Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6J3LYM0

Protein Details
Accession A0A6J3LYM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-107TPTQPTPASQSSKKKKKKKKKAKTGGNATEGTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-98SKKKKKKKKKAK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11.5, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006994  TCF25/Rqc1  
Pfam View protein in Pfam  
PF04910  Tcf25  
Amino Acid Sequences MSSRALRKVQQEKEAQLRLQQLEKEAQDLEEDDDIDDIRPTQTKTSAFALLGEDNDENEDEDEDESIEDSAQTKDTPTQPTPASQSSKKKKKKKKKAKTGGNATEGTAQDEDIDEIDAALKELATDNNGNAVAATTSAGVDPVVEEANRLLAVDTVHLHAQNEMKRLFGRAALEQDEDEQPVPAAAGGNRRQQRMAQQMGLAQALRGGRQGGGRAGGFSAVSLRRNIFIQGKEEWPMATGGGLGMEVEEKRADGTVLYRYVHNTSYQNVQSQFNSCVATMDPNSLVALLRENPYHISTLLQVSEIAKHESDHATSGDLLERALFSFGRAAHSTFAKNLAEGKARFDFRRAENREFWLASWRYMQNLTMRATWRTVFEWGKLLISLSPEEDPYGLWLVLDQYALRSRQDLDYINISRNTKLGQVHGNLPNVQFSQALAEYRSGDKRKGRQALYTTIGKFPWVVARLLQEINQDAPPGVWGSEPRTDHERLHSELYATRAKDLWNTPETSSLLVEISSALSDAVSSSPPDETEITLREARHVLLTDNPHLIALIPRALTEQMTSASDVLPPPDGIESHLTSDPAAAAGPRGGAHNRAEVARSMQQIFQDLMAAPAPAADDDDANAAAAVVPEDFRREFEALQRSGGVAGDEGNAEAMYGLFERLMNTLRGGFGGGPTGARAGGVAAGEGEGEGEGEEWDDLGLEGDAGRNPRRARVEDADDDDDDGDEVDVDDGNGNGRRRP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.63
3 0.59
4 0.59
5 0.53
6 0.52
7 0.47
8 0.42
9 0.42
10 0.41
11 0.38
12 0.32
13 0.28
14 0.25
15 0.24
16 0.22
17 0.17
18 0.17
19 0.14
20 0.14
21 0.14
22 0.13
23 0.12
24 0.1
25 0.11
26 0.14
27 0.15
28 0.19
29 0.24
30 0.25
31 0.28
32 0.31
33 0.32
34 0.29
35 0.28
36 0.28
37 0.24
38 0.23
39 0.22
40 0.18
41 0.15
42 0.16
43 0.15
44 0.13
45 0.12
46 0.12
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.08
54 0.07
55 0.07
56 0.08
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.11
61 0.17
62 0.22
63 0.29
64 0.29
65 0.34
66 0.34
67 0.38
68 0.42
69 0.44
70 0.46
71 0.47
72 0.56
73 0.61
74 0.71
75 0.77
76 0.82
77 0.86
78 0.91
79 0.94
80 0.95
81 0.95
82 0.96
83 0.97
84 0.97
85 0.97
86 0.96
87 0.93
88 0.88
89 0.77
90 0.67
91 0.62
92 0.51
93 0.42
94 0.31
95 0.22
96 0.17
97 0.16
98 0.15
99 0.1
100 0.1
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.08
110 0.08
111 0.1
112 0.11
113 0.11
114 0.14
115 0.14
116 0.13
117 0.12
118 0.12
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.05
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.07
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.1
142 0.1
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.14
147 0.19
148 0.21
149 0.25
150 0.23
151 0.24
152 0.24
153 0.26
154 0.24
155 0.22
156 0.21
157 0.19
158 0.22
159 0.23
160 0.23
161 0.22
162 0.23
163 0.21
164 0.2
165 0.17
166 0.13
167 0.11
168 0.1
169 0.09
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.15
174 0.19
175 0.28
176 0.32
177 0.34
178 0.35
179 0.36
180 0.43
181 0.44
182 0.44
183 0.38
184 0.35
185 0.35
186 0.35
187 0.34
188 0.25
189 0.16
190 0.14
191 0.12
192 0.11
193 0.1
194 0.09
195 0.1
196 0.11
197 0.13
198 0.12
199 0.14
200 0.13
201 0.13
202 0.12
203 0.11
204 0.1
205 0.08
206 0.11
207 0.11
208 0.12
209 0.14
210 0.14
211 0.15
212 0.16
213 0.19
214 0.2
215 0.2
216 0.22
217 0.23
218 0.24
219 0.25
220 0.25
221 0.22
222 0.17
223 0.15
224 0.12
225 0.09
226 0.07
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.03
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.07
242 0.1
243 0.13
244 0.13
245 0.14
246 0.16
247 0.18
248 0.18
249 0.19
250 0.17
251 0.16
252 0.22
253 0.23
254 0.25
255 0.25
256 0.26
257 0.24
258 0.26
259 0.26
260 0.21
261 0.2
262 0.16
263 0.15
264 0.13
265 0.15
266 0.13
267 0.13
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.09
273 0.06
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.11
280 0.12
281 0.13
282 0.11
283 0.1
284 0.1
285 0.12
286 0.11
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.11
291 0.12
292 0.12
293 0.1
294 0.1
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.11
