Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4PDA4

Protein Details
Accession F4PDA4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
209-235DTDEERARQREKRRRRREYQRQIAEYYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
215-225ARQREKRRRRR
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 10.5, nucl 8, mito 4, plas 1, E.R. 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003874  CDC45  
Gene Ontology GO:0031261  C:DNA replication preinitiation complex  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0003688  F:DNA replication origin binding  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006270  P:DNA replication initiation  
GO:0000727  P:double-strand break repair via break-induced replication  
GO:1902977  P:mitotic DNA replication preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF02724  CDC45  
Amino Acid Sequences MGFTPFSLLDKAYEQIRDTALGHSTTNSTATSFYSAKTSVLIFVAPDVDSLCCLKILVTLLKSDCILYRIVPVSGYNGLGDANDILIAGNTDLTSIIMINAGGMVDLEEFLTLEKDVTVYVLDAHRPLNLKNIFGSAQIQVLDDGDIVEMKDLQKAFEELEFDGDESSDEDESDTTALDEDEETDMHTNESGGFKQDFEDDQDSIGKSDTDEERARQREKRRRRREYQRQIAEYYSGGTYHGMAASGLMFALASQLGRSNSDYLWYGIVGLTDQYIQNKVSLVKYIDLVKSYQEEVNLTTIREGRAANSMTTVPSGRSADDYSIHYHEDFRLMLLRHWNMYDSMFHSEYVATKLGIWRSKGRQRLTNLLVKMGFPQKESRQSYREMGLLFKERIKPKLQDLAPRFNMPDLIFPSFIRNYGHNTPLSATDVAYSLAALIDFGGGVGTRSNAGSIALRILADSNYAQEGGDDQPDWIRNFYTAYDALDSVHWLHHGILLAIHIQRILVRTGMMLLDKKSVQTLQKFQMLSLLSLASDGVSTSGSNTVGAGSDAAVFGSSIMILHRLMGFLMDAFAEHRKSSKRLPFVLVACLDKDASSCLVLGRSETQYIGDAHKNPFGLAFQSAAEQIGVELKHDSFEASAVYVQKDDLSAFLENLQMAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.24
4 0.24
5 0.23
6 0.24
7 0.23
8 0.22
9 0.21
10 0.19
11 0.2
12 0.19
13 0.19
14 0.17
15 0.14
16 0.14
17 0.15
18 0.19
19 0.18
20 0.17
21 0.2
22 0.2
23 0.2
24 0.2
25 0.19
26 0.16
27 0.16
28 0.15
29 0.11
30 0.11
31 0.13
32 0.11
33 0.11
34 0.1
35 0.09
36 0.1
37 0.11
38 0.11
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.11
43 0.15
44 0.19
45 0.19
46 0.23
47 0.24
48 0.25
49 0.26
50 0.24
51 0.21
52 0.17
53 0.17
54 0.13
55 0.18
56 0.19
57 0.18
58 0.18
59 0.17
60 0.19
61 0.2
62 0.2
63 0.14
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.08
69 0.06
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.06
105 0.06
106 0.05
107 0.08
108 0.09
109 0.1
110 0.12
111 0.12
112 0.15
113 0.16
114 0.16
115 0.23
116 0.23
117 0.23
118 0.23
119 0.25
120 0.23
121 0.23
122 0.24
123 0.16
124 0.16
125 0.15
126 0.14
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.08
131 0.08
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.07
137 0.07
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.15
146 0.11
147 0.14
148 0.14
149 0.12
150 0.12
151 0.11
152 0.09
153 0.08
154 0.09
155 0.07
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.1
178 0.09
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.13
183 0.14
184 0.14
185 0.17
186 0.19
187 0.16
188 0.17
189 0.19
190 0.18
191 0.17
192 0.16
193 0.11
194 0.09
195 0.13
196 0.13
197 0.16
198 0.18
199 0.2
200 0.28
201 0.33
202 0.38
203 0.4
204 0.5
205 0.55
206 0.65
207 0.74
208 0.77
209 0.82
210 0.88
211 0.93
212 0.93
213 0.94
214 0.94
215 0.92
216 0.84
217 0.76
218 0.67
219 0.56
220 0.45
221 0.35
222 0.24
223 0.15
224 0.11
225 0.09
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.06
243 0.06
244 0.08
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.12
249 0.13
250 0.11
251 0.11
252 0.1
253 0.09
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.1
266 0.11
267 0.11
268 0.13
269 0.13
270 0.13
271 0.14
272 0.17
273 0.16
274 0.15
275 0.15
276 0.13
277 0.14
278 0.15
279 0.14
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.14
284 0.14
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.12
291 0.1
292 0.14
293 0.15
294 0.13
295 0.13
296 0.13
297 0.12
298 0.13
299 0.12
300 0.08
301 0.09
302 0.1
303 0.09
304 0.1
305 0.11
306 0.11
307 0.12
308 0.13
309 0.14
310 0.14
311 0.15
312 0.13
313 0.13
314 0.12
315 0.12
316 0.11
317 0.08
318 0.11
319 0.11
320 0.12
321 0.16
322 0.17
323 0.16
324 0.16
325 0.17
326 0.13
327 0.14
328 0.13
329 0.11
330 0.14
331 0.14
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.13
336 0.14
337 0.12
338 0.08
339 0.08
340 0.1
341 0.14
342 0.16
343 0.17
344 0.21
345 0.27
346 0.34
347 0.4
348 0.42
349 0.44
350 0.46
351 0.52
352 0.51
353 0.5
354 0.44
355 0.39
356 0.36
357 0.3
358 0.3
359 0.27
360 0.23
361 0.18
362 0.23
363 0.24
364 0.34
365 0.38
366 0.4
367 0.37
368 0.4
369 0.41
370 0.38
371 0.36
372 0.27
373 0.23
374 0.21
375 0.23
376 0.21
377 0.22
378 0.26
379 0.26
380 0.3
381 0.33
382 0.32
383 0.33
384 0.41
385 0.4
386 0.42
387 0.45
388 0.5
389 0.48
390 0.47
391 0.43
392 0.35
393 0.35
394 0.26
395 0.25
396 0.19
397 0.19
398 0.18
399 0.18
400 0.22
401 0.2
402 0.2
403 0.18
404 0.16
405 0.2
406 0.23
407 0.26
408 0.22
409 0.23
410 0.22
411 0.22
412 0.24
413 0.18
414 0.14
415 0.11
416 0.11
417 0.11
418 0.1
419 0.08
420 0.05
421 0.05
422 0.04
423 0.04
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.02
430 0.03
431 0.03
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.05
436 0.05
437 0.06
438 0.06
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.08
445 0.07
446 0.08
447 0.07
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.07
453 0.09
454 0.08
455 0.1
456 0.09
457 0.09
458 0.11
459 0.15
460 0.16
461 0.15
462 0.14
463 0.13
464 0.14
465 0.14
466 0.16
467 0.13
468 0.14
469 0.14
470 0.14
471 0.14
472 0.13
473 0.13
474 0.11
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.1
480 0.1
481 0.09
482 0.09
483 0.09
484 0.11
485 0.11
486 0.11
487 0.09
488 0.08
489 0.09
490 0.11
491 0.11
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.09
496 0.1
497 0.11
498 0.12
499 0.12
500 0.15
501 0.15
502 0.16
503 0.17
504 0.2
505 0.24
506 0.28
507 0.34
508 0.35
509 0.41
510 0.41
511 0.38
512 0.4
513 0.35
514 0.29
515 0.23
516 0.18
517 0.12
518 0.12
519 0.12
520 0.07
521 0.06
522 0.05
523 0.04
524 0.05
525 0.05
526 0.06
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.08
534 0.07
535 0.06
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.06
547 0.06
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.07
552 0.08
553 0.07
554 0.06
555 0.07
556 0.05
557 0.05
558 0.07
559 0.1
560 0.12
561 0.12
562 0.17
563 0.21
564 0.26
565 0.35
566 0.42
567 0.47
568 0.5
569 0.55
570 0.58
571 0.55
572 0.57
573 0.5
574 0.43
575 0.36
576 0.33
577 0.28
578 0.21
579 0.19
580 0.15
581 0.13
582 0.12
583 0.11
584 0.11
585 0.13
586 0.13
587 0.15
588 0.17
589 0.18
590 0.19
591 0.19
592 0.19
593 0.19
594 0.21
595 0.24
596 0.25
597 0.27
598 0.29
599 0.32
600 0.31
601 0.29
602 0.28
603 0.25
604 0.21
605 0.18
606 0.16
607 0.13
608 0.14
609 0.15
610 0.14
611 0.12
612 0.1
613 0.09
614 0.12
615 0.11
616 0.11
617 0.13
618 0.12
619 0.13
620 0.13
621 0.14
622 0.1
623 0.11
624 0.11
625 0.1
626 0.13
627 0.14
628 0.15
629 0.15
630 0.15
631 0.15
632 0.15
633 0.14
634 0.12
635 0.13
636 0.13
637 0.13
638 0.14
639 0.15