Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6A6Y9E0

Protein Details
Accession A0A6A6Y9E0    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
417-437LSPFTPTKRPRGRPRKATSTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
424-432KRPRGRPRK
Subcellular Location(s) nucl 18, plas 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR018306  Phage_T5_Orf172_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF10544  T5orf172  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MAAFNELVDEITYGLGVYTCFYSFIGHGPCRNKTHHQLDAQSILDAISDVPEEPVIRQWLCGQHQNLGVIYMLRERVQLWKIDQEYTDASGAEVLPSVENTDTATSHHPRRPSPSPIKANSDHNLLQSTRAESERVSPPTRYVSRSSRPKPSRSSLGASFKDTTRTQTTLDPGTPPRRARSTSQTSIPPTSPFSQGSSLIPNTQPGTAIFPGSPSPTLPPPPNTRVYQLPQSSSRKRPRWNSTTNPPNSQQKENPFEIPHAQSSVSEPHLPLRENTTLPTERSSHGGDSEQSQNRSSNKGRREVSTIQGPLDIQSSTVNALTRPRTTAPQLPGGFNLSDSEAEPIERPLSAAVNVTITRSDVESIETAAEMSDLPSSTIFNAIQSASDRSDDASDSEESRPTESRDDTPEVASNLTLSPFTPTKRPRGRPRKATSTEAPVTPSEKSPKQPAVPKTFSPRIIDDYIISTLGRPLPAPKPDKGFVYIMRDPLIPGLFKIGMTKGTITDRRRGLEAICRRPLDVVYLDDEGGREQLPIANYQRAEKLVHDELGHCLRPFVCPECGRKHREWFEVDKEVAKRTVRRWTEFMRKQPYDGQGLLGVMWNRRLDAMARPKSGEKLEDYEIRAKRWNSFISAGQKDFIKDYMRRAFFGTLKPRNESLAYRLVRMRWQLSCLVLSFAMFSLMVLGKQAPNIFLFGMDFFLYSSMGVLVLAGTCLLFHNLTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.05
4 0.06
5 0.08
6 0.08
7 0.09
8 0.09
9 0.11
10 0.11
11 0.18
12 0.24
13 0.26
14 0.32
15 0.38
16 0.45
17 0.48
18 0.54
19 0.56
20 0.59
21 0.64
22 0.65
23 0.66
24 0.65
25 0.65
26 0.64
27 0.56
28 0.46
29 0.38
30 0.29
31 0.22
32 0.17
33 0.11
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.08
39 0.09
40 0.1
41 0.15
42 0.19
43 0.18
44 0.19
45 0.23
46 0.3
47 0.34
48 0.41
49 0.38
50 0.38
51 0.41
52 0.42
53 0.38
54 0.31
55 0.27
56 0.2
57 0.19
58 0.17
59 0.15
60 0.14
61 0.15
62 0.15
63 0.21
64 0.23
65 0.27
66 0.26
67 0.33
68 0.34
69 0.37
70 0.36
71 0.33
72 0.32
73 0.3
74 0.28
75 0.19
76 0.17
77 0.16
78 0.15
79 0.12
80 0.1
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.09
85 0.08
86 0.08
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.12
91 0.19
92 0.23
93 0.3
94 0.34
95 0.38
96 0.4
97 0.48
98 0.53
99 0.57
100 0.62
101 0.64
102 0.7
103 0.7
104 0.74
105 0.7
106 0.7
107 0.62
108 0.59
109 0.5
110 0.42
111 0.41
112 0.34
113 0.33
114 0.29
115 0.28
116 0.25
117 0.24
118 0.23
119 0.19
120 0.25
121 0.29
122 0.32
123 0.33
124 0.31
125 0.33
126 0.41
127 0.44
128 0.41
129 0.4
130 0.43
131 0.5
132 0.6
133 0.63
134 0.65
135 0.69
