Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6A6Y2X8

Protein Details
Accession A0A6A6Y2X8    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-36LTKAQKRKSTTDTSPKTKRPKKSEAPATESAPHydrophilic
44-72GIEVVKKASKEKKVPKEKKVPKDEVAKLEBasic
74-102KVEVKETKAPKEKKAPKGKKAPKEPEVAGBasic
115-139EITASKEDKKAKKEKKDKPASTVLPHydrophilic
155-178TETVPKAKKEKKVKAVPKIPAKRAHydrophilic
379-400FKGAGKRFKKPAPRNALWRKDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-134PKTKRPKKSEAPATESAPEKATKEEGIEVVKKASKEKKVPKEKKVPKDEVAKLEEKVEVKETKAPKEKKAPKGKKAPKEPEVAGEKLSKKEKTATKEITASKEDKKAKKEKKDKPA
160-177KAKKEKKVKAVPKIPAKR
193-218KPPKAKKTKVAATEDSKKSKKSKKEK
381-400GAGKRFKKPAPRNALWRKDL
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPELTKAQKRKSTTDTSPKTKRPKKSEAPATESAPEKATKEEGIEVVKKASKEKKVPKEKKVPKDEVAKLEEKVEVKETKAPKEKKAPKGKKAPKEPEVAGEKLSKKEKTATKEITASKEDKKAKKEKKDKPASTVLPKRATTPDTASDIEVVTETVPKAKKEKKVKAVPKIPAKRAITPDTASDVEIVTEKPPKAKKTKVAATEDSKKSKKSKKEKVVAVVVEESDSDVEDDQTAALLAGFESSEGEAAAEKAESEDDGEGLDLDHLPDVPASDALKRQLKQAGQSGGEPGVIYVGRVPHGFYEHQMRAYFSQFGHIKRLRLSRNKRTGASKHYAFIEFASADVADIVARTMHNYLLFQRLLQVRVVPPAQVHEELFKGAGKRFKKPAPRNALWRKDLEHGADRKSWVGMVKKEQQRRLGKAEKMKSVFGYEFEAPPIREVDNVPVRTKAVKAAVETAVQAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.74
3 0.75
4 0.78
5 0.82
6 0.83
7 0.87
8 0.86
9 0.86
10 0.85
11 0.86
12 0.86
13 0.88
14 0.89
15 0.87
16 0.86
17 0.8
18 0.75
19 0.69
20 0.6
21 0.51
22 0.43
23 0.35
24 0.29
25 0.26
26 0.25
27 0.22
28 0.21
29 0.22
30 0.22
31 0.26
32 0.28
33 0.26
34 0.28
35 0.3
36 0.29
37 0.34
38 0.4
39 0.43
40 0.51
41 0.6
42 0.67
43 0.75
44 0.84
45 0.87
46 0.9
47 0.91
48 0.91
49 0.91
50 0.88
51 0.84
52 0.84
53 0.8
54 0.76
55 0.73
56 0.65
57 0.55
58 0.49
59 0.46
60 0.37
61 0.32
62 0.3
63 0.26
64 0.24
65 0.31
66 0.34
67 0.39
68 0.48
69 0.51
70 0.53
71 0.62
72 0.7
73 0.73
74 0.8
75 0.81
76 0.81
77 0.88
78 0.9
79 0.89
80 0.9
81 0.89
82 0.84
83 0.81
84 0.73
85 0.69
86 0.65
87 0.55
88 0.47
89 0.44
90 0.4
91 0.39
92 0.44
93 0.37
94 0.34
95 0.41
96 0.45
97 0.46
98 0.52
99 0.52
100 0.5
101 0.56
102 0.57
103 0.54
104 0.52
105 0.49
106 0.44
107 0.47
108 0.51
109 0.5
110 0.56
111 0.61
112 0.67
113 0.74
114 0.8
115 0.81
116 0.84
117 0.89
118 0.84
119 0.8
120 0.8
121 0.76
122 0.75
123 0.73
124 0.69
125 0.65
126 0.61
127 0.57
128 0.52
129 0.47
130 0.4
131 0.36
132 0.32
133 0.3
134 0.3
135 0.27
136 0.23
137 0.21
138 0.18
139 0.14
140 0.1
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.11
145 0.13
146 0.14
147 0.22
148 0.28
149 0.37
150 0.47
151 0.56
152 0.61
153 0.7
154 0.78
155 0.8
156 0.82
157 0.81
158 0.81
159 0.8
160 0.74
161 0.72
162 0.66
163 0.61
164 0.58
165 0.54
166 0.47
167 0.4
168 0.37
169 0.32
170 0.29
171 0.24
172 0.19
173 0.14
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.08
178 0.12
179 0.12
180 0.17
181 0.22
182 0.27
183 0.33
184 0.39
185 0.46
186 0.51
187 0.57
188 0.59
189 0.61
190 0.61
191 0.6
192 0.63
193 0.6
194 0.58
195 0.53
196 0.49
197 0.52
198 0.54
199 0.58
200 0.59
201 0.65
202 0.68
203 0.75
204 0.77
205 0.74
206 0.73
207 0.63
208 0.54
209 0.44
210 0.33
211 0.24
212 0.19
213 0.13
214 0.06
215 0.06
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.02
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.04
239 0.03
240 0.03
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.03
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.06
262 0.07
263 0.09
264 0.14
265 0.19
266 0.19
267 0.22
268 0.26
269 0.27
270 0.29
271 0.34
272 0.33
273 0.29
274 0.29
275 0.27
276 0.23
277 0.21
278 0.17
279 0.11
280 0.08
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.08
289 0.11
290 0.12
291 0.13
292 0.2
293 0.2
294 0.23
295 0.23
296 0.24
297 0.23
298 0.25
299 0.25
300 0.17
301 0.23
302 0.24
303 0.25
304 0.33
305 0.34
306 0.34
307 0.37
308 0.45
309 0.46
310 0.53
311 0.62
312 0.63
313 0.71
314 0.74
315 0.72
316 0.73
317 0.71
318 0.69
319 0.67
320 0.58
321 0.5
322 0.48
323 0.45
324 0.37
325 0.31
326 0.25
327 0.17
328 0.15
329 0.13
330 0.1
331 0.08
332 0.08
333 0.07
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.06
340 0.07
341 0.08
342 0.09
343 0.1
344 0.12
345 0.17
346 0.18
347 0.16
348 0.22
349 0.23
350 0.24
351 0.24
352 0.25
353 0.2
354 0.25
355 0.26
356 0.2
357 0.18
358 0.2
359 0.23
360 0.21
361 0.21
362 0.18
363 0.18
364 0.18
365 0.18
366 0.17
367 0.16
368 0.18
369 0.25
370 0.26
371 0.32
372 0.39
373 0.47
374 0.56
375 0.63
376 0.7
377 0.73
378 0.76
379 0.8
380 0.83
381 0.85
382 0.78
383 0.72
384 0.65
385 0.61
386 0.58
387 0.53
388 0.51
389 0.46
390 0.46
391 0.45
392 0.43
393 0.38
394 0.35
395 0.31
396 0.28
397 0.31
398 0.32
399 0.37
400 0.46
401 0.53
402 0.61
403 0.66
404 0.7
405 0.72
406 0.73
407 0.74
408 0.73
409 0.72
410 0.74
411 0.75
412 0.75
413 0.69
414 0.65
415 0.57
416 0.54
417 0.47
418 0.38
419 0.36
420 0.3
421 0.27
422 0.28
423 0.3
424 0.25
425 0.25
426 0.26
427 0.21
428 0.2
429 0.21
430 0.27
431 0.32
432 0.35
433 0.35
434 0.35
435 0.37
436 0.37
437 0.37
438 0.34
439 0.31
440 0.31
441 0.32
442 0.35
443 0.36
444 0.35