Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6H0XJD3

Protein Details
Accession A0A6H0XJD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
347-376VYSIGTGRPRAHRKKKHRVVDLRRNKPDDGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
354-365RPRAHRKKKHRV
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027536  Mdm34  
IPR031468  SMP_LBD  
Gene Ontology GO:0032865  C:ERMES complex  
GO:0008289  F:lipid binding  
GO:0006869  P:lipid transport  
GO:0000002  P:mitochondrial genome maintenance  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51847  SMP  
CDD cd21673  SMP_Mdm34  
Amino Acid Sequences MAFTFNWSPILGDTNRVRDMLTDALNKPKKPAIIVDNILVNELNLGSTPPKLEILEIGDLAEDRFRGIFKMSYTGDAYLTLKTKVQVNPLKTYLATKPSFTSPQPLAASSGLTMPVQITLSDIRLSGFVILVFSKQKGITLVFRNDPLESLKVSSTFDSIPFVRDFLQKTIESQLRTLLMEDLPAIIHRLSLQVFNPEYGPVDEELPSKEEFLQQAPIDPFAGPTLDGSDGGEGSPFSLDAPTETYATFSQKNLLRLAALSESQRTLSLFTPSIRDTVYRAWTTAGERGDTTSTITAASTQKLASLSRIHNSLVRQGTWSSTASETSEAASLATRPSLMSMASAPSVYSIGTGRPRAHRKKKHRVVDLRRNKPDDGSETASVSTFDDSKSVSGSRSTAPSITGTQSSRDRASCPVEGELTTPPKTPERRKAASDRGVRTPVRPSLLAPVREDQDPTPRAVASTSEKQPARQALPRTSTLPSMKSTGLSRTLSDYDLGTVEEGSSGNILEQAWMNKITSEVAKRIREEKDTQFWSARSDEGQSGDAPPAYAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.34
3 0.33
4 0.32
5 0.27
6 0.31
7 0.29
8 0.29
9 0.29
10 0.3
11 0.41
12 0.47
13 0.46
14 0.46
15 0.46
16 0.43
17 0.39
18 0.44
19 0.41
20 0.44
21 0.46
22 0.44
23 0.44
24 0.41
25 0.39
26 0.31
27 0.23
28 0.15
29 0.12
30 0.1
31 0.06
32 0.08
33 0.08
34 0.09
35 0.11
36 0.11
37 0.13
38 0.13
39 0.14
40 0.15
41 0.18
42 0.19
43 0.18
44 0.16
45 0.15
46 0.15
47 0.14
48 0.13
49 0.09
50 0.07
51 0.08
52 0.08
53 0.09
54 0.12
55 0.14
56 0.14
57 0.21
58 0.21
59 0.24
60 0.25
61 0.25
62 0.23
63 0.22
64 0.22
65 0.19
66 0.2
67 0.17
68 0.17
69 0.18
70 0.24
71 0.25
72 0.34
73 0.38
74 0.41
75 0.46
76 0.46
77 0.46
78 0.4
79 0.42
80 0.37
81 0.38
82 0.35
83 0.3
84 0.31
85 0.34
86 0.38
87 0.34
88 0.36
89 0.29
90 0.35
91 0.35
92 0.32
93 0.3
94 0.26
95 0.26
96 0.19
97 0.19
98 0.13
99 0.11
100 0.1
101 0.08
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.11
109 0.11
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.09
114 0.08
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.1
120 0.1
121 0.12
122 0.12
123 0.13
124 0.14
125 0.16
126 0.21
127 0.26
128 0.31
129 0.3
130 0.32
131 0.33
132 0.31
133 0.29
134 0.25
135 0.2
136 0.16
137 0.16
138 0.15
139 0.15
140 0.16
141 0.15
142 0.14
143 0.13
144 0.13
145 0.14
146 0.14
147 0.16
148 0.15
149 0.15
150 0.16
151 0.19
152 0.21
153 0.2
154 0.24
155 0.21
156 0.23
157 0.29
158 0.3
159 0.27
160 0.25
161 0.25
162 0.22
163 0.22
164 0.21
165 0.16
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.09
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.08
178 0.1
179 0.1
180 0.14
181 0.15
182 0.15
183 0.15
184 0.14
185 0.14
186 0.13
187 0.14
188 0.09
189 0.1