136 0.73
137 0.74
138 0.73
139 0.72
140 0.66
141 0.66
142 0.63
143 0.65
144 0.6
145 0.56
146 0.51
147 0.43
148 0.43
149 0.38
150 0.35
151 0.31
152 0.3
153 0.28
154 0.3
155 0.33
156 0.31
157 0.31
158 0.3
159 0.32
160 0.37
161 0.41
162 0.4
163 0.42
164 0.44
165 0.46
166 0.47
167 0.51
168 0.53
169 0.52
170 0.54
171 0.55
172 0.54
173 0.54
174 0.49
175 0.41
176 0.36
177 0.34
178 0.32
179 0.27
180 0.26
181 0.24
182 0.25
183 0.24
184 0.25
185 0.23
186 0.22
187 0.21
188 0.21
189 0.2
190 0.18
191 0.17
192 0.13
193 0.18
194 0.15
195 0.16
196 0.13
197 0.13
198 0.14
199 0.15
200 0.15
201 0.11
202 0.13
203 0.15
204 0.2
205 0.22
206 0.26
207 0.32
208 0.36
209 0.41
210 0.4
211 0.4
212 0.42
213 0.42
214 0.45
215 0.41
216 0.4
217 0.42
218 0.49
219 0.53
220 0.57
221 0.63
222 0.62
223 0.68
224 0.74
225 0.76
226 0.77
227 0.79
228 0.77
229 0.77
230 0.8
231 0.76
232 0.71
233 0.66
234 0.66
235 0.61
236 0.59
237 0.54
238 0.52
239 0.54
240 0.51
241 0.5
242 0.42
243 0.4
244 0.38
245 0.35
246 0.28
247 0.23
248 0.2
249 0.17
250 0.18
251 0.19
252 0.17
253 0.15
254 0.15
255 0.17
256 0.2
257 0.21
258 0.19
259 0.21
260 0.22
261 0.22
262 0.23
263 0.25
264 0.24
265 0.24
266 0.26
267 0.23
268 0.2
269 0.23
270 0.23
271 0.18
272 0.17
273 0.17
274 0.15
275 0.16
276 0.24
277 0.25
278 0.24
279 0.25
280 0.27
281 0.28
282 0.33
283 0.36
284 0.35
285 0.36
286 0.43
287 0.44
288 0.43
289 0.48
290 0.45
291 0.43
292 0.42
293 0.38
294 0.3
295 0.29
296 0.26
297 0.2
298 0.18
299 0.14
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.08
305 0.08
306 0.07
307 0.11
308 0.13
309 0.13
310 0.15
311 0.16
312 0.18
313 0.21
314 0.26
315 0.26
316 0.31
317 0.32
318 0.3
319 0.29
320 0.29
321 0.25
322 0.19
323 0.17
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.09
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.05
356 0.05
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.08
372 0.1
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.1
378 0.09
379 0.09
380 0.1
381 0.1
382 0.11
383 0.12
384 0.14
385 0.13
386 0.15
387 0.16
388 0.15
389 0.18
390 0.18
391 0.19
392 0.22
393 0.25
394 0.24
395 0.24
396 0.23
397 0.21
398 0.19
399 0.16
400 0.12
401 0.09
402 0.08
403 0.07
404 0.06
405 0.08
406 0.1
407 0.11
408 0.19
409 0.22
410 0.32
411 0.41
412 0.5
413 0.58
414 0.68
415 0.76
416 0.79
417 0.84
418 0.84
419 0.8
420 0.77
421 0.69
422 0.67
423 0.59
424 0.49
425 0.43
426 0.33
427 0.3
428 0.25
429 0.24
430 0.21
431 0.22
