Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4P3V6

Protein Details
Accession F4P3V6    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
383-403LSGPKFRSQQQRDRLHRKFKTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 12.5, cyto 9, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR030843  PAN2  
IPR028881  PAN2_UCH_dom  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR028889  USP_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000932  C:P-body  
GO:0031251  C:PAN complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004535  F:poly(A)-specific ribonuclease activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
Pfam View protein in Pfam  
PF13423  UCH_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50235  USP_3  
CDD cd06143  PAN2_exo  
Amino Acid Sequences MANTHGLLPRLQGQVTSFLNIGDASPRYTSFPAHHGVPASQLLIHDSGVISLSSKNVRFTSRCGIQRWNKLMSDARCMSFTNTSSQLHVVGSPTTLSVVNMYRGTIVNEISLDEPIVAMKQGKFMAHATESGRVQFLDPRTMEIEHTILAHAGGILSMDIIGNTMATCGYSIRNGALLPDRLIKLYDIRTMRALSPIPFSVGPEHVRFHPKQPSRLLILSKTGAVQICDITSPNYTGVTFIRADMPGMISSMDISSNSDAFAVGDTTNSCAVFSTHETIRYNPYSRQSEYRSMFVDKSTVEIGDDTPLSAVGMPRYTSELLSAWPNSLLINVGRPQPRIPPEVLKNVKMSDFVGYVQDMPLKRNQNLIMSIRASTPTCASPGLSGPKFRSQQQRDRLHRKFKTEGHSAKSSLKSPETNDPSLQESEISEYHWHKIEIKYSKFGVEDFDFEYYNHTVYGGLETHIQNSYCNPLLQILFFNRPLCELVKSHIRTACMKDLCLACELGFLFRMLEDSKGANCQASNFLRAFGATPEACALGLVDAEVSHTDPQSVLTLQYDKLIQTTMRFLLEQLHQELGAKSTKHSQAIDYPPDEYIKTIYGIPLWTLIKCHGNHDHNRDSVPFVIDLHYDHKNLPANFLELLHASINKESSTRAWCDKCQKYQNIKQSRKLTKLPNFLNLNANITNDLESELWRRDTQDGSSCFLLKSFVLRRDADGYLIVDQSGVDVDVDLNSSDVAIYDLKTVVSAIQFENEPTHLVACINVSDDYDAPKWYLFNDFLVQEIFNGEECRFEDWKMPAIIQYIRRTHPDKNEFFLSPVEPDFSILIKHQNINKQKDVCFNYELLTELEIPCISEYICAIDAEFVVMTEAEMEIKSDGSKSIIRPAESGLARVSVIRGIEPRMGVPFIDDYIFISQPVVNYLTEFSGIIASDLDVRTSKLPIVSLKIAYKKLRLLVDIGCIFVGHGLKKDCRTINILIPPHQIIDTVDIYYLKQYSRKLSLRFLVWFFFKEDIHSSSHDSVEDARGALRIYQKYLEAKEQARFDTLLEEIYQEGRKFNFRPPNALTGIANTTQYDMHARTQSSDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.29
4 0.22
5 0.19
6 0.2
7 0.18
8 0.17
9 0.15
10 0.14
11 0.15
12 0.16
13 0.17
14 0.21
15 0.22
16 0.25
17 0.23
18 0.27
19 0.28
20 0.29
21 0.3
22 0.29
23 0.28
24 0.29
25 0.27
26 0.24
27 0.21
28 0.18
29 0.19
30 0.17
31 0.17
32 0.14
33 0.12
34 0.11
35 0.11
36 0.11
37 0.09
38 0.09
39 0.13
40 0.18
41 0.19
42 0.23
43 0.25
44 0.32
45 0.33
46 0.38
47 0.44
48 0.47
49 0.51
50 0.52
51 0.59
52 0.62
53 0.7
54 0.7
55 0.67
56 0.59
57 0.58
58 0.62
59 0.55
60 0.55
61 0.49
62 0.44
63 0.4
64 0.4
65 0.39
66 0.36
67 0.34
68 0.3
69 0.31
70 0.3
71 0.31
72 0.3
73 0.28
74 0.23
75 0.23
76 0.19
77 0.15
78 0.14
79 0.12
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.1
84 0.12
85 0.13
86 0.16
87 0.16
88 0.16
89 0.17
90 0.18
91 0.2
92 0.18
93 0.17
94 0.14
95 0.14
96 0.15
97 0.14
98 0.13
99 0.11
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.1
106 0.1
107 0.14
108 0.16
109 0.17
110 0.19
