FuNGI

F4P028

Protein Details

Accession

F4P028

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
554-587	ETAEEKRQRKAQVKAERRDRRTAKKMTKSAFKGE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
558-582	EKRQRKAQVKAERRDRRTAKKMTKS

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 11.5, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0005634 C:nucleus GO:0030688 C:preribosome, small subunit precursor GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MGKKRFIDPSKSVKFQLVHRSQRDPKIADETASKLVLRPIAASSNLARKGKGLDLSTALGELGNDSQFDTENKYDQESDYSDSDTENELDSKDASKKLKAYVAPVTPNDPALYGIFFKDQESYDYMQHLKPIGSDPTAMFVAAKSVQKPEKEEIKFVEANTNNSTSSVDFPQAKLILPEGVLPSQTEEDVGLLTRLAQPYTPGLNLELGDDVRETLYALDDDEYVEDELEDDFFGALDAEEIPEQYKSMVEQAENGYENKDNENQHEDQEWMKEYARFQKSAGKPPSHDDIHSDGSDSTDATPKAPVRTGDSVRIKKGAFTDTSSYSMSSSSMFRNDKLTLLDDRFDKVLAEYSDDEIGELDPDDPEVQGVLDAMSTFSGLSKPSSCISLGADSDSSRRLDVMFDDFLESTQVVSNGRALIPARQPLDALYSSTQQNVKSLVDKYAFEEVTSAATQAELDKKIYMPEEKNYDTWDVESVLSTYSNIYNRPKLIREISKNAPRIQLKGPHGMPSVVPSISSTLQNELSDDYSDNESQFTDCTERHNTAIGRNKSETAEEKRQRKAQVKAERRDRRTAKKMTKSAFKGEELRQSRLTSNHERQDRSFGLV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.57
3	0.6
4	0.59
5	0.61
6	0.62
7	0.7
8	0.72
9	0.77
10	0.78
11	0.69
12	0.63
13	0.62
14	0.58
15	0.5
16	0.46
17	0.41
18	0.37
19	0.36
20	0.31
21	0.24
22	0.26
23	0.26
24	0.23
25	0.2
26	0.19
27	0.21
28	0.22
29	0.23
30	0.24
31	0.3
32	0.36
33	0.36
34	0.33
35	0.31
36	0.34
37	0.36
38	0.38
39	0.32
40	0.28
41	0.3
42	0.31
43	0.29
44	0.25
45	0.2
46	0.15
47	0.12
48	0.11
49	0.09
50	0.08
51	0.08
52	0.08
53	0.09
54	0.1
55	0.12
56	0.16
57	0.17
58	0.2
59	0.21
60	0.24
61	0.25
62	0.24
63	0.28
64	0.24
65	0.25
66	0.23
67	0.23
68	0.21
69	0.2
70	0.2
71	0.18
72	0.16
73	0.14
74	0.14
75	0.12
76	0.13
77	0.14
78	0.16
79	0.18
80	0.23
81	0.24
82	0.28
83	0.31
84	0.34
85	0.4
86	0.38
87	0.39
88	0.42
89	0.44
90	0.45
91	0.43
92	0.42
93	0.37
94	0.36
95	0.31
96	0.23
97	0.19
98	0.14
99	0.15
100	0.12
101	0.12
102	0.13
103	0.13
104	0.13
105	0.15
106	0.14
107	0.15
108	0.19
109	0.2
110	0.19
111	0.22
112	0.24
113	0.22
114	0.24
115	0.23
116	0.19
117	0.18
118	0.2
119	0.2
120	0.18
121	0.19
122	0.17
123	0.19
124	0.19
125	0.17
126	0.14
127	0.1
128	0.12
129	0.14
130	0.16
131	0.14
132	0.2
133	0.24
134	0.26
135	0.31
136	0.35
137	0.41
138	0.41
139	0.43
140	0.41
141	0.43
142	0.43
143	0.39
144	0.42
145	0.33
146	0.35
147	0.34
148	0.33
149	0.26
150	0.24
151	0.25
152	0.17
153	0.18
154	0.16
155	0.17
156	0.17
157	0.17
158	0.21
159	0.21
160	0.2
161	0.17
162	0.17
163	0.13
164	0.12
165	0.14
166	0.11
167	0.11
168	0.11
169	0.1
170	0.11
171	0.11
172	0.1
173	0.09
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.05
179	0.05
180	0.06
181	0.08
182	0.09
183	0.09
184	0.08
185	0.09
186	0.12
187	0.14
188	0.13
189	0.11
190	0.12
191	0.13
192	0.13
193	0.12
194	0.1
195	0.08
196	0.08
197	0.08
198	0.07
199	0.06
200	0.06
201	0.05
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.07
211	0.06
212	0.06
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.08
236	0.09
237	0.08
238	0.11
239	0.12
240	0.14
241	0.15
242	0.15
243	0.13
244	0.14
245	0.14
246	0.14
247	0.18
248	0.17
249	0.18
250	0.23
251	0.22
252	0.22
253	0.22
254	0.21
255	0.18
256	0.18
257	0.17
258	0.14
259	0.14
260	0.14
261	0.15
262	0.24
263	0.25
264	0.24
265	0.23
266	0.31
267	0.34
268	0.43
269	0.47
270	0.4
271	0.39
272	0.42
273	0.47
274	0.39
275	0.35
276	0.28
277	0.26
278	0.27
279	0.25
280	0.23
281	0.16
282	0.16
283	0.16
284	0.12
285	0.09
286	0.1
287	0.1
288	0.09
289	0.12
290	0.13
291	0.14
292	0.15
293	0.15
294	0.17
295	0.22
296	0.23
297	0.29
298	0.36
299	0.37
300	0.37
301	0.39
302	0.34
303	0.31
304	0.31
305	0.26
306	0.19
307	0.19
308	0.21
309	0.19
310	0.22
311	0.2
312	0.19
313	0.16
314	0.15
315	0.12
316	0.1
317	0.1
318	0.09
319	0.15
320	0.15
321	0.16
322	0.19
323	0.19
324	0.19
325	0.19
326	0.2
327	0.17
328	0.18
329	0.19
330	0.17
331	0.17
332	0.16
333	0.15
334	0.13
335	0.1
336	0.13
337	0.11
338	0.13
339	0.12
340	0.13
341	0.14
342	0.13
343	0.13
344	0.09
345	0.09
346	0.06
347	0.06
348	0.05
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.07
369	0.08
370	0.1
371	0.1
372	0.12
373	0.12
374	0.12
375	0.13
376	0.14
377	0.13
378	0.13
379	0.13
380	0.12
381	0.13
382	0.14
383	0.13
384	0.1
385	0.1
386	0.09
387	0.09
388	0.11
389	0.13
390	0.12
391	0.12
392	0.13
393	0.13
394	0.13
395	0.13
396	0.11
397	0.08
398	0.08
399	0.08
400	0.07
401	0.08
402	0.09
403	0.09
404	0.09
405	0.11
406	0.1
407	0.14
408	0.17
409	0.22
410	0.22
411	0.21
412	0.21
413	0.2
414	0.23
415	0.19
416	0.18
417	0.15
418	0.16
419	0.17
420	0.2
421	0.22
422	0.18
423	0.19
424	0.19
425	0.18
426	0.2
427	0.21
428	0.22
429	0.22
430	0.22
431	0.24
432	0.28
433	0.26
434	0.22
435	0.21
436	0.17
437	0.18
438	0.17
439	0.15
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.1
444	0.14
445	0.12
446	0.13
447	0.14
448	0.14
449	0.17
450	0.19
451	0.23
452	0.22
453	0.26
454	0.32
455	0.34
456	0.34
457	0.35
458	0.34
459	0.29
460	0.26
461	0.22
462	0.17
463	0.15
464	0.15
465	0.12
466	0.11
467	0.1
468	0.1
469	0.1
470	0.12
471	0.14
472	0.17
473	0.22
474	0.26
475	0.3
476	0.34
477	0.36
478	0.38
479	0.45
480	0.5
481	0.53
482	0.55
483	0.61
484	0.65
485	0.67
486	0.64
487	0.64
488	0.57
489	0.54
490	0.53
491	0.53
492	0.49
493	0.52
494	0.5
495	0.48
496	0.47
497	0.43
498	0.37
499	0.31
500	0.3
501	0.21
502	0.2
503	0.15
504	0.17
505	0.17
506	0.2
507	0.17
508	0.17
509	0.2
510	0.2
511	0.2
512	0.18
513	0.18
514	0.17
515	0.17
516	0.16
517	0.18
518	0.18
519	0.18
520	0.16
521	0.16
522	0.15
523	0.14
524	0.15
525	0.14
526	0.14
527	0.19
528	0.24
529	0.26
530	0.27
531	0.33
532	0.31
533	0.36
534	0.46
535	0.46
536	0.47
537	0.47
538	0.49
539	0.44
540	0.47
541	0.47
542	0.45
543	0.51
544	0.53
545	0.58
546	0.64
547	0.69
548	0.73
549	0.74
550	0.74
551	0.74
552	0.76
553	0.79
554	0.81
555	0.86
556	0.87
557	0.84
558	0.86
559	0.85
560	0.84
561	0.84
562	0.85
563	0.84
564	0.85
565	0.88
566	0.85
567	0.86
568	0.81
569	0.8
570	0.75
571	0.69
572	0.66
573	0.63
574	0.65
575	0.6
576	0.6
577	0.55
578	0.52
579	0.51
580	0.49
581	0.52
582	0.52
583	0.56
584	0.6
585	0.63
586	0.65
587	0.63
588	0.67

F4P028

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer