Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6A6Y3D3

Protein Details
Accession A0A6A6Y3D3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
400-432IPDVVLVKKHYPRRKKGKSRNWRLKRMAKEESEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
407-428KKHYPRRKKGKSRNWRLKRMAK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11, nucl 10.5, cyto 8.5, cysk 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039768  Nmd3  
IPR007064  Nmd3_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0043023  F:ribosomal large subunit binding  
GO:0015031  P:protein transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF04981  NMD3  
Amino Acid Sequences MSMEVDQPISFQPGVGKTATILCCNCGAPIDGTVSAGALCGDCIKATIDITQGIQREGTLHQCRDCDRWLSPPNQWLVAQMESQALLAICLRKLRGINKVRLTDASFIWTEPHSRRIKVKITIQSEFEGAILQQTFDVEFVQASQQCPECAKSYTHNTWRAVVQVRQKVPHKRTFLFLEQLILKHQAHNNAINIKESSEGIDFFFAQRNSAEKFVDFLKSVVPCNMKKSSELISKDIHTSTSQYKFTFSIELIPICKDDLVALPIKLAKSIGNVNPLTLCYRIGTSVNLIDVTTLQTADVSTEIYWRAPFRPLADVQELVEFVVLDIEPLGPSKGRFALAEATVARASDMGANDATFYTRTHLGGVLHPGDSVMGYLITGTNYNNEHFDALEESKYASTIPDVVLVKKHYPRRKKGKSRNWRLKRMAKEESEMAPRKQDQARMEQDFEMFLRDVEEDTELRAGLAVYKAQQQAKADKAAVDAMEESDDDDEEGPVIPMEQLLDEFEDLTMADGDGVEVH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.2
4 0.17
5 0.25
6 0.26
7 0.27
8 0.25
9 0.24
10 0.26
11 0.26
12 0.25
13 0.19
14 0.19
15 0.16
16 0.17
17 0.18
18 0.16
19 0.16
20 0.16
21 0.14
22 0.12
23 0.1
24 0.09
25 0.05
26 0.05
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.07
31 0.09
32 0.1
33 0.1
34 0.12
35 0.13
36 0.14
37 0.16
38 0.19
39 0.19
40 0.18
41 0.17
42 0.16
43 0.16
44 0.17
45 0.25
46 0.28
47 0.3
48 0.33
49 0.36
50 0.39
51 0.41
52 0.43
53 0.38
54 0.33
55 0.39
56 0.43
57 0.44
58 0.46
59 0.48
60 0.47
61 0.45
62 0.43
63 0.36
64 0.33
65 0.3
66 0.25
67 0.2
68 0.18
69 0.15
70 0.15
71 0.13
72 0.1
73 0.08
74 0.1
75 0.1
76 0.11
77 0.13
78 0.13
79 0.16
80 0.2
81 0.25
82 0.33
83 0.39
84 0.47
85 0.53
86 0.56
87 0.55
88 0.54
89 0.52
90 0.45
91 0.37
92 0.32
93 0.24
94 0.21
95 0.21
96 0.18
97 0.2
98 0.2
99 0.28
100 0.29
101 0.32
102 0.37
103 0.43
104 0.5
105 0.52
106 0.58
107 0.58
108 0.6
109 0.6
110 0.56
111 0.5
112 0.43
113 0.36
114 0.27
115 0.18
116 0.12
117 0.12
118 0.09
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.1
129 0.11
130 0.12
131 0.14
132 0.15
133 0.15
134 0.17
135 0.18
136 0.17
137 0.18
138 0.19
139 0.22
140 0.3
141 0.38
142 0.44
143 0.49
144 0.48
145 0.48
146 0.46
147 0.45
148 0.42
149 0.38
150 0.38
151 0.39
152 0.41
153 0.45
154 0.51
155 0.56
156 0.59
157 0.62
158 0.6
159 0.54
160 0.56
161 0.56
162 0.53
163 0.47
164 0.4
165 0.35
166 0.29
167 0.28
168 0.26
169 0.24
170 0.2
171 0.2
172 0.22
173 0.23
174 0.25
175 0.27
176 0.29
177 0.29
178 0.29
179 0.27
180 0.25
181 0.2
182 0.18
183 0.15
184 0.14
185 0.11
186 0.11
187 0.09
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.14
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.14
196 0.15
197 0.16
198 0.16
199 0.11
200 0.13
201 0.13
202 0.15
203 0.13
204 0.11
205 0.13
206 0.13
207 0.14
208 0.17
209 0.2
210 0.19
211 0.23
212 0.27
213 0.25
214 0.25
215 0.27
216 0.29
217 0.31
218 0.33
219 0.31
220 0.28
221 0.29
222 0.3
223 0.27
224 0.22
225 0.16
226 0.16
227 0.19
228 0.21
229 0.22
230 0.21
231 0.22
232 0.22
233 0.22
234 0.21
235 0.15
236 0.14
237 0.14
238 0.14
239 0.13
240 0.13
241 0.12
242 0.11
243 0.11
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.08
249 0.07
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.07
256 0.08
257 0.12
258 0.13
259 0.18
260 0.18
261 0.18
262 0.18
263 0.18
264 0.18
265 0.14
266 0.13
267 0.07
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.04
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.08
293 0.09
294 0.1
295 0.12
296 0.13
297 0.14
298 0.18
299 0.19
300 0.22
301 0.23
302 0.22
303 0.2
304 0.2
305 0.18
306 0.13
307 0.12
308 0.07
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.08
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.11
325 0.15
326 0.14
327 0.17
328 0.15
329 0.16
330 0.15
331 0.14
332 0.13
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.1
347 0.11
348 0.11
349 0.13
350 0.14
351 0.15
352 0.2
353 0.18
354 0.17
355 0.16
356 0.15
357 0.13
358 0.12
359 0.09
360 0.05
361 0.04
362 0.03
363 0.04
364 0.04
365 0.05
366 0.06
367 0.06
368 0.09
369 0.1
370 0.11
371 0.12
372 0.13
373 0.13
374 0.12
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.13
379 0.12
380 0.12
381 0.12
382 0.12
383 0.11
384 0.08
385 0.07
386 0.08
387 0.08
388 0.13
389 0.14
390 0.15
391 0.19
392 0.22
393 0.27
394 0.33
395 0.42
396 0.46
397 0.55
398 0.65
399 0.72
400 0.81
401 0.86
402 0.9
403 0.92
404 0.94
405 0.96
406 0.96
407 0.95
408 0.94
409 0.93
410 0.91
411 0.89
412 0.87
413 0.84
414 0.76
415 0.7
416 0.64
417 0.59
418 0.59
419 0.54
420 0.46
421 0.44
422 0.42
423 0.45
424 0.45
425 0.46
426 0.41
427 0.46
428 0.53
429 0.52
430 0.53
431 0.48
432 0.44
433 0.39
434 0.35
435 0.28
436 0.2
437 0.14
438 0.13
439 0.12
440 0.12
441 0.12
442 0.14
443 0.11
444 0.12
445 0.13
446 0.11
447 0.11
448 0.11
449 0.09
450 0.09
451 0.11
452 0.11
453 0.12
454 0.18
455 0.24
456 0.26
457 0.29
458 0.31
459 0.37
460 0.4
461 0.43
462 0.38
463 0.34
464 0.33
465 0.32
466 0.28
467 0.23
468 0.19
469 0.14
470 0.14
471 0.13
472 0.12
473 0.1
474 0.1
475 0.09
476 0.09
477 0.08
478 0.08
479 0.09
480 0.08
481 0.07
482 0.08
483 0.07
484 0.06
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.08
489 0.1
490 0.1
491 0.1
492 0.09
493 0.09
494 0.08
495 0.09
496 0.09
497 0.07
498 0.07
499 0.06