Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6A6YRM6

Protein Details
Accession A0A6A6YRM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
416-445STMKSSKRGTYFRKRRRWERVKRVVQETRAHydrophilic
588-609EARGTFRAGKKRKIQVEPEKGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
427-437FRKRRRWERVK
595-600AGKKRK
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 11, cyto 8.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSYIRPNTYIVLRLPSGILKLLEILPNTNISIGKFGTFQANSLLGRPYYLTFEILDKEGDSNSELRVVPAAELHESSLTTAEDDTPAESTDEPADGGAEFDIVGDNGEIIMQSNRLTIDDPSRQTLTMEEIEELKKAGTGSGKEVIARIMKSHQAIDEKTPFSLAKYTLRKSRKYLRRFTVFPADVNMLSEYVLDKEAHRIMELREENLGLINSWANIHCAESSSIVPSSCGKGMIGGGRWLVVDDTGGLLVASLAERMGLLYPEESEDEASGKEEEAIESKPTEESKSNGIPEEDAMVIDTPAEGTSETTKQEPPEAPKEANTTTSESNPSKPRTPRAAHIPPMSAQTNTLTIVHSNAQPNLGYLKYFSYDATASNPKHPLHTHLKTLTWLQMLYPEDDPGYQEPETLSDDLLSTMKSSKRGTYFRKRRRWERVKRVVQETRAGGFDGLVVASVMEPATVLRACVPLLKGGATVTVYSANVEPLVELCDYYSKERRTAFVSRQNIDTTEQSQDANDSTKALGPDEAIDPDFPVNPTLLLAPSLQTARARQYQVLPGRTHPLMTSRGGAEGFLFTATRVLPVAGRVEARGTFRAGKKRKIQVEPEKGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.26
4 0.24
5 0.22
6 0.2
7 0.15
8 0.17
9 0.18
10 0.2
11 0.19
12 0.2
13 0.18
14 0.2
15 0.2
16 0.19
17 0.18
18 0.15
19 0.18
20 0.16
21 0.16
22 0.15
23 0.16
24 0.22
25 0.21
26 0.21
27 0.21
28 0.24
29 0.23
30 0.24
31 0.27
32 0.19
33 0.19
34 0.2
35 0.18
36 0.19
37 0.2
38 0.19
39 0.17
40 0.19
41 0.21
42 0.2
43 0.19
44 0.15
45 0.15
46 0.14
47 0.14
48 0.14
49 0.13
50 0.12
51 0.16
52 0.15
53 0.15
54 0.16
55 0.16
56 0.14
57 0.15
58 0.16
59 0.13
60 0.14
61 0.14
62 0.13
63 0.13
64 0.13
65 0.13
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.1
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.06
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.11
105 0.12
106 0.18
107 0.24
108 0.26
109 0.3
110 0.3
111 0.3
112 0.29
113 0.28
114 0.25
115 0.21
116 0.19
117 0.16
118 0.17
119 0.18
120 0.18
121 0.17
122 0.12
123 0.11
124 0.1
125 0.12
126 0.13
127 0.14
128 0.17
129 0.21
130 0.22
131 0.21
132 0.21
133 0.22
134 0.21
135 0.2
136 0.18
137 0.17
138 0.2
139 0.21
140 0.22
141 0.23
142 0.24
143 0.26
144 0.3
145 0.34
146 0.31
147 0.29
148 0.3
149 0.27
150 0.23
151 0.25
152 0.21
153 0.24
154 0.3
155 0.34
156 0.41
157 0.48
158 0.51
159 0.54
160 0.63
161 0.64
162 0.66
163 0.71
164 0.72
165 0.73
166 0.71
167 0.7
168 0.7
169 0.61
170 0.52
171 0.45
172 0.38
173 0.3
174 0.29
175 0.24
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.09
180 0.07
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.12
185 0.14
186 0.14
187 0.14
188 0.14
189 0.14
190 0.22
191 0.23
192 0.2
193 0.19
194 0.18
195 0.18
196 0.18
197 0.17
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.07
208 0.08
209 0.09
210 0.1
211 0.1
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.13
218 0.11
219 0.11
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.12
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.09
230 0.08
231 0.06
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.09
271 0.1
272 0.12
273 0.11
274 0.12
275 0.15
276 0.18
277 0.19
278 0.18
279 0.18
280 0.16
281 0.15
282 0.15
283 0.1
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.04
295 0.06
296 0.07
297 0.08
298 0.1
299 0.11
300 0.11
301 0.15
302 0.17
303 0.2
304 0.24
305 0.26
306 0.25
307 0.26
308 0.29
309 0.26
310 0.26
311 0.23
312 0.2
313 0.18
314 0.19
315 0.22
316 0.2
317 0.24
318 0.28
319 0.3
320 0.34
321 0.36
322 0.41
323 0.45
324 0.46
325 0.46
326 0.5
327 0.53
328 0.52
329 0.51
330 0.46
331 0.38
332 0.4
333 0.36
334 0.26
335 0.2
336 0.15
337 0.14
338 0.13
339 0.13
340 0.09
341 0.08
342 0.1
343 0.11
344 0.13
345 0.14
346 0.13
347 0.14
348 0.13
349 0.14
350 0.14
351 0.12
352 0.09
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.1
357 0.09
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.14
362 0.2
363 0.2
364 0.24
365 0.28
366 0.26
367 0.29
368 0.3
369 0.32
370 0.35
371 0.37
372 0.4
373 0.37
374 0.38
375 0.36
376 0.37
377 0.33
378 0.24
379 0.21
380 0.15
381 0.18
382 0.18
383 0.19
384 0.17
385 0.14
386 0.14
387 0.14
388 0.16
389 0.12
390 0.14
391 0.11
392 0.11
393 0.11
394 0.13
395 0.15
396 0.14
397 0.13
398 0.09
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.09
403 0.07
404 0.1
405 0.12
406 0.16
407 0.17
408 0.22
409 0.28
410 0.36
411 0.45
412 0.53
413 0.62
414 0.69
415 0.78
416 0.82
417 0.86
418 0.89
419 0.91
420 0.91
421 0.91
422 0.91
423 0.91
424 0.89
425 0.88
426 0.84
427 0.76
428 0.71
429 0.62
430 0.52
431 0.43
432 0.36
433 0.26
434 0.19
435 0.16
436 0.1
437 0.07
438 0.05
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.07
451 0.08
452 0.09
453 0.11
454 0.12
455 0.12
456 0.13
457 0.13
458 0.12
459 0.11
460 0.13
461 0.11
462 0.1
463 0.09
464 0.1
465 0.09
466 0.1
467 0.1
468 0.09
469 0.09
470 0.09
471 0.08
472 0.07
473 0.09
474 0.08
475 0.07
476 0.07
477 0.11
478 0.13
479 0.19
480 0.26
481 0.26
482 0.31
483 0.33
484 0.35
485 0.37
486 0.43
487 0.46
488 0.48
489 0.53
490 0.51
491 0.52
492 0.52
493 0.47
494 0.43
495 0.37
496 0.3
497 0.26
498 0.25
499 0.22
500 0.2
501 0.2
502 0.19
503 0.19
504 0.16
505 0.14
506 0.13
507 0.16
508 0.16
509 0.16
510 0.15
511 0.13
512 0.15
513 0.15
514 0.16
515 0.14
516 0.14
517 0.14
518 0.14
519 0.15
520 0.14
521 0.13
522 0.11
523 0.1
524 0.11
525 0.11
526 0.1
527 0.1
528 0.1
529 0.1
530 0.12
531 0.13
532 0.14
533 0.16
534 0.18
535 0.23
536 0.29
537 0.32
538 0.32
539 0.36
540 0.43
541 0.49
542 0.53
543 0.49
544 0.45
545 0.49
546 0.46
547 0.42
548 0.34
549 0.31
550 0.28
551 0.28
552 0.29
553 0.23
554 0.25
555 0.24
556 0.23
557 0.19
558 0.16
559 0.14
560 0.11
561 0.11
562 0.08
563 0.1
564 0.1
565 0.1
566 0.1
567 0.1
568 0.1
569 0.12
570 0.15
571 0.16
572 0.17
573 0.16
574 0.19
575 0.21
576 0.24
577 0.24
578 0.25
579 0.31
580 0.37
581 0.47
582 0.52
583 0.58
584 0.64
585 0.72
586 0.78
587 0.79
588 0.83
589 0.83