FuNGI

A0A6H0XRS9

Protein Details

Accession

A0A6H0XRS9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
173-196	TFRSALRKGDRRHRQVRCVKYLKS	Hydrophilic
731-753	LIYGRWYRRKATKHTREGEGKDW	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 14, cyto_nucl 10.833, cyto_pero 8.833, nucl 6.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036188 FAD/NAD-bd_sf IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR005576 Rpb7-like_N IPR003029 S1_domain
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF13450 NAD_binding_8 PF00575 S1 PF03876 SHS2_Rpb7-N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50126 S1
CDD	cd04329 RNAP_II_Rpb7_N

Amino Acid Sequences

MFFVHSLEHRINLHPSYFTSQTEQLIRDRLYVDVEGTNTGTMMIVAVINVQDISEPKIVPGTGYAQYDISYQAMVWRPYRGEVVDGLVTSVVNNGFFVEVAGLSIFVSKAMIPSSFRYIVEGSTPSFTDNEGQVIERSTQVRLRIKGVRGELGVMHILAHSHTQDDPKAGVLTFRSALRKGDRRHRQVRCVKYLKSRPPLLSRDDSQARFKMARTVENQKRKRVLVVGAGAAGMSCAEHLSNHPDKFDVTLVDAVDYCGGQAYSIPVDKEKTGASWLNQGVQGGSYIFHHTLTMFARNGFWADPVGLQVSFGKGEQFWTNVYPTKMLAKHSSEVKRFYYMLKIVRWFEVFFALLPIKYLVKLFWFSDEFANVVALPMIALFLGTGNYGNEVMSMILERLCTSPTYGMWYPPDKNSVASNIPSMVVFPNLSEFYQTWKKNLIKKGVTVRLSTEVTRVVRRDKKGVVVKIISRTPAEDGHNPDSAWVPDNVEGSKADRDATETTEEYDEIVLCVLTDTAKRLLSPCITGLENRVLRNARFANDITVTHQDTEYMKNHYENFYSEEFAVRKINGVDANERCDFGKKNFKPMYYIKMYPKDLTKLEMSFDATNYQPQFAPEVPFENHVFQTIFLNKERDGHLWSIDEIDESKIIRKDWWHQLCHSYKHYIFVVPWMWLLQGKRHTRYAASWTMINAHEVACISGISAAVDLGADYPADLERDKFSFLAFRMYYLLIYGRWYRRKATKHTREGEGKDWAQGNEYGSTYRGPGVNYEEERRIFKKELKEGRSKEF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.3
3	0.33
4	0.33
5	0.32
6	0.32
7	0.32
8	0.35
9	0.38
10	0.36
11	0.34
12	0.38
13	0.37
14	0.34
15	0.32
16	0.28
17	0.27
18	0.25
19	0.24
20	0.2
21	0.19
22	0.18
23	0.18
24	0.17
25	0.13
26	0.12
27	0.1
28	0.07
29	0.07
30	0.06
31	0.05
32	0.05
33	0.06
34	0.06
35	0.06
36	0.06
37	0.06
38	0.06
39	0.08
40	0.13
41	0.15
42	0.15
43	0.15
44	0.18
45	0.18
46	0.17
47	0.18
48	0.18
49	0.19
50	0.21
51	0.21
52	0.19
53	0.2
54	0.2
55	0.19
56	0.15
57	0.11
58	0.09
59	0.14
60	0.19
61	0.22
62	0.23
63	0.25
64	0.26
65	0.28
66	0.31
67	0.26
68	0.23
69	0.2
70	0.23
71	0.2
72	0.19
73	0.17
74	0.14
75	0.13
76	0.11
77	0.12
78	0.09
79	0.08
80	0.08
81	0.08
82	0.08
83	0.08
84	0.08
85	0.06
86	0.06
87	0.06
88	0.06
89	0.06
90	0.05
91	0.06
92	0.06
93	0.05
94	0.06
95	0.05
96	0.07
97	0.08
98	0.1
99	0.11
100	0.15
101	0.21
102	0.23
103	0.23
104	0.25
105	0.24
106	0.23
107	0.24
108	0.23
109	0.18
110	0.18
111	0.18
112	0.16
113	0.16
114	0.16
115	0.15
116	0.14
117	0.14
118	0.13
119	0.14
120	0.14
121	0.15
122	0.15
123	0.16
124	0.16
125	0.17
126	0.2
127	0.26
128	0.33
129	0.33
130	0.38
131	0.42
132	0.45
133	0.48
134	0.48
135	0.44
136	0.37
137	0.36
138	0.3
139	0.25
140	0.22
141	0.16
142	0.13
143	0.09
144	0.09
145	0.08
146	0.1
147	0.08
148	0.09
149	0.1
150	0.13
151	0.14
152	0.16
153	0.16
154	0.16
155	0.17
156	0.15
157	0.16
158	0.14
159	0.16
160	0.16
161	0.19
162	0.2
163	0.2
164	0.25
165	0.31
166	0.39
167	0.43
168	0.52
169	0.59
170	0.66
171	0.75
172	0.78
173	0.8
174	0.82
175	0.84
176	0.84
177	0.8
178	0.77
179	0.77
180	0.79
181	0.78
182	0.77
183	0.74
184	0.69
185	0.69
186	0.68
187	0.64
188	0.6
189	0.53
190	0.52
191	0.53
192	0.5
193	0.48
194	0.45
195	0.42
196	0.38
197	0.35
198	0.35
199	0.3
200	0.33
201	0.34
202	0.42
203	0.48
204	0.57
205	0.62
206	0.62
207	0.66
208	0.61
209	0.59
210	0.53
211	0.47
212	0.42
213	0.39
214	0.32
215	0.27
216	0.25
217	0.21
218	0.17
219	0.13
220	0.06
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.04
226	0.05
227	0.13
228	0.2
229	0.21
230	0.21
231	0.21
232	0.22
233	0.23
234	0.23
235	0.16
236	0.11
237	0.13
238	0.12
239	0.12
240	0.12
241	0.1
242	0.09
243	0.08
244	0.06
245	0.05
246	0.05
247	0.04
248	0.04
249	0.06
250	0.07
251	0.09
252	0.09
253	0.1
254	0.12
255	0.12
256	0.13
257	0.12
258	0.11
259	0.13
260	0.15
261	0.15
262	0.2
263	0.21
264	0.21
265	0.22
266	0.21
267	0.17
268	0.15
269	0.14
270	0.08
271	0.08
272	0.07
273	0.08
274	0.09
275	0.09
276	0.09
277	0.08
278	0.11
279	0.12
280	0.14
281	0.13
282	0.13
283	0.13
284	0.13
285	0.14
286	0.12
287	0.1
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.07
292	0.08
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.06
301	0.08
302	0.09
303	0.09
304	0.1
305	0.11
306	0.13
307	0.15
308	0.16
309	0.14
310	0.14
311	0.19
312	0.2
313	0.21
314	0.24
315	0.24
316	0.26
317	0.34
318	0.39
319	0.37
320	0.39
321	0.38
322	0.36
323	0.33
324	0.32
325	0.29
326	0.26
327	0.28
328	0.27
329	0.28
330	0.27
331	0.28
332	0.28
333	0.23
334	0.19
335	0.16
336	0.13
337	0.1
338	0.11
339	0.09
340	0.08
341	0.08
342	0.09
343	0.07
344	0.08
345	0.08
346	0.06
347	0.07
348	0.09
349	0.09
350	0.11
351	0.12
352	0.13
353	0.13
354	0.13
355	0.12
356	0.1
357	0.1
358	0.07
359	0.06
360	0.05
361	0.04
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.02
366	0.02
367	0.02
368	0.02
369	0.02
370	0.03
371	0.03
372	0.03
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.05
385	0.05
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.07
390	0.07
391	0.13
392	0.12
393	0.14
394	0.16
395	0.19
396	0.2
397	0.21
398	0.24
399	0.18
400	0.19
401	0.18
402	0.19
403	0.17
404	0.16
405	0.15
406	0.13
407	0.13
408	0.11
409	0.11
410	0.08
411	0.07
412	0.06
413	0.06
414	0.07
415	0.08
416	0.08
417	0.09
418	0.08
419	0.13
420	0.21
421	0.22
422	0.21
423	0.28
424	0.33
425	0.38
426	0.44
427	0.47
428	0.41
429	0.46
430	0.53
431	0.53
432	0.51
433	0.44
434	0.4
435	0.36
436	0.35
437	0.3
438	0.23
439	0.2
440	0.19
441	0.22
442	0.21
443	0.26
444	0.31
445	0.33
446	0.37
447	0.35
448	0.41
449	0.46
450	0.47
451	0.44
452	0.4
453	0.4
454	0.4
455	0.39
456	0.33
457	0.25
458	0.23
459	0.2
460	0.21
461	0.21
462	0.21
463	0.26
464	0.27
465	0.28