190 0.1
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.13
198 0.13
199 0.13
200 0.16
201 0.14
202 0.18
203 0.18
204 0.18
205 0.16
206 0.15
207 0.14
208 0.1
209 0.11
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.07
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.1
233 0.1
234 0.13
235 0.14
236 0.12
237 0.16
238 0.19
239 0.21
240 0.2
241 0.2
242 0.17
243 0.16
244 0.17
245 0.13
246 0.11
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.14
259 0.14
260 0.14
261 0.13
262 0.12
263 0.12
264 0.14
265 0.18
266 0.16
267 0.16
268 0.16
269 0.17
270 0.18
271 0.2
272 0.17
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.13
277 0.12
278 0.12
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.09
287 0.09
288 0.1
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.15
293 0.16
294 0.17
295 0.18
296 0.18
297 0.19
298 0.2
299 0.24
300 0.21
301 0.2
302 0.19
303 0.18
304 0.19
305 0.18
306 0.18
307 0.14
308 0.12
309 0.13
310 0.12
311 0.12
312 0.11
313 0.1
314 0.1
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.06
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.08
338 0.12
339 0.15
340 0.18
341 0.26
342 0.36
343 0.46
344 0.57
345 0.64
346 0.72
347 0.8
348 0.87
349 0.89
350 0.89
351 0.89
352 0.9
353 0.9
354 0.9
355 0.89
356 0.87
357 0.81
358 0.71
359 0.62
360 0.55
361 0.49
362 0.44
363 0.38
364 0.32
365 0.29
366 0.28
367 0.26
368 0.22
369 0.18
370 0.13
371 0.09
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.11
380 0.13
381 0.14
382 0.16
383 0.17
384 0.15
385 0.16
386 0.17
387 0.18
388 0.18
389 0.2
390 0.18
391 0.21
392 0.24
393 0.27
394 0.28
395 0.27
396 0.26
397 0.28
398 0.32
399 0.3
400 0.28
401 0.27
402 0.25
403 0.24
404 0.24
405 0.25
406 0.24
407 0.23
408 0.22
409 0.23
410 0.29
411 0.37
412 0.44
413 0.49
414 0.54
415 0.57
416 0.63
417 0.7
418 0.73
419 0.74
420 0.73
421 0.68
422 0.65
423 0.67
424 0.61
425 0.54
426 0.51
427 0.46
428 0.41
429 0.37
430 0.32
431 0.35
432 0.41
433 0.42
434 0.38
435 0.38
436 0.36
437 0.37
438 0.38
439 0.29
440 0.31
441 0.3
442 0.29
443 0.27
444 0.24
445 0.24
446 0.22
447 0.25
448 0.22
449 0.29
450 0.31
451 0.37
452 0.38
453 0.39
454 0.45
455 0.47
456 0.46
457 0.45
458 0.48
459 0.48
460 0.53
461 0.54
462 0.51
463 0.46
464 0.47
465 0.44
466 0.4
467 0.34
468 0.32
469 0.3
470 0.3
471 0.3
472 0.28
473 0.31
474 0.29
475 0.28
476 0.3
477 0.3
478 0.29
479 0.27
480 0.23
481 0.18
482 0.17
483 0.16
484 0.12
485 0.1
486 0.09
487 0.09
488 0.08
489 0.07
490 0.07
491 0.06
492 0.06
493 0.07
494 0.07
495 0.08
496 0.11
497 0.12
498 0.15
499 0.16
500 0.16
501 0.15
502 0.16
503 0.17
504 0.21
505 0.24
506 0.29
507 0.36
508 0.4
509 0.44
510 0.5
511 0.53
512 0.53
513 0.55
514 0.56
515 0.58
516 0.58
517 0.59
518 0.57
519 0.52
520 0.49
521 0.45
522 0.38
523 0.3
524 0.3
525 0.28
526 0.25
527 0.26
528 0.23
529 0.23
530 0.24
531 0.22