Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6A6YVM2

Protein Details
Accession A0A6A6YVM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-43SATSPQPQVSKRDKRRNMLSDKLQEMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
561-574AGSGRGRRGGRRGG
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 6.5, cyto_mito 5.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MARIRSVSPADGFPLGHSATSPQPQVSKRDKRRNMLSDKLQEMVASFADNRDTHYKAQLAAVQADMNLIMRADPYANKPLEDGGEEAAELIQTILGNHTRPAPSAETDYVAQVGSYYSRFVEAVNDAMEERDYNLTMLWNKHQSARLEHENTHQYKVRVAEEEHRLLAATVRERLTQSITARRARLLREKEQLDLADSNALLLHPNQFSITNPASPGGVQSNRKTRHTRHRIDPDDLAGAAAANENKKKRKLFEAEDNGSPGPSGRNADLGTNSPFRDAKARTIHTQFEAPAYSIERLFTEKELAMSMNNAAIAAAHFFAKMKNADNTTSQDPTTNGTNGVSHENGSDNEVNSNEIDHDSDSPPGPPDMLRTMSQSHHATRGATRSALGDLASLATRSYPFTAAQPIILPANIGSKPNAAAPSPAPLQAQDAEQDFMIIFRDAPANDALNEKLLADAVAPLRTREYQYQPPGWQPPVPEITTNIRTVAPHLEVGIGGTSSGIGGVPMSAQSSMGGYSEIGGGVAMNRFGEGSSLGGVGMRRTASGAGYSEIGEESGPVRGAGSGRGRRGGRRGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.19
3 0.17
4 0.16
5 0.16
6 0.2
7 0.24
8 0.25
9 0.24
10 0.3
11 0.34
12 0.43
13 0.5
14 0.56
15 0.62
16 0.72
17 0.78
18 0.81
19 0.88
20 0.89
21 0.87
22 0.86
23 0.85
24 0.82
25 0.75
26 0.67
27 0.56
28 0.46
29 0.38
30 0.3
31 0.2
32 0.14
33 0.12
34 0.11
35 0.16
36 0.16
37 0.2
38 0.23
39 0.26
40 0.26
41 0.31
42 0.32
43 0.29
44 0.32
45 0.31
46 0.29
47 0.27
48 0.25
49 0.2
50 0.18
51 0.17
52 0.14
53 0.11
54 0.08
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.09
60 0.11
61 0.15
62 0.23
63 0.24
64 0.24
65 0.24
66 0.25
67 0.25
68 0.24
69 0.2
70 0.14
71 0.13
72 0.13
73 0.12
74 0.1
75 0.08
76 0.07
77 0.05
78 0.05
79 0.04
80 0.05
81 0.08
82 0.1
83 0.11
84 0.12
85 0.17
86 0.17
87 0.18
88 0.21
89 0.22
90 0.22
91 0.26
92 0.27
93 0.24
94 0.24
95 0.24
96 0.2
97 0.17
98 0.14
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.12
109 0.11
110 0.13
111 0.12
112 0.13
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.09
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.12
123 0.15
124 0.17
125 0.21
126 0.24
127 0.25
128 0.3
129 0.35
130 0.35
131 0.37
132 0.42
133 0.46
134 0.44
135 0.45
136 0.47
137 0.51
138 0.5
139 0.49
140 0.46
141 0.37
142 0.37
143 0.38
144 0.35
145 0.29
146 0.29
147 0.32
148 0.34
149 0.36
150 0.33
151 0.3
152 0.27
153 0.23
154 0.23
155 0.19
156 0.15
157 0.16
158 0.17
159 0.19
160 0.2
161 0.21
162 0.21
163 0.23
164 0.24
165 0.29
166 0.33
167 0.37
168 0.37
169 0.39
170 0.39
171 0.39
172 0.45
173 0.44
174 0.46
175 0.49
176 0.5
177 0.48
178 0.47
179 0.42
180 0.35
181 0.29
182 0.22
183 0.15
184 0.13
185 0.12
186 0.1
187 0.09
188 0.07
189 0.07
190 0.1
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.11
196 0.16
197 0.17
198 0.14
199 0.15
200 0.15
201 0.14
202 0.14
203 0.14
204 0.13
205 0.17
206 0.2
207 0.24
208 0.33
209 0.36
210 0.42
211 0.47
212 0.5
213 0.56
214 0.63
215 0.66
216 0.67
217 0.74
218 0.73
219 0.71
220 0.65
221 0.55
222 0.46
