Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6A6Z550

Protein Details
Accession A0A6A6Z550    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-27VTATRPSQALRQRRESQRPALARHydrophilic
168-187VPYPKKTKPAHPRQDGQTKAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 8.5, cyto_mito 6.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MSSVVTATRPSQALRQRRESQRPALARTNTSKANAMDQTTLVKDEPKPYVIDQAYILRKFNGCRPSMAIHLYKQNFRINDSQDPFSYTSPMKGLLEHLKKRTIPHDILEELYQYNVQFYDGCLIIEVHNHVSTAEVARPSSSTGSSGAQEKAFSIHNYNNFITPSPFVPYPKKTKPAHPRQDGQTKAHSGPGTETATGEAETDKENMPAPGQPASATQKQPTKGTVTTVVLFPTPLSHDADIRMLANTAVPDMQTYRRNQSLASRGGATPTMAHPPTPLTSVPPTPLLPSGRSPKRQKMVLDETNVHEFESDLIIATAPKLYLGLTGSLEESVALIDKMTPAHYKCPPPAPKVRKRTTAELAADEAEAADMQRFMLAGDERKASTSGAATNADEGQAGLRGGNSFEPRFSRFKTLESIKMLQEDKQRRDKEEEARKAQLKAQQRAEAEAQKRQAEVNARQDQQNQQNQQNQAIMQQRREQMLQQQQEQQQAQQARLLQQQQQQEAHRAASQAQQMPNVPSAQFNQMAHQQPQHSSPVVRQQTPLASSPAMNAHNMASHAMASAPMAPTSSSHGAGSPPRPASAISHHPLPMARNMSQQHSGQGVSRNGTPQMVQGTPIMNAAMPARNMTPQPRMQGSPNSGMQGTPTMMHTPSGQPYTPEQMQLLQRRQQMARMNAQQQAQMTGMQGSPNPNMDIQQMALMRAQQQIQQQGGVPAGQDPQQYRQNLARSMLIQLQERNKAMAASSPQNGAQMRPTTSQPGGVLIPGLPPNFASLDSATLRQEYVRRKRGIQEQFGNQVPQNYLNQMRQLEGIIRNAEMREGQASVGGVGGGHLGGQPNAQAMHAMGINVGAGANSTQQQMQQAMMMRRQQMQQQQHLIRMQNAQHTQQLGQQQQQGGGQMNMGGMGNNMNAMINGGSMGGGMGGGMGGMGMGQMNMGQMGGMQGMQGMQGMQGMQGMQGMGMGAANGSGMSMQQMQQMRMHQALARQQQQQRPQPGQDGGMEWNG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.59
3 0.65
4 0.74
5 0.82
6 0.82
7 0.82
8 0.82
9 0.8
10 0.77
11 0.76
12 0.71
13 0.68
14 0.66
15 0.63
16 0.57
17 0.54
18 0.52
19 0.44
20 0.46
21 0.43
22 0.39
23 0.35
24 0.32
25 0.33
26 0.29
27 0.3
28 0.23
29 0.24
30 0.25
31 0.29
32 0.32
33 0.3
34 0.32
35 0.31
36 0.4
37 0.36
38 0.34
39 0.31
40 0.35
41 0.4
42 0.39
43 0.39
44 0.33
45 0.35
46 0.36
47 0.41
48 0.41
49 0.35
50 0.36
51 0.4
52 0.41
53 0.42
54 0.46
55 0.42
56 0.38
57 0.46
58 0.48
59 0.47
60 0.49
61 0.51
62 0.46
63 0.47
64 0.5
65 0.46
66 0.51
67 0.51
68 0.5
69 0.44
70 0.47
71 0.45
72 0.38
73 0.37
74 0.28
75 0.26
76 0.23
77 0.25
78 0.21
79 0.2
80 0.24
81 0.3
82 0.39
83 0.43
84 0.47
85 0.51
86 0.53
87 0.56
88 0.57
89 0.56
90 0.5
91 0.47
92 0.48
93 0.43
94 0.43
95 0.39
96 0.34
97 0.26
98 0.23
99 0.2
100 0.14
101 0.13
102 0.11
103 0.11
104 0.09
105 0.09
106 0.13
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.14
113 0.16
114 0.15
115 0.15
116 0.15
117 0.14
118 0.14
119 0.16
120 0.15
121 0.16
122 0.15
123 0.15
124 0.16
125 0.16
126 0.17
127 0.18
128 0.16
129 0.14
130 0.15
131 0.16
132 0.17
133 0.21
134 0.21
135 0.19
136 0.19
137 0.18
