FuNGI

A0A6A6YMN4

Protein Details

Accession

A0A6A6YMN4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-27	LPRVLLKKGMRPPAKRTPNPPPAPA	Hydrophilic
486-514	LNPSSTDRKKILKRRAKAKREGTRAKILN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
329-361	RRAKAIEHSKIPSEARLQRKAIAKSKREQAERR
493-510	RKKILKRRAKAKREGTRA

Subcellular Location(s)

mito 20.5, cyto_mito 11.5, nucl 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006630 La_HTH
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA

Amino Acid Sequences

MFLPRVLLKKGMRPPAKRTPNPPPAPAQAEEGTADPQAVPPTRPATLQTSESTGPESTQQTGGQAPDNEALLVRGKRKLDQTPLAEETTTVPKKAKGDQPRKGSNFTPKQKWIVNDDYLKEVTLGIEIFFSDYAHRDSTSSLNRLQKVIDGESGYIHLQTLISSRLLDRMKPYATHDIIRQALQSFPSDYVEIAQDGLHVRRKPSTYPLPFLLDEESAAIKEEEEGLSFWDSHTIYVEPSNPLLCVRPTSVAASLLKNGDLSAKLLPIQAIQVLRPSCAFVVFSGSITLSSGETWLEKGLPKDWIVMSKEEHDGRTKEYKGLVDHDRQRRAKAIEHSKIPSEARLQRKAIAKSKREQAERREARVQREATYTVGTVSDALIAFPDRWTFVRLSNMPWRLPVQTILKLVKDISPRPIESFIAFHTYGKLFVILQFAMKEDAEAIVKAFNDKVTALKETDELGNWLHRLSSEHEPRAWKDIPDKSVFLNPSSTDRKKILKRRAKAKREGTRAKILNLEEAKACWDQLQRKAGITCSGAPVSD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.73
3	0.8
4	0.78
5	0.78
6	0.79
7	0.81
8	0.81
9	0.77
10	0.72
11	0.68
12	0.67
13	0.6
14	0.54
15	0.44
16	0.4
17	0.36
18	0.3
19	0.24
20	0.19
21	0.18
22	0.12
23	0.13
24	0.17
25	0.18
26	0.18
27	0.21
28	0.24
29	0.25
30	0.26
31	0.28
32	0.29
33	0.31
34	0.33
35	0.31
36	0.32
37	0.32
38	0.31
39	0.31
40	0.24
41	0.21
42	0.22
43	0.22
44	0.2
45	0.21
46	0.21
47	0.2
48	0.22
49	0.23
50	0.23
51	0.22
52	0.22
53	0.21
54	0.21
55	0.2
56	0.17
57	0.17
58	0.18
59	0.2
60	0.21
61	0.25
62	0.27
63	0.31
64	0.38
65	0.44
66	0.47
67	0.52
68	0.53
69	0.55
70	0.56
71	0.53
72	0.46
73	0.39
74	0.33
75	0.35
76	0.32
77	0.26
78	0.24
79	0.26
80	0.3
81	0.37
82	0.43
83	0.44
84	0.54
85	0.61
86	0.69
87	0.76
88	0.76
89	0.73
90	0.69
91	0.69
92	0.69
93	0.69
94	0.68
95	0.63
96	0.65
97	0.65
98	0.62
99	0.59
100	0.55
101	0.53
102	0.5
103	0.46
104	0.44
105	0.4
106	0.37
107	0.3
108	0.23
109	0.16
110	0.12
111	0.11
112	0.07
113	0.06
114	0.06
115	0.07
116	0.06
117	0.07
118	0.06
119	0.08
120	0.1
121	0.11
122	0.12
123	0.12
124	0.13
125	0.2
126	0.25
127	0.26
128	0.3
129	0.35
130	0.36
131	0.37
132	0.35
133	0.32
134	0.3
135	0.28
136	0.25
137	0.19
138	0.18
139	0.18
140	0.19
141	0.15
142	0.12
143	0.1
144	0.07
145	0.07
146	0.07
147	0.08
148	0.08
149	0.08
150	0.08
151	0.09
152	0.15
153	0.16
154	0.17
155	0.19
156	0.22
157	0.23
158	0.24
159	0.29
160	0.31
161	0.32
162	0.32
163	0.31
164	0.32
165	0.31
166	0.3
167	0.27
168	0.19
169	0.19
170	0.18
171	0.18
172	0.13
173	0.13
174	0.14
175	0.13
176	0.12
177	0.11
178	0.11
179	0.1
180	0.09
181	0.07
182	0.07
183	0.08
184	0.11
185	0.16
186	0.16
187	0.17
188	0.21
189	0.23
190	0.25
191	0.31
192	0.39
193	0.38
194	0.4
195	0.42
196	0.41
197	0.4
198	0.38
199	0.32
200	0.22
201	0.17
202	0.14
203	0.12
204	0.08
205	0.09
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.07
215	0.07
216	0.07
217	0.09
218	0.09
219	0.09
220	0.1
221	0.09
222	0.09
223	0.1
224	0.12
225	0.1
226	0.1
227	0.1
228	0.09
229	0.09
230	0.1
231	0.09
232	0.09
233	0.1
234	0.1
235	0.11
236	0.12
237	0.13
238	0.14
239	0.15
240	0.14
241	0.14
242	0.13
243	0.12
244	0.11
245	0.1
246	0.09
247	0.08
248	0.08
249	0.07
250	0.07
251	0.08
252	0.08
253	0.08
254	0.07
255	0.07
256	0.08
257	0.08
258	0.07
259	0.11
260	0.11
261	0.11
262	0.11
263	0.11
264	0.09
265	0.09
266	0.1
267	0.05
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.09
272	0.09
273	0.09
274	0.09
275	0.09
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.06
284	0.07
285	0.08
286	0.09
287	0.11
288	0.12
289	0.14
290	0.14
291	0.17
292	0.18
293	0.19
294	0.19
295	0.19
296	0.23
297	0.21
298	0.22
299	0.22
300	0.21
301	0.23
302	0.29
303	0.27
304	0.25
305	0.26
306	0.28
307	0.25
308	0.29
309	0.3
310	0.31
311	0.39
312	0.44
313	0.51
314	0.5
315	0.5
316	0.51
317	0.48
318	0.47
319	0.48
320	0.51
321	0.48
322	0.51
323	0.51
324	0.47
325	0.47
326	0.41
327	0.34
328	0.31
329	0.33
330	0.36
331	0.4
332	0.4
333	0.42
334	0.48
335	0.53
336	0.54
337	0.56
338	0.54
339	0.54
340	0.61
341	0.63
342	0.64
343	0.63
344	0.63
345	0.65
346	0.66
347	0.65
348	0.66
349	0.62
350	0.6
351	0.62
352	0.56
353	0.47
354	0.45
355	0.4
356	0.32
357	0.3
358	0.24
359	0.17
360	0.15
361	0.12
362	0.09
363	0.08
364	0.08
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.08
372	0.08
373	0.09
374	0.12
375	0.12
376	0.14
377	0.22
378	0.23
379	0.28
380	0.35
381	0.38
382	0.36
383	0.37
384	0.36
385	0.3
386	0.3
387	0.3
388	0.26
389	0.27
390	0.31
391	0.31
392	0.3
393	0.29
394	0.29
395	0.28
396	0.29
397	0.27
398	0.29
399	0.32
400	0.33
401	0.35
402	0.36
403	0.33
404	0.29
405	0.28
406	0.22
407	0.23
408	0.22
409	0.19
410	0.2
411	0.19
412	0.18
413	0.17
414	0.16
415	0.11
416	0.12
417	0.15
418	0.12
419	0.13
420	0.12
421	0.13
422	0.14
423	0.13
424	0.12
425	0.09
426	0.1
427	0.1
428	0.09
429	0.09
430	0.09
431	0.09
432	0.11
433	0.11
434	0.1
435	0.1
436	0.11
437	0.14
438	0.15
439	0.18
440	0.17
441	0.18
442	0.18
443	0.19
444	0.2
445	0.18
446	0.16
447	0.15
448	0.17
449	0.16
450	0.15
451	0.14
452	0.13
453	0.15
454	0.19
455	0.27
456	0.33
457	0.37
458	0.41
459	0.45
460	0.47
461	0.52
462	0.49
463	0.42
464	0.42
465	0.46
466	0.48
467	0.48
468	0.47
469	0.42
470	0.47
471	0.45
472	0.38
473	0.34
474	0.29
475	0.33
476	0.41
477	0.41
478	0.39
479	0.42
480	0.5
481	0.57
482	0.65
483	0.69
484	0.7
485	0.76
486	0.82
487	0.88
488	0.89
489	0.89
490	0.9
491	0.89
492	0.9
493	0.9
494	0.86
495	0.86
496	0.79
497	0.72
498	0.68
499	0.58
500	0.57
501	0.49
502	0.44
503	0.35
504	0.31
505	0.32
506	0.27
507	0.26
508	0.21
509	0.26
510	0.31
511	0.38
512	0.45
513	0.43
514	0.48
515	0.5
516	0.48
517	0.45
518	0.42
519	0.36
520	0.34

A0A6A6YMN4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer