Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4PBM4

Protein Details
Accession F4PBM4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-32MSDTRESRDRRRKATHSAIERRRRERTNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-29DRRRKATHSAIERRRRE
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd00083  bHLH_SF  
Amino Acid Sequences MNHSMSDTRESRDRRRKATHSAIERRRRERTNDKIAQLKDMLPSCAGRSGLHKLTILEEGIQYTRMLEGQIRELQLMAARVPLLQSRSAMEAASPAVTSKVMCMPSGPASMPTCANIKLEDTAESHESYRSNDRRACHSLGTLTTPVDQYHLDTNHSLGTFATLCSASKMLPSPACSQRQASPFSEIAGICDSSSSTHSPCAEIMSLGSILS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.73
3 0.76
4 0.78
5 0.82
6 0.81
7 0.81
8 0.83
9 0.84
10 0.85
11 0.87
12 0.84
13 0.82
14 0.78
15 0.77
16 0.77
17 0.76
18 0.77
19 0.76
20 0.74
21 0.73
22 0.68
23 0.63
24 0.54
25 0.46
26 0.4
27 0.34
28 0.3
29 0.23
30 0.24
31 0.2
32 0.21
33 0.2
34 0.16
35 0.18
36 0.24
37 0.25
38 0.26
39 0.26
40 0.23
41 0.24
42 0.25
43 0.21
44 0.15
45 0.13
46 0.12
47 0.11
48 0.12
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.12
57 0.15
58 0.15
59 0.15
60 0.14
61 0.14
62 0.14
63 0.13
64 0.09
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.1
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.07
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.1
92 0.12
93 0.13
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.12
101 0.11
102 0.12
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.11
107 0.11
108 0.1
109 0.12
110 0.13
111 0.13
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.14
116 0.23
117 0.24
118 0.28
119 0.3
120 0.32
121 0.37
122 0.42
123 0.42
124 0.34
125 0.32
126 0.28
127 0.26
128 0.28
129 0.22
130 0.17
131 0.16
132 0.15
133 0.14
134 0.13
135 0.12
136 0.11
137 0.16
138 0.16
139 0.17
140 0.17
141 0.17
142 0.18
143 0.18
144 0.16
145 0.11
146 0.12
147 0.11
148 0.1
149 0.11
150 0.09
151 0.09
152 0.11
153 0.11
154 0.09
155 0.11
156 0.13
157 0.16
158 0.18
159 0.22
160 0.27
161 0.34
162 0.38
163 0.39
164 0.4
165 0.42
166 0.44
167 0.45
168 0.41
169 0.39
170 0.35
171 0.33
172 0.34
173 0.27
174 0.24
175 0.22
176 0.2
177 0.14
178 0.14
179 0.13
180 0.11
181 0.14
182 0.15
183 0.14
184 0.18
185 0.19
186 0.21
187 0.21
188 0.23
189 0.21
190 0.18
191 0.17
192 0.15