Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6A6YMK0

Protein Details
Accession A0A6A6YMK0    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
57-91PRDMRRRTASHNPRRVPQRLRNRIRKEMKDDNTPVHydrophilic
109-138RKDGIKQAKAKAKARKKKKKDDDGVVVTKLBasic
161-204KETLLKSLQTRKPKAKRSTTLATPPKPPAQFRKRQIHKSWLPTHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
60-83MRRRTASHNPRRVPQRLRNRIRKE
108-128LRKDGIKQAKAKAKARKKKKK
170-189TRKPKAKRSTTLATPPKPPA
192-193RK
Subcellular Location(s) nucl 9, mito 8, cyto 6, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MWAPPSVVSIPTSKAFPNDEVNVARFVKAREVEVRALEEGIRSAKKSQMRRAFQDVPRDMRRRTASHNPRRVPQRLRNRIRKEMKDDNTPVASGKSGSGVGKGTTAWLRKDGIKQAKAKAKARKKKKKDDDGVVVTKLDEKNEDMDVDVEEGKEKKDLRLKETLLKSLQTRKPKAKRSTTLATPPKPPAQFRKRQIHKSWLPTHLFHTKRAHMTPPVEPLWRFAVPLTPTQKSYRPTHRASTLRGAVAWDMSYMATIALEGVEKSISGLLKAIGVGADHDGELWKDGGFGKKWRTGTRIWEGWVFEREGWPLKPIAPVVVVWSSEGKSDIDATDPTSKVSKTPSKRKVFIRIHPAGFLQLWQEVTRLAKVQKPSVSVEDLRFEIGSIEISGPGATETLQTALWPTQAPNSEQYPPDSPQAVWKILSSCINPGSLPNNTLLAFNISDPRLHHPPRPREATEPAASLALLNQVISAWPLDKTLSPPALFDRNARLAAQRCLPSQQSINRRKGAAKPGQYPEPRPTDPQIPVLLYPSRISGSWTVILPWKCVMPVWAAIMYHPLSTGSTPRFGGLKEIRQIAFEGSRTWYPGDYLGTAAGWDWELQERAVREKEWSKRPKGNRVAWESIDLGNNRKGEIGRGWACDWERLLLGPPTPPESRASKSTKLSLPPFQHLSSPIISDLLSSNPPCALRDITTSPTLFTAGIKLLTRGVPVPCARIYRLPTNNAELRAKWLSLVPTSSVLYKSKSKANRPPQALSKDVPLHLRRRALAAGLLAPVVVEKEIPQPGDKEYPTVPDEPDLIGFITTGNFNLGEGRGTAVANLLADRVLVANAENKVRNGKVQEKFLCIVREAGQGFGRLARWEVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.26
3 0.28
4 0.32
5 0.32
6 0.35
7 0.36
8 0.37
9 0.38
10 0.35
11 0.33
12 0.3
13 0.28
14 0.31
15 0.29
16 0.32
17 0.33
18 0.37
19 0.39
20 0.39
21 0.4
22 0.33
23 0.32
24 0.28
25 0.22
26 0.2
27 0.22
28 0.21
29 0.2
30 0.22
31 0.27
32 0.35
33 0.43
34 0.51
35 0.56
36 0.62
37 0.67
38 0.73
39 0.77
40 0.74
41 0.76
42 0.72
43 0.7
44 0.72
45 0.71
46 0.63
47 0.62
48 0.64
49 0.58
50 0.59
51 0.62
52 0.64
53 0.69
54 0.78
55 0.74
56 0.76
57 0.81
58 0.81
59 0.8
60 0.79
61 0.8
62 0.8
63 0.86
64 0.88
65 0.88
66 0.9
67 0.9
68 0.89
69 0.86
70 0.86
71 0.81
72 0.8
73 0.76
74 0.71
75 0.62
76 0.54
77 0.46
78 0.36
79 0.31
80 0.22
81 0.18
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.15
86 0.15
87 0.15
88 0.15
89 0.14
90 0.15
91 0.19
92 0.22
93 0.22
94 0.24
95 0.26
96 0.3
97 0.37
98 0.43
99 0.47
100 0.51
101 0.55
102 0.61
103 0.67
104 0.71
105 0.72
106 0.73
107 0.74
108 0.77
109 0.83
110 0.85
111 0.87
112 0.9
113 0.93
114 0.94
115 0.93
116 0.92
117 0.91
118 0.89
119 0.83
120 0.73
121 0.62
122 0.51
123 0.47
124 0.38
125 0.29
126 0.21
127 0.18
128 0.19
129 0.2
130 0.2
131 0.15
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.13
136 0.11
137 0.12
138 0.13
139 0.13
140 0.16
141 0.17
142 0.21
143 0.28
144 0.33
145 0.36
146 0.44
147 0.47
148 0.51
149 0.54
150 0.54
151 0.49
152 0.48
153 0.47
154 0.48
155 0.51
156 0.53
157 0.56
158 0.61
159 0.68
160 0.76
161 0.81
162 0.81
163 0.82
164 0.8
165 0.8
166 0.76
167 0.77
168 0.76
169 0.7
170 0.65
171 0.63
172 0.62
173 0.58
174 0.56
175 0.57
176 0.58
177 0.63
178 0.67
179 0.73
180 0.75
181 0.81
182 0.83
183 0.83
184 0.8
185 0.8
186 0.79
187 0.76
188 0.71
189 0.62
190 0.61
191 0.59
192 0.53
193 0.5
194 0.49
195 0.47
196 0.48
197 0.5
198 0.49
199 0.46
200 0.48
201 0.45
202 0.44
203 0.41
204 0.39
205 0.36
206 0.34
207 0.32
208 0.29
209 0.26
210 0.2
211 0.23
212 0.21
213 0.28
214 0.31
215 0.27
216 0.3
217 0.33
218 0.38
219 0.37
220 0.43
221 0.47
222 0.49
223 0.52
224 0.55
225 0.6
226 0.59
227 0.59
228 0.6
229 0.53
230 0.46
231 0.41
232 0.36
233 0.28
234 0.24
235 0.19
236 0.11
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.03
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.06
271 0.05
272 0.06
273 0.08
274 0.12
275 0.14
276 0.18
277 0.23
278 0.28
279 0.31
280 0.34
281 0.36
282 0.35
283 0.41
284 0.44
285 0.42
286 0.38
287 0.38
288 0.36
289 0.34
290 0.33
291 0.27
292 0.19
293 0.18
294 0.17
295 0.18
296 0.17
297 0.16
298 0.14
299 0.14
300 0.16
301 0.15
302 0.14
303 0.11
304 0.11
305 0.12
306 0.13
307 0.11
308 0.1
309 0.12
310 0.11
311 0.1
312 0.11
313 0.09
314 0.08
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.11
320 0.15
321 0.15
322 0.15
323 0.16
324 0.16
325 0.16
326 0.22
327 0.28
328 0.32
329 0.43
330 0.53
331 0.58
332 0.65
333 0.69
334 0.73
335 0.72
336 0.7
337 0.69
338 0.65
339 0.58
340 0.53
341 0.48
342 0.38
343 0.31
344 0.24
345 0.15
346 0.1
347 0.1
348 0.09
349 0.09
350 0.08
351 0.09
352 0.1
353 0.11
354 0.11
355 0.14
356 0.16
357 0.21
358 0.22
359 0.24
360 0.25
361 0.25
362 0.27
363 0.26
364 0.25
365 0.22
366 0.2
367 0.18
368 0.15
369 0.13
370 0.1
371 0.08
372 0.07
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.1
393 0.11
394 0.13
395 0.15
396 0.17
397 0.19
398 0.19
399 0.21
400 0.21
401 0.21
402 0.22
403 0.2
404 0.18
405 0.21
406 0.23
407 0.22
408 0.19
409 0.18
410 0.17
411 0.17
412 0.2
413 0.14
414 0.13
415 0.13
416 0.13
417 0.12
418 0.12
419 0.13
420 0.12
421 0.12
422 0.11
423 0.11
424 0.11
425 0.12
426 0.11
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.11
431 0.1
432 0.1
433 0.11
434 0.16
435 0.22
436 0.23
437 0.28
438 0.35
439 0.43
440 0.49
441 0.54
442 0.51
443 0.48
444 0.51
445 0.51
446 0.43
447 0.36
448 0.29
449 0.23
450 0.21
451 0.16
452 0.12
453 0.08
454 0.06
455 0.05
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.05
460 0.05
461 0.04
462 0.04
463 0.05
464 0.06
465 0.06
466 0.09
467 0.12
468 0.15
469 0.14
470 0.15
471 0.17
472 0.21
473 0.21
474 0.2
475 0.21
476 0.21
477 0.22
478 0.22
479 0.23
480 0.22
481 0.23
482 0.27
483 0.24
484 0.22
485 0.24
486 0.24
487 0.22
488 0.24
489 0.29
490 0.35
491 0.41
492 0.47
493 0.47
494 0.48
495 0.49
496 0.5
497 0.53
498 0.5
499 0.47
500 0.48
501 0.49
502 0.56
503 0.55
504 0.53
505 0.49
506 0.48
507 0.43
508 0.4
509 0.39
510 0.37
511 0.36
512 0.36
513 0.32
514 0.26
515 0.25
516 0.24
517 0.22
518 0.17
519 0.15
520 0.13
521 0.12
522 0.11
523 0.13
524 0.12
525 0.13
526 0.14
527 0.14
528 0.14
529 0.18
530 0.19
531 0.18
532 0.17
533 0.14
534 0.13
535 0.13
536 0.13
537 0.09
538 0.1
539 0.11
540 0.12
541 0.11
542 0.11
543 0.15
544 0.14
545 0.12
546 0.1
547 0.09
548 0.08
549 0.09
550 0.13
551 0.12
552 0.13
553 0.14
554 0.15
555 0.15
556 0.15
557 0.22
558 0.22
559 0.26
560 0.28
561 0.32
562 0.31
563 0.31
564 0.31
565 0.26
566 0.23
567 0.18
568 0.16
569 0.15
570 0.15
571 0.16
572 0.16
573 0.14
574 0.12
575 0.14
576 0.14
577 0.11
578 0.11
579 0.1
580 0.09
581 0.09
582 0.08
583 0.07
584 0.05
585 0.05
586 0.05
587 0.07
588 0.08
589 0.08
590 0.1
591 0.11
592 0.15
593 0.17
594 0.17
595 0.2
596 0.27
597 0.35
598 0.43
599 0.51
600 0.54
601 0.61
602 0.69
603 0.75
604 0.77
605 0.77
606 0.75
607 0.75
608 0.72
609 0.64
610 0.59
611 0.5
612 0.42
613 0.38
614 0.3
615 0.26
616 0.25
617 0.24
618 0.22
619 0.22
620 0.2
621 0.19
622 0.2
623 0.25
624 0.23
625 0.26
626 0.26
627 0.28
628 0.29
629 0.28
630 0.27
631 0.2
632 0.17
633 0.14
634 0.17
635 0.15
636 0.15
637 0.15
638 0.16
639 0.19
640 0.2
641 0.2
642 0.21
643 0.24
644 0.27
645 0.32
646 0.37
647 0.39
648 0.42
649 0.47
650 0.48
651 0.5
652 0.52
653 0.52
654 0.51
655 0.5
656 0.51
657 0.45
658 0.42
659 0.38
660 0.36
661 0.29
662 0.26
663 0.2
664 0.17
665 0.15
666 0.14
667 0.13
668 0.12
669 0.14
670 0.13
671 0.13
672 0.15
673 0.16
674 0.16
675 0.18
676 0.17
677 0.16
678 0.21
679 0.24
680 0.25
681 0.29
682 0.28
683 0.26
684 0.24
685 0.23
686 0.18
687 0.15
688 0.13
689 0.11
690 0.13
691 0.13
692 0.13
693 0.15
694 0.15
695 0.16
696 0.17
697 0.17
698 0.2
699 0.21
700 0.24
701 0.25
702 0.28
703 0.29
704 0.32
705 0.36
706 0.4
707 0.45
708 0.46
709 0.47
710 0.51
711 0.52
712 0.51
713 0.48
714 0.39
715 0.4
716 0.37
717 0.34
718 0.27
719 0.26
720 0.24
721 0.23
722 0.24
723 0.19
724 0.19
725 0.2
726 0.21
727 0.22
728 0.21
729 0.23
730 0.28
731 0.29
732 0.35
733 0.43
734 0.51
735 0.58
736 0.67
737 0.73
738 0.73
739 0.77
740 0.77
741 0.75
742 0.69
743 0.6
744 0.58
745 0.53
746 0.49
747 0.5
748 0.47
749 0.48
750 0.5
751 0.53
752 0.46
753 0.45
754 0.44
755 0.37
756 0.34
757 0.29
758 0.24
759 0.2
760 0.19
761 0.14
762 0.12
763 0.11
764 0.09
765 0.07
766 0.05
767 0.06
768 0.12
769 0.15
770 0.17
771 0.19
772 0.2
773 0.24
774 0.31
775 0.3
776 0.29
777 0.27
778 0.31
779 0.32
780 0.33
781 0.3
782 0.25
783 0.26
784 0.23
785 0.22
786 0.18
787 0.15
788 0.13
789 0.11
790 0.1
791 0.09
792 0.08
793 0.08
794 0.08
795 0.08
796 0.08
797 0.1
798 0.1
799 0.1
800 0.1
801 0.12
802 0.12
803 0.12
804 0.12
805 0.11
806 0.11
807 0.1
808 0.1
809 0.08
810 0.07
811 0.07
812 0.07
813 0.07
814 0.06
815 0.06
816 0.07
817 0.12
818 0.15
819 0.2
820 0.22
821 0.23
822 0.29
823 0.31
824 0.35
825 0.38
826 0.45
827 0.46
828 0.54
829 0.57
830 0.57
831 0.58
832 0.57
833 0.53
834 0.44
835 0.41
836 0.34
837 0.37
838 0.31
839 0.33
840 0.29
841 0.27
842 0.27
843 0.26
844 0.25
845 0.19