Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4PAT8

Protein Details
Accession F4PAT8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
309-352VQPAKPKTIKSSSSKRKRDNKLESTLSTTPKKKSKNTNVAHTSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
318-326KSSSSKRKR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito_nucl 11.166, cyto_nucl 10.333, mito 8.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0005736  C:RNA polymerase I complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MVQKSLKHMEKVGALSAETKKGSLDAHTESKPSASEAVQSAFDSLMHSAAIHTITKEQSTPFLESPFVQIQAQVRICISPSFITTPLEGVKNYLNTFIMRYIAELDGVVLAYENVKLVTKNGHIMNESPFIFFNAQAKFTLFSPKVGSILYGVVNKVSPDHIGLLVYGVFNTSIPSSHICNKKFSWDAEGYAWKFESAIDHSTMFIATNSIIKFSVDSLITANKMLAISGSLTSHPTDTGVIDSTGLPMPTVLQPVEFGNDMTGVETVQPTHFVFNDEVDEPVEECIKDHDTPTHHEIDTKEQSIDISVQPAKPKTIKSSSSKRKRDNKLESTLSTTPKKKSKNTNVAHTSDDKLLNSAAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.31
3 0.31
4 0.31
5 0.27
6 0.25
7 0.21
8 0.22
9 0.22
10 0.2
11 0.22
12 0.23
13 0.29
14 0.3
15 0.31
16 0.3
17 0.3
18 0.28
19 0.24
20 0.21
21 0.15
22 0.18
23 0.19
24 0.2
25 0.2
26 0.2
27 0.19
28 0.16
29 0.16
30 0.13
31 0.11
32 0.09
33 0.08
34 0.08
35 0.07
36 0.09
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.13
41 0.15
42 0.16
43 0.17
44 0.16
45 0.2
46 0.23
47 0.27
48 0.24
49 0.24
50 0.24
51 0.24
52 0.28
53 0.25
54 0.24
55 0.19
56 0.2
57 0.21
58 0.27
59 0.28
60 0.23
61 0.21
62 0.2
63 0.21
64 0.19
65 0.18
66 0.12
67 0.13
68 0.15
69 0.16
70 0.17
71 0.16
72 0.17
73 0.18
74 0.18
75 0.16
76 0.15
77 0.17
78 0.18
79 0.19
80 0.18
81 0.17
82 0.16
83 0.17
84 0.16
85 0.15
86 0.12
87 0.12
88 0.13
89 0.12
90 0.11
91 0.09
92 0.09
93 0.07
94 0.07
95 0.06
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.05
103 0.05
104 0.06
105 0.1
106 0.11
107 0.16
108 0.17
109 0.19
110 0.19
111 0.21
112 0.23
113 0.23
114 0.23
115 0.18
116 0.17
117 0.17
118 0.17
119 0.16
120 0.17
121 0.14
122 0.15
123 0.15
124 0.15
125 0.15
126 0.14
127 0.22
128 0.17
129 0.18
130 0.19
131 0.19
132 0.19
133 0.18
134 0.18
135 0.1
136 0.11
137 0.11
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.07
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.07
163 0.09
164 0.16
165 0.23
166 0.24
167 0.27
168 0.28
169 0.32
170 0.33
171 0.31
172 0.3
173 0.25
174 0.25
175 0.24
176 0.29
177 0.24
178 0.22
179 0.21
180 0.15
181 0.14
182 0.12
183 0.12
184 0.09
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.1
192 0.07
193 0.06
194 0.05
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.11
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.07
218 0.06
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.1
233 0.09
234 0.08
235 0.07
236 0.08
237 0.09
238 0.11
239 0.09
240 0.08
241 0.09
242 0.1
243 0.12
244 0.1
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.09
257 0.09
258 0.11
259 0.11
260 0.13
261 0.13
262 0.14
263 0.16
264 0.15
265 0.15
266 0.14
267 0.14
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.09
272 0.09
273 0.12
274 0.14
275 0.15
276 0.16
277 0.2
278 0.22
279 0.28
280 0.32
281 0.34
282 0.31
283 0.34
284 0.34
285 0.38
286 0.41
287 0.37
288 0.33
289 0.28
290 0.28
291 0.26
292 0.27
293 0.18
294 0.18
295 0.19
296 0.21
297 0.26
298 0.28
299 0.32
300 0.33
301 0.37
302 0.39
303 0.45
304 0.5
305 0.53
306 0.62
307 0.68
308 0.75
309 0.82
310 0.84
311 0.86
312 0.89
313 0.91
314 0.91
315 0.89
316 0.87
317 0.84
318 0.76
319 0.74
320 0.69
321 0.64
322 0.61
323 0.58
324 0.57
325 0.58
326 0.64
327 0.65
328 0.71
329 0.76
330 0.78
331 0.81
332 0.83
333 0.83
334 0.78
335 0.74
336 0.66
337 0.59
338 0.53
339 0.49
340 0.38
341 0.32