FuNGI

F4PA81

Protein Details

Accession

F4PA81

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
9-30	EIRAAQERRKNQQLKSRRSATN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 12, nucl 5, cyto 4, E.R. 2, vacu 2, cyto_mito 2, cyto_pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0071013 C:catalytic step 2 spliceosome GO:0005689 C:U12-type spliceosomal complex GO:0005686 C:U2 snRNP GO:0071004 C:U2-type prespliceosome GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MLTLDLDAEIRAAQERRKNQQLKSRRSATNDALYDSDIYGTNPDADAYLDSLPMGDLADDDVDSMANAGQKKLSSYTAPKEAYADVLGAESDTVDPLMAGVQSRRIIDREDKYRAQRLNRQLSPERVDAFAATSKTAPTSIADTSNGSGTGSSRSYVEVMRDNELDREREQTLRKIHEKQKEESEMRTQWEDDEKSKDAMSGTTAASVSSQRWDETPVAASNDSTVAVPRKRNRWDETPVNASTGESTTSNFDATPTADKRSRWDQTPVNSTQFGATPVGNSGMMTPTASQVFVPMTPEAMNSMRWEKEIEQRNRYLTDEDIDAILPTEGYVVLDVPVSYVPIRTPARKLMATPTPMAGSGGFMMQEEDNSLRNELPPEIPGMVGLQFFKAEDMQHFAKLLDKKDDSELSSEEVKERRIMRLLLKIKNGTPPIRKASLRQITDKAREFGAGPLFNQILPLLMSPSLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNMSKAAGLATMIATMRPDIDHVDEYVRNTTARAFSVVASALGIHALLPFLKAVCHSKKSWQARHTGTKIVQQIAILLGCAILPHLRNLVEAIGRGLEDEQQKVKTIAALAIAALAEAATPYGIESFDSVIQPLWDGVKKHRGKGRAAFLKAIGYIIPLMDERYANEYTKGIVPTLIAEFSSPDEEMKKIVLKVVKQCVGTDGVDPAYIKTEILPEFFRNFWVRRMALDRRNYKQLVETTVEIAQKVGVTEIIGHIVEGLKDESEAYRKMVMETIDSVVQTLGTADIDDRLEEVLIDGILYAFQEQTMEDVVMLNGFGTVVNSLGLRVKPYLPQICSTVLWRLNNKSAKVRQQAADLISRIAIVMRTCGEEKLMGQLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILKALKSIVNVIGMSSMTPPIKDLLPRLTPILKNRHEKVQENCIDLVGRIADRGAEFVSAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRATVNTFGYIAKAIGPQDVLATLLNNLKVQERQNRVCTTVAIAIVAETCAPFTVLPALMNEYRLPELNVQNGVLKSMSFLFEYIGEMGKDYIYAVTPLLEDALMDRDLVHRQTACATVKHISLGVAGLGCEDALIHLLNLVWPNIFETSPHVINAVMDAIDGLRVALGPGILLHYTLQGMFHPARRVREIYWKIYNSLYIGSQDALIPMYPRIDDDKRNKYERREMDYVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.38
3	0.46
4	0.57
5	0.64
6	0.67
7	0.74
8	0.79
9	0.8
10	0.82
11	0.82
12	0.78
13	0.78
14	0.78
15	0.75
16	0.73
17	0.65
18	0.57
19	0.5
20	0.44
21	0.38
22	0.31
23	0.25
24	0.16
25	0.14
26	0.13
27	0.13
28	0.13
29	0.11
30	0.11
31	0.1
32	0.11
33	0.11
34	0.12
35	0.11
36	0.1
37	0.1
38	0.1
39	0.09
40	0.08
41	0.08
42	0.05
43	0.05
44	0.06
45	0.07
46	0.06
47	0.07
48	0.07
49	0.06
50	0.06
51	0.07
52	0.07
53	0.1
54	0.11
55	0.11
56	0.14
57	0.14
58	0.17
59	0.2
60	0.22
61	0.25
62	0.31
63	0.38
64	0.44
65	0.45
66	0.43
67	0.43
68	0.4
69	0.36
70	0.29
71	0.22
72	0.13
73	0.12
74	0.12
75	0.09
76	0.08
77	0.06
78	0.06
79	0.06
80	0.06
81	0.05
82	0.05
83	0.05
84	0.06
85	0.06
86	0.07
87	0.08
88	0.13
89	0.16
90	0.18
91	0.2
92	0.21
93	0.25
94	0.33
95	0.4
96	0.43
97	0.49
98	0.54
99	0.59
100	0.66
101	0.67
102	0.67
103	0.68
104	0.7
105	0.73
106	0.7
107	0.72
108	0.71
109	0.72
110	0.69
111	0.64
112	0.56
113	0.46
114	0.42
115	0.34
116	0.3
117	0.26
118	0.21
119	0.18
120	0.17
121	0.16
122	0.17
123	0.17
124	0.15
125	0.12
126	0.15
127	0.16
128	0.17
129	0.18
130	0.19
131	0.19
132	0.2
133	0.18
134	0.15
135	0.13
136	0.11
137	0.14
138	0.13
139	0.13
140	0.12
141	0.13
142	0.15
143	0.16
144	0.19
145	0.22
146	0.23
147	0.27
148	0.28
149	0.27
150	0.31
151	0.33
152	0.32
153	0.26
154	0.28
155	0.26
156	0.31
157	0.34
158	0.36
159	0.4
160	0.46
161	0.52
162	0.58
163	0.64
164	0.68
165	0.69
166	0.67
167	0.7
168	0.71
169	0.66
170	0.61
171	0.6
172	0.55
173	0.53
174	0.5
175	0.41
176	0.34
177	0.39
178	0.38
179	0.33
180	0.35
181	0.33
182	0.32
183	0.32
184	0.31
185	0.24
186	0.21
187	0.2
188	0.16
189	0.14
190	0.15
191	0.15
192	0.13
193	0.14
194	0.14
195	0.13
196	0.14
197	0.15
198	0.14
199	0.15
200	0.18
201	0.18
202	0.19
203	0.21
204	0.19
205	0.21
206	0.21
207	0.2
208	0.17
209	0.16
210	0.15
211	0.12
212	0.13
213	0.16
214	0.21
215	0.29
216	0.35
217	0.43
218	0.51
219	0.59
220	0.62
221	0.63
222	0.68
223	0.68
224	0.68
225	0.66
226	0.58
227	0.52
228	0.45
229	0.37
230	0.3
231	0.22
232	0.17
233	0.11
234	0.12
235	0.13
236	0.13
237	0.14
238	0.12
239	0.12
240	0.11
241	0.13
242	0.19
243	0.18
244	0.24
245	0.27
246	0.28
247	0.33
248	0.41
249	0.44
250	0.41
251	0.47
252	0.47
253	0.51
254	0.58
255	0.57
256	0.51
257	0.47
258	0.43
259	0.37
260	0.31
261	0.25
262	0.19
263	0.15
264	0.12
265	0.12
266	0.13
267	0.12
268	0.11
269	0.1
270	0.09
271	0.09
272	0.09
273	0.09
274	0.09
275	0.1
276	0.1
277	0.09
278	0.09
279	0.1
280	0.1
281	0.12
282	0.1
283	0.1
284	0.1
285	0.11
286	0.12
287	0.12
288	0.13
289	0.13
290	0.17
291	0.17
292	0.17
293	0.2
294	0.2
295	0.27
296	0.37
297	0.41
298	0.43
299	0.47
300	0.49
301	0.48
302	0.47
303	0.41
304	0.32
305	0.26
306	0.21
307	0.18
308	0.15
309	0.13
310	0.12
311	0.1
312	0.09
313	0.06
314	0.05
315	0.05
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.06
329	0.14
330	0.17
331	0.19
332	0.22
333	0.27
334	0.32
335	0.32
336	0.34
337	0.33
338	0.37
339	0.37
340	0.34
341	0.3
342	0.26
343	0.25
344	0.24
345	0.17
346	0.11
347	0.09
348	0.08
349	0.06
350	0.06
351	0.07
352	0.06
353	0.06
354	0.07
355	0.08
356	0.1
357	0.11
358	0.12
359	0.11
360	0.12
361	0.13
362	0.14
363	0.13
364	0.12
365	0.13
366	0.12
367	0.12
368	0.11
369	0.1
370	0.09
371	0.09
372	0.09
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.13
381	0.14
382	0.14
383	0.15
384	0.14
385	0.2
386	0.23
387	0.24
388	0.26
389	0.25
390	0.26
391	0.29
392	0.31
393	0.27
394	0.25
395	0.23
396	0.2
397	0.21
398	0.2
399	0.19
400	0.19
401	0.19
402	0.21
403	0.22
404	0.21
405	0.23
406	0.25
407	0.25
408	0.33
409	0.4
410	0.4
411	0.43
412	0.42
413	0.41
414	0.45
415	0.45
416	0.42
417	0.4
418	0.41
419	0.42
420	0.45
421	0.44
422	0.41
423	0.47
424	0.49
425	0.47
426	0.46
427	0.47
428	0.48
429	0.54
430	0.53
431	0.44
432	0.36
433	0.33
434	0.3
435	0.26
436	0.25
437	0.19
438	0.16
439	0.17
440	0.17
441	0.16
442	0.16
443	0.12
444	0.08
445	0.07
446	0.07
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.07
452	0.08
453	0.08
454	0.08
455	0.09
456	0.14
457	0.15
458	0.15
459	0.14
460	0.15
461	0.15
462	0.2
463	0.2
464	0.16
465	0.18
466	0.18
467	0.18
468	0.18
469	0.18
470	0.13
471	0.13
472	0.14
473	0.14
474	0.15
475	0.17
476	0.16
477	0.16
478	0.18
479	0.18
480	0.16
481	0.14
482	0.13
483	0.13
484	0.14
485	0.13
486	0.12
487	0.09
488	0.09
489	0.09
490	0.09
491	0.06
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.05
496	0.05
497	0.06
498	0.05
499	0.05
500	0.06
501	0.08
502	0.09
503	0.11
504	0.11
505	0.13
506	0.14
507	0.14
508	0.14
509	0.12
510	0.1
511	0.07
512	0.07
513	0.05
514	0.04
515	0.04
516	0.04
517	0.04
518	0.04
519	0.05
520	0.04
521	0.04
522	0.05
523	0.04
524	0.05
525	0.05
526	0.07
527	0.08
528	0.08
529	0.11
530	0.12
531	0.13
532	0.14
533	0.13
534	0.11
535	0.11
536	0.12
537	0.11
538	0.11
539	0.11
540	0.1
541	0.1
542	0.11
543	0.11
544	0.09
545	0.07
546	0.07
547	0.05
548	0.04
549	0.04
550	0.03
551	0.03
552	0.03
553	0.03
554	0.03
555	0.03
556	0.03
557	0.04
558	0.05
559	0.11
560	0.14
561	0.18
562	0.18
563	0.25
564	0.34
565	0.43
566	0.49
567	0.47
568	0.51
569	0.54
570	0.61
571	0.58
572	0.54
573	0.46
574	0.44
575	0.43
576	0.37
577	0.31
578	0.22
579	0.21
580	0.16
581	0.14
582	0.08
583	0.05
584	0.04
585	0.04
586	0.03
587	0.03
588	0.04
589	0.04
590	0.05
591	0.06
592	0.06
593	0.07
594	0.07
595	0.08
596	0.07
597	0.07
598	0.07
599	0.06
600	0.06
601	0.06
602	0.06
603	0.08
604	0.09
605	0.1
606	0.12
607	0.12
608	0.13
609	0.13
610	0.13
611	0.1
612	0.09
613	0.09
614	0.08
615	0.07
616	0.06
617	0.06
618	0.05
619	0.04
620	0.04
621	0.03
622	0.02
623	0.02
624	0.02
625	0.02
626	0.02
627	0.02
628	0.03
629	0.03
630	0.03
631	0.04
632	0.05
633	0.06
634	0.06
635	0.06
636	0.06
637	0.06
638	0.06
639	0.06
640	0.06
641	0.08
642	0.09
643	0.12
644	0.22
645	0.24
646	0.29
647	0.32
648	0.35
649	0.38
650	0.44
651	0.51
652	0.49
653	0.48
654	0.45
655	0.41
656	0.38
657	0.33
658	0.26
659	0.16
660	0.08
661	0.07
662	0.05
663	0.05
664	0.04
665	0.05
666	0.06