466	0.27
467	0.26
468	0.24
469	0.21
470	0.18
471	0.13
472	0.11
473	0.11
474	0.13
475	0.12
476	0.12
477	0.11
478	0.12
479	0.13
480	0.12
481	0.11
482	0.1
483	0.13
484	0.13
485	0.15
486	0.16
487	0.14
488	0.16
489	0.16
490	0.16
491	0.13
492	0.12
493	0.1
494	0.07
495	0.07
496	0.05
497	0.04
498	0.04
499	0.04
500	0.04
501	0.05
502	0.07
503	0.09
504	0.1
505	0.1
506	0.11
507	0.15
508	0.15
509	0.16
510	0.15
511	0.15
512	0.16
513	0.16
514	0.18
515	0.22
516	0.24
517	0.22
518	0.26
519	0.26
520	0.26
521	0.32
522	0.31
523	0.25
524	0.25
525	0.25
526	0.24
527	0.23
528	0.24
529	0.2
530	0.22
531	0.22
532	0.2
533	0.19
534	0.17
535	0.17
536	0.21
537	0.21
538	0.2
539	0.21
540	0.22
541	0.24
542	0.25
543	0.25
544	0.22
545	0.23
546	0.21
547	0.21
548	0.19
549	0.21
550	0.19
551	0.19
552	0.2
553	0.15
554	0.16
555	0.15
556	0.18
557	0.16
558	0.18
559	0.23
560	0.23
561	0.28
562	0.27
563	0.27
564	0.25
565	0.26
566	0.26
567	0.25
568	0.35
569	0.31
570	0.42
571	0.46
572	0.46
573	0.49
574	0.5
575	0.52
576	0.47
577	0.52
578	0.49
579	0.52
580	0.54
581	0.51
582	0.51
583	0.47
584	0.42
585	0.39
586	0.35
587	0.28
588	0.27
589	0.25
590	0.25
591	0.2
592	0.2
593	0.19
594	0.16
595	0.21
596	0.2
597	0.19
598	0.16
599	0.16
600	0.19
601	0.18
602	0.21
603	0.17
604	0.21
605	0.21
606	0.24
607	0.25
608	0.24
609	0.23
610	0.22
611	0.21
612	0.17
613	0.21
614	0.21
615	0.23
616	0.23
617	0.25
618	0.24
619	0.27
620	0.29
621	0.26
622	0.26
623	0.25
624	0.24
625	0.22
626	0.22
627	0.2
628	0.18
629	0.16
630	0.13
631	0.13
632	0.12
633	0.11
634	0.16
635	0.17
636	0.18
637	0.2
638	0.23
639	0.3
640	0.4
641	0.47
642	0.46
643	0.46
644	0.55
645	0.6
646	0.62
647	0.58
648	0.55
649	0.48
650	0.49
651	0.47
652	0.4
653	0.34
654	0.33
655	0.3
656	0.22
657	0.22
658	0.18
659	0.17
660	0.18
661	0.19
662	0.2
663	0.28
664	0.34
665	0.38
666	0.42
667	0.44
668	0.44
669	0.47
670	0.47
671	0.46
672	0.4
673	0.37
674	0.33
675	0.35
676	0.33
677	0.3
678	0.23
679	0.16
680	0.15
681	0.13
682	0.13
683	0.09
684	0.08
685	0.07
686	0.07
687	0.07
688	0.06
689	0.06
690	0.05
691	0.05
692	0.05
693	0.05
694	0.05
695	0.05
696	0.04
697	0.04
698	0.05
699	0.06
700	0.08
701	0.08
702	0.09
703	0.13
704	0.14
705	0.16
706	0.16
707	0.16
708	0.2
709	0.2
710	0.27
711	0.24
712	0.24
713	0.24
714	0.25
715	0.24
716	0.2
717	0.21
718	0.12
719	0.17
720	0.23
721	0.3
722	0.37
723	0.39
724	0.46
725	0.53
726	0.61
727	0.68
728	0.72
729	0.74
730	0.77
731	0.81
732	0.83
733	0.83
734	0.8
735	0.75
736	0.73
737	0.63
738	0.57
739	0.54
740	0.45
741	0.39
742	0.36
743	0.32
744	0.26
745	0.26
746	0.22
747	0.19
748	0.2
749	0.18
750	0.19
751	0.19
752	0.16
753	0.19
754	0.24
755	0.31
756	0.35
757	0.39
758	0.42
759	0.43
760	0.48
761	0.47
762	0.47
763	0.44
764	0.46
765	0.51
766	0.55
767	0.63
768	0.65
769	0.73

A0A6H0XRS9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer