Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4NYT2

Protein Details
Accession F4NYT2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-36SEPVRAAHGRRTNNHRQHSTHydrophilic
40-65NASQTGKGLQKKQSRSRQQSGPLVDKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 9.5, cyto 6.5, mito 2, pero 2, E.R. 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0000932  C:P-body  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
GO:0033962  P:P-body assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSFFGFDTALPSEADSSEPVRAAHGRRTNNHRQHSTSPANASQTGKGLQKKQSRSRQQSGPLVDKGSQSSTNKDSSRQDQHQLLGLQSGVAVSDNMDGDHLDEMLRDRYENSLDTFGDNDQLMENYTRALDEENQDLNDETFGDAAIDPSGRDFQYANHNVPHELDRQGPARPSAEGSPISKSQQLQQKNELMAAQQQRRLMQQQAAENMRNQSAFNTMPGAPSNHPQVAPQYMRQMPPSYNGGGLSGISSNKPMSSFQEIEAQMMRQARMGASNTIKMDQSHLLSSDHMFSSRRVVDHLHPHNAGTPPTQGGGVFSQRSPQGMQSMINMSEVEAAMRSRQAQFGMQLPSPMHQSMMSNNNSPPMNASDIETMLRAQQMGQNSQIQLNQQLHSSQFQQMHPMIQQHGQPLMRSEMIPGRYDYASSPPVQNSPNTMFIEEQLRRQQLGEIQREHPMQPSQGGLSDNQTNRLASNLPQHQPSVVPEQQFTSHDLDYAEDLENEIGFEDPDCLEEIQTKSKLHKQKLEDERDQPIFAVDTDEDFPALGATRTTNSNNFKNNSRSKQPFNNTIQKKYKNQRERHQGDQRIPIDFVHRERERFTPNDSHLSREARYKGLMRKFEMEYIAKIQVSNLFSEDPHKDDYYYHRIKEQTLSLEGTLGKITSTTSRNPKKAIQVATSSPSEGHQSSVSSGNALSAGVVLKSIEKVYSTVLDLEYLQQSKNHEAESDEEKPSKYLHTQNKLWTSLRVMESTPNTMQHPFVCMLNYSKGARILPRALRFFDRNQLMQIFAVILNRFECLKVSNIFTGIQNSDVDAFMGNVIPLLVGVISEAPMIAVISLARTVLERHNIIWFAKNKVGISILTMLLSRAEVLKQGLPNIRAPSEQELGMWSEIYNFLFQSLQGHFSSLFPTNPLSADNVCVWQFMSAVAVGASGIDHQRILVTEVREHVMHASKTGDPKALDNVNLFLNALGLGISAAQLAAMPI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.14
4 0.15
5 0.17
6 0.16
7 0.18
8 0.24
9 0.26
10 0.34
11 0.4
12 0.46
13 0.53
14 0.62
15 0.7
16 0.74
17 0.8
18 0.77
19 0.76
20 0.74
21 0.75
22 0.74
23 0.69
24 0.65
25 0.59
26 0.57
27 0.54
28 0.51
29 0.43
30 0.39
31 0.37
32 0.38
33 0.4
34 0.43
35 0.48
36 0.55
37 0.63
38 0.7
39 0.76
40 0.81
41 0.84
42 0.85
43 0.85
44 0.84
45 0.83
46 0.8
47 0.77
48 0.69
49 0.62
50 0.56
51 0.49
52 0.43
53 0.39
54 0.38
55 0.33
56 0.36
57 0.36
58 0.42
59 0.41
60 0.44
61 0.47
62 0.49
63 0.56
64 0.56
65 0.59
66 0.56
67 0.56
68 0.57
69 0.51
70 0.43
71 0.35
72 0.28
73 0.21
74 0.17
75 0.15
76 0.08
77 0.07
78 0.06
79 0.05
80 0.07
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.08
88 0.06
89 0.07
90 0.1
91 0.13
92 0.14
93 0.13
94 0.14
95 0.17
96 0.19
97 0.21
98 0.21
99 0.21
100 0.21
101 0.21
102 0.22
103 0.19
104 0.19
105 0.17
106 0.14
107 0.12
108 0.12
109 0.13
110 0.12
111 0.12
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.12
117 0.14
118 0.15
119 0.2
120 0.21
121 0.22
