Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4PA39

Protein Details
Accession F4PA39    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MGARRKKKRTHVPIQDITNTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-8RRKKK
Subcellular Location(s) nucl 17, mito_nucl 13.333, cyto_nucl 9.833, mito 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MGARRKKKRTHVPIQDITNTPKSFVIKSGEVGQSLGRLVRDVRRTMEPNTATRLKESRGNRIKDFVHVASQLSVTHMLIFSRSKTGEPNLRIGRIPRGPTLSFHISSYSLSKDVVSSQPSSKSFGVEFSKSPLVVLNNFAGDAKHIKLISTMVQNMFPAIRVQQMKISDARRVVIFNLNSETGRVEFRHYKIIVKTTGISKSVKTLIHTNVPDLKGYKDISDYVIRGAFSTESDVEDATESTVTLPDNYQPKDSIKTSQRAIKLIELGPRMELELVKIQGGLCAGEIIHHSFVKKTSEEIKKLEEAMEIRNKEKEQRRAQQAKNVQAKQTAKKAMKSAGNGESNDQDTDQDDDMEDQDDDMEDQDDVHMDDADDEEDEFEHDMDSDEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.82
3 0.75
4 0.71
5 0.68
6 0.57
7 0.48
8 0.44
9 0.4
10 0.34
11 0.35
12 0.35
13 0.28
14 0.3
15 0.36
16 0.35
17 0.32
18 0.31
19 0.27
20 0.22
21 0.21
22 0.21
23 0.13
24 0.12
25 0.15
26 0.22
27 0.28
28 0.29
29 0.32
30 0.38
31 0.42
32 0.44
33 0.5
34 0.46
35 0.44
36 0.48
37 0.5
38 0.43
39 0.44
40 0.44
41 0.38
42 0.41
43 0.42
44 0.46
45 0.5
46 0.55
47 0.53
48 0.55
49 0.54
50 0.51
51 0.53
52 0.44
53 0.39
54 0.34
55 0.33
56 0.27
57 0.27
58 0.22
59 0.17
60 0.17
61 0.12
62 0.12
63 0.11
64 0.1
65 0.12
66 0.13
67 0.13
68 0.16
69 0.17
70 0.17
71 0.2
72 0.27
73 0.33
74 0.34
75 0.41
76 0.41
77 0.42
78 0.43
79 0.41
80 0.43
81 0.4
82 0.41
83 0.35
84 0.37
85 0.36
86 0.36
87 0.41
88 0.38
89 0.33
90 0.3
91 0.28
92 0.24
93 0.24
94 0.24
95 0.19
96 0.14
97 0.14
98 0.13
99 0.12
100 0.14
101 0.16
102 0.17
103 0.18
104 0.19
105 0.25
106 0.26
107 0.3
108 0.27
109 0.26
110 0.23
111 0.26
112 0.28
113 0.24
114 0.24
115 0.23
116 0.25
117 0.22
118 0.22
119 0.19
120 0.17
121 0.16
122 0.18
123 0.14
124 0.12
125 0.13
126 0.13
127 0.1
128 0.1
129 0.11
130 0.1
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.13
136 0.15
137 0.16
138 0.17
139 0.15
140 0.16
141 0.16
142 0.15
143 0.14
144 0.11
145 0.09
146 0.07
147 0.12
148 0.12
149 0.13
150 0.16
151 0.17
152 0.19
153 0.23
154 0.24
155 0.22
156 0.21
157 0.22
158 0.19
159 0.19
160 0.18
161 0.19
162 0.18
163 0.16
164 0.17
165 0.17
166 0.16
167 0.16
168 0.15
169 0.1
170 0.11
171 0.1
172 0.12
173 0.16
174 0.17
175 0.24
176 0.24
177 0.27
178 0.27
179 0.3
180 0.28
181 0.24
182 0.24
183 0.2
184 0.22
185 0.21
186 0.2
187 0.16
188 0.18
189 0.21
190 0.2
191 0.18
192 0.21
193 0.21
194 0.27
195 0.27
196 0.26
197 0.27
198 0.27
199 0.26
200 0.23
201 0.21
202 0.18
203 0.18
204 0.17
205 0.13
206 0.13
207 0.15
208 0.16
209 0.15
210 0.13
211 0.14
212 0.13
213 0.12
214 0.12
215 0.1
216 0.08
217 0.1
218 0.09
219 0.08
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.1
234 0.16
235 0.17
236 0.19
237 0.2
238 0.22
239 0.26
240 0.27
241 0.31
242 0.31
243 0.35
244 0.37
245 0.41
246 0.42
247 0.4
248 0.4
249 0.35
250 0.33
251 0.31
252 0.33
253 0.28
254 0.25
255 0.23
256 0.21
257 0.19
258 0.16
259 0.13
260 0.1
261 0.13
262 0.13
263 0.13
264 0.13
265 0.12
266 0.12
267 0.13
268 0.1
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.09
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.13
279 0.16
280 0.19
281 0.18
282 0.19
283 0.27
284 0.35
285 0.39
286 0.41
287 0.43
288 0.41
289 0.41
290 0.39
291 0.33
292 0.26
293 0.28
294 0.33
295 0.31
296 0.31
297 0.34
298 0.35
299 0.4
300 0.48
301 0.51
302 0.53
303 0.61
304 0.7
305 0.76
306 0.79
307 0.8
308 0.79
309 0.79
310 0.79
311 0.73
312 0.65
313 0.63
314 0.65
315 0.62
316 0.62
317 0.62
318 0.56
319 0.57
320 0.59
321 0.58
322 0.57
323 0.54
324 0.52
325 0.51
326 0.51
327 0.47
328 0.45
329 0.41
330 0.38
331 0.35
332 0.28
333 0.21
334 0.17
335 0.2
336 0.18
337 0.15
338 0.14
339 0.14
340 0.14
341 0.15
342 0.14
343 0.1
344 0.1
345 0.1
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.07
350 0.07
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.08
356 0.07
357 0.08
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.09
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.09