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.08
305 0.08
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.06
311 0.05
312 0.07
313 0.08
314 0.11
315 0.12
316 0.12
317 0.13
318 0.15
319 0.15
320 0.13
321 0.16
322 0.13
323 0.12
324 0.14
325 0.15
326 0.18
327 0.18
328 0.21
329 0.22
330 0.24
331 0.24
332 0.24
333 0.26
334 0.26
335 0.36
336 0.39
337 0.39
338 0.4
339 0.43
340 0.43
341 0.39
342 0.35
343 0.32
344 0.27
345 0.23
346 0.24
347 0.21
348 0.2
349 0.2
350 0.21
351 0.16
352 0.19
353 0.2
354 0.19
355 0.2
356 0.2
357 0.21
358 0.2
359 0.18
360 0.15
361 0.18
362 0.16
363 0.16
364 0.17
365 0.16
366 0.16
367 0.14
368 0.13
369 0.09
370 0.1
371 0.09
372 0.08
373 0.08
374 0.07
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.06
381 0.05
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.07
386 0.05
387 0.05
388 0.08
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.1
393 0.11
394 0.14
395 0.14
396 0.14
397 0.2
398 0.21
399 0.22
400 0.24
401 0.24
402 0.22
403 0.21
404 0.2
405 0.17
406 0.17
407 0.17
408 0.18
409 0.19
410 0.25
411 0.29
412 0.3
413 0.27
414 0.26
415 0.26
416 0.22
417 0.2
418 0.14
419 0.1
420 0.11
421 0.1
422 0.11
423 0.09
424 0.1
425 0.11
426 0.13
427 0.19
428 0.18
429 0.23
430 0.28
431 0.34
432 0.42
433 0.48
434 0.48
435 0.48
436 0.5
437 0.51
438 0.49
439 0.48
440 0.4
441 0.35
442 0.33
443 0.27
444 0.23
445 0.18
446 0.19
447 0.15
448 0.14
449 0.13
450 0.15
451 0.18
452 0.18
453 0.19
454 0.15
455 0.15
456 0.16
457 0.15
458 0.13
459 0.1
460 0.1
461 0.09
462 0.08
463 0.07
464 0.06
465 0.07
466 0.1
467 0.16
468 0.17
469 0.19
470 0.23
471 0.25
472 0.26
473 0.31
474 0.31
475 0.29
476 0.31
477 0.29
478 0.25
479 0.25
480 0.28
481 0.26
482 0.23
483 0.21
484 0.19
485 0.19
486 0.22
487 0.23
488 0.25
489 0.24
490 0.26
491 0.25
492 0.28
493 0.28
494 0.24
495 0.22
496 0.16
497 0.13
498 0.11
499 0.1
500 0.06
501 0.06
502 0.05
503 0.05
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.04
508 0.05
509 0.05
510 0.06
511 0.06
512 0.07
513 0.07
514 0.09
515 0.1
516 0.1
517 0.12
518 0.14
519 0.17
520 0.2
521 0.2
522 0.2
523 0.2
524 0.19
525 0.18
526 0.17
527 0.15
528 0.17
529 0.21
530 0.21
531 0.22
532 0.21
533 0.19
534 0.18
535 0.17
536 0.14
537 0.12
538 0.12
539 0.1
540 0.11
541 0.12
542 0.12
543 0.12
544 0.11
545 0.1
546 0.09
547 0.1
548 0.11
549 0.1
550 0.1
551 0.11
552 0.11
553 0.11
554 0.1
555 0.09
556 0.1
557 0.1
558 0.1
559 0.11
560 0.15
561 0.15
562 0.17
563 0.18
564 0.17
565 0.16
566 0.17
567 0.14
568 0.1
569 0.09
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.06
574 0.07
575 0.09
576 0.1
577 0.14
578 0.15
579 0.18
580 0.2
581 0.2
582 0.21
583 0.2
584 0.23
585 0.25
586 0.26
587 0.25
588 0.25
589 0.25
590 0.26
591 0.25
592 0.2
593 0.17
594 0.14
595 0.13
596 0.12
597 0.11
598 0.08
599 0.08
600 0.08
601 0.06
602 0.07
603 0.06
604 0.06
605 0.07
606 0.08
607 0.08
608 0.08
609 0.07
610 0.06
611 0.06
612 0.06
613 0.06
614 0.05
615 0.06
616 0.06
617 0.1
618 0.1
619 0.12
620 0.16
621 0.17
622 0.18
623 0.25
624 0.33
625 0.3
626 0.31
627 0.3
628 0.26
629 0.25
630 0.24
631 0.17
632 0.09
633 0.09
634 0.08
635 0.08
636 0.07
637 0.07
638 0.07
639 0.06
640 0.06
641 0.05
642 0.05
643 0.05
644 0.06
645 0.06
646 0.06
647 0.07
648 0.09
649 0.12
650 0.12
651 0.13
652 0.14
653 0.13
654 0.13
655 0.14
656 0.12
657 0.1
658 0.12
659 0.11
660 0.1
661 0.1
662 0.11
663 0.09
664 0.09
665 0.08
666 0.06
667 0.07
668 0.07
669 0.06
670 0.06
671 0.06
672 0.06
673 0.06
674 0.05
675 0.04
676 0.04
677 0.04
678 0.04
679 0.04
680 0.05
681 0.05
682 0.05
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.05
687 0.05
688 0.05
689 0.05
690 0.07
691 0.09
692 0.14
693 0.17
694 0.23
695 0.24
696 0.32
697 0.39
698 0.42
699 0.48
700 0.51
701 0.57
702 0.57
703 0.62
704 0.59
705 0.52
706 0.49
707 0.41
708 0.33
709 0.24
710 0.18
711 0.11
712 0.07
713 0.07
714 0.06
715 0.06
716 0.06
717 0.07
718 0.06
719 0.1
720 0.16