122 0.22
123 0.23
124 0.2
125 0.17
126 0.15
127 0.1
128 0.08
129 0.07
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.09
137 0.12
138 0.11
139 0.12
140 0.12
141 0.14
142 0.24
143 0.29
144 0.3
145 0.31
146 0.32
147 0.32
148 0.34
149 0.35
150 0.27
151 0.24
152 0.24
153 0.24
154 0.25
155 0.28
156 0.28
157 0.27
158 0.25
159 0.24
160 0.24
161 0.23
162 0.25
163 0.25
164 0.24
165 0.26
166 0.27
167 0.29
168 0.29
169 0.28
170 0.3
171 0.36
172 0.42
173 0.43
174 0.47
175 0.51
176 0.48
177 0.48
178 0.42
179 0.35
180 0.34
181 0.37
182 0.35
183 0.32
184 0.34
185 0.34
186 0.37
187 0.4
188 0.37
189 0.32
190 0.33
191 0.34
192 0.39
193 0.42
194 0.4
195 0.39
196 0.37
197 0.34
198 0.3
199 0.25
200 0.19
201 0.19
202 0.18
203 0.16
204 0.17
205 0.15
206 0.16
207 0.18
208 0.21
209 0.18
210 0.21
211 0.25
212 0.24
213 0.24
214 0.23
215 0.25
216 0.29
217 0.3
218 0.3
219 0.32
220 0.33
221 0.35
222 0.37
223 0.37
224 0.3
225 0.31
226 0.32
227 0.26
228 0.23
229 0.21
230 0.19
231 0.16
232 0.15
233 0.12
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.12
242 0.14
243 0.21
244 0.22
245 0.22
246 0.3
247 0.29
248 0.3
249 0.29
250 0.25
251 0.21
252 0.22
253 0.21
254 0.14
255 0.14
256 0.13
257 0.15
258 0.17
259 0.19
260 0.19
261 0.22
262 0.22
263 0.23
264 0.23
265 0.2
266 0.21
267 0.19
268 0.19
269 0.16
270 0.17
271 0.16
272 0.16
273 0.17
274 0.16
275 0.14
276 0.13
277 0.14
278 0.13
279 0.19
280 0.2
281 0.19
282 0.18
283 0.21
284 0.25
285 0.34
286 0.4
287 0.38
288 0.37
289 0.37
290 0.39
291 0.38
292 0.34
293 0.25
294 0.21
295 0.16
296 0.16
297 0.16
298 0.12
299 0.12
300 0.13
301 0.15
302 0.14
303 0.14
304 0.16
305 0.16
306 0.18
307 0.17
308 0.16
309 0.15
310 0.15
311 0.16
312 0.15
313 0.17
314 0.16
315 0.16
316 0.14
317 0.12
318 0.12
319 0.11
320 0.09
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.09
326 0.09
327 0.1
328 0.11
329 0.12
330 0.13
331 0.17
332 0.2
333 0.19
334 0.2
335 0.19
336 0.19
337 0.2
338 0.18
339 0.14
340 0.11
341 0.12
342 0.14
343 0.21
344 0.22
345 0.22
346 0.22
347 0.26
348 0.25
349 0.24
350 0.22
351 0.17
352 0.17
353 0.15
354 0.17
355 0.14
356 0.14
357 0.15
358 0.13
359 0.11
360 0.09
361 0.09
362 0.07
363 0.07
364 0.08
365 0.11
366 0.12
367 0.14
368 0.16
369 0.16
370 0.18
371 0.18
372 0.17
373 0.19
374 0.2
375 0.18
376 0.16
377 0.17
378 0.16
379 0.17
380 0.19
381 0.18
382 0.2
383 0.19
384 0.23
385 0.23
386 0.23
387 0.23
388 0.23
389 0.2
390 0.18
391 0.2
392 0.17
393 0.2
394 0.19
395 0.18
396 0.17
397 0.18
398 0.16
399 0.14
400 0.15
401 0.15
402 0.16
403 0.17
404 0.16
405 0.16
406 0.15
407 0.16
408 0.15
409 0.15
410 0.15
411 0.15
412 0.16
413 0.14
414 0.17
415 0.18
416 0.17
417 0.18
418 0.19
419 0.23
420 0.22
421 0.22
422 0.19
423 0.19
424 0.26
425 0.23
426 0.23
427 0.23
428 0.23
429 0.23
430 0.23
431 0.23
432 0.21
433 0.28
434 0.3
435 0.28
436 0.29
437 0.33
438 0.34
439 0.32
440 0.3
441 0.23
442 0.19
443 0.16
444 0.15
445 0.11
446 0.12
447 0.12
448 0.1
449 0.11
450 0.16
451 0.16
452 0.18
453 0.18
454 0.16
455 0.16
456 0.16
457 0.15
458 0.11
459 0.19
460 0.21
461 0.22
462 0.23
463 0.23
464 0.23
465 0.22
466 0.23
467 0.23
468 0.2
469 0.19
470 0.18
471 0.19
472 0.2
473 0.2
474 0.21
475 0.17
476 0.14
477 0.14
478 0.14
479 0.13
480 0.12
481 0.13
482 0.1
483 0.07
484 0.07
485 0.06
486 0.06
487 0.05
488 0.05
489 0.04
490 0.03
491 0.03
492 0.04
493 0.04
494 0.05
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.09
499 0.1
500 0.13
501 0.16
502 0.16
503 0.18
504 0.25
505 0.33
506 0.35
507 0.4
508 0.4
509 0.48
510 0.57
511 0.62
512 0.6
513 0.56
514 0.57
515 0.51
516 0.47
517 0.37
518 0.27
519 0.2
520 0.14
521 0.13
522 0.07
523 0.08
524 0.09
525 0.08
526 0.08
527 0.07
528 0.07
529 0.06
530 0.06
531 0.05
532 0.04
533 0.04
534 0.06
535 0.08
536 0.1
537 0.15
538 0.2
539 0.25
540 0.3
541 0.32
542 0.36
543 0.42
544 0.48
545 0.48
546 0.52
547 0.53
548 0.53
549 0.6
550 0.6
551 0.61
552 0.6
553 0.65
554 0.6
555 0.64
556 0.67
557 0.64
558 0.67
559 0.68
560 0.71
561 0.71
562 0.75
563 0.75
564 0.78
565 0.77
566 0.78
567 0.79
568 0.74
569 0.7
570 0.7
571 0.62
572 0.53
573 0.48
574 0.38
575 0.33
576 0.29
577 0.26
578 0.26
579 0.26
580 0.25
581 0.28
582 0.32
583 0.32
584 0.31
585 0.34
586 0.32
587 0.33
588 0.41
589 0.39
590 0.38
591 0.38
592 0.39
593 0.35
594 0.34
595 0.34
596 0.26
597 0.28
598 0.3
599 0.34
600 0.37
601 0.41
602 0.37
603 0.4
604 0.39
605 0.39
606 0.38
607 0.31
608 0.26
609 0.25
610 0.24
611 0.2
612 0.18
613 0.16
614 0.17
615 0.17
616 0.16
617 0.14
618 0.12
619 0.12
620 0.16
621 0.17
622 0.15
623 0.17
624 0.17
625 0.16
626 0.17
627 0.24
628 0.3
629 0.34
630 0.32
631 0.33
632 0.34
633 0.35
634 0.38
635 0.34
636 0.28
637 0.26
638 0.26
639 0.22
640 0.22
641 0.2
642 0.17
643 0.14
644 0.1
645 0.07
646 0.06
647 0.07
648 0.1
649 0.13
650 0.18
651 0.28
652 0.36
653 0.39
654 0.43
655 0.47
656 0.5
657 0.55
658 0.54
659 0.47
660 0.43
661 0.43
662 0.43
663 0.39
664 0.31
665 0.24
666 0.21
667 0.2
668 0.16
669 0.15
670 0.12
671 0.12
672 0.14
673 0.17
674 0.16
675 0.13
676 0.13
677 0.11
678 0.11
679 0.1
680 0.08
681 0.05
682 0.05
