FuNGI

A0A6A6YBT8

Protein Details

Accession

A0A6A6YBT8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
491-525	ITPRLPRNTRKAIVKKNNRARRERKKAERAEQASI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
484-519	KRERGPNITPRLPRNTRKAIVKKNNRARRERKKAER

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MEASSKGRNLAVTKDGAKYNKLTRPDDLSDLIPKATSAAPPMDSAKRKLDELNPANADTDEEPHSKRARPSELPPQEEYHLAVASTQQREAIINTRKSIKPKLGARNEKYGQAQGIGPGLDEWDDGDATDSSTNEAMQYLRSVRQEADAIPVLVTAPAPEILEGESDEAIYNDGVGDMRAIFRDGVCMAARSDSSLTPTETSDECRGLAVPDISPQEAYRAMLLKELGGLRDSFSGTPPLEALDRLRAASKTLTTFNRLNHASMTRWNPILRHTYPTPTQISQMSHRTTMHLIAALAECLKPNRNITPQLSCWIWGLFGRIGERGTLQADDDYTVRELGKAAVAIRLSHLGYDVHRPSLDLDESDELGEDGYEPAEGQDSEHDEHNSEPDEESSTSLKAEDQDASAGTETKGQSTISVKPLDHHPQANPSLLKCESGSEDGEIADDDPSTVVSSIETAKGNIPSTLTVESPNPETSPQVDAAPKRERGPNITPRLPRNTRKAIVKKNNRARRERKKAERAEQASIGTKHPSTGPHGSNRSSYDPDRFVSSNPQLGTRRSVSNTHMNSNDATRGRQQTRNTSSPEPSPDPSRTRRNTSSPELSPGPYRRLRRTSTPDKQTFPSRAEAERSRLIQNNGAIPQVDGAKEHDVHVVKGGDDAMDVVMEPEVDDGEVEKEQCKEVEEEVPNMNTLATLDMIITIVGERYGQRDLLDAREVWQHAVEV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.41
3	0.4
4	0.41
5	0.42
6	0.46
7	0.48
8	0.52
9	0.51
10	0.5
11	0.55
12	0.55
13	0.54
14	0.47
15	0.44
16	0.42
17	0.39
18	0.35
19	0.27
20	0.23
21	0.2
22	0.2
23	0.18
24	0.16
25	0.17
26	0.18
27	0.2
28	0.25
29	0.31
30	0.34
31	0.37
32	0.42
33	0.41
34	0.42
35	0.46
36	0.48
37	0.5
38	0.51
39	0.55
40	0.5
41	0.48
42	0.47
43	0.41
44	0.37
45	0.27
46	0.25
47	0.21
48	0.22
49	0.23
50	0.28
51	0.33
52	0.35
53	0.4
54	0.45
55	0.49
56	0.51
57	0.56
58	0.62
59	0.66
60	0.66
61	0.64
62	0.59
63	0.52
64	0.48
65	0.42
66	0.33
67	0.25
68	0.19
69	0.16
70	0.18
71	0.23
72	0.23
73	0.22
74	0.2
75	0.21
76	0.22
77	0.24
78	0.28
79	0.3
80	0.32
81	0.35
82	0.42
83	0.45
84	0.5
85	0.55
86	0.53
87	0.53
88	0.59
89	0.66
90	0.7
91	0.77
92	0.76
93	0.79
94	0.73
95	0.69
96	0.63
97	0.55
98	0.45
99	0.36
100	0.32
101	0.23
102	0.23
103	0.18
104	0.15
105	0.12
106	0.11
107	0.09
108	0.08
109	0.07
110	0.06
111	0.06
112	0.06
113	0.08
114	0.08
115	0.09
116	0.1
117	0.1
118	0.1
119	0.1
120	0.1
121	0.09
122	0.09
123	0.09
124	0.08
125	0.11
126	0.13
127	0.17
128	0.18
129	0.2
130	0.2
131	0.22
132	0.23
133	0.21
134	0.23
135	0.21
136	0.2
137	0.18
138	0.17
139	0.14
140	0.13
141	0.12
142	0.07
143	0.06
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.07
148	0.07
149	0.08
150	0.08
151	0.08
152	0.07
153	0.07
154	0.07
155	0.07
156	0.07
157	0.06
158	0.06
159	0.04
160	0.05
161	0.05
162	0.04
163	0.05
164	0.05
165	0.05
166	0.06
167	0.07
168	0.07
169	0.07
170	0.09
171	0.09
172	0.11
173	0.11
174	0.11
175	0.11
176	0.12
177	0.12
178	0.12
179	0.13
180	0.11
181	0.14
182	0.15
183	0.16
184	0.15
185	0.16
186	0.17
187	0.16
188	0.2
189	0.19
190	0.18
191	0.17
192	0.16
193	0.16
194	0.14
195	0.16
196	0.13
197	0.1
198	0.13
199	0.14
200	0.14
201	0.15
202	0.14
203	0.13
204	0.13
205	0.13
206	0.11
207	0.12
208	0.12
209	0.13
210	0.14
211	0.11
212	0.13
213	0.13
214	0.12
215	0.11
216	0.11
217	0.1
218	0.11
219	0.12
220	0.1
221	0.1
222	0.14
223	0.13
224	0.13
225	0.12
226	0.12
227	0.11
228	0.12
229	0.12
230	0.13
231	0.13
232	0.13
233	0.15
234	0.14
235	0.15
236	0.16
237	0.17
238	0.15
239	0.2
240	0.21
241	0.24
242	0.27
243	0.27
244	0.32
245	0.31
246	0.29
247	0.27
248	0.27
249	0.24
250	0.26
251	0.29
252	0.25
253	0.26
254	0.26
255	0.24
256	0.26
257	0.32
258	0.28
259	0.29
260	0.28
261	0.31
262	0.32
263	0.36
264	0.36
265	0.29
266	0.3
267	0.27
268	0.28
269	0.28
270	0.32
271	0.29
272	0.28
273	0.27
274	0.27
275	0.25
276	0.24
277	0.19
278	0.14
279	0.12
280	0.11
281	0.11
282	0.09
283	0.08
284	0.07
285	0.07
286	0.08
287	0.1
288	0.11
289	0.13
290	0.17
291	0.21
292	0.26
293	0.29
294	0.33
295	0.32
296	0.33
297	0.3
298	0.26
299	0.23
300	0.18
301	0.15
302	0.1
303	0.12
304	0.1
305	0.1
306	0.1
307	0.1
308	0.1
309	0.1
310	0.1
311	0.09
312	0.09
313	0.08
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.07
324	0.07
325	0.06
326	0.07
327	0.06
328	0.06
329	0.08
330	0.08
331	0.08
332	0.08
333	0.09
334	0.09
335	0.08
336	0.08
337	0.07
338	0.08
339	0.14
340	0.14
341	0.13
342	0.13
343	0.14
344	0.14
345	0.16
346	0.15
347	0.09
348	0.1
349	0.1
350	0.1
351	0.1
352	0.09
353	0.06
354	0.06
355	0.05
356	0.04
357	0.03
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.05
366	0.08
367	0.09
368	0.1
369	0.11
370	0.1
371	0.11
372	0.12
373	0.12
374	0.1
375	0.09
376	0.08
377	0.1
378	0.1
379	0.12
380	0.11
381	0.1
382	0.1
383	0.1
384	0.1
385	0.08
386	0.1
387	0.08
388	0.08
389	0.08
390	0.08
391	0.09
392	0.09
393	0.08
394	0.07
395	0.1
396	0.1
397	0.1
398	0.11
399	0.1
400	0.12
401	0.14
402	0.17
403	0.17
404	0.2
405	0.19
406	0.2
407	0.26
408	0.31
409	0.31
410	0.3
411	0.27
412	0.3
413	0.32
414	0.35
415	0.3
416	0.23
417	0.25
418	0.23
419	0.23
420	0.17
421	0.17
422	0.15
423	0.15
424	0.16
425	0.12
426	0.12
427	0.11
428	0.11
429	0.09
430	0.08
431	0.06
432	0.05
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.05
437	0.05
438	0.04
439	0.04
440	0.05
441	0.06
442	0.09
443	0.09
444	0.09
445	0.11
446	0.13
447	0.14
448	0.13
449	0.13
450	0.11
451	0.13
452	0.13
453	0.12
454	0.11
455	0.12
456	0.13
457	0.15
458	0.15
459	0.14
460	0.13
461	0.13
462	0.14
463	0.15
464	0.15
465	0.14
466	0.17
467	0.18
468	0.24
469	0.29
470	0.3
471	0.31
472	0.35
473	0.35
474	0.38
475	0.45
476	0.48
477	0.5
478	0.56
479	0.58
480	0.58
481	0.65
482	0.66
483	0.64
484	0.63
485	0.64
486	0.62
487	0.67
488	0.71
489	0.73
490	0.76
491	0.8
492	0.82
493	0.84
494	0.88
495	0.86
496	0.87
497	0.87
498	0.87
499	0.88
500	0.88
501	0.88
502	0.89
503	0.9
504	0.89
505	0.89
506	0.82
507	0.75
508	0.67
509	0.58
510	0.54
511	0.46
512	0.38
513	0.3
514	0.25
515	0.22
516	0.21
517	0.21
518	0.21
519	0.27
520	0.3
521	0.35
522	0.4
523	0.4
524	0.42
525	0.44
526	0.43
527	0.4
528	0.39
529	0.36
530	0.35
531	0.34
532	0.35
533	0.32
534	0.29
535	0.32
536	0.33
537	0.32
538	0.3
539	0.35
540	0.33
541	0.35
542	0.38
543	0.33
544	0.34
545	0.32
546	0.35
547	0.34
548	0.41
549	0.42
550	0.42
551	0.4
552	0.37
553	0.35
554	0.34
555	0.36
556	0.27
557	0.27
558	0.28
559	0.35
560	0.39
561	0.45
562	0.48
563	0.52
564	0.59
565	0.62
566	0.62
567	0.58
568	0.56
569	0.54
570	0.56
571	0.5
572	0.45
573	0.45
574	0.45
575	0.48
576	0.52
577	0.57
578	0.56
579	0.61
580	0.64
581	0.66
582	0.68
583	0.69
584	0.69
585	0.61
586	0.61
587	0.55
588	0.5
589	0.5
590	0.46
591	0.46
592	0.44
593	0.49
594	0.52
595	0.56
596	0.6
597	0.62
598	0.68
599	0.72
600	0.75
601	0.79
602	0.77
603	0.74
604	0.73
605	0.71
606	0.66
607	0.58
608	0.55
609	0.48
610	0.45
611	0.48
612	0.48
613	0.46
614	0.47
615	0.47
616	0.45
617	0.46
618	0.46
619	0.44
620	0.42
621	0.42
622	0.37
623	0.35
624	0.3
625	0.25
626	0.24
627	0.21
628	0.18
629	0.13
630	0.15
631	0.18
632	0.19
633	0.2
634	0.24
635	0.23
636	0.24
637	0.28
638	0.25
639	0.21
640	0.21
641	0.2
642	0.14
643	0.13
644	0.13
645	0.08
646	0.07
647	0.06
648	0.06
649	0.05
650	0.05
651	0.05
652	0.05
653	0.05
654	0.05
655	0.05
656	0.06
657	0.08
658	0.1
659	0.11
660	0.13
661	0.14
662	0.16
663	0.16
664	0.18
665	0.18
666	0.19
667	0.27
668	0.28
669	0.3
670	0.32
671	0.32
672	0.3
673	0.28
674	0.25
675	0.16
676	0.14
677	0.11
678	0.08
679	0.07
680	0.07
681	0.07
682	0.07
683	0.07
684	0.07
685	0.05
686	0.05
687	0.05
688	0.07
689	0.07
690	0.1
691	0.13
692	0.13
693	0.13
694	0.18
695	0.2
696	0.23
697	0.27
698	0.24
699	0.24
700	0.3
701	0.3
702	0.27

A0A6A6YBT8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer