Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6A6YTN0

Protein Details
Accession A0A6A6YTN0    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-156EADGDAKKKKKRDNRREKPRKSRKGRSGDDEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-180KRKRTEGEADGDAKKKKKRDNRREKPRKSRKGRSGDDEAASGGEDESRRRKRKDGGGGRARAA
195-219RRRRALDRAMDEALKKGGTGRRRKK
455-469RMRAKQLGKTGRGGR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MRATMEDVQITRSHSRSPLPEAGHDPQDPLRPEIEEENSTPTPPFLNPTQDMETAGNGPETPDEDDPDVQADPDLSDNDSDLSDVDEAQFDDFDPANIAIEGPAVLDETNLNLIGVHKRKRTEGEADGDAKKKKKRDNRREKPRKSRKGRSGDDEAASGGEDESRRRKRKDGGGGRARAATPPEENEENLSPEERRRRALDRAMDEALKKGGTGRRRKKDGIDLEQMADAEIEDMRRRMTDAAKWDNEGRDRGQPAMHKLKLLPEVVALLNKNTLKESLVDPDINLLQAVRFFLEPLNDGSLPAYNIQRELFAALSKLPITKDSLVASGIGKVIMFYTKSKRPELVIKRQAERLFNDWTRPILKQSDDYRKKEFQQAAFDDSMKLPVRSANPANSQAVAQAAARKKALETPKVWNRARMESGPTTYTIVPKSNVQVPEGTVKRAPGAAGDEAFRRMRAKQLGKTGRGGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.35
3 0.37
4 0.43
5 0.46
6 0.44
7 0.48
8 0.51
9 0.52
10 0.52
11 0.47
12 0.42
13 0.39
14 0.43
15 0.4
16 0.36
17 0.33
18 0.28
19 0.3
20 0.33
21 0.34
22 0.29
23 0.28
24 0.33
25 0.32
26 0.31
27 0.29
28 0.24
29 0.22
30 0.19
31 0.22
32 0.19
33 0.26
34 0.27
35 0.33
36 0.37
37 0.35
38 0.37
39 0.33
40 0.31
41 0.25
42 0.23
43 0.18
44 0.13
45 0.13
46 0.11
47 0.12
48 0.14
49 0.14
50 0.16
51 0.18
52 0.19
53 0.19
54 0.2
55 0.18
56 0.14
57 0.13
58 0.11
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.07
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.05
90 0.05
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.08
101 0.16
102 0.22
103 0.28
104 0.31
105 0.34
106 0.37
107 0.42
108 0.46
109 0.45
110 0.44
111 0.43
112 0.43
113 0.45
114 0.45
115 0.45
116 0.45
117 0.44
118 0.44
119 0.45
120 0.5
121 0.56
122 0.64
123 0.71
124 0.78
125 0.83
126 0.9
127 0.94
128 0.95
129 0.96
130 0.96
131 0.96
132 0.95
133 0.94
134 0.93
135 0.92
136 0.87
137 0.83
138 0.8
139 0.73
140 0.64
141 0.53
142 0.43
143 0.32
144 0.26
145 0.19
146 0.1
147 0.08
148 0.07
149 0.1
150 0.19
151 0.29
152 0.36
153 0.38
154 0.44
155 0.51
156 0.59
157 0.67
158 0.68
159 0.69
160 0.72
161 0.72
162 0.68
163 0.62
164 0.52
165 0.43
166 0.34
167 0.25
168 0.17
169 0.16
170 0.19
171 0.18
172 0.17
173 0.19
174 0.19
175 0.18
176 0.17
177 0.16
178 0.13
179 0.17
180 0.25
181 0.24
182 0.26
183 0.29
184 0.33
185 0.38
186 0.44
187 0.46
188 0.41
189 0.43
190 0.42
191 0.39
192 0.35
193 0.29
194 0.23
195 0.16
196 0.12
197 0.12
198 0.14
199 0.21
200 0.32
201 0.41
202 0.49
203 0.55
204 0.58
205 0.58
206 0.63
207 0.64
208 0.6
209 0.56
210 0.48
211 0.43
212 0.41
213 0.37
214 0.27
215 0.19
216 0.11
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.08
226 0.1
227 0.13
228 0.19
229 0.25
230 0.26
231 0.27
232 0.28
233 0.29
234 0.29
235 0.28
236 0.23
237 0.21
238 0.21
239 0.21
240 0.22
241 0.21
242 0.26
243 0.33
244 0.31
245 0.28
246 0.27
247 0.31
248 0.32
249 0.3
250 0.24
251 0.15
252 0.16
253 0.16
254 0.17
255 0.13
256 0.09
257 0.12
258 0.12
259 0.13
260 0.12
261 0.12
262 0.11
263 0.12
264 0.13
265 0.13
266 0.15
267 0.15
268 0.14
269 0.15
270 0.14
271 0.13
272 0.11
273 0.08
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.07
281 0.08
282 0.09
283 0.1
284 0.13
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.13
291 0.13
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.11
298 0.09
299 0.08
300 0.09
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.1
305 0.09
306 0.1
307 0.14
308 0.14
309 0.16
310 0.16
311 0.16
312 0.15
313 0.16
314 0.15
315 0.12
316 0.11
317 0.09
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.09
323 0.11
324 0.17
325 0.24
326 0.28
327 0.3
328 0.32
329 0.34
330 0.43
331 0.49
332 0.54
333 0.56
334 0.58
335 0.59
336 0.64
337 0.64
338 0.58
339 0.52
340 0.45
341 0.44
342 0.4
343 0.4
344 0.35
345 0.34
346 0.33
347 0.3
348 0.31
349 0.27
350 0.27
351 0.31
352 0.39
353 0.47
354 0.53
355 0.57
356 0.6
357 0.61
358 0.63
359 0.64
360 0.62
361 0.56
362 0.56
363 0.55
364 0.53
365 0.49
366 0.46
367 0.39
368 0.33
369 0.33
370 0.26
371 0.23
372 0.18
373 0.2
374 0.23
375 0.28
376 0.32
377 0.32
378 0.36
379 0.4
380 0.41
381 0.37
382 0.34
383 0.28
384 0.25
385 0.19
386 0.15
387 0.18
388 0.2
389 0.23
390 0.23
391 0.23
392 0.23
393 0.3
394 0.37
395 0.38
396 0.38
397 0.45
398 0.54
399 0.63
400 0.64
401 0.63
402 0.6
403 0.59
404 0.61
405 0.54
406 0.52
407 0.48
408 0.5
409 0.44
410 0.41
411 0.37
412 0.32
413 0.33
414 0.29
415 0.27
416 0.25
417 0.27
418 0.31
419 0.34
420 0.34
421 0.32
422 0.31
423 0.3
424 0.38
425 0.37
426 0.36
427 0.31
428 0.3
429 0.3
430 0.29
431 0.26
432 0.19
433 0.22
434 0.21
435 0.21
436 0.22
437 0.22
438 0.25
439 0.26
440 0.25
441 0.23
442 0.22
443 0.29
444 0.37
445 0.44
446 0.47
447 0.57
448 0.65
449 0.67