Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6A6YJJ3

Protein Details
Accession A0A6A6YJJ3    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
148-169IRDYREPKKKGEKKTNHSKAGTBasic
420-445EVLNPPAKTPAKKRKRATQAQGGEDGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
153-172EPKKKGEKKTNHSKAGTKKS
429-435PAKKRKR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 7.5, cyto_mito 6.5, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
Gene Ontology GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
CDD cd09870  PIN_YEN1  
Amino Acid Sequences VETAQLATKHFQRTRRPLRIAVDEAGWRFNNINEHQVKAIREKSGEPAFQGIEKQLFWRICRLLKQNIELVFVFDGSRRPWKNGKTAGRIDYKSRELTEELLDALRIPHYRAPAETEAECVRLQQLGVVDAVWSEDADALMFGCDFLIRDYREPKKKGEKKTNHSKAGTKKSNTHVRVIRPKHLQAVHLSKEDIVLFAVVCGGDYDREGLRNCGRNTAMKMIKHGLAKTLYACKSENDLGDWRHALIEFLRRAKATSNVIVRNDYPRLRHVKNYREPLVSTNEAIANLECLRHGWDRSFDEEVLREFISTRFNIWTKGYFNWIGPILLARFLSISTARSNPHAVRLTKRRAAKSAEAGEEEVLPSFESKLTFSPFDLSSLSQDRFHDGYWTGKREDEFEPDYRVECEILDRMLRQALPDEVLNPPAKTPAKKRKRATQAQGGEDGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.79
3 0.79
4 0.76
5 0.78
6 0.78
7 0.72
8 0.63
9 0.56
10 0.5
11 0.46
12 0.43
13 0.36
14 0.29
15 0.25
16 0.25
17 0.3
18 0.27
19 0.35
20 0.32
21 0.34
22 0.36
23 0.4
24 0.4
25 0.4
26 0.42
27 0.37
28 0.37
29 0.36
30 0.41
31 0.44
32 0.42
33 0.36
34 0.35
35 0.32
36 0.31
37 0.31
38 0.26
39 0.21
40 0.2
41 0.2
42 0.24
43 0.26
44 0.25
45 0.31
46 0.33
47 0.36
48 0.43
49 0.48
50 0.5
51 0.53
52 0.55
53 0.54
54 0.5
55 0.49
56 0.41
57 0.37
58 0.28
59 0.22
60 0.19
61 0.14
62 0.15
63 0.15
64 0.24
65 0.24
66 0.29
67 0.37
68 0.42
69 0.5
70 0.58
71 0.64
72 0.64
73 0.68
74 0.7
75 0.7
76 0.67
77 0.63
78 0.6
79 0.55
80 0.49
81 0.44
82 0.4
83 0.33
84 0.33
85 0.29
86 0.23
87 0.2
88 0.16
89 0.15
90 0.12
91 0.11
92 0.12
93 0.11
94 0.12
95 0.14
96 0.17
97 0.18
98 0.19
99 0.24
100 0.24
101 0.27
102 0.25
103 0.26
104 0.23
105 0.24
106 0.23
107 0.17
108 0.15
109 0.12
110 0.12
111 0.1
112 0.1
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.05
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.04
133 0.05
134 0.09
135 0.1
136 0.14
137 0.21
138 0.3
139 0.39
140 0.42
141 0.48
142 0.55
143 0.62
144 0.69
145 0.74
146 0.75
147 0.76
148 0.85
149 0.87
150 0.84
151 0.79
152 0.75
153 0.74
154 0.74
155 0.73
156 0.65
157 0.62
158 0.62
159 0.69
160 0.64
161 0.62
162 0.56
163 0.56
164 0.63
165 0.61
166 0.6
167 0.56
168 0.55
169 0.55
170 0.51
171 0.45
172 0.41
173 0.44
174 0.4
175 0.35
176 0.34
177 0.27
178 0.26
179 0.24
180 0.17
181 0.1
182 0.07
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.03
189 0.04
190 0.03
191 0.04
192 0.06
193 0.06
194 0.08
195 0.09
196 0.12
197 0.16
198 0.23
199 0.23
200 0.25
201 0.26
202 0.27
203 0.29
204 0.34
205 0.33
206 0.27
207 0.29
208 0.28
209 0.3
210 0.29
211 0.27
212 0.22
213 0.18
214 0.18
215 0.18
216 0.22
217 0.19
218 0.19
219 0.2
220 0.18
221 0.2
222 0.22
223 0.2
224 0.16
225 0.18
226 0.18
227 0.19
228 0.18
229 0.15
230 0.13
231 0.13
232 0.11
233 0.09
234 0.15
235 0.16
236 0.18
237 0.19
238 0.18
239 0.19
240 0.2
241 0.23
242 0.2
243 0.23
244 0.26
245 0.29
246 0.3
247 0.31
248 0.3
249 0.3
250 0.31
251 0.28
252 0.24
253 0.26
254 0.33
255 0.33
256 0.4
257 0.44
258 0.5
259 0.56
260 0.63
261 0.61
262 0.56
263 0.55
264 0.5
265 0.48
266 0.39
267 0.31
268 0.24
269 0.2
270 0.18
271 0.18
272 0.15
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.07
277 0.07
278 0.11
279 0.12
280 0.13
281 0.14
282 0.19
283 0.21
284 0.25
285 0.27
286 0.24
287 0.23
288 0.23
289 0.22
290 0.2
291 0.17
292 0.14
293 0.12
294 0.13
295 0.15
296 0.14
297 0.15
298 0.17
299 0.18
300 0.2
301 0.21
302 0.24
303 0.23
304 0.24
305 0.27
306 0.24
307 0.23
308 0.24
309 0.23
310 0.19
311 0.16
312 0.17
313 0.12
314 0.13
315 0.12
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.11
320 0.1
321 0.11
322 0.12
323 0.15
324 0.15
325 0.18
326 0.23
327 0.22
328 0.29
329 0.34
330 0.34
331 0.41
332 0.49
333 0.56
334 0.57
335 0.64
336 0.6
337 0.59
338 0.63
339 0.6
340 0.6
341 0.58
342 0.54
343 0.49
344 0.45
345 0.4
346 0.33
347 0.27
348 0.18
349 0.12
350 0.09
351 0.08
352 0.08
353 0.09
354 0.09
355 0.1
356 0.13
357 0.16
358 0.17
359 0.18
360 0.21
361 0.2
362 0.21
363 0.21
364 0.19
365 0.2
366 0.24
367 0.25
368 0.25
369 0.25
370 0.28
371 0.28
372 0.27
373 0.26
374 0.22
375 0.3
376 0.34
377 0.38
378 0.34
379 0.36
380 0.36
381 0.37
382 0.38
383 0.36
384 0.33
385 0.32
386 0.35
387 0.33
388 0.34
389 0.31
390 0.29
391 0.23
392 0.18
393 0.19
394 0.16
395 0.17
396 0.18
397 0.17
398 0.18
399 0.21
400 0.21
401 0.19
402 0.2
403 0.2
404 0.2
405 0.2
406 0.2
407 0.18
408 0.23
409 0.25
410 0.22
411 0.21
412 0.27
413 0.32
414 0.37
415 0.46
416 0.52
417 0.6
418 0.7
419 0.78
420 0.81
421 0.86
422 0.9
423 0.89
424 0.89
425 0.86
426 0.82