FuNGI

A0A6H0XYM2

Protein Details

Accession

A0A6H0XYM2

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
323-342	LASGRRKKRKGARTSTSNYS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
326-334	GRRKKRKGA

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPRRKFDKKTATTFQLVHRAQNDPLIHDESAPSMVFAEKQSKHRAQDPDDDTIPSSGASVFSSSSRTSKIRHRGDLEQEYGFNVRANEGEAAEHGIFYDDSKYDYMQHMRDLGQGGGQVTWVEASAPRASKGKQKLEDALKELDLGRFDDAQSVGQSSMASSVARSLLPEEMLPSEFVQKRSYQDQQDVPDEIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEEYVDDEEDIFAELTSEGREVDRDEWDRLGEQQMFAEDELDDGWESDHTVRARSPSRPAEEEEAAPPADALAQPPADPTEGAWLNEYKKFKTEKQAPAIPSAVESGLSSLASGRRKKRKGARTSTSNYSMSSSALVRTDQQTLLDSRFDKIEEEYAADEFDDGQFDDAMSAASGMTGMSKASKVSHYSNISGLSGVSGISSYSRATDSEAPQLERVDFNSIMDEFLGSHSKAGKTGRFVKRSGPQTGMQQLDEIRAGLGPARLKRPTTKAI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.65
3	0.58
4	0.54
5	0.48
6	0.45
7	0.41
8	0.44
9	0.39
10	0.31
11	0.35
12	0.33
13	0.3
14	0.27
15	0.27
16	0.21
17	0.22
18	0.19
19	0.15
20	0.11
21	0.11
22	0.12
23	0.14
24	0.22
25	0.24
26	0.31
27	0.4
28	0.46
29	0.5
30	0.56
31	0.62
32	0.59
33	0.64
34	0.63
35	0.6
36	0.55
37	0.52
38	0.45
39	0.37
40	0.32
41	0.21
42	0.17
43	0.11
44	0.1
45	0.09
46	0.09
47	0.09
48	0.1
49	0.13
50	0.14
51	0.16
52	0.2
53	0.22
54	0.25
55	0.34
56	0.44
57	0.49
58	0.56
59	0.59
60	0.62
61	0.69
62	0.72
63	0.65
64	0.57
65	0.48
66	0.42
67	0.38
68	0.31
69	0.23
70	0.16
71	0.13
72	0.12
73	0.13
74	0.13
75	0.12
76	0.12
77	0.1
78	0.14
79	0.13
80	0.12
81	0.1
82	0.1
83	0.1
84	0.1
85	0.12
86	0.09
87	0.1
88	0.12
89	0.12
90	0.13
91	0.18
92	0.23
93	0.21
94	0.23
95	0.24
96	0.24
97	0.26
98	0.25
99	0.21
100	0.17
101	0.16
102	0.15
103	0.12
104	0.12
105	0.09
106	0.07
107	0.07
108	0.06
109	0.05
110	0.05
111	0.08
112	0.12
113	0.13
114	0.15
115	0.18
116	0.19
117	0.27
118	0.36
119	0.42
120	0.43
121	0.46
122	0.53
123	0.57
124	0.6
125	0.55
126	0.48
127	0.39
128	0.35
129	0.32
130	0.26
131	0.19
132	0.16
133	0.14
134	0.12
135	0.12
136	0.13
137	0.13
138	0.12
139	0.12
140	0.12
141	0.1
142	0.1
143	0.1
144	0.07
145	0.08
146	0.08
147	0.07
148	0.06
149	0.07
150	0.08
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.08
155	0.09
156	0.09
157	0.09
158	0.09
159	0.1
160	0.1
161	0.09
162	0.16
163	0.18
164	0.2
165	0.21
166	0.21
167	0.24
168	0.29
169	0.34
170	0.3
171	0.33
172	0.36
173	0.37
174	0.38
175	0.36
176	0.31
177	0.26
178	0.22
179	0.17
180	0.13
181	0.1
182	0.07
183	0.06
184	0.07
185	0.07
186	0.09
187	0.09
188	0.09
189	0.1
190	0.13
191	0.13
192	0.12
193	0.12
194	0.11
195	0.11
196	0.11
197	0.11
198	0.07
199	0.07
200	0.07
201	0.07
202	0.06
203	0.05
204	0.04
205	0.04
206	0.03
207	0.03
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.03
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.04
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.05
220	0.06
221	0.07
222	0.11
223	0.13
224	0.14
225	0.14
226	0.14
227	0.14
228	0.14
229	0.16
230	0.12
231	0.1
232	0.09
233	0.09
234	0.1
235	0.09
236	0.09
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.03
245	0.04
246	0.05
247	0.08
248	0.08
249	0.1
250	0.1
251	0.15
252	0.18
253	0.2
254	0.27
255	0.29
256	0.32
257	0.33
258	0.35
259	0.36
260	0.34
261	0.33
262	0.26
263	0.22
264	0.18
265	0.16
266	0.13
267	0.08
268	0.07
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.06
274	0.07
275	0.08
276	0.08
277	0.07
278	0.07
279	0.12
280	0.12
281	0.13
282	0.14
283	0.15
284	0.17
285	0.22
286	0.24
287	0.18
288	0.22
289	0.26
290	0.29
291	0.37
292	0.45
293	0.49
294	0.54
295	0.6
296	0.56
297	0.55
298	0.52
299	0.42
300	0.33
301	0.25
302	0.18
303	0.11
304	0.1
305	0.07
306	0.07
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.11
311	0.17
312	0.23
313	0.32
314	0.42
315	0.46
316	0.55
317	0.64
318	0.7
319	0.74
320	0.79
321	0.79
322	0.78
323	0.8
324	0.78
325	0.73
326	0.64
327	0.54
328	0.45
329	0.37
330	0.27
331	0.23
332	0.17
333	0.13
334	0.13
335	0.13
336	0.13
337	0.14
338	0.17
339	0.15
340	0.16
341	0.17
342	0.18
343	0.19
344	0.2
345	0.19
346	0.17
347	0.18
348	0.17
349	0.16
350	0.16
351	0.17
352	0.14
353	0.15
354	0.15
355	0.14
356	0.13
357	0.12
358	0.11
359	0.08
360	0.08
361	0.07
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.05
370	0.05
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.03
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.05
379	0.06
380	0.07
381	0.1
382	0.13
383	0.17
384	0.21
385	0.29
386	0.32
387	0.33
388	0.35
389	0.34
390	0.31
391	0.27
392	0.23
393	0.15
394	0.11
395	0.09
396	0.07
397	0.05
398	0.05
399	0.06
400	0.07
401	0.06
402	0.08
403	0.09
404	0.09
405	0.14
406	0.2
407	0.22
408	0.3
409	0.33
410	0.34
411	0.35
412	0.36
413	0.33
414	0.28
415	0.27
416	0.24
417	0.2
418	0.19
419	0.2
420	0.19
421	0.18
422	0.16
423	0.15
424	0.1
425	0.12
426	0.15
427	0.12
428	0.14
429	0.18
430	0.18
431	0.22
432	0.27
433	0.29
434	0.33
435	0.44
436	0.52
437	0.52
438	0.53
439	0.57
440	0.61
441	0.64
442	0.62
443	0.56
444	0.49
445	0.53
446	0.59
447	0.54
448	0.45
449	0.41
450	0.36
451	0.34
452	0.32
453	0.24
454	0.16
455	0.13
456	0.13
457	0.13
458	0.16
459	0.19
460	0.24
461	0.3
462	0.34
463	0.38
464	0.46

A0A6H0XYM2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer