363	0.24
364	0.26
365	0.28
366	0.29
367	0.26
368	0.27
369	0.25
370	0.2
371	0.16
372	0.15
373	0.12
374	0.09
375	0.08
376	0.06
377	0.06
378	0.07
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.07
388	0.08
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.07
393	0.07
394	0.07
395	0.06
396	0.05
397	0.05
398	0.06
399	0.06
400	0.07
401	0.07
402	0.07
403	0.07
404	0.08
405	0.08
406	0.07
407	0.07
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.05
427	0.05
428	0.12
429	0.16
430	0.21
431	0.25
432	0.32
433	0.36
434	0.41
435	0.44
436	0.4
437	0.4
438	0.4
439	0.4
440	0.35
441	0.31
442	0.26
443	0.24
444	0.2
445	0.17
446	0.11
447	0.07
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.05
452	0.04
453	0.05
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.07
460	0.07
461	0.07
462	0.06
463	0.06
464	0.06
465	0.06
466	0.06
467	0.05
468	0.04
469	0.04
470	0.03
471	0.03
472	0.03
473	0.03
474	0.03
475	0.05
476	0.05
477	0.06
478	0.06
479	0.09
480	0.14
481	0.21
482	0.24
483	0.24
484	0.31
485	0.32
486	0.33
487	0.32
488	0.28
489	0.23
490	0.24
491	0.24
492	0.25
493	0.25
494	0.26
495	0.29
496	0.32
497	0.32
498	0.38
499	0.4
500	0.33
501	0.34
502	0.35
503	0.36
504	0.32
505	0.32
506	0.23
507	0.19
508	0.19
509	0.19
510	0.17
511	0.18
512	0.19
513	0.18
514	0.18
515	0.17
516	0.17
517	0.15
518	0.13
519	0.08
520	0.07
521	0.08
522	0.08
523	0.1
524	0.12
525	0.12
526	0.12
527	0.14
528	0.14
529	0.14
530	0.17
531	0.18
532	0.19
533	0.22
534	0.24
535	0.26
536	0.25
537	0.25
538	0.22
539	0.2
540	0.18
541	0.15
542	0.16
543	0.17
544	0.16
545	0.19
546	0.22
547	0.24
548	0.26
549	0.29
550	0.29
551	0.29
552	0.34
553	0.34
554	0.31
555	0.3
556	0.27
557	0.24
558	0.21
559	0.17
560	0.11
561	0.08
562	0.08
563	0.06
564	0.06
565	0.05
566	0.05
567	0.05
568	0.05
569	0.06
570	0.05
571	0.06
572	0.06
573	0.06
574	0.06
575	0.07
576	0.08
577	0.13
578	0.18
579	0.24
580	0.24
581	0.26
582	0.26
583	0.28
584	0.28
585	0.22
586	0.2
587	0.18
588	0.18
589	0.17
590	0.18
591	0.16
592	0.14
593	0.14
594	0.11
595	0.07
596	0.07
597	0.08
598	0.07
599	0.06
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.07
604	0.06
605	0.05
606	0.05
607	0.06
608	0.06
609	0.07
610	0.07
611	0.07
612	0.07
613	0.07
614	0.08
615	0.1
616	0.11
617	0.12
618	0.15
619	0.16
620	0.2
621	0.22
622	0.25
623	0.26
624	0.25
625	0.25
626	0.24
627	0.25
628	0.21
629	0.2
630	0.18
631	0.18
632	0.18
633	0.18
634	0.17
635	0.15
636	0.16
637	0.16
638	0.2
639	0.23
640	0.26
641	0.28
642	0.28
643	0.27
644	0.27
645	0.24
646	0.19
647	0.15
648	0.1
649	0.07
650	0.08
651	0.08
652	0.08
653	0.13
654	0.17
655	0.22
656	0.29
657	0.3
658	0.3
659	0.35
660	0.42
661	0.46
662	0.54
663	0.55
664	0.55
665	0.54
666	0.6
667	0.56
668	0.5
669	0.46
670	0.39
671	0.36
672	0.3
673	0.29
674	0.22
675	0.2
676	0.2
677	0.14
678	0.1
679	0.06
680	0.05
681	0.04
682	0.04
683	0.05
684	0.04
685	0.05
686	0.06
687	0.09
688	0.11
689	0.12
690	0.12
691	0.14
692	0.2
693	0.24
694	0.24
695	0.25
696	0.28
697	0.35
698	0.38
699	0.38
700	0.33
701	0.29
702	0.28
703	0.24
704	0.22
705	0.15
706	0.12
707	0.11
708	0.1
709	0.09
710	0.08
711	0.08
712	0.07
713	0.06
714	0.05
715	0.05
716	0.04
717	0.05
718	0.05
719	0.04
720	0.04
721	0.04
722	0.05
723	0.05
724	0.05
725	0.05
726	0.06
727	0.09
728	0.11
729	0.12
730	0.13
731	0.14
732	0.13
733	0.15
734	0.15
735	0.12
736	0.11
737	0.11
738	0.11
739	0.09
740	0.1
741	0.08
742	0.08
743	0.07
744	0.06
745	0.05
746	0.04
747	0.04
748	0.03
749	0.03
750	0.04
751	0.03
752	0.03
753	0.03
754	0.03
755	0.06
756	0.05
757	0.06
758	0.07
759	0.09
760	0.14
761	0.18
762	0.24
763	0.29
764	0.32
765	0.4
766	0.48
767	0.56
768	0.58
769	0.64
770	0.69
771	0.72
772	0.79
773	0.77
774	0.77
775	0.72
776	0.72
777	0.66
778	0.58
779	0.49
780	0.4
781	0.35
782	0.26
783	0.31
784	0.27
785	0.26
786	0.25
787	0.28
788	0.27
789	0.29
790	0.35
791	0.29
792	0.29
793	0.28
794	0.3
795	0.27
796	0.28
797	0.27
798	0.21
799	0.21
800	0.19
801	0.2
802	0.23
803	0.24
804	0.24
805	0.25
806	0.25
807	0.29
808	0.34
809	0.38
810	0.38
811	0.4
812	0.43
813	0.41
814	0.42
815	0.36
816	0.32
817	0.24
818	0.19
819	0.16
820	0.12
821	0.11
822	0.1
823	0.11
824	0.12
825	0.13
826	0.14
827	0.16
828	0.17
829	0.19
830	0.19
831	0.18
832	0.18
833	0.17
834	0.17
835	0.23
836	0.23
837	0.23
838	0.26
839	0.26
840	0.24
841	0.28
842	0.27
843	0.19
844	0.18
845	0.16
846	0.13
847	0.13
848	0.12
849	0.09
850	0.08
851	0.08
852	0.08
853	0.07
854	0.06
855	0.05
856	0.05
857	0.05
858	0.07
859	0.09
860	0.11
861	0.15
862	0.18
863	0.21
864	0.25
865	0.28
866	0.28
867	0.34
868	0.41
869	0.44
870	0.48
871	0.48
872	0.48
873	0.47
874	0.47
875	0.41
876	0.41
877	0.36
878	0.33
879	0.34
880	0.3
881	0.32
882	0.31
883	0.31
884	0.23
885	0.22
886	0.2
887	0.16
888	0.2
889	0.16
890	0.14
891	0.14
892	0.14
893	0.13
894	0.11
895	0.14
896	0.1
897	0.12
898	0.13
899	0.13
900	0.13
901	0.13
902	0.14
903	0.16
904	0.21
905	0.25
906	0.29
907	0.3
908	0.35
909	0.38
910	0.44
911	0.44
912	0.48
913	0.45
914	0.46
915	0.47
916	0.49
917	0.52
918	0.48
919	0.43
920	0.35
921	0.4
922	0.35
923	0.33
924	0.26
925	0.22
926	0.2
927	0.21
928	0.21
929	0.13
930	0.11
931	0.16
932	0.15
933	0.16
934	0.16
935	0.14
936	0.13
937	0.17
938	0.18
939	0.17
940	0.26
941	0.31
942	0.39
943	0.44
944	0.49
945	0.55
946	0.64
947	0.68
948	0.68
949	0.65
950	0.62
951	0.63
952	0.58
953	0.49
954	0.41
955	0.36
956	0.27
957	0.22
958	0.18
959	0.13
960	0.13
961	0.11
962	0.1
963	0.1
964	0.11
965	0.12
966	0.13
967	0.18
968	0.23
969	0.25
970	0.3
971	0.31
972	0.31
973	0.36
974	0.39
975	0.39
976	0.38
977	0.38
978	0.41
979	0.43
980	0.42
981	0.37
982	0.34
983	0.31
984	0.31
985	0.34
986	0.3
987	0.33
988	0.33
989	0.42
990	0.52
991	0.58
992	0.62
993	0.67
994	0.71
995	0.73
996	0.78
997	0.72
998	0.74
999	0.75
1000	0.76
1001	0.75
1002	0.73
1003	0.72
1004	0.75
1005	0.76
1006	0.74
1007	0.72
1008	0.67
1009	0.58
1010	0.54
1011	0.51
1012	0.47
1013	0.48
1014	0.42
1015	0.38
1016	0.44
1017	0.5
1018	0.51
1019	0.56
1020	0.55
1021	0.58
1022	0.61
1023	0.62
1024	0.55
1025	0.55
1026	0.59
1027	0.54
1028	0.52
1029	0.43
1030	0.4
1031	0.39
1032	0.41
1033	0.35
1034	0.33
1035	0.41
1036	0.41
1037	0.43
1038	0.44
1039	0.4
1040	0.36
1041	0.37
1042	0.36
1043	0.3
1044	0.3
1045	0.29
1046	0.28
1047	0.34
1048	0.35
1049	0.34
1050	0.31
1051	0.3
1052	0.25
1053	0.3
1054	0.35
1055	0.38
1056	0.48
1057	0.55
1058	0.63
1059	0.69
1060	0.78
1061	0.81
1062	0.85
1063	0.86
1064	0.86
1065	0.86
1066	0.81
1067	0.79
1068	0.78
1069	0.76
1070	0.7
1071	0.72
1072	0.69
1073	0.65
1074	0.63
1075	0.6
1076	0.54
1077	0.51
1078	0.5
1079	0.49
1080	0.43
1081	0.41
1082	0.38
1083	0.38
1084	0.39
1085	0.4
1086	0.39
1087	0.36
1088	0.38
1089	0.41
1090	0.45
1091	0.51
1092	0.51
1093	0.55
1094	0.63
1095	0.66
1096	0.71
1097	0.77
1098	0.81
1099	0.79
1100	0.79
1101	0.79
1102	0.76
1103	0.75
1104	0.76
1105	0.75
1106	0.74
1107	0.7
1108	0.67
1109	0.64
1110	0.66
1111	0.65
1112	0.67
1113	0.67
1114	0.69
1115	0.74

F4P1N4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer