Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6A6YXP1

Protein Details
Accession A0A6A6YXP1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-54DTILDEQRPRKRSRKTKEEVKQNLEKGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-42PRKRSRKT
544-597AAPTRGGGNQRGGGRGPNQRGGAQRGGAGRGGPQQRGQGPPAARGRGNIARTGR
Subcellular Location(s) cyto 15, nucl 6, pero 3, cysk 3, mito_nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MEDLPGAMTKLHLTAQSLGTEDPTWIDTILDEQRPRKRSRKTKEEVKQNLEKGFLSPSTSFNTPWLNELQQRWEVSTNYSDLFEIAPTQTRTIIRFTREGLEGRVTGYKEITVPANSATAKNSTSLLRKPANRADFVRGAAGFFPFAPGGLDGVEAIAALEDEAILRQEGGVSKKSGGLDRVINFGVEGGLLEVPPGFTRGLDFTKKPSSDQKAAKEVEETLEEEPAPVSETDEPNEDETEALLASDAEKPGIVDGTDADGDEEIDSLLPVEFPALAPHGTLVGSGKKGGREWAHMVDINREITNFKELVPDMAREWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKRMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRLIFDDVGILTGDIQIRPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKKKDIYVISTPKRPVPLEHFLWANKAMHKIVTADKKFLDAGWKEANDALSGKDKIKALAAKEEAAPTRGGGNQRGGGRGPNQRGGAQRGGAGRGGPQQRGQGPPAARGRGNIARTGRGGGRTTAAQDRNIWVHLIQHLRTKELLPACIFVFSKKRCEENADALSNLDYCTAAEKSAIHMTIEKSLARLKPEDRVLPQIRRLRELLARGIAVHHGGMLPIVKEVVEILFAKTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKHDGRQFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDPVGSVIIVSPGAEEAPPVARLRQMILGDPTKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHENKVKLSEADLAKIKREPCDICDIDLEQVHRACMNYQRLTTELYLSALGNPLGRKCFGAKRLIVYKKDGVRTAGMLLREGINNSKEAEPTVQVLEISTNSKRLPSDLLPYLPSFAKHFNSLPAEESDMILKVVFVPLSEIECVTRTIVDVPETAKNLNKRKDALELARNQFMPLCKSWAYQDWDETNTWDRIKNLHFREAADARKREGEVAQSGACLTCPNFPKHFAMQHDEWIIQENIAQLRQLMSDQNLQLLPDYEQRISVLKDVGFIDSNSRVELKGKVACEIHSADELVLTELILENVLAQYEPEEIVALLSAFVFQEKTDVVPTLTTSLEKGRDKIVEIAEKVNQIQTFHQVILSADDSNDFVSRPRFGMVEVVYEWARGMSFNRITDLTDVMEGTIVRVITRLDETCREVKNAARIIGDPVLFSKMQEAQQAIKRDICNCASLYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.22
4 0.22
5 0.21
6 0.21
7 0.2
8 0.17
9 0.15
10 0.14
11 0.13
12 0.12
13 0.11
14 0.09
15 0.14
16 0.2
17 0.25
18 0.29
19 0.35
20 0.44
21 0.51
22 0.59
23 0.63
24 0.68
25 0.73
26 0.79
27 0.83
28 0.84
29 0.88
30 0.9
31 0.92
32 0.91
33 0.89
34 0.87
35 0.82
36 0.75
37 0.66
38 0.57
39 0.47
40 0.42
41 0.34
42 0.3
43 0.26
44 0.25
45 0.28
46 0.29
47 0.28
48 0.27
49 0.32
50 0.27
51 0.29
52 0.31
53 0.31
54 0.35
55 0.37
56 0.4
57 0.39
58 0.4
59 0.4
60 0.39
61 0.35
62 0.33
63 0.33
64 0.29
65 0.25
66 0.25
67 0.22
68 0.18
69 0.18
70 0.14
71 0.13
72 0.12
73 0.17
74 0.18
75 0.19
76 0.23
77 0.25
78 0.26
79 0.31
80 0.35
81 0.33
82 0.35
83 0.37
84 0.37
85 0.39
86 0.39
87 0.35
88 0.34
89 0.3
90 0.29
91 0.31
92 0.27
93 0.24
94 0.23