111 0.2
112 0.23
113 0.21
114 0.24
115 0.22
116 0.26
117 0.27
118 0.25
119 0.25
120 0.2
121 0.2
122 0.23
123 0.23
124 0.26
125 0.25
126 0.27
127 0.29
128 0.29
129 0.29
130 0.25
131 0.23
132 0.16
133 0.16
134 0.13
135 0.11
136 0.1
137 0.09
138 0.07
139 0.06
140 0.05
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.03
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.07
157 0.08
158 0.09
159 0.1
160 0.11
161 0.11
162 0.13
163 0.18
164 0.19
165 0.19
166 0.24
167 0.24
168 0.23
169 0.24
170 0.23
171 0.22
172 0.23
173 0.28
174 0.25
175 0.26
176 0.28
177 0.3
178 0.29
179 0.29
180 0.28
181 0.23
182 0.25
183 0.24
184 0.24
185 0.22
186 0.22
187 0.21
188 0.23
189 0.24
190 0.23
191 0.24
192 0.26
193 0.33
194 0.34
195 0.37
196 0.44
197 0.46
198 0.52
199 0.55
200 0.56
201 0.55
202 0.58
203 0.55
204 0.47
205 0.45
206 0.39
207 0.33
208 0.29
209 0.26
210 0.22
211 0.19
212 0.17
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.12
220 0.11
221 0.12
222 0.11
223 0.12
224 0.12
225 0.14
226 0.13
227 0.12
228 0.14
229 0.14
230 0.14
231 0.13
232 0.14
233 0.11
234 0.11
235 0.1
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.06
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.08
258 0.09
259 0.11
260 0.14
261 0.16
262 0.16
263 0.21
264 0.23
265 0.24
266 0.3
267 0.32
268 0.32
269 0.32
270 0.39
271 0.39
272 0.41
273 0.46
274 0.45
275 0.49
276 0.49
277 0.48
278 0.43
279 0.41
280 0.38
281 0.32
282 0.29
283 0.19
284 0.19
285 0.17
286 0.14
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.09
302 0.12
303 0.13
304 0.12
305 0.13
306 0.12
307 0.12
308 0.15
309 0.15
310 0.12
311 0.11
312 0.12
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.07
317 0.1
318 0.11
319 0.17
320 0.2
321 0.21
322 0.22
323 0.28
324 0.31
325 0.32
326 0.32
327 0.34
328 0.36
329 0.45
330 0.47
331 0.43
332 0.41
333 0.39
334 0.37
335 0.3
336 0.26
337 0.18
338 0.15
339 0.13
340 0.12
341 0.11
342 0.11
343 0.11
344 0.14
345 0.12
346 0.13
347 0.19
348 0.22
349 0.23
350 0.27
351 0.28
352 0.28
353 0.32
354 0.32
355 0.3
356 0.26
357 0.26
358 0.22
359 0.22
360 0.19
361 0.16
362 0.15
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.11
367 0.11
368 0.14
369 0.2
370 0.2
371 0.22
372 0.24
373 0.31
374 0.33
375 0.38
376 0.45
377 0.45
378 0.53
379 0.61
380 0.68
381 0.7
382 0.79
383 0.82
384 0.81
385 0.79
386 0.76
387 0.73
388 0.68
389 0.66
390 0.65
391 0.62
392 0.57
393 0.55
394 0.51
395 0.49
396 0.46
397 0.42
398 0.36
399 0.33
400 0.3
401 0.3
402 0.37
403 0.37
404 0.36
405 0.34
406 0.32
407 0.32
408 0.31
409 0.28
410 0.18
411 0.13
412 0.13
413 0.13
414 0.13
415 0.13
416 0.13
417 0.15
418 0.16
419 0.16
420 0.17
421 0.19
422 0.26
423 0.3
424 0.31
425 0.33
426 0.32
427 0.34
428 0.3
429 0.28
430 0.25
431 0.18
432 0.17
433 0.15
434 0.15
435 0.14
436 0.14
437 0.17
438 0.13
439 0.12
440 0.1
441 0.09
442 0.08
443 0.08
444 0.1
445 0.07
446 0.07
447 0.1
448 0.11
449 0.12
450 0.13
451 0.13
452 0.11
453 0.11
454 0.14
455 0.12
456 0.12
457 0.11
458 0.11
459 0.12
460 0.12
461 0.13
462 0.12
463 0.14
464 0.16
465 0.16
466 0.14
467 0.15
468 0.16
469 0.15
470 0.14
471 0.12
472 0.14
473 0.22
474 0.23
475 0.26
476 0.26
477 0.27
478 0.28
479 0.32
480 0.36
481 0.28
482 0.27
483 0.27
484 0.26
485 0.25
486 0.23
487 0.19
488 0.11
489 0.12
490 0.12
491 0.08
492 0.08
493 0.07
494 0.06
495 0.05
496 0.07
497 0.06
498 0.06
499 0.07
500 0.07
501 0.08
502 0.09
503 0.09
504 0.08
505 0.08
506 0.08
507 0.13
508 0.13
509 0.15
510 0.14
511 0.15
512 0.14
513 0.14
514 0.14
515 0.09
516 0.11
517 0.08
518 0.08
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.07
523 0.07
524 0.03
525 0.03
526 0.03
527 0.03
528 0.02
529 0.03
530 0.03
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.05
535 0.05
536 0.06
537 0.06
538 0.07
539 0.06
540 0.07
541 0.08
542 0.08
543 0.09
544 0.09
545 0.08
546 0.08
547 0.09
548 0.08
549 0.07
550 0.09
551 0.09
552 0.1
553 0.1
554 0.09
555 0.12
556 0.14
557 0.15
558 0.14
559 0.13
560 0.13
561 0.14
562 0.14
563 0.12
564 0.12
565 0.11
566 0.1
567 0.16
568 0.19
569 0.2
570 0.2
571 0.2
572 0.24
573 0.29
574 0.32
575 0.27
576 0.25
577 0.23
578 0.24
579 0.22
580 0.16
581 0.12
582 0.09
583 0.09
584 0.08
585 0.08
586 0.08
587 0.08
588 0.08
589 0.1
590 0.1
591 0.09
592 0.1
593 0.11
594 0.16
595 0.16
596 0.2
597 0.25
598 0.3
599 0.36
600 0.42
601 0.45
602 0.41
603 0.42
604 0.38
605 0.32
606 0.27
607 0.23
608 0.16
609 0.12
610 0.11
611 0.11
612 0.11
613 0.13
614 0.13
615 0.13
616 0.13
617 0.16
618 0.21
619 0.21
620 0.22
621 0.2
622 0.19
623 0.19
624 0.19
625 0.16
626 0.11
627 0.12
628 0.1
629 0.09
630 0.08
631 0.09
632 0.09
633 0.08
634 0.08
635 0.08
636 0.1
637 0.13
638 0.16
639 0.21
640 0.24
641 0.28
642 0.38
643 0.43
644 0.49
645 0.54
646 0.6
647 0.64
648 0.69
649 0.74
650 0.76
651 0.76
652 0.76
653 0.77
654 0.75
655 0.72
656 0.7
657 0.7
658 0.67
659 0.7
660 0.64
661 0.62
662 0.58
663 0.54
664 0.52
665 0.43
666 0.38
667 0.29
668 0.27
669 0.2
670 0.17
671 0.16
672 0.11
673 0.12
674 0.08
675 0.09
676 0.11
677 0.12
678 0.14
679 0.13
680 0.15
681 0.16
682 0.17
683 0.19
684 0.24
685 0.24
686 0.25
687 0.25
688 0.24
689 0.22
690 0.21
691 0.19
692 0.12
693 0.16
694 0.18
695 0.22
696 0.25
697 0.26
698 0.28
699 0.31
700 0.31
701 0.26
702 0.22
703 0.18
704 0.15
705 0.15
706 0.12
707 0.08
708 0.07
709 0.07
710 0.06
711 0.05
712 0.03
713 0.03
714 0.04
715 0.04
716 0.05
717 0.04
718 0.04
719 0.04
720 0.04
721 0.04
722 0.04
723 0.05
724 0.05
725 0.05
726 0.06
727 0.07
728 0.07
729 0.07
730 0.07
731 0.07
732 0.07
733 0.08
734 0.07
735 0.09
736 0.09
737 0.09
738 0.11
739 0.1
740 0.11
741 0.09
742 0.1
743 0.08
744 0.08
745 0.08
746 0.07
747 0.07
748 0.08
749 0.08
750 0.08
751 0.08
752 0.09
753 0.12
754 0.12
755 0.12
756 0.11
757 0.12
758 0.12
759 0.11
760 0.15
761 0.12
762 0.13
763 0.15
764 0.14
765 0.15
766 0.15
767 0.14
768 0.11
769 0.1
770 0.09
771 0.07
772 0.09
773 0.08
774 0.09
775 0.1
776 0.15
777 0.16
778 0.16
779 0.21
780 0.21
781 0.26
782 0.25
783 0.25
784 0.21
785 0.23
786 0.27
787 0.28
788 0.33
789 0.32
790 0.33
791 0.39
792 0.41
793 0.44
794 0.5
795 0.54
796 0.5
797 0.5
798 0.53
799 0.48
800 0.46
801 0.41
802 0.32
803 0.25
804 0.22
805 0.19
806 0.14
807 0.14
808 0.14
809 0.12
810 0.12
811 0.11
812 0.16
813 0.17
814 0.21
815 0.25
816 0.33
817 0.41
818 0.47
819 0.53
820 0.52
821 0.53
822 0.58
823 0.58
824 0.54
825 0.47
826 0.41
827 0.35
828 0.31
829 0.29
830 0.21
831 0.17
832 0.14
833 0.12
834 0.12
835 0.11
836 0.11
837 0.09
838 0.09
839 0.08
840 0.07
841 0.07
842 0.08
843 0.09
844 0.09
845 0.09
846 0.09
847 0.09
848 0.09
849 0.08
850 0.06
851 0.05
852 0.05
853 0.05
854 0.05
855 0.05
856 0.05
857 0.05
858 0.06
859 0.06
860 0.06
861 0.07
862 0.07
863 0.07
864 0.1
865 0.13
866 0.14
867 0.22
868 0.26
869 0.26
870 0.27
871 0.28
872 0.33
873 0.3
874 0.3
875 0.22
876 0.2
877 0.19
878 0.18
879 0.17
880 0.11
881 0.11
882 0.11
883 0.12
884 0.14
885 0.17
886 0.17
887 0.17
888 0.17
889 0.17
890 0.15
891 0.16
892 0.14
893 0.12
894 0.12
895 0.11
896 0.11
897 0.14
898 0.15
899 0.13
900 0.13
901 0.12
902 0.12
903 0.15
904 0.14
905 0.11
906 0.11
907 0.13
908 0.12
909 0.12
910 0.12
911 0.1
912 0.09
913 0.09
914 0.08
915 0.07
916 0.07
917 0.1
918 0.1
919 0.11
920 0.1
921 0.12
922 0.13
923 0.14
924 0.15
925 0.13
926 0.16
927 0.17
928 0.23
929 0.25
930 0.28
931 0.32
932 0.37
933 0.42
934 0.43
935 0.45
936 0.43
937 0.45
938 0.44
939 0.4
940 0.37
941 0.33
942 0.37
943 0.33
944 0.29
945 0.23
946 0.2
947 0.19
948 0.18
949 0.18
950 0.12
951 0.16
952 0.2
953 0.25
954 0.28
955 0.36
956 0.36
957 0.36
958 0.41
959 0.4
960 0.43
961 0.47
962 0.49
963 0.46
964 0.47
965 0.44
966 0.4
967 0.36
968 0.29
969 0.21
970 0.22
971 0.19
972 0.16
973 0.16
974 0.15
975 0.15
976 0.17
977 0.18
978 0.15
979 0.18
980 0.22
981 0.27
982 0.37
983 0.43
984 0.45
985 0.51
986 0.55
987 0.55
988 0.56
989 0.52
990 0.47
991 0.42
992 0.39
993 0.34
994 0.31
995 0.26
996 0.25
997 0.27
998 0.25
999 0.26
1000 0.26
1001 0.29
1002 0.29
1003 0.3
1004 0.27
1005 0.24
1006 0.24
1007 0.24
1008 0.23
1009 0.18
1010 0.16
1011 0.15
1012 0.16
1013 0.19
1014 0.24
1015 0.23
1016 0.25
1017 0.27
1018 0.31
1019 0.36
1020 0.39
1021 0.42
1022 0.42
1023 0.44
1024 0.46
1025 0.48
1026 0.46
1027 0.42
1028 0.39
1029 0.33
1030 0.28
1031 0.24
1032 0.2
1033 0.16
1034 0.15
1035 0.13
1036 0.17
1037 0.21
1038 0.18
1039 0.21
1040 0.22
1041 0.28
1042 0.3
1043 0.38
1044 0.45
1045 0.43
1046 0.51
1047 0.52
1048 0.57
1049 0.53
1050 0.53
1051 0.44
1052 0.38
1053 0.4
1054 0.33
1055 0.3
1056 0.22
1057 0.21
1058 0.19
1059 0.2
1060 0.21
1061 0.19
1062 0.24
1063 0.28
1064 0.28