138 0.18
139 0.19
140 0.19
141 0.2
142 0.23
143 0.27
144 0.32
145 0.33
146 0.33
147 0.31
148 0.3
149 0.28
150 0.24
151 0.21
152 0.2
153 0.22
154 0.24
155 0.3
156 0.36
157 0.43
158 0.5
159 0.57
160 0.56
161 0.65
162 0.72
163 0.76
164 0.79
165 0.78
166 0.78
167 0.78
168 0.84
169 0.79
170 0.72
171 0.68
172 0.62
173 0.55
174 0.53
175 0.44
176 0.35
177 0.32
178 0.34
179 0.28
180 0.24
181 0.23
182 0.19
183 0.19
184 0.18
185 0.16
186 0.1
187 0.09
188 0.1
189 0.12
190 0.11
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.13
195 0.14
196 0.15
197 0.15
198 0.15
199 0.15
200 0.18
201 0.24
202 0.29
203 0.3
204 0.33
205 0.36
206 0.39
207 0.41
208 0.39
209 0.38
210 0.33
211 0.34
212 0.34
213 0.3
214 0.29
215 0.28
216 0.26
217 0.2
218 0.19
219 0.15
220 0.12
221 0.11
222 0.12
223 0.14
224 0.14
225 0.15
226 0.16
227 0.18
228 0.17
229 0.15
230 0.14
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.09
240 0.14
241 0.19
242 0.22
243 0.27
244 0.3
245 0.31
246 0.31
247 0.36
248 0.39
249 0.37
250 0.36
251 0.33
252 0.29
253 0.31
254 0.3
255 0.23
256 0.16
257 0.14
258 0.18
259 0.16
260 0.16
261 0.15
262 0.17
263 0.18
264 0.19
265 0.18
266 0.15
267 0.19
268 0.2
269 0.21
270 0.21
271 0.21
272 0.2
273 0.24
274 0.22
275 0.21
276 0.25
277 0.33
278 0.38
279 0.46
280 0.52
281 0.57
282 0.61
283 0.64
284 0.61
285 0.6
286 0.62
287 0.59
288 0.57
289 0.51
290 0.47
291 0.46
292 0.43
293 0.34
294 0.24
295 0.18
296 0.14
297 0.13
298 0.1
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.04
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.07
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.05
325 0.05
326 0.07
327 0.11
328 0.12
329 0.17
330 0.23
331 0.27
332 0.29
333 0.39
334 0.43
335 0.46
336 0.55
337 0.6
338 0.65
339 0.71
340 0.74
341 0.74
342 0.73
343 0.74
344 0.69
345 0.66
346 0.58
347 0.49
348 0.44
349 0.35
350 0.3
351 0.22
352 0.16
353 0.08
354 0.06
355 0.05
356 0.04
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.04
361 0.03
362 0.06
363 0.07
364 0.09
365 0.11
366 0.13
367 0.13
368 0.14
369 0.14
370 0.12
371 0.12
372 0.11
373 0.1
374 0.11
375 0.12
376 0.11
377 0.12
378 0.12
379 0.11
380 0.1
381 0.08
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.08
390 0.11
391 0.1
392 0.12
393 0.14
394 0.18
395 0.21
396 0.23
397 0.27
398 0.25
399 0.27
400 0.33
401 0.34
402 0.35
403 0.37
404 0.37
405 0.31
406 0.34
407 0.33
408 0.3
409 0.35
410 0.38
411 0.39
412 0.46
413 0.47
414 0.46
415 0.52
416 0.54
417 0.55
418 0.58
419 0.6
420 0.56
421 0.6
422 0.59
423 0.54
424 0.51
425 0.48
426 0.46
