Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6H0XYN4

Protein Details
Accession A0A6H0XYN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-117GKVAQQEEPKRKKRKIVPEDLPEASHydrophilic
399-418LTGLVKQKKKPKTEATVVESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-107KRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.333, cyto 6.5, cyto_pero 5.666, pero 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MSHDEPSTNAAEARDQPESTKEELRSKLKKLEATATQQYALKNYSDAAEAFSEAVEVQDAINGEMATENADLLYLYGRCLYHVGVSNSDVLGGKVAQQEEPKRKKRKIVPEDLPEASGGASKQDVEKKEQGDSSTSKPFFQITGDENWTDSEEEEDNDKAEGEPAEEEDDDLAIAYEILDSARVLFMRKLESIEGERAAIVTPGKSEPDYRALRERLADTYDLQAEIKLENEQFKDAVNDAQQALTYKLSLYPQESGLIAEAHYKLSIALDFAALPVQSAETGEAEGVVNEDMRKQAAEEMEKAIMSCQARTKKLEASLAGLEGAKLEHAKRDVADTRGMVQDMKNRLVDLRTPLAGAASAVDDLSADSVKGLLGELLGQSKAEQLKMLAQATANANDLTGLVKQKKKPKTEATVVESAGKGKRKLGDIAEDNEAGKKVKLDSAQQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.28
4 0.31
5 0.35
6 0.34
7 0.37
8 0.37
9 0.41
10 0.48
11 0.56
12 0.58
13 0.6
14 0.64
15 0.63
16 0.63
17 0.6
18 0.6
19 0.58
20 0.59
21 0.6
22 0.54
23 0.5
24 0.48
25 0.44
26 0.39
27 0.34
28 0.27
29 0.2
30 0.18
31 0.17
32 0.17
33 0.16
34 0.15
35 0.14
36 0.14
37 0.13
38 0.12
39 0.11
40 0.09
41 0.09
42 0.06
43 0.06
44 0.05
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.09
61 0.07
62 0.07
63 0.1
64 0.1
65 0.11
66 0.12
67 0.13
68 0.15
69 0.21
70 0.23
71 0.22
72 0.23
73 0.24
74 0.23
75 0.23
76 0.19
77 0.12
78 0.11
79 0.09
80 0.11
81 0.13
82 0.14
83 0.15
84 0.21
85 0.3
86 0.4
87 0.5
88 0.57
89 0.63
90 0.68
91 0.75
92 0.79
93 0.82
94 0.82
95 0.83
96 0.82
97 0.8
98 0.8
99 0.72
100 0.62
101 0.51
102 0.4
103 0.29
104 0.22
105 0.14
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.12
110 0.17
111 0.19
112 0.24
113 0.29
114 0.3
115 0.33
116 0.34
117 0.32
118 0.31
119 0.32
120 0.3
121 0.34
122 0.33
123 0.3
124 0.29
125 0.29
126 0.24
127 0.22
128 0.21
129 0.15
130 0.19
131 0.21
132 0.21
133 0.2
134 0.2
135 0.2
136 0.17
137 0.14
138 0.11
139 0.09
140 0.1
141 0.12
142 0.11
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.08
147 0.09
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.04
170 0.04
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.11
175 0.11
176 0.12
177 0.12
178 0.14
179 0.15
180 0.16
181 0.15
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.1
186 0.09
187 0.07
188 0.05
189 0.06
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.09
194 0.1
195 0.18
196 0.2
197 0.21
198 0.27
199 0.27
200 0.28
201 0.28
202 0.28
203 0.21
204 0.21
205 0.2
206 0.14
207 0.14
208 0.14
209 0.12
210 0.11
211 0.1
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.11
223 0.1
224 0.11
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.07
235 0.08
236 0.09
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.11
244 0.1
245 0.09
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.09
284 0.12
285 0.15
286 0.16
287 0.18
288 0.18
289 0.18
290 0.17
291 0.15
292 0.15
293 0.13
294 0.14
295 0.18
296 0.24
297 0.27
298 0.3
299 0.33
300 0.33
301 0.37
302 0.39
303 0.33
304 0.31
305 0.29
306 0.26
307 0.24
308 0.19
309 0.15
310 0.11
311 0.1
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.1
316 0.12
317 0.13
318 0.13
319 0.2
320 0.23
321 0.24
322 0.27
323 0.24
324 0.25
325 0.26
326 0.26
327 0.21
328 0.19
329 0.24
330 0.25
331 0.27
332 0.25
333 0.23
334 0.25
335 0.26
336 0.27
337 0.25
338 0.25
339 0.22
340 0.22
341 0.21
342 0.2
343 0.18
344 0.14
345 0.09
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.06
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.06
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.12
369 0.14
370 0.14
371 0.14
372 0.13
373 0.18
374 0.23
375 0.24
376 0.2
377 0.19
378 0.22
379 0.24
380 0.25
381 0.22
382 0.17
383 0.16
384 0.15
385 0.15
386 0.12
387 0.12
388 0.17
389 0.23
390 0.3
391 0.38
392 0.47
393 0.56
394 0.63
395 0.7
396 0.73
397 0.75
398 0.78
399 0.8
400 0.78
401 0.75
402 0.68
403 0.61
404 0.52
405 0.46
406 0.42
407 0.39
408 0.33
409 0.32
410 0.36
411 0.37
412 0.42
413 0.43
414 0.47
415 0.46
416 0.49
417 0.48
418 0.44
419 0.41
420 0.38
421 0.34
422 0.26
423 0.22
424 0.2
425 0.18
426 0.23
427 0.26