95 0.21
96 0.17
97 0.19
98 0.2
99 0.16
100 0.17
101 0.16
102 0.2
103 0.2
104 0.2
105 0.2
106 0.2
107 0.19
108 0.19
109 0.2
110 0.21
111 0.26
112 0.29
113 0.35
114 0.4
115 0.44
116 0.51
117 0.59
118 0.6
119 0.59
120 0.59
121 0.58
122 0.54
123 0.5
124 0.46
125 0.37
126 0.32
127 0.27
128 0.24
129 0.18
130 0.14
131 0.14
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.09
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.04
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.07
156 0.11
157 0.14
158 0.18
159 0.19
160 0.19
161 0.23
162 0.25
163 0.27
164 0.25
165 0.25
166 0.28
167 0.28
168 0.31
169 0.28
170 0.26
171 0.22
172 0.2
173 0.16
174 0.1
175 0.08
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.06
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.09
187 0.13
188 0.18
189 0.23
190 0.24
191 0.29
192 0.37
193 0.38
194 0.4
195 0.46
196 0.49
197 0.52
198 0.59
199 0.6
200 0.6
201 0.61
202 0.58
203 0.5
204 0.43
205 0.36
206 0.3
207 0.25
208 0.17
209 0.17
210 0.16
211 0.14
212 0.13
213 0.11
214 0.11
215 0.09
216 0.1
217 0.13
218 0.15
219 0.16
220 0.19
221 0.2
222 0.2
223 0.21
224 0.19
225 0.14
226 0.13
227 0.12
228 0.09
229 0.07
230 0.06
231 0.05
232 0.06
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.08
241 0.06
242 0.06
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.1
271 0.11
272 0.13
273 0.15
274 0.16
275 0.17
276 0.23
277 0.23
278 0.26
279 0.3
280 0.31
281 0.33
282 0.34
283 0.34
284 0.32
285 0.32
286 0.29
287 0.24
288 0.21
289 0.18
290 0.17
291 0.2
292 0.16
293 0.14
294 0.16
295 0.16
296 0.2
297 0.21
298 0.21
299 0.19
300 0.26
301 0.26
302 0.22
303 0.23
304 0.2
305 0.19
306 0.18
307 0.18
308 0.15
309 0.17
310 0.19
311 0.17
312 0.17
313 0.17
314 0.18
315 0.19
316 0.18
317 0.17
318 0.15
319 0.15
320 0.14
321 0.14
322 0.14
323 0.1
324 0.07
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.05
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.09
350 0.09
351 0.1
352 0.13
353 0.16
354 0.23
355 0.25
356 0.27
357 0.29
358 0.32
359 0.31
360 0.34
361 0.4
362 0.4
363 0.47
364 0.47
365 0.52
366 0.52
367 0.53
368 0.59
369 0.49
370 0.42
371 0.39
372 0.39
373 0.32
374 0.29
375 0.28
376 0.17
377 0.17
378 0.15
379 0.08
380 0.05
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.09
394 0.08
395 0.08
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.07
402 0.08
403 0.11
404 0.1
405 0.09
406 0.1
407 0.11
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.09
418 0.07
419 0.06
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.09
424 0.09
425 0.07
426 0.09
427 0.09
428 0.07
429 0.07
430 0.08
431 0.09
432 0.08
433 0.08
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.05
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.04
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.09
461 0.1
462 0.1
463 0.16
464 0.22
465 0.26
466 0.29
467 0.34
468 0.37
469 0.39
470 0.45
471 0.41
472 0.41
473 0.45
474 0.52
475 0.51
476 0.51
477 0.49
478 0.45
479 0.46
480 0.4
481 0.34
482 0.32
483 0.35
484 0.32
485 0.33
486 0.33
487 0.29
488 0.31
489 0.29
490 0.24
491 0.19
492 0.19
493 0.17
494 0.15
495 0.16
496 0.16
497 0.2
498 0.28
499 0.27
500 0.26
501 0.26
502 0.27
503 0.26
504 0.25
505 0.25
506 0.16
507 0.2
508 0.22
509 0.22
510 0.21
511 0.22
512 0.22
513 0.15
514 0.15
515 0.12
516 0.13
517 0.14
518 0.14
519 0.16
520 0.16
521 0.16
522 0.19
523 0.21
524 0.17
525 0.22
526 0.23
527 0.21
528 0.21
529 0.23
530 0.2
531 0.19
532 0.17
533 0.11
534 0.12
535 0.13
536 0.14
537 0.14
538 0.15
539 0.18
540 0.19
541 0.2
542 0.19
543 0.18
544 0.22
545 0.27
546 0.27
547 0.28
548 0.28
549 0.3
550 0.32
551 0.34
552 0.31
553 0.24
554 0.24
555 0.21
556 0.21
557 0.18
558 0.15
559 0.12
560 0.17
561 0.19
562 0.17
563 0.18
564 0.2
565 0.23
566 0.25
567 0.25
568 0.24
569 0.22
570 0.28
571 0.3
572 0.29
573 0.26
574 0.25
575 0.28
576 0.28
577 0.29
578 0.26
579 0.24
580 0.23
581 0.24
582 0.25
583 0.21
584 0.18
585 0.18
586 0.14
587 0.14
588 0.13
589 0.15
590 0.19
591 0.19
592 0.18
593 0.18
594 0.19
595 0.19
596 0.19
597 0.17
598 0.11
599 0.11
600 0.14
601 0.16
602 0.15
603 0.19
604 0.19
605 0.2
606 0.21
607 0.2
608 0.2
609 0.19
610 0.2
611 0.15
612 0.16
613 0.15
614 0.16
615 0.15
616 0.13
617 0.19
618 0.18
619 0.25
620 0.25
621 0.28
622 0.26
623 0.32
624 0.34
625 0.34
626 0.38
627 0.32
628 0.3
629 0.28
630 0.27
631 0.21
632 0.17
633 0.1
634 0.05
635 0.04
636 0.06
637 0.06
638 0.06
639 0.06
640 0.06
641 0.08
642 0.1
643 0.11
644 0.09
645 0.11
646 0.11
647 0.14
648 0.15
649 0.12
650 0.11
651 0.15
652 0.16
653 0.16
654 0.18
655 0.16
656 0.2
657 0.23
658 0.25
659 0.23
660 0.31
661 0.34
662 0.34
663 0.41
664 0.41
665 0.39
666 0.39
667 0.38
668 0.32
669 0.31
670 0.3
671 0.25
672 0.2
673 0.19
674 0.17
675 0.16
676 0.14
677 0.11
678 0.08
679 0.06
680 0.05
681 0.04
682 0.05
683 0.05
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.04
688 0.04
689 0.04
690 0.04
691 0.05
692 0.05
693 0.05
694 0.06
695 0.06
696 0.07
697 0.06
698 0.08
699 0.06
700 0.07
701 0.06
702 0.06
703 0.08
704 0.08
705 0.09
706 0.08
707 0.08
708 0.07
709 0.08
710 0.07
711 0.06
712 0.07
713 0.07
714 0.07
715 0.06
716 0.06
717 0.07
718 0.07
719 0.07
720 0.08
721 0.1
722 0.12
723 0.18
724 0.19