667	0.06
668	0.06
669	0.1
670	0.12
671	0.12
672	0.12
673	0.12
674	0.12
675	0.15
676	0.15
677	0.11
678	0.1
679	0.09
680	0.1
681	0.1
682	0.09
683	0.06
684	0.06
685	0.06
686	0.07
687	0.08
688	0.07
689	0.07
690	0.08
691	0.08
692	0.08
693	0.09
694	0.1
695	0.09
696	0.13
697	0.15
698	0.17
699	0.23
700	0.29
701	0.32
702	0.3
703	0.3
704	0.28
705	0.28
706	0.25
707	0.2
708	0.15
709	0.11
710	0.11
711	0.11
712	0.1
713	0.09
714	0.09
715	0.08
716	0.07
717	0.1
718	0.1
719	0.12
720	0.14
721	0.13
722	0.15
723	0.16
724	0.18
725	0.19
726	0.19
727	0.21
728	0.24
729	0.22
730	0.23
731	0.29
732	0.34
733	0.37
734	0.45
735	0.48
736	0.47
737	0.54
738	0.52
739	0.46
740	0.44
741	0.39
742	0.35
743	0.31
744	0.27
745	0.23
746	0.25
747	0.25
748	0.2
749	0.17
750	0.13
751	0.11
752	0.1
753	0.08
754	0.05
755	0.04
756	0.05
757	0.05
758	0.06
759	0.05
760	0.05
761	0.05
762	0.06
763	0.05
764	0.06
765	0.06
766	0.05
767	0.05
768	0.06
769	0.07
770	0.09
771	0.1
772	0.1
773	0.13
774	0.13
775	0.14
776	0.16
777	0.15
778	0.14
779	0.15
780	0.15
781	0.13
782	0.12
783	0.12
784	0.09
785	0.09
786	0.07
787	0.06
788	0.05
789	0.04
790	0.04
791	0.04
792	0.05
793	0.06
794	0.06
795	0.06
796	0.06
797	0.06
798	0.05
799	0.05
800	0.04
801	0.04
802	0.04
803	0.03
804	0.03
805	0.03
806	0.03
807	0.03
808	0.03
809	0.03
810	0.04
811	0.04
812	0.05
813	0.05
814	0.05
815	0.05
816	0.06
817	0.06
818	0.05
819	0.05
820	0.04
821	0.03
822	0.03
823	0.03
824	0.03
825	0.03
826	0.04
827	0.04
828	0.04
829	0.05
830	0.08
831	0.08
832	0.09
833	0.11
834	0.12
835	0.15
836	0.22
837	0.27
838	0.26
839	0.28
840	0.28
841	0.29
842	0.29
843	0.28
844	0.27
845	0.26
846	0.28
847	0.3
848	0.32
849	0.37
850	0.42
851	0.42
852	0.45
853	0.47
854	0.53
855	0.56
856	0.57
857	0.5
858	0.49
859	0.5
860	0.44
861	0.41
862	0.33
863	0.27
864	0.21
865	0.19
866	0.15
867	0.12
868	0.11
869	0.07
870	0.08
871	0.08
872	0.11
873	0.12
874	0.12
875	0.12
876	0.11
877	0.12
878	0.15
879	0.16
880	0.13
881	0.12
882	0.14
883	0.13
884	0.12
885	0.12
886	0.06
887	0.05
888	0.05
889	0.05
890	0.04
891	0.05
892	0.04
893	0.05
894	0.05
895	0.05
896	0.05
897	0.05
898	0.05
899	0.05
900	0.05
901	0.07
902	0.08
903	0.08
904	0.08
905	0.09
906	0.1
907	0.11
908	0.13
909	0.11
910	0.12
911	0.12
912	0.12
913	0.12
914	0.11
915	0.1
916	0.09
917	0.11
918	0.09
919	0.1
920	0.1
921	0.11
922	0.13
923	0.14
924	0.17
925	0.2
926	0.23
927	0.24
928	0.27
929	0.31
930	0.33
931	0.38
932	0.45
933	0.46
934	0.51
935	0.53
936	0.59
937	0.6
938	0.62
939	0.61
940	0.61
941	0.59
942	0.54
943	0.51
944	0.43
945	0.37
946	0.31
947	0.26
948	0.17
949	0.12
950	0.09
951	0.08
952	0.09
953	0.08
954	0.09
955	0.08
956	0.08
957	0.08
958	0.09
959	0.1
960	0.12
961	0.12
962	0.14
963	0.14
964	0.13
965	0.17
966	0.18
967	0.18
968	0.16
969	0.15
970	0.18
971	0.18
972	0.19
973	0.16
974	0.18
975	0.22
976	0.22
977	0.24
978	0.22
979	0.27
980	0.34
981	0.43
982	0.49
983	0.48
984	0.54
985	0.6
986	0.66
987	0.62
988	0.54
989	0.46
990	0.37
991	0.33
992	0.28
993	0.2
994	0.12
995	0.13
996	0.12
997	0.12
998	0.12
999	0.11
1000	0.11
1001	0.1
1002	0.1
1003	0.08
1004	0.08
1005	0.09
1006	0.11
1007	0.12
1008	0.12
1009	0.13
1010	0.15
1011	0.19
1012	0.25
1013	0.32
1014	0.38
1015	0.44
1016	0.51
1017	0.53
1018	0.53
1019	0.5
1020	0.44
1021	0.38
1022	0.33
1023	0.27
1024	0.19
1025	0.16
1026	0.14
1027	0.13
1028	0.12
1029	0.09
1030	0.05
1031	0.05
1032	0.05
1033	0.06
1034	0.05
1035	0.06
1036	0.09
1037	0.1
1038	0.1
1039	0.11
1040	0.16
1041	0.16
1042	0.18
1043	0.18
1044	0.17
1045	0.18
1046	0.18
1047	0.19
1048	0.2
1049	0.23
1050	0.25
1051	0.26
1052	0.24
1053	0.27
1054	0.27
1055	0.26
1056	0.2
1057	0.17
1058	0.14
1059	0.14
1060	0.15
1061	0.11
1062	0.11
1063	0.11
1064	0.11
1065	0.13
1066	0.12
1067	0.12
1068	0.11
1069	0.11
1070	0.11
1071	0.1
1072	0.1
1073	0.09
1074	0.08
1075	0.07
1076	0.08
1077	0.08
1078	0.08
1079	0.08
1080	0.08
1081	0.08
1082	0.07
1083	0.06
1084	0.07
1085	0.1
1086	0.09
1087	0.09
1088	0.09
1089	0.11
1090	0.15
1091	0.17
1092	0.19
1093	0.17
1094	0.17
1095	0.2
1096	0.26
1097	0.27
1098	0.25
1099	0.27
1100	0.26
1101	0.27
1102	0.27
1103	0.25
1104	0.19
1105	0.16
1106	0.15
1107	0.13
1108	0.1
1109	0.09
1110	0.08
1111	0.07
1112	0.07
1113	0.06
1114	0.05
1115	0.04
1116	0.05
1117	0.05
1118	0.05
1119	0.06
1120	0.06
1121	0.08
1122	0.1
1123	0.1
1124	0.09
1125	0.09
1126	0.11
1127	0.13
1128	0.13
1129	0.11
1130	0.16
1131	0.21
1132	0.22
1133	0.22
1134	0.21
1135	0.19
1136	0.19
1137	0.2
1138	0.15
1139	0.09
1140	0.07
1141	0.07
1142	0.07
1143	0.07
1144	0.07
1145	0.05
1146	0.04
1147	0.04
1148	0.05
1149	0.05
1150	0.05
1151	0.04
1152	0.05
1153	0.07
1154	0.07
1155	0.08
1156	0.08
1157	0.08
1158	0.09
1159	0.1
1160	0.1
1161	0.09
1162	0.14
1163	0.17
1164	0.22
1165	0.29
1166	0.33
1167	0.39
1168	0.44
1169	0.47
1170	0.45
1171	0.53
1172	0.55
1173	0.55
1174	0.6
1175	0.56
1176	0.53
1177	0.51
1178	0.49
1179	0.4
1180	0.35
1181	0.29
1182	0.21
1183	0.2
1184	0.18
1185	0.17
1186	0.15
1187	0.14
1188	0.13
1189	0.12
1190	0.11
1191	0.11
1192	0.12
1193	0.12
1194	0.14
1195	0.2
1196	0.25
1197	0.34
1198	0.43
1199	0.52
1200	0.58
1201	0.67
1202	0.72
1203	0.73
1204	0.78
1205	0.78
1206	0.77

F4PA81

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer