FuNGI

A0A6A6YCD4

Protein Details

Accession

A0A6A6YCD4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-45	RASHYQKLHTSGRKRKRHEDDDEPPSS	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007224 TIF_Rrn11
Gene Ontology	GO:0001164 F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding GO:0001181 F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity
Pfam	View protein in Pfam PF04090 RNA_pol_I_TF

Amino Acid Sequences

MQYFVPPFDGSRQTTYSLRASHYQKLHTSGRKRKRHEDDDEPPSSPDDDTDAGATSNTQSPSARASVASLSAAETAQLRVAGLLPDDNFQAPKNPFPHAPLPSRLPGSKTTAAHVQRELAALEPPLYAAAAAKATQRVDGIGQQDTLRQTHIGNLTTMLHRCLLEGDYERAGRAWGMLLRSHARGRPIDVRHNGRWAIGAEIHLQRNRISRQSQPDAHVEDSASIQSHTDQLPASIEEDLFSEEGFRQARHYYDLLILQYPARKMHAHAVNQGHFYPAMFSLWIYEASQQSKIAKERLRSAPRSSTSHSKGSDDSDMDDSEYKDDAYVHINKPFNGHVSSEERRIIAVELKRARAIAERLDQLLGAPPFDKRPDLLQLRDMVALWIGDLLCQDAPGPDPMNEDGMESNSISDHSDMHETFTNSASRFEERQLTADSKSDEDDVQDPRRATENSALIWKDIRRLGNYADR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.4
3	0.4
4	0.36
5	0.37
6	0.39
7	0.42
8	0.47
9	0.5
10	0.52
11	0.5
12	0.53
13	0.59
14	0.6
15	0.66
16	0.68
17	0.73
18	0.77
19	0.82
20	0.86
21	0.87
22	0.88
23	0.86
24	0.85
25	0.84
26	0.83
27	0.79
28	0.7
29	0.6
30	0.51
31	0.44
32	0.33
33	0.24
34	0.19
35	0.16
36	0.16
37	0.15
38	0.14
39	0.13
40	0.13
41	0.13
42	0.11
43	0.15
44	0.15
45	0.15
46	0.15
47	0.16
48	0.2
49	0.22
50	0.2
51	0.15
52	0.17
53	0.17
54	0.17
55	0.16
56	0.13
57	0.12
58	0.12
59	0.11
60	0.1
61	0.09
62	0.09
63	0.09
64	0.09
65	0.08
66	0.07
67	0.08
68	0.08
69	0.08
70	0.1
71	0.1
72	0.11
73	0.12
74	0.13
75	0.12
76	0.12
77	0.19
78	0.19
79	0.25
80	0.26
81	0.28
82	0.29
83	0.34
84	0.41
85	0.4
86	0.43
87	0.42
88	0.44
89	0.45
90	0.47
91	0.43
92	0.39
93	0.36
94	0.38
95	0.4
96	0.36
97	0.34
98	0.39
99	0.41
100	0.41
101	0.38
102	0.32
103	0.27
104	0.27
105	0.25
106	0.17
107	0.15
108	0.12
109	0.12
110	0.1
111	0.09
112	0.08
113	0.07
114	0.06
115	0.05
116	0.06
117	0.06
118	0.07
119	0.08
120	0.11
121	0.11
122	0.12
123	0.12
124	0.12
125	0.12
126	0.15
127	0.16
128	0.14
129	0.15
130	0.15
131	0.17
132	0.18
133	0.17
134	0.15
135	0.13
136	0.12
137	0.16
138	0.2
139	0.18
140	0.16
141	0.17
142	0.18
143	0.2
144	0.2
145	0.16
146	0.14
147	0.13
148	0.13
149	0.13
150	0.12
151	0.12
152	0.14
153	0.15
154	0.16
155	0.16
156	0.16
157	0.14
158	0.14
159	0.11
160	0.09
161	0.08
162	0.08
163	0.09
164	0.1
165	0.13
166	0.15
167	0.17
168	0.19
169	0.2
170	0.21
171	0.21
172	0.24
173	0.3
174	0.32
175	0.38
176	0.43
177	0.48
178	0.46
179	0.5
180	0.46
181	0.37
182	0.35
183	0.27
184	0.22
185	0.16
186	0.15
187	0.14
188	0.17
189	0.2
190	0.19
191	0.19
192	0.2
193	0.24
194	0.25
195	0.27
196	0.26
197	0.29
198	0.36
199	0.42
200	0.44
201	0.41
202	0.43
203	0.41
204	0.39
205	0.33
206	0.25
207	0.19
208	0.16
209	0.13
210	0.1
211	0.07
212	0.06
213	0.06
214	0.08
215	0.07
216	0.08
217	0.07
218	0.07
219	0.08
220	0.08
221	0.09
222	0.07
223	0.07
224	0.06
225	0.06
226	0.07
227	0.06
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.08
232	0.08
233	0.08
234	0.09
235	0.1
236	0.11
237	0.13
238	0.14
239	0.12
240	0.13
241	0.15
242	0.14
243	0.13
244	0.13
245	0.11
246	0.13
247	0.13
248	0.12
249	0.12
250	0.12
251	0.13
252	0.21
253	0.26
254	0.26
255	0.32
256	0.36
257	0.36
258	0.37
259	0.36
260	0.28
261	0.22
262	0.2
263	0.14
264	0.1
265	0.08
266	0.06
267	0.06
268	0.07
269	0.08
270	0.08
271	0.08
272	0.1
273	0.12
274	0.13
275	0.15
276	0.15
277	0.15
278	0.19
279	0.21
280	0.25
281	0.27
282	0.28
283	0.35
284	0.44
285	0.51
286	0.51
287	0.53
288	0.54
289	0.54
290	0.56
291	0.53
292	0.52
293	0.49
294	0.51
295	0.47
296	0.41
297	0.38
298	0.37
299	0.36
300	0.27
301	0.25
302	0.21
303	0.2
304	0.18
305	0.19
306	0.16
307	0.14
308	0.13
309	0.11
310	0.09
311	0.09
312	0.09
313	0.13
314	0.18
315	0.19
316	0.25
317	0.27
318	0.27
319	0.29
320	0.3
321	0.28
322	0.23
323	0.22
324	0.2
325	0.26
326	0.29
327	0.3
328	0.3
329	0.27
330	0.25
331	0.25
332	0.22
333	0.21
334	0.22
335	0.26
336	0.29
337	0.3
338	0.31
339	0.3
340	0.3
341	0.28
342	0.28
343	0.26
344	0.27
345	0.28
346	0.28
347	0.28
348	0.27
349	0.22
350	0.25
351	0.19
352	0.15
353	0.13
354	0.13
355	0.16
356	0.18
357	0.19
358	0.14
359	0.18
360	0.27
361	0.32
362	0.33
363	0.34
364	0.36
365	0.36
366	0.36
367	0.32
368	0.23
369	0.18
370	0.15
371	0.11
372	0.09
373	0.07
374	0.07
375	0.06
376	0.08
377	0.07
378	0.07
379	0.08
380	0.07
381	0.09
382	0.11
383	0.13
384	0.12
385	0.16
386	0.17
387	0.19
388	0.18
389	0.18
390	0.15
391	0.15
392	0.16
393	0.13
394	0.12
395	0.1
396	0.11
397	0.11
398	0.1
399	0.09
400	0.1
401	0.16
402	0.16
403	0.19
404	0.23
405	0.23
406	0.24
407	0.26
408	0.28
409	0.23
410	0.26
411	0.25
412	0.25
413	0.26
414	0.28
415	0.33
416	0.31
417	0.34
418	0.36
419	0.36
420	0.33
421	0.35
422	0.34
423	0.27
424	0.28
425	0.26
426	0.22
427	0.22
428	0.24
429	0.27
430	0.3
431	0.34
432	0.32
433	0.32
434	0.38
435	0.36
436	0.36
437	0.38
438	0.37
439	0.34
440	0.41
441	0.39
442	0.34
443	0.38
444	0.36
445	0.34
446	0.35
447	0.37
448	0.34
449	0.37

A0A6A6YCD4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer