Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4PC45

Protein Details
Accession F4PC45    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MGLKQKSRKRQRALDKVYEVEHydrophilic
50-72ESAAKNKTKSQKSKPGNKRNSELHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 8.5, cyto_mito 6.5, pero 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR008251  Chromo_shadow_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005721  C:pericentric heterochromatin  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0035064  F:methylated histone binding  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PF01393  Chromo_shadow  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
CDD cd00024  CD_CSD  
Amino Acid Sequences MGLKQKSRKRQRALDKVYEVEAIVDFRINEGKEQFFIKWKGYASVENTWESAAKNKTKSQKSKPGNKRNSELDSFTKQDTVDTDEQDDLSKVYHSIDSLSRAVLDKASWENDVVNIETMEASATGEDDLAVYINWKNGKKTVVSSKVANTKCPQKIIKFYENHIKFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.83
3 0.75
4 0.67
5 0.57
6 0.46
7 0.35
8 0.27
9 0.18
10 0.12
11 0.11
12 0.09
13 0.09
14 0.13
15 0.13
16 0.14
17 0.16
18 0.17
19 0.18
20 0.2
21 0.2
22 0.23
23 0.26
24 0.25
25 0.25
26 0.25
27 0.27
28 0.27
29 0.3
30 0.28
31 0.3
32 0.31
33 0.28
34 0.28
35 0.24
36 0.23
37 0.2
38 0.21
39 0.21
40 0.23
41 0.26
42 0.32
43 0.41
44 0.49
45 0.58
46 0.61
47 0.66
48 0.7
49 0.78
50 0.83
51 0.85
52 0.85
53 0.81
54 0.77
55 0.73
56 0.69
57 0.6
58 0.53
59 0.46
60 0.41
61 0.37
62 0.32
63 0.27
64 0.22
65 0.2
66 0.17
67 0.18
68 0.16
69 0.14
70 0.15
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.13
75 0.08
76 0.06
77 0.06
78 0.05
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.07
83 0.09
84 0.11
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.09
92 0.08
93 0.1
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.13
100 0.11
101 0.1
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.05
119 0.06
120 0.1
121 0.15
122 0.17
123 0.19
124 0.22
125 0.25
126 0.26
127 0.32
128 0.39
129 0.42
130 0.44
131 0.45
132 0.49
133 0.56
134 0.55
135 0.53
136 0.49
137 0.5
138 0.52
139 0.56
140 0.55
141 0.53
142 0.62
143 0.65
144 0.69
145 0.63
146 0.63
147 0.67