Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6A6YFQ1

Protein Details
Accession A0A6A6YFQ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-77AQIRHGIRSRPKAQKSLKDSIIRRQERRKAPYEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-71RSRPKAQKSLKDSIIRRQERR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12, nucl 11, cyto 11, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043519  NT_sf  
IPR007685  RelA_SpoT  
Gene Ontology GO:0015969  P:guanosine tetraphosphate metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF04607  RelA_SpoT  
CDD cd05399  NT_Rel-Spo_like  
Amino Acid Sequences MSGTQQEALSVIDSFVNNWPKEIETYEKLAKQAEAICTQKLEIAQIRHGIRSRPKAQKSLKDSIIRRQERRKAPYEDTDKIKHDLIDLAGVRIAITFPNDVDQVREMIETTFDPFLNPWDWKPPLENPLNDKLSDLESSIINRTGIKREAKRVVGEGGWPLGLKSIHFRCKLKTDDAQYRDYPGLAVEIQVATAFMYAWEDVYHDIVYKPYLGKITPEEERFIEILNGLAHTGELALKQLRQSLSLRAELEQMPFPTYSNFVNWLQESLPWTEKSNPKKELCNFDTLYYLLPLLELNTPGKLKLVIDSNQSEIMSSGDALYALLPPPKVRGDANSLVSLTERQQNLLLALMHKNTRYLAQISGTFDPINEVAVNQNSVEGAFGLYVSDDGTSTELFESWQETLERFVEPSYLSKYIRHYKMAFELACQGVMYHGSYGTWERDHLFEYNPELGAMVDILSCGCKKIFGLVEPESQNHAWHKFDWDRVWQEDEKAPLFDYGSLIKDGTVILLLGLLGNTLKDWSTKGRPDLPRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.19
3 0.27
4 0.26
5 0.26
6 0.27
7 0.26
8 0.29
9 0.31
10 0.31
11 0.27
12 0.33
13 0.39
14 0.4
15 0.4
16 0.39
17 0.36
18 0.33
19 0.34
20 0.32
21 0.33
22 0.32
23 0.32
24 0.31
25 0.31
26 0.29
27 0.25
28 0.26
29 0.25
30 0.26
31 0.28
32 0.35
33 0.36
34 0.39
35 0.41
36 0.43
37 0.46
38 0.53
39 0.58
40 0.62
41 0.67
42 0.71
43 0.78
44 0.8
45 0.79
46 0.79
47 0.77
48 0.76
49 0.73
50 0.73
51 0.75
52 0.73
53 0.73
54 0.74
55 0.76
56 0.77
57 0.81
58 0.8
59 0.77
60 0.75
61 0.77
62 0.75
63 0.72
64 0.68
65 0.66
66 0.61
67 0.56
68 0.51
69 0.41
70 0.35
71 0.3
72 0.24
73 0.25
74 0.22
75 0.2
76 0.18
77 0.17
78 0.16
79 0.13
80 0.13
81 0.07
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.1
86 0.11
87 0.11
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.11
94 0.1
95 0.12
96 0.1
97 0.12
98 0.13
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.15
103 0.17
104 0.18
105 0.17
106 0.22
107 0.24
108 0.25
109 0.29
110 0.3
111 0.35
112 0.4
113 0.42
114 0.41
115 0.48
116 0.48
117 0.44
118 0.4
119 0.33
120 0.29
121 0.26
122 0.21
123 0.13
124 0.12
125 0.13
126 0.15
127 0.15
128 0.13
129 0.14
130 0.16
131 0.19
132 0.24
133 0.31
134 0.34
135 0.41
136 0.47
137 0.48
138 0.48
139 0.45
140 0.42
141 0.35
142 0.31
143 0.24
144 0.18
145 0.15
146 0.13
147 0.11
148 0.11
149 0.1
150 0.09
151 0.15
152 0.21
153 0.29
154 0.34
155 0.35
156 0.36
157 0.43
158 0.47
159 0.46
160 0.45
161 0.46
162 0.5
163 0.53
164 0.54
165 0.47
166 0.46
167 0.41
168 0.34
169 0.26
170 0.17
171 0.15
172 0.1
173 0.1
