Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4NXF9

Protein Details
Accession F4NXF9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-38SDRNKKRSSSSHHKHTSHKHHKNSHEETHSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-27KKHDSDRNKKRSSSSHHKHTSHK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019532  Nucl_RNA-splicing_assoc_SR-25  
Gene Ontology GO:0016607  C:nuclear speck  
GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF10500  SR-25  
Amino Acid Sequences MGKSKKHDSDRNKKRSSSSHHKHTSHKHHKNSHEETHSKSHTKSHRHGGIATGSILSLVSQSLTTPLLPHITPPVCSPKPSPTQPIQTLASTSSQSLNKTRVTKRSAMMPMSQKEYLAEQSTIRKVYDQETGRTRTIRGSGEVIEEIVSRSQQKAINTASTASDGAVFMHGLTLLGQPSPKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.78
3 0.77
4 0.77
5 0.76
6 0.76
7 0.79
8 0.79
9 0.81
10 0.82
11 0.83
12 0.84
13 0.84
14 0.83
15 0.82
16 0.86
17 0.87
18 0.84
19 0.82
20 0.79
21 0.73
22 0.68
23 0.68
24 0.64
25 0.57
26 0.51
27 0.5
28 0.49
29 0.54
30 0.55
31 0.56
32 0.57
33 0.56
34 0.56
35 0.5
36 0.45
37 0.38
38 0.32
39 0.22
40 0.15
41 0.13
42 0.12
43 0.08
44 0.05
45 0.04
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.05
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.14
58 0.14
59 0.15
60 0.17
61 0.25
62 0.23
63 0.25
64 0.27
65 0.28
66 0.34
67 0.36
68 0.39
69 0.35
70 0.41
71 0.41
72 0.43
73 0.38
74 0.31
75 0.29
76 0.25
77 0.21
78 0.15
79 0.14
80 0.13
81 0.12
82 0.14
83 0.16
84 0.18
85 0.21
86 0.27
87 0.3
88 0.34
89 0.37
90 0.39
91 0.38
92 0.43
93 0.43
94 0.38
95 0.4
96 0.39
97 0.37
98 0.37
99 0.36
100 0.28
101 0.25
102 0.24
103 0.22
104 0.18
105 0.17
106 0.13
107 0.18
108 0.21
109 0.21
110 0.2
111 0.19
112 0.18
113 0.2
114 0.26
115 0.24
116 0.27
117 0.31
118 0.36
119 0.37
120 0.37
121 0.35
122 0.3
123 0.32
124 0.29
125 0.25
126 0.23
127 0.22
128 0.23
129 0.22
130 0.19
131 0.15
132 0.13
133 0.12
134 0.1
135 0.11
136 0.1
137 0.11
138 0.15
139 0.18
140 0.19
141 0.24
142 0.26
143 0.29
144 0.28
145 0.29
146 0.25
147 0.24
148 0.23
149 0.17
150 0.15
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.09
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.09