Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6A6Y305

Protein Details
Accession A0A6A6Y305    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-63DSSPTKKKSPVPVAKSLKRKAHydrophilic
90-114DSDTPAKKIKKVKKVKKAKSASSSSHydrophilic
218-243SPALSKSKSKTKKSKANPSPPRKGSTHydrophilic
252-271PSSSPKPTTQNKRKRTASPSHydrophilic
324-351LVVTKGKGFTKEKNKKKKGAYKGGFIDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
95-108AKKIKKVKKVKKAK
223-240KSKSKTKKSKANPSPPRK
330-343KGFTKEKNKKKKGA
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MDIDSSSANSDSDSSDDESSDSDNEAVAVKATPPSSSDSESADSSPTKKKSPVPVAKSLKRKASISSSSSSSSSSSLESSSDSSGSSDSDSDTPAKKIKKVKKVKKAKSASSSSSSSSSSSSSSSSSDSSSSSDSDSDEATKKALPESDSDSSSSDSDSDSSSSDSDEPANKPLPESGSDSDSDSSSSDSDNDEPASKAFPESGSDSDSSDSDSSSDSPALSKSKSKTKKSKANPSPPRKGSTDSNSSATLPSSSPKPTTQNKRKRTASPSADPTSGADSSAKRPKGSERKFFSRIPENVYVDPKFASNKYVSYDYADKAHQDLVVTKGKGFTKEKNKKKKGAYKGGFIDSTPRGIKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.16
4 0.16
5 0.16
6 0.17
7 0.16
8 0.14
9 0.11
10 0.1
11 0.1
12 0.11
13 0.1
14 0.09
15 0.09
16 0.09
17 0.12
18 0.12
19 0.12
20 0.13
21 0.18
22 0.21
23 0.24
24 0.24
25 0.24
26 0.26
27 0.27
28 0.26
29 0.24
30 0.23
31 0.23
32 0.3
33 0.31
34 0.32
35 0.36
36 0.43
37 0.5
38 0.6
39 0.66
40 0.65
41 0.72
42 0.77
43 0.8
44 0.83
45 0.79
46 0.76
47 0.7
48 0.64
49 0.59
50 0.58
51 0.56
52 0.51
53 0.48
54 0.43
55 0.4
56 0.4
57 0.35
58 0.27
59 0.22
60 0.18
61 0.16
62 0.14
63 0.12
64 0.12
65 0.12
66 0.13
67 0.13
68 0.12
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.1
74 0.09
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.14
79 0.15
80 0.17
81 0.22
82 0.25
83 0.29
84 0.38
85 0.46
86 0.54
87 0.63
88 0.71
89 0.76
90 0.84
91 0.88
92 0.89
93 0.88
94 0.86
95 0.83
96 0.79
97 0.73
98 0.67
99 0.59
100 0.5
101 0.44
102 0.36
103 0.29
104 0.23
105 0.19
106 0.15
107 0.14
108 0.13
109 0.12
110 0.12
111 0.13
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.12
116 0.13
117 0.13
118 0.12
119 0.12
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.14
132 0.13
133 0.13
134 0.19
135 0.21
136 0.21
137 0.21
138 0.21
139 0.2
140 0.19
141 0.17
142 0.11
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.11
155 0.12
156 0.14
157 0.17
158 0.16
159 0.16
160 0.16
161 0.16
162 0.15
163 0.18
164 0.16
165 0.15
166 0.16
167 0.17
168 0.16
169 0.15
170 0.13
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.08
189 0.11
190 0.11
191 0.12
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.13
197 0.1
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.07
205 0.08
206 0.1
207 0.12
208 0.12
209 0.16
210 0.19
211 0.29
212 0.38
213 0.47
214 0.56
215 0.64
216 0.72
217 0.77
218 0.85
219 0.86
220 0.88
221 0.89
222 0.89
223 0.89
224 0.83
225 0.77
226 0.68
227 0.62
228 0.58
229 0.54
230 0.52
231 0.44
232 0.43
233 0.4
234 0.38
235 0.34
236 0.27
237 0.22
238 0.14
239 0.13
240 0.14
241 0.15
242 0.17
243 0.2
244 0.27
245 0.35
246 0.46
247 0.55
248 0.63
249 0.69
250 0.76
251 0.8
252 0.8
253 0.79
254 0.78
255 0.75
256 0.73
257 0.72
258 0.66
259 0.6
260 0.52
261 0.46
262 0.39
263 0.31
264 0.24
265 0.18
266 0.16
267 0.23
268 0.31
269 0.32
270 0.28
271 0.3
272 0.4
273 0.49
274 0.56
275 0.59
276 0.59
277 0.66
278 0.7
279 0.71
280 0.68
281 0.67
282 0.61
283 0.58
284 0.58
285 0.53
286 0.51
287 0.54
288 0.47
289 0.39
290 0.36
291 0.3
292 0.26
293 0.23
294 0.24
295 0.2
296 0.22
297 0.25
298 0.28
299 0.27
300 0.29
301 0.32
302 0.29
303 0.31
304 0.29
305 0.26
306 0.25
307 0.26
308 0.21
309 0.18
310 0.19
311 0.21
312 0.28
313 0.27
314 0.26
315 0.3
316 0.32
317 0.38
318 0.4
319 0.44
320 0.48
321 0.58
322 0.68
323 0.74
324 0.81
325 0.83
326 0.89
327 0.89
328 0.89
329 0.9
330 0.85
331 0.84
332 0.81
333 0.78
334 0.68
335 0.58
336 0.54
337 0.44
338 0.44
339 0.37
340 0.31