Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4P4B5

Protein Details
Accession F4P4B5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-190SQIKQALQKKWKKSPENPLNQAHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-88PKKGDAKKP
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 11, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010422  Ccdc124/Oxs1  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06244  Ccdc124  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MPPKNSKAAAALEKKAVAQAGKNAQKQANIEAIEAQSWKTGAKDSTSKMTEEAKRQEALAKKAERQAILDAEEAAISFKPKKGDAKKPPARTGNLDAFLGTTPDVDSYAASGIDNAMELLNLASKSGSASNNDKVERHAEKRVKSAYAVFEERELPIIKAENPTLRLSQIKQALQKKWKKSPENPLNQAHISFDATREEEKNTVSANREKALSQFQNK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.36
3 0.32
4 0.24
5 0.2
6 0.24
7 0.31
8 0.39
9 0.42
10 0.45
11 0.45
12 0.48
13 0.47
14 0.43
15 0.4
16 0.33
17 0.3
18 0.27
19 0.25
20 0.23
21 0.21
22 0.18
23 0.12
24 0.12
25 0.11
26 0.1
27 0.12
28 0.12
29 0.17
30 0.22
31 0.23
32 0.31
33 0.32
34 0.32
35 0.31
36 0.38
37 0.38
38 0.4
39 0.44
40 0.39
41 0.38
42 0.38
43 0.41
44 0.39
45 0.39
46 0.4
47 0.37
48 0.37
49 0.42
50 0.44
51 0.39
52 0.35
53 0.34
54 0.27
55 0.26
56 0.22
57 0.17
58 0.14
59 0.13
60 0.11
61 0.09
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.09
66 0.11
67 0.14
68 0.23
69 0.3
70 0.41
71 0.5
72 0.6
73 0.66
74 0.71
75 0.76
76 0.73
77 0.68
78 0.62
79 0.57
80 0.51
81 0.44
82 0.37
83 0.29
84 0.24
85 0.22
86 0.17
87 0.11
88 0.06
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.05
113 0.08
114 0.09
115 0.11
116 0.15
117 0.19
118 0.23
119 0.24
120 0.24
121 0.23
122 0.29
123 0.31
124 0.31
125 0.36
126 0.37
127 0.39
128 0.45
129 0.47
130 0.41
131 0.37
132 0.37
133 0.32
134 0.31
135 0.31
136 0.25
137 0.23
138 0.23
139 0.22
140 0.21
141 0.18
142 0.13
143 0.13
144 0.14
145 0.14
146 0.16
147 0.18
148 0.19
149 0.21
150 0.23
151 0.22
152 0.23
153 0.24
154 0.24
155 0.28
156 0.31
157 0.33
158 0.39
159 0.45
160 0.52
161 0.59
162 0.65
163 0.67
164 0.7
165 0.76
166 0.78
167 0.79
168 0.82
169 0.83
170 0.85
171 0.83
172 0.79
173 0.75
174 0.67
175 0.59
176 0.49
177 0.4
178 0.33
179 0.26
180 0.22
181 0.2
182 0.2
183 0.23
184 0.22
185 0.23
186 0.22
187 0.23
188 0.24
189 0.22
190 0.24
191 0.27
192 0.32
193 0.33
194 0.34
195 0.34
196 0.33
197 0.34
198 0.4