725 0.23
726 0.25
727 0.26
728 0.31
729 0.38
730 0.4
731 0.41
732 0.43
733 0.4
734 0.45
735 0.44
736 0.39
737 0.32
738 0.27
739 0.22
740 0.18
741 0.18
742 0.11
743 0.11
744 0.1
745 0.08
746 0.09
747 0.11
748 0.11
749 0.11
750 0.12
751 0.13
752 0.13
753 0.13
754 0.12
755 0.1
756 0.1
757 0.09
758 0.08
759 0.06
760 0.06
761 0.05
762 0.04
763 0.04
764 0.03
765 0.04
766 0.03
767 0.03
768 0.04
769 0.05
770 0.06
771 0.07
772 0.07
773 0.08
774 0.09
775 0.11
776 0.14
777 0.13
778 0.14
779 0.17
780 0.18
781 0.19
782 0.19
783 0.2
784 0.19
785 0.21
786 0.2
787 0.2
788 0.24
789 0.29
790 0.32
791 0.37
792 0.36
793 0.38
794 0.38
795 0.36
796 0.32
797 0.25
798 0.22
799 0.15
800 0.13
801 0.09
802 0.07
803 0.06
804 0.05
805 0.06
806 0.06
807 0.07
808 0.09
809 0.11
810 0.13
811 0.14
812 0.14
813 0.15
814 0.16
815 0.18
816 0.17
817 0.2
818 0.19
819 0.2
820 0.21
821 0.2
822 0.19
823 0.17
824 0.17
825 0.14
826 0.15
827 0.16
828 0.17
829 0.18
830 0.18
831 0.19
832 0.19
833 0.17
834 0.16
835 0.2
836 0.18
837 0.2
838 0.25
839 0.24
840 0.24
841 0.28
842 0.27
843 0.23
844 0.27
845 0.26
846 0.23
847 0.32
848 0.31
849 0.29
850 0.29
851 0.27
852 0.24
853 0.24
854 0.22
855 0.15
856 0.15
857 0.14
858 0.13
859 0.12
860 0.13
861 0.18
862 0.25
863 0.25
864 0.25
865 0.26
866 0.26
867 0.29
868 0.28
869 0.22
870 0.15
871 0.13
872 0.14
873 0.12
874 0.12
875 0.1
876 0.1
877 0.1
878 0.1
879 0.11
880 0.12
881 0.13
882 0.13
883 0.16
884 0.22
885 0.25
886 0.31
887 0.31
888 0.36
889 0.45
890 0.51
891 0.49
892 0.48
893 0.5
894 0.49
895 0.51
896 0.46
897 0.38
898 0.33
899 0.32
900 0.29
901 0.26
902 0.2
903 0.17
904 0.16
905 0.15
906 0.14
907 0.14
908 0.15
909 0.13
910 0.13
911 0.15
912 0.15
913 0.14
914 0.15
915 0.16
916 0.14
917 0.15
918 0.15
919 0.13
920 0.11
921 0.11
922 0.11
923 0.1
924 0.13
925 0.12
926 0.14
927 0.13
928 0.16
929 0.16
930 0.16
931 0.2
932 0.19
933 0.25
934 0.26
935 0.27
936 0.27
937 0.27
938 0.28
939 0.24
940 0.22
941 0.18
942 0.19
943 0.19
944 0.2
945 0.21
946 0.24
947 0.27
948 0.27
949 0.27
950 0.24
951 0.25
952 0.22
953 0.21
954 0.17
955 0.14
956 0.13
957 0.1
958 0.09
959 0.06
960 0.07
961 0.06
962 0.05
963 0.07
964 0.07
965 0.09
966 0.1
967 0.1
968 0.09
969 0.1
970 0.11
971 0.1
972 0.09
973 0.08
974 0.1
975 0.11
976 0.12
977 0.12
978 0.14
979 0.17
980 0.18
981 0.19
982 0.21
983 0.28
984 0.36
985 0.42
986 0.44
987 0.43
988 0.44
989 0.5
990 0.52
991 0.51
992 0.51
993 0.52
994 0.52
995 0.53
996 0.51
997 0.45
998 0.4
999 0.35
1000 0.31
1001 0.24
1002 0.25
1003 0.22
1004 0.22
1005 0.25
1006 0.3
1007 0.33
1008 0.31
1009 0.35
1010 0.33
1011 0.34
1012 0.34
1013 0.34
1014 0.31
1015 0.28
1016 0.28
1017 0.25
1018 0.23
1019 0.26
1020 0.31
1021 0.37
1022 0.37
1023 0.41
1024 0.42
1025 0.41
1026 0.48
1027 0.48
1028 0.51
1029 0.5
1030 0.48
1031 0.42
1032 0.45
1033 0.44
1034 0.38
1035 0.35
1036 0.31
1037 0.25
1038 0.27
1039 0.24
1040 0.2
1041 0.2
1042 0.18
1043 0.16
1044 0.12
1045 0.11
1046 0.14
1047 0.18
1048 0.23
1049 0.26
1050 0.29
1051 0.35
1052 0.39
1053 0.44
1054 0.42
1055 0.45
1056 0.42
1057 0.44
1058 0.43
1059 0.38
1060 0.33
1061 0.31
1062 0.27
1063 0.19
1064 0.18
1065 0.16
1066 0.16
1067 0.16
1068 0.16
1069 0.12
1070 0.12
1071 0.13
1072 0.13
1073 0.13
1074 0.14
1075 0.19
1076 0.19
1077 0.22
1078 0.21
1079 0.21
1080 0.2
1081 0.19
1082 0.19
1083 0.19
1084 0.22
1085 0.19
1086 0.19
1087 0.2
1088 0.22
1089 0.22
1090 0.22
1091 0.2
1092 0.17
1093 0.2
1094 0.2
1095 0.21
1096 0.2
1097 0.18
1098 0.2
1099 0.2
1100 0.2
1101 0.19
1102 0.19
1103 0.17
1104 0.18
1105 0.21
1106 0.22
1107 0.23
1108 0.23
1109 0.27
1110 0.27
1111 0.27
1112 0.29
1113 0.28
1114 0.25
1115 0.22
1116 0.22
1117 0.17
1118 0.17
1119 0.16
1120 0.13
1121 0.11
1122 0.09
1123 0.07
1124 0.07
1125 0.07
1126 0.06
1127 0.05
1128 0.04
1129 0.05
1130 0.05
1131 0.05
1132 0.05
1133 0.05
1134 0.07
1135 0.07
1136 0.07
1137 0.07
1138 0.07
1139 0.07
1140 0.07
1141 0.06
1142 0.05
1143 0.05
1144 0.05
1145 0.05
1146 0.05
1147 0.06
1148 0.05
1149 0.07
1150 0.08
1151 0.09
1152 0.11
1153 0.12
1154 0.12
1155 0.13
1156 0.14
1157 0.14
1158 0.15
1159 0.14
1160 0.14
1161 0.17
1162 0.24
1163 0.26
1164 0.27
1165 0.3
1166 0.31
1167 0.33
1168 0.37
1169 0.39
1170 0.38
1171 0.37
1172 0.4
1173 0.38
1174 0.38
1175 0.36
1176 0.35
1177 0.3
1178 0.25
1179 0.25
1180 0.27
1181 0.27
1182 0.25
1183 0.24
1184 0.21
1185 0.2
1186 0.22
1187 0.21
1188 0.16
1189 0.13
1190 0.14
1191 0.14
1192 0.14
1193 0.14
1194 0.1
1195 0.12
1196 0.14
1197 0.17
1198 0.17
1199 0.18
1200 0.17
1201 0.17
1202 0.23
1203 0.22
1204 0.23
1205 0.21
1206 0.23
1207 0.21
1208 0.21
1209 0.2
1210 0.14
1211 0.13
1212 0.1
1213 0.11
1214 0.17
1215 0.22
1216 0.23
1217 0.26
1218 0.26
1219 0.28
1220 0.28
1221 0.28
1222 0.21
1223 0.17
1224 0.16
1225 0.13
1226 0.14
1227 0.12
1228 0.11
1229 0.12
1230 0.1
1231 0.09
1232 0.1
1233 0.1
1234 0.11
1235 0.16
1236 0.17
1237 0.19
1238 0.24
1239 0.29
1240 0.35
1241 0.38
1242 0.38
1243 0.36
1244 0.39
1245 0.43
1246 0.44
1247 0.42
1248 0.37
1249 0.35
1250 0.38
1251 0.4
1252 0.35
1253 0.27
1254 0.23
1255 0.24
1256 0.22
1257 0.21
1258 0.2
1259 0.21
1260 0.23
1261 0.27
1262 0.28
1263 0.31
1264 0.38
1265 0.44
1266 0.43
1267 0.44
1268 0.44
1269 0.42
1270 0.47
1271 0.42
1272 0.39