Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4NZF1

Protein Details
Accession F4NZF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MQCMAIPKEKKGRLKKSISVQNYRLHydrophilic
499-526IYKFAARQYPNQKIHKLKKDVKSESIKAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 12, mito 4.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13812  PPR_3  
Amino Acid Sequences MQCMAIPKEKKGRLKKSISVQNYRLYYMMNVVFTKESSLLNSQFVKKAIANSTRPKTIFSLFRPATPTPTYSGLLKALKNQNFSRAYTLYLELQNNYPELLKSANATLYDDILGIINLPQKNVVSDPTIITRASRTNNVYRFMQKQKVDPKMSSFETITYVNSKTKNRIMLDNALEHIERLGLTEKMSIKARANFVYGYITIGDEAQGIHHFKKMCEISRNTFPYKVLIDAYAHTNQPERLFKIIDAMKRSDHTKPNIHCYFPALLCYYRKKDFAKMQELIDDYMAVDGTLCEPLLYAQLLISNHSETPQKGFDYLSDIRNTPFRNTSRVEQEEIICHALCNQTDDMWRQYADQSAHSIRAVNRLCSAMVKAIGSCAPSESSETSNDTLDAIKQKIKEHRIRPRAVYTDLLAGYTSQFDHASVKALIPALTTYQILSHKNIVSLILQSCDAAKDFAFEFQLFQDIIGNGHSVSFNHVVKLLRNCEQSDDPAHAKMVQDIYKFAARQYPNQKIHKLKKDVKSESIKADHSDSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.82
3 0.83
4 0.85
5 0.84
6 0.83
7 0.77
8 0.75
9 0.69
10 0.62
11 0.52
12 0.43
13 0.35
14 0.31
15 0.29
16 0.24
17 0.22
18 0.22
19 0.23
20 0.22
21 0.23
22 0.19
23 0.17
24 0.17
25 0.23
26 0.22
27 0.26
28 0.31
29 0.32
30 0.34
31 0.34
32 0.34
33 0.31
34 0.35
35 0.39
36 0.42
37 0.46
38 0.52
39 0.57
40 0.61
41 0.59
42 0.56
43 0.52
44 0.5
45 0.5
46 0.45
47 0.5
48 0.43
49 0.46
50 0.49
51 0.46
52 0.45
53 0.4
54 0.37
55 0.29
56 0.33
57 0.31
58 0.26
59 0.28
60 0.28
61 0.3
62 0.29
63 0.34
64 0.4
65 0.42
66 0.47
67 0.46
68 0.5
69 0.49
70 0.49
71 0.47
72 0.38
73 0.36
74 0.33
75 0.33
76 0.29
77 0.3
78 0.3
79 0.25
80 0.27
81 0.25
82 0.23
83 0.21
84 0.18
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.11
89 0.11
90 0.13
91 0.15
92 0.14
93 0.16
94 0.15
95 0.15
96 0.14
97 0.13
98 0.11
99 0.09
100 0.08
101 0.06
102 0.08
103 0.12
104 0.12
105 0.12
106 0.13
107 0.13
108 0.15
109 0.16
110 0.16
111 0.13
112 0.14
113 0.16
114 0.18
115 0.19
116 0.18
117 0.17
118 0.18
119 0.2
120 0.22
121 0.26
122 0.29
123 0.35
124 0.39
125 0.42
126 0.43
127 0.43
128 0.47
129 0.49
130 0.52
131 0.46
132 0.5
133 0.55
134 0.61
135 0.61
136 0.55
137 0.53
138 0.5
139 0.5
140 0.45
141 0.36
142 0.28
143 0.26
144 0.25
145 0.21
146 0.18
147 0.18
148 0.19
149 0.24
150 0.25
151 0.28
152 0.32
153 0.38
154 0.37
155 0.4
156 0.4
157 0.42
158 0.42
159 0.38
160 0.34
161 0.29
162 0.27
163 0.22
164 0.17
165 0.11
166 0.08
167 0.07
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.12
172 0.14
173 0.16
174 0.19
175 0.2
176 0.22
177 0.26
178 0.29
179 0.26
180 0.26
181 0.23
182 0.22
183 0.22
184 0.18
185 0.14
186 0.11
187 0.1
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.07
195 0.09
196 0.09
197 0.12
198 0.13
199 0.13
200 0.2
201 0.23
202 0.26
203 0.32
204 0.35
205 0.37
206 0.45
207 0.5
208 0.44
209 0.42
210 0.38
211 0.33
212 0.3
213 0.26
214 0.18
215 0.14
216 0.13
217 0.12
218 0.16
219 0.15
220 0.14
221 0.13
222 0.14
223 0.14
224 0.17
225 0.19
226 0.17
227 0.17
228 0.18
229 0.17
230 0.22
231 0.25
232 0.24
233 0.24
234 0.24
235 0.23
236 0.24
237 0.27
238 0.26
239 0.28
240 0.3
241 0.35
242 0.36
243 0.45
244 0.46
245 0.44
246 0.38
247 0.35
248 0.33
249 0.25
250 0.25
251 0.17
252 0.16
253 0.19
254 0.23
255 0.24
256 0.24
257 0.28
258 0.28
259 0.33
260 0.38
261 0.43
262 0.45
263 0.44
264 0.42
265 0.4
266 0.39
267 0.33
268 0.26
269 0.18
270 0.1
271 0.08
272 0.08
273 0.04
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.03
280 0.03
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.04
285 0.04
286 0.07
287 0.07
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.11
293 0.13
294 0.1
295 0.14
296 0.15
297 0.14
298 0.14
299 0.14
300 0.13
301 0.18
302 0.2
303 0.2
304 0.2
305 0.2
306 0.2
307 0.24
308 0.25
309 0.21
310 0.25
311 0.24
312 0.27
313 0.3
314 0.33
315 0.38
316 0.39
317 0.39
318 0.34
319 0.33
320 0.3
321 0.29
322 0.26
323 0.18
324 0.15
325 0.14
326 0.14
327 0.13
328 0.14
329 0.13
330 0.12
331 0.15
332 0.17
333 0.18
334 0.17
335 0.17
336 0.16
337 0.16
338 0.19
339 0.18
340 0.17
341 0.19
342 0.19
343 0.2
344 0.2
345 0.22
346 0.18
347 0.26
348 0.27
349 0.23
350 0.23
351 0.23
352 0.23
353 0.21
354 0.21
355 0.14
356 0.14
357 0.13
358 0.11
359 0.11
360 0.12
361 0.12
362 0.11
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.12
367 0.13
368 0.14
369 0.15
370 0.18
371 0.18
372 0.17
373 0.17
374 0.14
375 0.13
376 0.14
377 0.17
378 0.16
379 0.18
380 0.2
381 0.26
382 0.34
383 0.43
384 0.5
385 0.56
386 0.64
387 0.71
388 0.74
389 0.73
390 0.73
391 0.68
392 0.61
393 0.54
394 0.44
395 0.4
396 0.34
397 0.29
398 0.21
399 0.17
400 0.15
401 0.13
402 0.12
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.1
407 0.1
408 0.14
409 0.13
410 0.13
411 0.14
412 0.15
413 0.14
414 0.13
415 0.13
416 0.11
417 0.12
418 0.12
419 0.1
420 0.12
421 0.17
422 0.18
423 0.2
424 0.24
425 0.24
426 0.25
427 0.25
428 0.23
429 0.2
430 0.21
431 0.2
432 0.16
433 0.15
434 0.14
435 0.14
436 0.14
437 0.13
438 0.11
439 0.09
440 0.1
441 0.11
442 0.13
443 0.15
444 0.14
445 0.14
446 0.14
447 0.17
448 0.14
449 0.14
450 0.15
451 0.12
452 0.13
453 0.13
454 0.13
455 0.1
456 0.11
457 0.11
458 0.08
459 0.13
460 0.19
461 0.18
462 0.19
463 0.22
464 0.23
465 0.28
466 0.36
467 0.36
468 0.37
469 0.4
470 0.4
471 0.43
472 0.44
473 0.43
474 0.38
475 0.39
476 0.35
477 0.33
478 0.33
479 0.29
480 0.26
481 0.27
482 0.3
483 0.28
484 0.27
485 0.27
486 0.3
487 0.33
488 0.33
489 0.29
490 0.32
491 0.3
492 0.38
493 0.47
494 0.53
495 0.57
496 0.65
497 0.72
498 0.75
499 0.82
500 0.83
501 0.84
502 0.83
503 0.83
504 0.86
505 0.85
506 0.83
507 0.82
508 0.77
509 0.75
510 0.72
511 0.66
512 0.58