Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6A6YGJ2

Protein Details
Accession A0A6A6YGJ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
413-437LTGLVRKKKSTEAKKEEPNGKGKRKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
418-455RKKKSTEAKKEEPNGKGKRKLEADGGEPAEGKRAKTEK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MASADTPATVPSNDKLTELITSANLQYSLKNYTAAADIFSQATELQAELNGEMAPENAELLYEYGRCLYKVAVAKSDVLGGKVASEEKPDESKKNKKAQAEASSSAAPVNGTEDPAGANKPADDVKNKPFFQLTGDENWTDSEEEDEEGEGEEEGEDDDFANAYEILDVGRVLLSRQLEALTSQAASGTDAKSKRKGKTTSTSEDTPEIRHIKERLADTHDLQAEISLENERFMDAISDSRAAIELRKQLYPQDSSMIAEGHYKLSLSLEFASVSAVRDAQREQEAGGSADSKPQNAEIDMALREEAAVEMEAAIASLQLRLEKEEAELASLPEDKKEDRKLSIADVKEMAEEMNLRLNDLRTSPTKQVTNPLADLSGADPALFKGLLGDLLGADPAAQKARLDEAAKGANDLTGLVRKKKSTEAKKEEPNGKGKRKLEADGGEPAEGKRAKTEKAM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.2
4 0.21
5 0.19
6 0.18
7 0.14
8 0.15
9 0.16
10 0.16
11 0.16
12 0.15
13 0.16
14 0.17
15 0.2
16 0.19
17 0.19
18 0.17
19 0.18
20 0.21
21 0.19
22 0.18
23 0.15
24 0.16
25 0.15
26 0.15
27 0.14
28 0.1
29 0.11
30 0.09
31 0.08
32 0.07
33 0.08
34 0.09
35 0.08
36 0.09
37 0.08
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.06
43 0.07
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.11
52 0.12
53 0.12
54 0.13
55 0.12
56 0.17
57 0.23
58 0.25
59 0.27
60 0.28
61 0.29
62 0.28
63 0.33
64 0.27
65 0.21
66 0.19
67 0.15
68 0.13
69 0.13
70 0.15
71 0.11
72 0.13
73 0.14
74 0.16
75 0.23
76 0.27
77 0.33
78 0.4
79 0.49
80 0.55
81 0.64
82 0.67
83 0.66
84 0.7
85 0.71
86 0.72
87 0.69
88 0.62
89 0.55
90 0.5
91 0.44
92 0.36
93 0.27
94 0.18
95 0.11
96 0.12
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.1
102 0.11
103 0.12
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.1
108 0.13
109 0.15
110 0.18
111 0.22
112 0.3
113 0.39
114 0.39
115 0.39
116 0.37
117 0.35
118 0.34
119 0.33
120 0.27
121 0.24
122 0.26
123 0.25
124 0.24
125 0.24
126 0.22
127 0.17
128 0.14
129 0.11
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.13
177 0.16
178 0.18
179 0.26
180 0.33
181 0.36
182 0.43
183 0.47
184 0.49
185 0.56
186 0.61
187 0.6
188 0.59
189 0.56
190 0.49
191 0.47
192 0.41
193 0.32
194 0.3
195 0.25
196 0.21
197 0.23
198 0.22
199 0.21
200 0.24
201 0.25
202 0.23
203 0.26
204 0.27
205 0.24
206 0.28
207 0.26
208 0.22
209 0.2
210 0.17
211 0.12
212 0.11
213 0.1
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.1
232 0.14
233 0.16
234 0.17
235 0.17
236 0.19
237 0.22
238 0.24
239 0.21
240 0.18
241 0.17
242 0.16
243 0.17
244 0.14
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.09
249 0.09
250 0.08
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.09
266 0.1
267 0.12
268 0.13
269 0.13
270 0.13
271 0.13
272 0.13
273 0.12
274 0.12
275 0.11
276 0.09
277 0.15
278 0.15
279 0.14
280 0.13
281 0.14
282 0.15
283 0.14
284 0.15
285 0.09
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.1
290 0.09
291 0.08
292 0.07
293 0.06
294 0.05
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.04
305 0.04
306 0.06
307 0.06
308 0.08
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.13
313 0.12
314 0.13
315 0.13
316 0.11
317 0.12
318 0.15
319 0.14
320 0.13
321 0.15
322 0.15
323 0.21
324 0.28
325 0.31
326 0.3
327 0.34
328 0.35
329 0.39
330 0.45
331 0.4
332 0.34
333 0.32
334 0.29
335 0.26
336 0.24
337 0.17
338 0.11
339 0.11
340 0.09
341 0.14
342 0.13
343 0.14
344 0.15
345 0.16
346 0.17
347 0.17
348 0.21
349 0.19
350 0.24
351 0.28
352 0.33
353 0.35
354 0.35
355 0.42
356 0.44
357 0.44
358 0.4
359 0.36
360 0.3
361 0.27
362 0.26
363 0.18
364 0.15
365 0.1
366 0.09
367 0.08
368 0.08
369 0.1
370 0.09
371 0.08
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.07
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.11
388 0.15
389 0.2
390 0.2
391 0.21
392 0.24
393 0.29
394 0.29
395 0.28
396 0.25
397 0.2
398 0.18
399 0.17
400 0.15
401 0.16
402 0.21
403 0.27
404 0.31
405 0.33
406 0.36
407 0.45
408 0.53
409 0.57
410 0.65
411 0.68
412 0.73
413 0.81
414 0.87
415 0.86
416 0.82
417 0.81
418 0.8
419 0.8
420 0.79
421 0.73
422 0.73
423 0.69
424 0.66
425 0.64
426 0.59
427 0.53
428 0.52
429 0.51
430 0.43
431 0.39
432 0.34
433 0.34
434 0.32
435 0.28
436 0.29
437 0.31