432 0.25
433 0.29
434 0.33
435 0.37
436 0.43
437 0.48
438 0.51
439 0.52
440 0.53
441 0.55
442 0.55
443 0.52
444 0.48
445 0.42
446 0.38
447 0.36
448 0.33
449 0.25
450 0.22
451 0.2
452 0.17
453 0.15
454 0.1
455 0.1
456 0.11
457 0.1
458 0.08
459 0.12
460 0.17
461 0.24
462 0.28
463 0.29
464 0.34
465 0.35
466 0.37
467 0.36
468 0.34
469 0.3
470 0.34
471 0.34
472 0.29
473 0.29
474 0.27
475 0.24
476 0.23
477 0.21
478 0.13
479 0.1
480 0.12
481 0.11
482 0.11
483 0.12
484 0.11
485 0.11
486 0.12
487 0.13
488 0.12
489 0.17
490 0.25
491 0.26
492 0.32
493 0.34
494 0.35
495 0.36
496 0.35
497 0.31
498 0.33
499 0.4
500 0.42
501 0.45
502 0.44
503 0.42
504 0.42
505 0.4
506 0.35
507 0.27
508 0.2
509 0.17
510 0.18
511 0.17
512 0.16
513 0.16
514 0.12
515 0.11
516 0.1
517 0.07
518 0.06
519 0.09
520 0.09
521 0.14
522 0.17
523 0.2
524 0.2
525 0.22
526 0.24
527 0.24
528 0.24
529 0.21
530 0.24
531 0.23
532 0.24
533 0.23
534 0.22
535 0.24
536 0.28
537 0.29
538 0.22
539 0.2
540 0.19
541 0.2
542 0.22
543 0.22
544 0.24
545 0.27
546 0.33
547 0.42
548 0.5
549 0.54
550 0.57
551 0.63
552 0.63
553 0.64
554 0.64
555 0.61
556 0.6
557 0.6
558 0.55
559 0.51
560 0.46
561 0.42
562 0.41
563 0.39
564 0.36
565 0.35
566 0.44
567 0.45
568 0.48
569 0.51
570 0.55
571 0.62
572 0.65
573 0.7
574 0.7
575 0.65
576 0.63
577 0.64
578 0.6
579 0.54
580 0.46
581 0.38
582 0.29
583 0.28
584 0.25
585 0.21
586 0.19
587 0.14
588 0.18
589 0.16
590 0.15
591 0.15
592 0.16
593 0.15
594 0.23
595 0.32
596 0.36
597 0.38
598 0.41
599 0.42
600 0.46
601 0.47
602 0.4
603 0.34
604 0.31
605 0.34
606 0.36
607 0.38
608 0.43
609 0.42
610 0.42
611 0.45
612 0.42
613 0.42
614 0.43
615 0.42
616 0.38
617 0.39
618 0.43
619 0.46
620 0.49
621 0.45
622 0.41
623 0.39
624 0.36
625 0.34
626 0.31
627 0.28
628 0.25
629 0.33
630 0.4
631 0.41
632 0.41
633 0.42
634 0.45
635 0.42
636 0.49
637 0.51
638 0.49
639 0.52
640 0.55
641 0.53
642 0.51
643 0.5
644 0.44
645 0.39
646 0.4
647 0.38
648 0.37
649 0.39
650 0.38
651 0.41
652 0.43
653 0.43
654 0.36
655 0.38
656 0.37
657 0.36
658 0.36
659 0.31
660 0.28
661 0.22
662 0.2
663 0.17
664 0.14
665 0.13
666 0.1
667 0.09
668 0.1
669 0.1
670 0.1
671 0.1
672 0.12
673 0.12
674 0.15
675 0.17
676 0.15
677 0.15
678 0.16
679 0.15
680 0.14
681 0.14
682 0.12
683 0.13
684 0.11
685 0.11
686 0.09
687 0.1
688 0.09
689 0.08
690 0.08
691 0.06
692 0.06
693 0.06
694 0.05
695 0.05
696 0.05
697 0.05
698 0.05
699 0.04
700 0.04
701 0.06
702 0.08