427 0.44
428 0.44
429 0.43
430 0.4
431 0.42
432 0.41
433 0.42
434 0.35
435 0.33
436 0.31
437 0.27
438 0.27
439 0.25
440 0.24
441 0.24
442 0.27
443 0.33
444 0.36
445 0.37
446 0.38
447 0.4
448 0.43
449 0.45
450 0.47
451 0.41
452 0.4
453 0.44
454 0.44
455 0.43
456 0.38
457 0.3
458 0.28
459 0.32
460 0.29
461 0.25
462 0.3
463 0.3
464 0.31
465 0.31
466 0.27
467 0.27
468 0.33
469 0.34
470 0.31
471 0.36
472 0.37
473 0.41
474 0.4
475 0.33
476 0.3
477 0.28
478 0.25
479 0.21
480 0.19
481 0.17
482 0.2
483 0.22
484 0.22
485 0.25
486 0.28
487 0.29
488 0.31
489 0.3
490 0.3
491 0.28
492 0.25
493 0.21
494 0.18
495 0.16
496 0.17
497 0.19
498 0.2
499 0.19
500 0.2
501 0.2
502 0.21
503 0.21
504 0.17
505 0.14
506 0.11
507 0.12
508 0.14
509 0.16
510 0.14
511 0.15
512 0.2
513 0.23
514 0.23
515 0.24
516 0.23
517 0.21
518 0.23
519 0.24
520 0.19
521 0.16
522 0.17
523 0.24
524 0.26
525 0.26
526 0.24
527 0.24
528 0.25
529 0.26
530 0.26
531 0.18
532 0.15
533 0.14
534 0.15
535 0.17
536 0.15
537 0.13
538 0.12
539 0.11
540 0.11
541 0.11
542 0.11
543 0.07
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.05
548 0.05
549 0.06
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.06
555 0.1
556 0.12
557 0.11
558 0.11
559 0.12
560 0.13
561 0.17
562 0.18
563 0.19
564 0.17
565 0.17
566 0.18
567 0.18
568 0.18
569 0.2
570 0.25
571 0.22
572 0.24
573 0.24
574 0.25
575 0.25
576 0.24
577 0.24
578 0.21
579 0.2
580 0.23
581 0.24
582 0.27
583 0.29
584 0.28
585 0.25
586 0.22
587 0.22
588 0.18
589 0.23
590 0.21
591 0.19
592 0.19
593 0.19
594 0.18
595 0.18
596 0.16
597 0.12
598 0.14
599 0.12
600 0.13
601 0.12
602 0.13
603 0.12
604 0.12
605 0.11
606 0.07
607 0.08
608 0.08
609 0.09
610 0.08
611 0.09
612 0.09
613 0.11
614 0.12
615 0.15
616 0.2
617 0.21
618 0.24
619 0.26
620 0.27
621 0.29
622 0.34
623 0.34
624 0.33
625 0.31
626 0.29
627 0.26
628 0.24
629 0.22
630 0.17
631 0.14
632 0.1
633 0.1
634 0.1
635 0.1
636 0.11
637 0.12
638 0.12
639 0.15
640 0.17
641 0.16
642 0.16
643 0.18
644 0.24
645 0.23
646 0.22
647 0.19
648 0.21
649 0.28
650 0.33
651 0.36
652 0.36
653 0.38
654 0.42
655 0.42
656 0.43
657 0.44
658 0.41
659 0.44
660 0.45
661 0.45
662 0.45
663 0.46
664 0.41
665 0.34
666 0.31
667 0.24
668 0.18
669 0.15
670 0.12
671 0.11
672 0.1
673 0.11
674 0.12
675 0.13
676 0.14
677 0.14
678 0.13
679 0.14
680 0.14
681 0.13
682 0.11
683 0.13
684 0.12
685 0.12
686 0.12
687 0.12
688 0.13
689 0.15
690 0.15
691 0.15
692 0.18
693 0.22
694 0.22
695 0.22
696 0.21
697 0.2
698 0.19
699 0.16
700 0.12
701 0.09
702 0.1
703 0.11
704 0.13
705 0.14
706 0.19
707 0.25
708 0.26
709 0.28
710 0.32
711 0.35
712 0.35
713 0.35
714 0.32
715 0.26
716 0.28
717 0.29
718 0.26
719 0.23
720 0.25
721 0.28
722 0.31
723 0.3
724 0.29
725 0.25
726 0.23
727 0.21
728 0.21
729 0.2
730 0.19
731 0.2
732 0.21
733 0.21
734 0.24
735 0.24
736 0.21
737 0.22
738 0.21
739 0.23
740 0.24
741 0.26
742 0.27
743 0.27
744 0.28
745 0.23
746 0.22
747 0.19
748 0.16
749 0.15
750 0.1
751 0.12
752 0.13
753 0.13
754 0.1
755 0.1
756 0.12
757 0.12
758 0.12
759 0.11
760 0.09
761 0.13
762 0.14
763 0.16
764 0.15
765 0.15
766 0.15
767 0.15
768 0.21
769 0.27
770 0.36
771 0.44
772 0.46
773 0.49
774 0.57
775 0.65
776 0.68
777 0.67
778 0.64
779 0.61
780 0.63
781 0.62
782 0.57
783 0.48
784 0.42
785 0.34
786 0.29
787 0.25
788 0.24
789 0.26
790 0.26
791 0.3
792 0.27
793 0.27
794 0.25
795 0.24
796 0.25
797 0.23
798 0.24
799 0.2
800 0.2
801 0.21
802 0.2
803 0.2
804 0.15
805 0.14
806 0.12
807 0.11
808 0.1
809 0.1
810 0.1
811 0.09
812 0.09
813 0.07
814 0.06
815 0.05
816 0.05
817 0.04
818 0.04
819 0.04
820 0.05
821 0.05
822 0.06
823 0.06
824 0.07
825 0.08
826 0.08
827 0.07
828 0.07
829 0.09
830 0.09
831 0.09
832 0.07
833 0.07
834 0.07
835 0.06
836 0.06
837 0.04
838 0.04
839 0.04
840 0.06
841 0.07
842 0.08
843 0.09
844 0.1
845 0.13
846 0.14
847 0.14
848 0.16
849 0.21
850 0.24
851 0.29
852 0.32
853 0.33
854 0.36
855 0.38
856 0.41
857 0.44
858 0.49
859 0.52
860 0.57
861 0.57
862 0.59
863 0.61
864 0.57
865 0.52
866 0.49
867 0.45
868 0.44
869 0.44
870 0.41
871 0.4
872 0.39
873 0.37
874 0.35
875 0.39
876 0.35
877 0.36
878 0.38
879 0.35
880 0.35
881 0.35
882 0.33
883 0.28
884 0.24
885 0.19
886 0.15
887 0.14
888 0.12
889 0.11
890 0.08
891 0.06
892 0.07
893 0.07
894 0.06
895 0.07
896 0.06
897 0.06
898 0.07
899 0.06
900 0.05
901 0.05
902 0.05
903 0.05
904 0.05
905 0.05
906 0.03
907 0.03
908 0.03
909 0.03
910 0.02
911 0.02
912 0.02
913 0.02
914 0.02
915 0.02
916 0.02
917 0.02
918 0.02
919 0.02
920 0.03
921 0.03
922 0.04
923 0.04
924 0.03
925 0.04
926 0.04
927 0.05
928 0.05
929 0.04
930 0.05
931 0.05
932 0.05
933 0.05
934 0.05
935 0.05
936 0.06
937 0.06
938 0.06
939 0.07
940 0.07
941 0.07
942 0.07
943 0.07
944 0.06
945 0.06
946 0.06
947 0.05
948 0.05
949 0.04
950 0.03
951 0.03
952 0.04
953 0.03
954 0.03
955 0.03
956 0.03
957 0.06
958 0.08
959 0.09
960 0.15
961 0.19
962 0.21
963 0.25
964 0.29
965 0.32
966 0.31
967 0.32
968 0.28
969 0.31
970 0.38
971 0.44
972 0.46
973 0.5
974 0.56
975 0.62
976 0.7
977 0.74
978 0.74
979 0.72
980 0.7
981 0.69
982 0.64
983 0.6
984 0.52
985 0.45