FuNGI

A0A6J3LUS6

Protein Details

Accession

A0A6J3LUS6

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-43	MSDRRLQASRDDRRRDRDGDARGADARGDRRDRRRSRSPAGGI	Basic
108-130	GDRRDQRRGDDDRRREPRRDRDD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
14-39	RRDRDGDARGADARGDRRDRRRSRSP
84-182	RERNGGGERDWGRDRGADRGADRGGDRRDQRRGDDDRRREPRRDRDDLFSDRRRPGRDDRGDRGDRRDDRERDTRRDRDDERELERQTRKSPEPAARKP

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR003954 RRM_dom_euk IPR006529 U2AF_lg
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing GO:0008380 P:RNA splicing
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12232 RRM3_U2AF65

Amino Acid Sequences

MSDRRLQASRDDRRRDRDGDARGADARGDRRDRRRSRSPAGGIVAGPQSSNGGGRRYERREDVDSYSSSRGYREREREDRYGGRERNGGGERDWGRDRGADRGADRGGDRRDQRRGDDDRRREPRRDRDDLFSDRRRPGRDDRGDRGDRRDDRERDTRRDRDDERELERQTRKSPEPAARKPREPTPDLTDVVPILERKRRLTQWDIKPAGYENITAEQAKMSGMYPLPGAPQAQRQPMDPQRLQAFMNQPGNQASNTALKPNTARQSKRLMVYNISETLTDSGTVDFFNLQLNGLNVTRNNDPCVSAHISKDRSFALLEFKSPEDATTAMTLLDGVNVDASTATSNGHSNGTSAGLRIERPKDYIVPTVAADAESDNGTISNVVPDTQNKLVLANLPVNLDEAQILELLQSFGPMKSFVLVSYGGEDVSRGVVFLEYKDPNHTDVAIEGLSGMDLGSMPLKISRACIGTQQVGGEMSVNNMSLMAGTKSSEFGNGRVLCLMNMVTPAELMDAEEADEILEDITEECAKFGTLLETKMPRPVGGARHGSGVGKIYLKYESPESAAKALAALAGRNFSGRTVVVTHYLEENFDLNAW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.81
2	0.75
3	0.72
4	0.7
5	0.67
6	0.66
7	0.6
8	0.56
9	0.5
10	0.47
11	0.41
12	0.37
13	0.36
14	0.35
15	0.41
16	0.47
17	0.55
18	0.65
19	0.72
20	0.76
21	0.81
22	0.82
23	0.82
24	0.84
25	0.8
26	0.76
27	0.71
28	0.65
29	0.54
30	0.48
31	0.42
32	0.31
33	0.25
34	0.18
35	0.15
36	0.13
37	0.16
38	0.15
39	0.16
40	0.19
41	0.25
42	0.34
43	0.4
44	0.46
45	0.48
46	0.51
47	0.53
48	0.55
49	0.55
50	0.51
51	0.47
52	0.44
53	0.41
54	0.37
55	0.32
56	0.31
57	0.3
58	0.31
59	0.39
60	0.44
61	0.51
62	0.58
63	0.64
64	0.67
65	0.69
66	0.69
67	0.66
68	0.67
69	0.61
70	0.56
71	0.52
72	0.48
73	0.49
74	0.46
75	0.41
76	0.31
77	0.37
78	0.35
79	0.37
80	0.39
81	0.31
82	0.29
83	0.31
84	0.32
85	0.29
86	0.31
87	0.29
88	0.27
89	0.31
90	0.3
91	0.28
92	0.28
93	0.28
94	0.28
95	0.32
96	0.38
97	0.4
98	0.48
99	0.49
100	0.53
101	0.55
102	0.6
103	0.64
104	0.68
105	0.7
106	0.72
107	0.79
108	0.8
109	0.8
110	0.8
111	0.81
112	0.79
113	0.79
114	0.72
115	0.7
116	0.71
117	0.71
118	0.7
119	0.68
120	0.65
121	0.63
122	0.65
123	0.61
124	0.59
125	0.6
126	0.63
127	0.65
128	0.66
129	0.67
130	0.71
131	0.74
132	0.71
133	0.68
134	0.67
135	0.61
136	0.6
137	0.63
138	0.57
139	0.57
140	0.64
141	0.64
142	0.64
143	0.69
144	0.69
145	0.66
146	0.7
147	0.66
148	0.64
149	0.66
150	0.62
151	0.58
152	0.58
153	0.54
154	0.54
155	0.56
156	0.52
157	0.48
158	0.5
159	0.47
160	0.45
161	0.51
162	0.52
163	0.57
164	0.63
165	0.69
166	0.67
167	0.7
168	0.68
169	0.68
170	0.66
171	0.59
172	0.54
173	0.5
174	0.49
175	0.44
176	0.41
177	0.34
178	0.27
179	0.24
180	0.21
181	0.15
182	0.14
183	0.17
184	0.19
185	0.23
186	0.29
187	0.32
188	0.37
189	0.45
190	0.51
191	0.56
192	0.64
193	0.62
194	0.56
195	0.53
196	0.48
197	0.41
198	0.32
199	0.23
200	0.14
201	0.14
202	0.15
203	0.14
204	0.13
205	0.11
206	0.1
207	0.09
208	0.08
209	0.06
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.08
214	0.08
215	0.09
216	0.09
217	0.1
218	0.09
219	0.15
220	0.19
221	0.23
222	0.23
223	0.24
224	0.32
225	0.37
226	0.44
227	0.38
228	0.38
229	0.35
230	0.36
231	0.35
232	0.31
233	0.29
234	0.27
235	0.32
236	0.29
237	0.28
238	0.27
239	0.28
240	0.23
241	0.2
242	0.15
243	0.15
244	0.15
245	0.16
246	0.15
247	0.15
248	0.17
249	0.22
250	0.28
251	0.3
252	0.32
253	0.33
254	0.4
255	0.43
256	0.44
257	0.44
258	0.38
259	0.34
260	0.34
261	0.33
262	0.27
263	0.23
264	0.2
265	0.15
266	0.15
267	0.12
268	0.1
269	0.08
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.06
274	0.05
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.06
281	0.07
282	0.07
283	0.08
284	0.07
285	0.1
286	0.13
287	0.13
288	0.15
289	0.14
290	0.14
291	0.14
292	0.18
293	0.2
294	0.19
295	0.2
296	0.23
297	0.26
298	0.26
299	0.27
300	0.23
301	0.19
302	0.18
303	0.17
304	0.18
305	0.16
306	0.15
307	0.15
308	0.15
309	0.16
310	0.15
311	0.15
312	0.09
313	0.09
314	0.09
315	0.08
316	0.08
317	0.07
318	0.06
319	0.06
320	0.05
321	0.05
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.03
326	0.04
327	0.03
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.05
333	0.06
334	0.07
335	0.08
336	0.08
337	0.08
338	0.08
339	0.09
340	0.09
341	0.08
342	0.09
343	0.09
344	0.1
345	0.14
346	0.17
347	0.16
348	0.18
349	0.19
350	0.21
351	0.23
352	0.25
353	0.22
354	0.2
355	0.19
356	0.18
357	0.16
358	0.13
359	0.11
360	0.08
361	0.07
362	0.06
363	0.06
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.06
372	0.07
373	0.08
374	0.13
375	0.14
376	0.15
377	0.14
378	0.14
379	0.14
380	0.15
381	0.16
382	0.14
383	0.14
384	0.13
385	0.13
386	0.14
387	0.14
388	0.11
389	0.09
390	0.07
391	0.07
392	0.06
393	0.06
394	0.05
395	0.05
396	0.06
397	0.05
398	0.06
399	0.06
400	0.06
401	0.07
402	0.08
403	0.07
404	0.08
405	0.08
406	0.07
407	0.08
408	0.09
409	0.08
410	0.1
411	0.1
412	0.09
413	0.08
414	0.08
415	0.06
416	0.07
417	0.07
418	0.05
419	0.05
420	0.06
421	0.07
422	0.08
423	0.14
424	0.14
425	0.15
426	0.19
427	0.2
428	0.21
429	0.22
430	0.21
431	0.15
432	0.14
433	0.15
434	0.11
435	0.09
436	0.08
437	0.06
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.03
442	0.03
443	0.03
444	0.04
445	0.04
446	0.05
447	0.06
448	0.08
449	0.08
450	0.1
451	0.13
452	0.14
453	0.15
454	0.19
455	0.22
456	0.23
457	0.24
458	0.22
459	0.2
460	0.18
461	0.17
462	0.14
463	0.1
464	0.09
465	0.09
466	0.09
467	0.08
468	0.07
469	0.07
470	0.06
471	0.08
472	0.07
473	0.07
474	0.08
475	0.08
476	0.09
477	0.1
478	0.15
479	0.14
480	0.15
481	0.23
482	0.23
483	0.23
484	0.24
485	0.24
486	0.19
487	0.19
488	0.19
489	0.1
490	0.11
491	0.11
492	0.09
493	0.08
494	0.08
495	0.08
496	0.07
497	0.07
498	0.06
499	0.06
500	0.06
501	0.06
502	0.06
503	0.05
504	0.06
505	0.05
506	0.04
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.06
511	0.08
512	0.08
513	0.08
514	0.08
515	0.08
516	0.08
517	0.09
518	0.14
519	0.15
520	0.17
521	0.23
522	0.27
523	0.27
524	0.33
525	0.33
526	0.27
527	0.28
528	0.31
529	0.32
530	0.36
531	0.41
532	0.36
533	0.38
534	0.39
535	0.36
536	0.32
537	0.29
538	0.24
539	0.2
540	0.2
541	0.19
542	0.2
543	0.2
544	0.22
545	0.23
546	0.22
547	0.23
548	0.26
549	0.27
550	0.26
551	0.25
552	0.22
553	0.19
554	0.17
555	0.16
556	0.13
557	0.12
558	0.11
559	0.13
560	0.13
561	0.14
562	0.14
563	0.12
564	0.14
565	0.13
566	0.14
567	0.16
568	0.18
569	0.23
570	0.23
571	0.24
572	0.26
573	0.26
574	0.24
575	0.23
576	0.21

A0A6J3LUS6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer