Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4P1U4

Protein Details
Accession F4P1U4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-46CRHGDRCSRKHVKPNFSQTLHydrophilic
195-222EDDGRSRSHSRERYRDRPREGRERDGYRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
199-229RSRSHSRERYRDRPREGRERDGYRERGGRER
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12.5, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR009145  U2AF_small  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0089701  C:U2AF complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0030628  F:pre-mRNA 3'-splice site binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences FADHLASIYGTEKDKVNCSFYFKIGACRHGDRCSRKHVKPNFSQTLLIPNLYLNPAHNPGCTMTPDEIQENFDLLFEDLFMELAKYGELEDMNICDNVGDHLIGNVYARFKYEEDAGNAVESLNNRFYAGRPLYAELSPVTDFGEACCRQYELGECTRGGFCNFMHIKKPSKAMIKDMYKAQRLSIKILKPRGDEDDGRSRSHSRERYRDRPREGRERDGYRERGGRERDDRRYRDYDTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.29
3 0.32
4 0.31
5 0.37
6 0.38
7 0.35
8 0.4
9 0.35
10 0.42
11 0.41
12 0.44
13 0.42
14 0.45
15 0.48
16 0.48
17 0.57
18 0.55
19 0.57
20 0.62
21 0.67
22 0.67
23 0.73
24 0.75
25 0.75
26 0.76
27 0.82
28 0.78
29 0.72
30 0.67
31 0.57
32 0.56
33 0.48
34 0.38
35 0.28
36 0.2
37 0.19
38 0.18
39 0.18
40 0.11
41 0.13
42 0.17
43 0.18
44 0.18
45 0.18
46 0.18
47 0.2
48 0.2
49 0.19
50 0.16
51 0.17
52 0.18
53 0.19
54 0.18
55 0.18
56 0.17
57 0.15
58 0.13
59 0.11
60 0.1
61 0.08
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.03
73 0.04
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.05
87 0.04
88 0.04
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.12
100 0.13
101 0.14
102 0.15
103 0.14
104 0.13
105 0.12
106 0.11
107 0.1
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.09
115 0.16
116 0.16
117 0.16
118 0.16
119 0.17
120 0.19
121 0.18
122 0.19
123 0.11
124 0.13
125 0.11
126 0.11
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.16
132 0.13
133 0.14
134 0.15
135 0.14
136 0.14
137 0.15
138 0.18
139 0.14
140 0.18
141 0.19
142 0.18
143 0.2
144 0.2
145 0.2
146 0.18
147 0.15
148 0.11
149 0.19
150 0.21
151 0.21
152 0.26
153 0.29
154 0.35
155 0.36
156 0.41
157 0.37
158 0.44
159 0.44
160 0.46
161 0.51
162 0.5
163 0.5
164 0.53
165 0.53
166 0.5
167 0.48
168 0.44
169 0.4
170 0.37
171 0.41
172 0.4
173 0.4
174 0.43
175 0.5
176 0.52
177 0.49
178 0.5
179 0.5
180 0.48
181 0.44
182 0.44
183 0.47
184 0.45
185 0.44
186 0.43
187 0.39
188 0.39
189 0.46
190 0.48
191 0.47
192 0.56
193 0.64
194 0.72
195 0.8
196 0.85
197 0.85
198 0.86
199 0.85
200 0.85
201 0.82
202 0.82
203 0.8
204 0.77
205 0.76
206 0.75
207 0.71
208 0.66
209 0.66
210 0.6
211 0.59
212 0.58
213 0.58
214 0.59
215 0.64
216 0.68
217 0.72
218 0.74
219 0.73
220 0.73