Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6A6YMH3

Protein Details
Accession A0A6A6YMH3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-43HVCSKVPSQKPQSPKSRMDRAAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017351  PINCH_1-4-like  
IPR001781  Znf_LIM  
Gene Ontology GO:0110165  C:cellular anatomical entity  
GO:0030695  F:GTPase regulator activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00412  LIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00478  LIM_DOMAIN_1  
PS50023  LIM_DOMAIN_2  
CDD cd08368  LIM  
cd09397  LIM1_UF1  
Amino Acid Sequences MLPAIKCSDCGVEIEIMSMADHVCSKVPSQKPQSPKSRMDRAATFSTSLAAKTSGLLRPGRMPPPPKIDSSVANKPFAPRDQLTPLSSYSDPRSASPISPGYKPKMMRSATSPMPRPFSPPSPDLLSGNMDCPFPPFPTSRSGTPTPKEAKPKSRDGLQPIPDHRYAEADPLYAPLSPRTTGGASVLKRMNTIAPGPFDARSGKGPEKTPPIDKSGLGHRRNATHGSIGSNYTGNVQRASSVGSTRSRSSTLSSNGVVGLPSRPKQSGPPARPSRPEGIDAFLEQLQEQANELPKRGLSADSRARTFPLRKDSEANVDVPPLPSLPPLQRRPTMGSEASDSSSIVSRGLPSDPKSSNGFPPRSASRSGSFSGSRAGLRRDDPPPVPALPVLPNIQTQVPAKPLHTPSDSGSSDDSVANSDIRSATSSRSSPPASEAWGLSRRPSKASAYEPPAQEDNRIQRIASPSVDSRTQSPRPLTPETRSDSRNGPTGYNRGMAPEPLMKPRPFPVADGPESPMDPAIQLGLFNQRRPSKPSILPTPQPPPPPSFNFSMSPPKGAPPMVAPQASTPPVSRRGTMASKGKCRGCSEPIVGKSVKAADGRLTGRYHKQCFVCKTCRAPFQTADFYVINNFPYCEQHYHQLNGSLCKGCNRGIEGQYLETDQRQKFHSNCFTCNHCRVRLRDDYFEVGGKVFCERHAFHVAQQNNMLGARRNPERRTTRLMMMM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.16
3 0.13
4 0.13
5 0.11
6 0.09
7 0.07
8 0.08
9 0.08
10 0.1
11 0.11
12 0.14
13 0.23
14 0.3
15 0.39
16 0.47
17 0.54
18 0.62
19 0.7
20 0.78
21 0.77
22 0.8
23 0.8
24 0.81
25 0.79
26 0.77
27 0.73
28 0.68
29 0.67
30 0.59
31 0.51
32 0.41
33 0.37
34 0.31
35 0.25
36 0.2
37 0.15
38 0.13
39 0.13
40 0.18
41 0.18
42 0.23
43 0.24
44 0.25
45 0.31
46 0.37
47 0.41
48 0.44
49 0.46
50 0.49
51 0.56
52 0.57
53 0.53
54 0.52
55 0.49
56 0.49
57 0.51
58 0.54
59 0.49
60 0.49
61 0.47
62 0.45
63 0.48
64 0.44
65 0.44
66 0.35
67 0.37
68 0.42
69 0.46
70 0.44
71 0.4
72 0.38
73 0.35
74 0.34
75 0.32
76 0.29
77 0.3
78 0.29
79 0.27
80 0.31
81 0.28
82 0.29
83 0.31
84 0.33
85 0.31
86 0.36
87 0.4
88 0.41
89 0.45
90 0.46
91 0.46
92 0.49
93 0.48
94 0.45
95 0.45
96 0.47
97 0.49
98 0.54
99 0.55
100 0.5
101 0.54
102 0.51
103 0.51
104 0.5
105 0.49
106 0.47
107 0.41
108 0.42
109 0.42
110 0.43
111 0.38
112 0.34
113 0.31
114 0.26
115 0.27
116 0.23
117 0.18
118 0.16
119 0.19
120 0.18
121 0.16
122 0.18
123 0.18
124 0.19
125 0.25
126 0.29
127 0.29
128 0.34
129 0.39
130 0.43
131 0.43
132 0.5
133 0.49
134 0.51
135 0.58
136 0.6
137 0.64
138 0.63
139 0.7
140 0.65
141 0.67
142 0.67
143 0.65
144 0.67
145 0.63
146 0.64
147 0.59
148 0.6
149 0.54
150 0.49
151 0.41
152 0.36
153 0.3
154 0.28
155 0.25
156 0.2
157 0.18
158 0.18
159 0.18
160 0.15
161 0.15
162 0.12
163 0.14
164 0.14
165 0.14
166 0.16
167 0.16
168 0.15
169 0.18
170 0.22
171 0.2
172 0.26
173 0.28
174 0.25
175 0.25
176 0.26
177 0.24
178 0.19
179 0.21
180 0.18
181 0.17
182 0.19
183 0.2
184 0.2
185 0.2
186 0.19
187 0.18
188 0.19
189 0.22
190 0.25
191 0.27
192 0.29
193 0.33
194 0.39
195 0.41
196 0.45
197 0.42
198 0.43
199 0.4
200 0.38
201 0.36
202 0.38
203 0.44
204 0.4
205 0.43
206 0.4
207 0.41
208 0.44
209 0.44
210 0.35
211 0.29
212 0.29
213 0.25
214 0.24
215 0.22
216 0.2
217 0.17
218 0.16
219 0.15
220 0.18
221 0.16
222 0.15
223 0.14
224 0.14
225 0.14
226 0.16
227 0.13
228 0.11
229 0.15
230 0.18
231 0.2
232 0.22
233 0.23
234 0.22
235 0.22
236 0.23
237 0.26
238 0.25
239 0.26
240 0.25
241 0.23
242 0.22
243 0.21
244 0.18
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.14
249 0.16
250 0.17
251 0.18
252 0.22
253 0.32
254 0.39
255 0.4
256 0.49
257 0.55
258 0.59
259 0.62
260 0.62
261 0.57
262 0.49
263 0.47
264 0.37
265 0.31
266 0.28
267 0.24
268 0.22
269 0.16
270 0.14
271 0.11
272 0.11
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.15
281 0.14
282 0.15
283 0.15
284 0.16
285 0.12
286 0.19
287 0.26
288 0.28
289 0.3
290 0.29
291 0.3
292 0.31
293 0.33
294 0.32
295 0.33
296 0.34
297 0.35
298 0.38
299 0.39
300 0.41
301 0.39
302 0.35
303 0.25
304 0.23
305 0.22
306 0.18
307 0.16
308 0.1
309 0.09
310 0.08
311 0.1
312 0.14
313 0.21
314 0.26
315 0.3
316 0.32
317 0.34
318 0.38
319 0.39
320 0.38
321 0.31
322 0.27
323 0.25
324 0.24
325 0.22
326 0.18
327 0.14
328 0.11
329 0.1
330 0.1
331 0.08
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.09
336 0.1
337 0.12
338 0.18
339 0.18
340 0.2
341 0.23
342 0.24
343 0.29
344 0.34
345 0.33
346 0.28
347 0.31
348 0.32
349 0.31
350 0.32
351 0.28
352 0.23
353 0.25
354 0.25
355 0.24
356 0.21
357 0.19
358 0.19
359 0.17
360 0.16
361 0.14
362 0.15
363 0.15
364 0.16
365 0.2
366 0.2
367 0.23
368 0.22
369 0.22
370 0.22
371 0.21
372 0.2
373 0.15
374 0.15
375 0.13
376 0.14
377 0.14
378 0.12
379 0.12
380 0.13
381 0.13
382 0.13
383 0.13
384 0.12
385 0.15
386 0.15
387 0.15
388 0.2
389 0.21
390 0.23
391 0.23
392 0.23
393 0.22
394 0.28
395 0.28
396 0.23
397 0.22
398 0.18
399 0.18
400 0.17
401 0.15
402 0.09
403 0.1
404 0.09
405 0.08
406 0.08
407 0.07
408 0.07
409 0.09
410 0.08
411 0.09
412 0.12
413 0.13
414 0.14
415 0.18
416 0.19
417 0.17
418 0.2
419 0.19
420 0.18
421 0.18
422 0.17
423 0.17
424 0.22
425 0.21
426 0.22
427 0.26
428 0.25
429 0.26
430 0.28
431 0.27
432 0.27
433 0.32
434 0.35
435 0.37
436 0.41
437 0.39
438 0.39
439 0.39
440 0.34
441 0.31
442 0.29
443 0.3
444 0.29
445 0.29
446 0.26
447 0.26
448 0.3
449 0.31
450 0.27
451 0.23
452 0.2
453 0.22
454 0.25
455 0.22
456 0.22
457 0.27
458 0.29
459 0.31
460 0.32
461 0.34
462 0.37
463 0.44
464 0.44
465 0.4
466 0.44
467 0.44
468 0.46
469 0.43
470 0.4
471 0.38
472 0.36
473 0.38
474 0.33
475 0.3
476 0.29
477 0.32
478 0.32
479 0.29
480 0.27
481 0.23
482 0.22
483 0.2
484 0.19
485 0.21
486 0.21
487 0.25
488 0.31
489 0.28
490 0.3
491 0.32
492 0.36
493 0.31
494 0.31
495 0.33
496 0.35
497 0.37
498 0.36
499 0.36
500 0.3
501 0.3
502 0.27
503 0.19
504 0.12
505 0.1
506 0.08
507 0.07
508 0.06
509 0.05
510 0.06
511 0.16
512 0.17
513 0.19
514 0.26
515 0.31
516 0.34
517 0.41
518 0.46
519 0.44
520 0.49
521 0.54
522 0.57
523 0.58
524 0.6
525 0.59
526 0.59
527 0.56
528 0.56
529 0.51
530 0.47
531 0.46
532 0.48
533 0.45
534 0.43
535 0.41
536 0.38
537 0.39
538 0.44
539 0.39
540 0.37
541 0.34
542 0.32
543 0.31
544 0.29
545 0.26
546 0.19
547 0.24
548 0.25
549 0.25
550 0.23
551 0.22
552 0.26
553 0.27
554 0.25
555 0.21
556 0.21
557 0.28
558 0.3
559 0.29
560 0.26
561 0.31
562 0.35
563 0.4
564 0.45
565 0.45
566 0.51
567 0.58
568 0.6
569 0.58
570 0.58
571 0.56
572 0.52
573 0.51
574 0.5
575 0.51
576 0.48
577 0.49
578 0.45
579 0.39
580 0.36
581 0.32
582 0.29
583 0.22
584 0.21
585 0.19
586 0.25
587 0.26
588 0.28
589 0.28
590 0.29
591 0.38
592 0.45
593 0.46
594 0.47
595 0.51
596 0.55
597 0.61
598 0.65
599 0.64
600 0.62
601 0.67
602 0.68
603 0.71
604 0.68
605 0.65
606 0.61
607 0.6
608 0.6
609 0.52
610 0.49
611 0.41
612 0.36
613 0.34
614 0.3
615 0.25
616 0.18
617 0.18
618 0.14
619 0.18
620 0.22
621 0.24
622 0.26
623 0.33
624 0.37
625 0.39
626 0.4
627 0.43
628 0.42
629 0.41
630 0.43
631 0.39
632 0.34
633 0.37
634 0.37
635 0.33
636 0.34
637 0.34
638 0.37
639 0.35
640 0.4
641 0.37
642 0.36
643 0.34
644 0.32
645 0.29
646 0.26
647 0.32
648 0.28
649 0.29
650 0.31
651 0.37
652 0.38
653 0.46
654 0.53
655 0.5
656 0.53
657 0.55
658 0.59
659 0.6
660 0.66
661 0.62
662 0.6
663 0.62
664 0.63
665 0.66
666 0.68
667 0.66
668 0.65
669 0.62
670 0.59
671 0.54
672 0.51
673 0.44
674 0.34
675 0.28
676 0.22
677 0.21
678 0.17
679 0.17
680 0.21
681 0.22
682 0.27
683 0.33
684 0.34
685 0.36
686 0.45
687 0.45
688 0.43
689 0.43
690 0.38
691 0.33
692 0.34
693 0.3
694 0.25
695 0.27
696 0.3
697 0.37
698 0.44
699 0.46
700 0.55
701 0.6
702 0.63
703 0.68
704 0.66