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.05
687 0.06
688 0.07
689 0.06
690 0.07
691 0.07
692 0.09
693 0.1
694 0.1
695 0.11
696 0.11
697 0.11
698 0.11
699 0.12
700 0.14
701 0.14
702 0.13
703 0.14
704 0.17
705 0.2
706 0.22
707 0.2
708 0.17
709 0.18
710 0.21
711 0.26
712 0.28
713 0.27
714 0.27
715 0.27
716 0.27
717 0.26
718 0.26
719 0.24
720 0.29
721 0.36
722 0.43
723 0.47
724 0.54
725 0.59
726 0.6
727 0.55
728 0.48
729 0.42
730 0.4
731 0.38
732 0.32
733 0.26
734 0.28
735 0.28
736 0.31
737 0.29
738 0.25
739 0.24
740 0.24
741 0.25
742 0.2
743 0.22
744 0.18
745 0.17
746 0.16
747 0.16
748 0.17
749 0.19
750 0.22
751 0.19
752 0.21
753 0.22
754 0.23
755 0.24
756 0.26
757 0.31
758 0.35
759 0.4
760 0.41
761 0.42
762 0.46
763 0.47
764 0.45
765 0.46
766 0.44
767 0.38
768 0.38
769 0.36
770 0.32
771 0.28
772 0.25
773 0.17
774 0.13
775 0.15
776 0.12
777 0.12
778 0.11
779 0.12
780 0.12
781 0.11
782 0.11
783 0.1
784 0.14
785 0.15
786 0.18
787 0.19
788 0.2
789 0.21
790 0.21
791 0.23
792 0.2
793 0.19
794 0.16
795 0.15
796 0.15
797 0.14
798 0.13
799 0.09
800 0.08
801 0.07
802 0.07
803 0.06
804 0.05
805 0.05
806 0.05
807 0.04
808 0.04
809 0.03
810 0.03
811 0.03
812 0.04
813 0.04
814 0.04
815 0.04
816 0.04
817 0.04
818 0.04
819 0.04
820 0.04
821 0.03
822 0.04
823 0.05
824 0.05
825 0.05
826 0.06
827 0.08
828 0.13
829 0.18
830 0.19
831 0.2
832 0.24
833 0.27
834 0.27
835 0.33
836 0.32
837 0.31
838 0.34
839 0.36
840 0.32
841 0.31
842 0.32
843 0.24
844 0.24
845 0.21
846 0.18
847 0.16
848 0.15
849 0.14
850 0.12
851 0.12
852 0.1
853 0.08
854 0.08
855 0.09
856 0.12
857 0.16
858 0.17
859 0.23
860 0.28
861 0.29
862 0.34
863 0.36
864 0.35
865 0.32
866 0.34
867 0.34
868 0.31
869 0.28
870 0.24
871 0.21
872 0.22
873 0.22
874 0.18
875 0.12
876 0.12
877 0.13
878 0.14
879 0.13
880 0.1
881 0.1
882 0.1
883 0.11
884 0.13
885 0.14
886 0.16
887 0.16
888 0.17
889 0.17
890 0.17
891 0.21
892 0.2
893 0.19
894 0.16
895 0.18
896 0.18
897 0.18
898 0.18
899 0.18
900 0.16
901 0.19
902 0.19
903 0.2
904 0.19
905 0.19
906 0.18
907 0.15
908 0.14
909 0.11
910 0.11
911 0.08
912 0.08
913 0.07
914 0.07
915 0.06
916 0.06
917 0.06
918 0.06
919 0.07
920 0.08
921 0.08
922 0.08
923 0.09
924 0.1
925 0.13
926 0.17
927 0.18
928 0.21
929 0.23
930 0.26
931 0.25
932 0.25
933 0.27
934 0.29
935 0.27
936 0.25
937 0.26
938 0.28
939 0.34
940 0.36
941 0.36
942 0.3
943 0.32
944 0.37
945 0.38
946 0.36
947 0.32
948 0.31
949 0.28
950 0.27
951 0.25
952 0.17
953 0.13
954 0.11
955 0.09
956 0.06
957 0.05
958 0.05
959 0.04
960 0.05
961 0.04
962 0.04
963 0.04