Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6A6YH13

Protein Details
Accession A0A6A6YH13    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-106DGSGHDRKRRRLRGEDDTDRDBasic
164-183ERNDKAEREKRKKENEHELQBasic
279-303MGERERRREKHGKSKKGHHDQAKLEBasic
316-388WRRDEERSSKHQQHRSRSREDSHKRRSSHRSERRRSRSPVRDRSPESSKLRGHHHGSRKHRDERKSGDKYGRVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-96HDRKRRR
160-176LRKGERNDKAEREKRKK
280-298GERERRREKHGKSKKGHHD
309-383KSPKHESWRRDEERSSKHQQHRSRSREDSHKRRSSHRSERRRSRSPVRDRSPESSKLRGHHHGSRKHRDERKSGD
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 5.5, cyto_mito 4.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR039875  LENG1-like  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
Amino Acid Sequences MPLHLLAKKSWNVYNPANVARVRADEAAAAAREEAEEQRMQEADAERRIAILRGVTPPPLLPAPADNLQTGHKRDRSDKAEKRDTDGSGHDRKRRRLRGEDDTDRDIRLAQVTTTPRAKNNQDLEAKGWKPKVAVDAPVVDHRGHISLFPVDEKAEMQRLRKGERNDKAEREKRKKENEHELQNGMPLGGVKAPEKPWYSAAKVLYDGARGDDMLMNMPTKDMWGKEDPRREEREKKRLVTNDPFAVMQKAQAQLKQAERDRRAWTAKREQEITELRAMGERERRREKHGKSKKGHHDQAKLESFSLDKSPKHESWRRDEERSSKHQQHRSRSREDSHKRRSSHRSERRRSRSPVRDRSPESSKLRGHHHGSRKHRDERKSGDKYGRVQH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.49
3 0.48
4 0.48
5 0.44
6 0.41
7 0.37
8 0.35
9 0.31
10 0.26
11 0.23
12 0.19
13 0.2
14 0.2
15 0.18
16 0.16
17 0.13
18 0.12
19 0.11
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.14
24 0.14
25 0.17
26 0.17
27 0.17
28 0.2
29 0.23
30 0.25
31 0.27
32 0.28
33 0.25
34 0.26
35 0.27
36 0.23
37 0.2
38 0.17
39 0.16
40 0.2
41 0.21
42 0.21
43 0.21
44 0.2
45 0.22
46 0.21
47 0.18
48 0.14
49 0.14
50 0.19
51 0.22
52 0.23
53 0.2
54 0.2
55 0.24
56 0.29
57 0.32
58 0.35
59 0.35
60 0.38
61 0.43
62 0.52
63 0.55
64 0.6
65 0.64
66 0.66
67 0.72
68 0.69
69 0.69
70 0.65
71 0.59
72 0.51
73 0.48
74 0.46
75 0.46
76 0.51
77 0.53
78 0.55
79 0.63
80 0.71
81 0.74
82 0.75
83 0.75
84 0.77
85 0.8
86 0.82
87 0.82
88 0.76
89 0.72
90 0.64
91 0.55
92 0.47
93 0.36
94 0.27
95 0.2
96 0.15
97 0.1
98 0.15
99 0.18
100 0.22
101 0.28
102 0.28
103 0.29
104 0.35
105 0.38
106 0.4
107 0.42
108 0.45
109 0.43
110 0.43
111 0.44
112 0.46
113 0.44
114 0.4
115 0.37
116 0.3
117 0.27
118 0.27
119 0.3
120 0.24
121 0.25
122 0.22
123 0.24
124 0.24
125 0.26
126 0.26
127 0.2
128 0.18
129 0.15
130 0.14
131 0.12
132 0.1
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.14
143 0.16
144 0.17
145 0.21
146 0.23
147 0.27
148 0.32
149 0.37
150 0.4
151 0.46
152 0.52
153 0.53
154 0.57
155 0.64
156 0.66
157 0.7
158 0.7
159 0.72
160 0.73
161 0.78
162 0.8
163 0.77
164 0.81
165 0.78
166 0.76
167 0.7
168 0.63
169 0.52
170 0.44
171 0.36
172 0.25
173 0.17
174 0.09
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.09
180 0.1
181 0.14
182 0.16
183 0.17
184 0.2
185 0.22
186 0.23
187 0.25
188 0.25
189 0.21
190 0.2
191 0.2
192 0.17
193 0.14
194 0.13
195 0.09
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.1
211 0.16
212 0.22
213 0.28
214 0.36
215 0.4
216 0.45
217 0.52
218 0.55
219 0.6
220 0.63
221 0.68
222 0.67
223 0.66
224 0.67
225 0.66
226 0.67
227 0.64
228 0.59
229 0.51
230 0.45
231 0.42
232 0.35
233 0.31
234 0.23
235 0.17
236 0.16
237 0.17
238 0.17
239 0.18
240 0.21
241 0.23
242 0.28
243 0.33
244 0.36
245 0.41
246 0.43
247 0.47
248 0.48
249 0.5
250 0.53
251 0.52
252 0.55
253 0.56
254 0.59
255 0.58
256 0.57
257 0.52
258 0.52
259 0.5
260 0.45
261 0.37
262 0.31
263 0.27
264 0.27
265 0.26
266 0.23
267 0.28
268 0.3
269 0.35
270 0.45
271 0.48
272 0.54
273 0.63
274 0.67
275 0.69
276 0.75
277 0.77
278 0.76
279 0.84
280 0.86
281 0.87
282 0.87
283 0.85
284 0.83
285 0.78
286 0.79
287 0.75
288 0.65
289 0.55
290 0.46
291 0.38
292 0.31
293 0.31
294 0.26
295 0.2
296 0.23
297 0.3
298 0.33
299 0.42
300 0.48
301 0.48
302 0.54
303 0.64
304 0.66
305 0.65
306 0.68
307 0.68
308 0.69
309 0.7
310 0.7
311 0.69
312 0.73
313 0.76
314 0.77
315 0.79
316 0.82
317 0.81
318 0.81
319 0.78
320 0.77
321 0.79
322 0.82
323 0.82
324 0.82
325 0.82
326 0.78
327 0.79
328 0.81
329 0.81
330 0.81
331 0.81
332 0.82
333 0.84
334 0.92
335 0.92
336 0.91
337 0.9
338 0.89
339 0.89
340 0.89
341 0.89
342 0.87
343 0.87
344 0.84
345 0.82
346 0.79
347 0.77
348 0.72
349 0.7
350 0.66
351 0.62
352 0.63
353 0.64
354 0.64
355 0.64
356 0.67
357 0.68
358 0.74
359 0.8
360 0.81
361 0.83
362 0.85
363 0.84
364 0.84
365 0.84
366 0.85
367 0.82
368 0.81
369 0.8
370 0.79