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.03
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.13
202 0.17
203 0.2
204 0.2
205 0.21
206 0.2
207 0.22
208 0.2
209 0.18
210 0.14
211 0.1
212 0.1
213 0.08
214 0.08
215 0.05
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.11
227 0.11
228 0.13
229 0.14
230 0.18
231 0.21
232 0.23
233 0.23
234 0.2
235 0.22
236 0.21
237 0.21
238 0.17
239 0.15
240 0.14
241 0.13
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.09
247 0.12
248 0.11
249 0.13
250 0.13
251 0.13
252 0.12
253 0.12
254 0.13
255 0.12
256 0.14
257 0.13
258 0.15
259 0.19
260 0.26
261 0.32
262 0.38
263 0.42
264 0.42
265 0.49
266 0.52
267 0.56
268 0.52
269 0.51
270 0.44
271 0.38
272 0.37
273 0.3
274 0.26
275 0.17
276 0.14
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.08
290 0.09
291 0.13
292 0.14
293 0.17
294 0.19
295 0.2
296 0.2
297 0.2
298 0.17
299 0.13
300 0.12
301 0.08
302 0.07
303 0.06
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.09
314 0.11
315 0.12
316 0.12
317 0.14
318 0.2
319 0.24
320 0.27
321 0.25
322 0.24
323 0.23
324 0.23
325 0.21
326 0.15
327 0.17
328 0.14
329 0.14
330 0.15
331 0.15
332 0.15
333 0.16
334 0.15
335 0.11
336 0.13
337 0.14
338 0.15
339 0.14
340 0.15
341 0.14
342 0.15
343 0.16
344 0.15
345 0.15
346 0.16
347 0.18
348 0.21
349 0.22
350 0.21
351 0.18
352 0.16
353 0.17
354 0.14
355 0.13
356 0.09
357 0.08
358 0.09
359 0.1
360 0.11
361 0.09
362 0.09
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.05
367 0.05
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.06
382 0.07
383 0.07
384 0.09
385 0.08
386 0.1
387 0.1
388 0.1
389 0.13
390 0.13
391 0.14
392 0.12
393 0.12
394 0.11
395 0.11
396 0.14
397 0.17
398 0.2
399 0.2
400 0.22
401 0.3
402 0.38
403 0.41
404 0.44
405 0.41
406 0.41
407 0.46
408 0.51
409 0.43
410 0.35
411 0.36
412 0.31
413 0.3
414 0.25
415 0.19
416 0.12
417 0.13
418 0.12
419 0.08
420 0.07
421 0.07
422 0.09
423 0.11
424 0.14
425 0.13
426 0.14
427 0.15
428 0.16
429 0.19
430 0.19
431 0.19
432 0.18
433 0.22
434 0.23
435 0.22
436 0.2
437 0.18
438 0.16
439 0.14
440 0.12
441 0.07
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.06
446 0.07
447 0.08
448 0.07
449 0.08
450 0.08
451 0.15
452 0.19
453 0.2
454 0.27
455 0.29
456 0.36
457 0.37
458 0.39
459 0.37
460 0.34
461 0.34
462 0.32
463 0.32
464 0.28
465 0.27
466 0.34
467 0.34
468 0.4
469 0.42
470 0.45
471 0.47
472 0.48
473 0.53
474 0.47
475 0.46
476 0.44
477 0.44
478 0.38
479 0.33
480 0.31
481 0.26
482 0.25
483 0.22
484 0.19
485 0.17
486 0.17
487 0.17
488 0.16
489 0.15
490 0.14
491 0.13
492 0.12
493 0.09
494 0.07
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.06
505 0.07
506 0.08
507 0.11
508 0.19
509 0.27
510 0.34
511 0.41
512 0.5