223 0.38
224 0.28
225 0.17
226 0.12
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.11
232 0.16
233 0.21
234 0.27
235 0.29
236 0.31
237 0.39
238 0.45
239 0.47
240 0.53
241 0.58
242 0.56
243 0.53
244 0.52
245 0.44
246 0.36
247 0.29
248 0.19
249 0.1
250 0.08
251 0.09
252 0.07
253 0.1
254 0.1
255 0.11
256 0.12
257 0.13
258 0.15
259 0.16
260 0.16
261 0.15
262 0.15
263 0.15
264 0.2
265 0.19
266 0.23
267 0.28
268 0.3
269 0.33
270 0.36
271 0.37
272 0.32
273 0.32
274 0.25
275 0.19
276 0.17
277 0.13
278 0.11
279 0.11
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.05
306 0.05
307 0.08
308 0.09
309 0.11
310 0.14
311 0.16
312 0.18
313 0.2
314 0.24
315 0.24
316 0.24
317 0.22
318 0.2
319 0.18
320 0.19
321 0.19
322 0.15
323 0.13
324 0.12
325 0.12
326 0.12
327 0.15
328 0.13
329 0.11
330 0.11
331 0.12
332 0.11
333 0.14
334 0.14
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.13
339 0.11
340 0.11
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.1
346 0.1
347 0.11
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.11
352 0.11
353 0.09
354 0.11
355 0.13
356 0.15
357 0.15
358 0.17
359 0.2
360 0.2
361 0.25
362 0.26
363 0.24
364 0.25
365 0.25
366 0.24
367 0.24
368 0.28
369 0.24
370 0.21
371 0.2
372 0.17
373 0.17
374 0.16
375 0.13
376 0.09
377 0.07
378 0.08
379 0.07
380 0.06
381 0.05
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.11
389 0.16
390 0.16
391 0.16
392 0.15
393 0.15
394 0.14
395 0.13
396 0.12
397 0.07
398 0.12
399 0.12
400 0.12
401 0.12
402 0.13
403 0.13
404 0.16
405 0.17
406 0.13
407 0.14
408 0.14
409 0.18
410 0.19
411 0.2
412 0.17
413 0.16
414 0.18
415 0.17
416 0.17
417 0.14
418 0.15
419 0.14
420 0.13
421 0.13
422 0.1
423 0.09
424 0.1
425 0.08
426 0.06
427 0.07
428 0.1
429 0.09
430 0.11
431 0.13
432 0.13
433 0.13
434 0.15
435 0.14
436 0.13
437 0.13
438 0.11
439 0.1
440 0.09
441 0.08
442 0.06
443 0.09
444 0.09
445 0.12
446 0.13
447 0.13
448 0.16
449 0.18
450 0.22
451 0.25
452 0.31
453 0.36
454 0.43
455 0.49
456 0.49
457 0.54
458 0.56
459 0.53
460 0.48
461 0.4
462 0.39
463 0.38
464 0.37
465 0.31
466 0.29
467 0.34
468 0.35
469 0.35
470 0.3
471 0.26
472 0.24
473 0.26
474 0.27
475 0.21
476 0.18
477 0.17
478 0.16
479 0.15
480 0.15
481 0.14
482 0.09
483 0.06
484 0.06
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.04
489 0.03
490 0.03
491 0.03
492 0.04
493 0.04
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.08
502 0.06
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.06
507 0.06
508 0.05
509 0.06
510 0.08
511 0.07
512 0.07
513 0.07
514 0.07
515 0.07
516 0.08
517 0.07
518 0.07
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.09
523 0.1
524 0.1
525 0.12
526 0.11
527 0.1
528 0.12
529 0.13
530 0.12
531 0.14
532 0.15
533 0.14
534 0.15
535 0.15
536 0.14
537 0.14
538 0.13
539 0.1
540 0.09
541 0.08
542 0.1
543 0.1
544 0.09
545 0.09
546 0.11
547 0.12
548 0.18
549 0.27
550 0.31
551 0.35
552 0.42
553 0.45
554 0.49