Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6A6YYR0

Protein Details
Accession A0A6A6YYR0    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-42SENSAGNKRARDKKQWRTPRKEGMSSRGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-36KKRKAAPGSENSAGNKRARDKKQWRTPRKE
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004114  THUMP_dom  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF02926  THUMP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51165  THUMP  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MADTSSKKRKAAPGSENSAGNKRARDKKQWRTPRKEGMSSRGIEPGDVGIWVTCDMKKQSKCAAECRDLFEEYAAKLYEAAAAESGDAEDGEADIEAEIQQELEAIRKPSAEPLFTQIRIETECLVFFKTRPPIEPVSFVHAICEDAANRAGQKQTRFIRRLTPMTAIGKATEKGIDEIAAEVLKPHFHTPGARSKKFAIRPTLRNNKTDRLALIKRVAEAVGPGHPVDLSSPDVTILVEVYQNVCGMSVVGSDYEQLKRYNIAEIYEPTGKKQSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.72
3 0.69
4 0.64
5 0.6
6 0.54
7 0.47
8 0.44
9 0.46
10 0.52
11 0.56
12 0.63
13 0.68
14 0.75
15 0.83
16 0.88
17 0.89
18 0.89
19 0.91
20 0.91
21 0.89
22 0.87
23 0.81
24 0.78
25 0.74
26 0.66
27 0.59
28 0.53
29 0.44
30 0.35
31 0.29
32 0.23
33 0.16
34 0.13
35 0.12
36 0.06
37 0.07
38 0.08
39 0.09
40 0.08
41 0.12
42 0.17
43 0.25
44 0.27
45 0.32
46 0.38
47 0.44
48 0.47
49 0.53
50 0.56
51 0.55
52 0.54
53 0.55
54 0.51
55 0.44
56 0.41
57 0.33
58 0.27
59 0.2
60 0.2
61 0.15
62 0.11
63 0.11
64 0.1
65 0.11
66 0.1
67 0.1
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.03
81 0.03
82 0.03
83 0.03
84 0.04
85 0.04
86 0.03
87 0.03
88 0.04
89 0.04
90 0.05
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.1
95 0.1
96 0.16
97 0.18
98 0.17
99 0.16
100 0.19
101 0.23
102 0.23
103 0.23
104 0.17
105 0.17
106 0.17
107 0.17
108 0.13
109 0.09
110 0.1
111 0.1
112 0.11
113 0.1
114 0.09
115 0.13
116 0.18
117 0.18
118 0.2
119 0.23
120 0.26
121 0.27
122 0.31
123 0.27
124 0.27
125 0.27
126 0.25
127 0.22
128 0.17
129 0.16
130 0.13
131 0.12
132 0.07
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.1
139 0.13
140 0.14
141 0.21
142 0.27
143 0.35
144 0.37
145 0.37
146 0.42
147 0.45
148 0.47
149 0.42
150 0.38
151 0.34
152 0.34
153 0.34
154 0.27
155 0.22
156 0.2
157 0.18
158 0.16
159 0.13
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.1
176 0.14
177 0.17
178 0.27
179 0.36
180 0.36
181 0.38
182 0.41
183 0.49
184 0.53
185 0.55
186 0.54
187 0.53
188 0.6
189 0.68
190 0.74
191 0.7
192 0.68
193 0.67
194 0.64
195 0.59
196 0.54
197 0.45
198 0.43
199 0.43
200 0.42
201 0.43
202 0.37
203 0.34
204 0.32
205 0.3
206 0.22
207 0.2
208 0.16
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.12
218 0.11
219 0.12
220 0.11
221 0.12
222 0.12
223 0.11
224 0.09
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.11
242 0.14
243 0.16
244 0.17
245 0.18
246 0.21
247 0.22
248 0.27
249 0.26
250 0.25
251 0.27
252 0.28
253 0.33
254 0.36
255 0.36
256 0.33