Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6A6YVI1

Protein Details
Accession A0A6A6YVI1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-121GSSRRASKPRGGDKRPCVRCSQRKIKCDRLSPCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-98RASKPR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences METGQSHEATLVNNGDLVKRERSRTMDRHSSSDPLFYCQECGRGYKTVESLNCHHKNHSSNKYVCHICQVGFKRKDLLHRHLTQVHKWGSSRRASKPRGGDKRPCVRCSQRKIKCDRLSPCSGCTRGKHSCQYPTPPKSSISPFATIGAFPNPNATTASHVPPNLALSSWSGNLYSQNTDPGRDNHSQLSPETTTTLPSSGTATMWHSPEPQNAAMAYTVVCSGANELPTVRHVRSFSMMETTPPVVKTEAPSQIHHTPPQENVRLREENARLREENARLQENARLRENVGLQEIARLREEIARLEEKIARNRWLNETTVSTQETLSNGSVEITSFNTLSRLLCASRPEDSNFMAQPLYSPTTSTWNFQDSRSATSNSFIAPQPIQHCESYSGKCSVCCCPNFEMDSGRYCTTRFYKDLPPRMCKECGHQDSNHAPPGAQVWAANAGSVLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.2
4 0.23
5 0.28
6 0.31
7 0.36
8 0.4
9 0.47
10 0.55
11 0.6
12 0.65
13 0.67
14 0.65
15 0.67
16 0.64
17 0.63
18 0.54
19 0.52
20 0.43
21 0.37
22 0.37
23 0.31
24 0.32
25 0.27
26 0.31
27 0.26
28 0.28
29 0.27
30 0.3
31 0.31
32 0.33
33 0.35
34 0.36
35 0.38
36 0.4
37 0.42
38 0.47
39 0.53
40 0.5
41 0.5
42 0.5
43 0.55
44 0.59
45 0.64
46 0.62
47 0.59
48 0.63
49 0.67
50 0.65
51 0.57
52 0.54
53 0.47
54 0.38
55 0.43
56 0.46
57 0.49
58 0.48
59 0.49
60 0.49
61 0.49
62 0.58
63 0.57
64 0.57
65 0.56
66 0.57
67 0.61
68 0.62
69 0.64
70 0.58
71 0.59
72 0.54
73 0.48
74 0.46
75 0.46
76 0.46
77 0.5
78 0.53
79 0.54
80 0.61
81 0.61
82 0.67
83 0.7
84 0.74
85 0.76
86 0.77
87 0.77
88 0.77
89 0.83
90 0.83
91 0.76
92 0.73
93 0.73
94 0.75
95 0.76
96 0.77
97 0.75
98 0.77
99 0.82
100 0.85
101 0.82
102 0.81
103 0.77
104 0.74
105 0.74
106 0.67
107 0.63
108 0.59
109 0.55
110 0.5
111 0.46
112 0.46
113 0.44
114 0.48
115 0.52
116 0.5
117 0.55
118 0.56
119 0.63
120 0.66
121 0.65
122 0.63
123 0.58
124 0.54
125 0.5
126 0.5
127 0.47
128 0.4
129 0.36
130 0.32
131 0.32
132 0.31
133 0.26
134 0.22
135 0.19
136 0.15
137 0.13
138 0.16
139 0.14
140 0.15
141 0.16
142 0.15
143 0.16
144 0.18
145 0.21
146 0.2
147 0.2
148 0.19
149 0.18
150 0.19
151 0.15
152 0.12
153 0.1
154 0.09
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.09
159 0.1
160 0.12
161 0.13
162 0.13
163 0.12
164 0.17
165 0.17
166 0.18
167 0.2
168 0.21
169 0.25
170 0.25
171 0.27
172 0.24
173 0.25
174 0.25
175 0.23
176 0.25
177 0.2
178 0.18
179 0.18
180 0.15
181 0.14
182 0.14
183 0.14
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.1
191 0.12
192 0.13
193 0.13
194 0.14
195 0.15
196 0.17
197 0.19
198 0.17
199 0.15
200 0.14
201 0.14
202 0.11
203 0.1
204 0.08
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.1
217 0.13
218 0.11
219 0.12
220 0.13
221 0.14
222 0.16
223 0.17
224 0.16
225 0.16
226 0.16
227 0.14
228 0.16
229 0.15
230 0.14
231 0.13
232 0.13
233 0.11
234 0.11
235 0.13
236 0.16
237 0.22
238 0.23
239 0.24
240 0.29
241 0.33
242 0.35
243 0.35
244 0.32
245 0.27
246 0.3
247 0.35
248 0.36
249 0.34
250 0.35
251 0.38
252 0.38
253 0.37
254 0.4
255 0.38
256 0.38
257 0.39
258 0.4
259 0.34
260 0.35
261 0.39
262 0.34
263 0.35
264 0.32
265 0.31
266 0.27
267 0.28
268 0.31
269 0.3
270 0.31
271 0.28
272 0.25
273 0.24
274 0.26
275 0.27
276 0.23
277 0.2
278 0.17
279 0.14
280 0.18
281 0.19
282 0.17
283 0.16
284 0.15
285 0.14
286 0.16
287 0.17
288 0.14
289 0.17
290 0.18
291 0.18
292 0.2
293 0.24
294 0.25
295 0.31
296 0.33
297 0.34
298 0.36
299 0.38
300 0.42
301 0.4
302 0.37
303 0.32
304 0.34
305 0.31
306 0.3
307 0.28
308 0.23
309 0.21
310 0.2
311 0.19
312 0.16
313 0.14
314 0.11
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.08
319 0.09
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.14
331 0.17
332 0.18
333 0.21
334 0.24
335 0.25
336 0.26
337 0.26
338 0.28
339 0.25
340 0.24
341 0.2
342 0.17
343 0.16
344 0.17
345 0.19
346 0.15
347 0.15
348 0.15
349 0.23
350 0.24
351 0.26
352 0.24
353 0.27
354 0.28
355 0.28
356 0.35
357 0.29
358 0.34
359 0.35
360 0.35
361 0.3
362 0.31
363 0.31
364 0.23
365 0.25
366 0.19
367 0.19
368 0.17
369 0.21
370 0.23
371 0.26
372 0.29
373 0.26
374 0.27
375 0.29
376 0.34
377 0.33
378 0.34
379 0.34
380 0.32
381 0.34
382 0.35
383 0.37
384 0.4
385 0.38
386 0.38
387 0.36
388 0.41
389 0.42
390 0.41
391 0.39
392 0.33
393 0.37
394 0.37
395 0.35
396 0.3
397 0.28
398 0.33
399 0.33
400 0.37
401 0.35
402 0.36
403 0.45
404 0.54
405 0.64
406 0.66
407 0.68
408 0.67
409 0.69
410 0.69
411 0.61
412 0.6
413 0.61
414 0.61
415 0.58
416 0.54
417 0.57
418 0.59
419 0.63
420 0.6
421 0.49
422 0.41
423 0.36
424 0.37
425 0.31
426 0.24
427 0.18
428 0.14
429 0.2
430 0.2
431 0.18