FuNGI

F4PCF1

Protein Details

Accession

F4PCF1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
201-227	DVPLSSKPTKLSKKEKKLKSTLQTPSI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
214-214	K

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, mito_nucl 10, cyto 5, mito 3.5, cyto_pero 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012921 SPOC_C IPR003618 TFIIS_cen_dom IPR036575 TFIIS_cen_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0006351 P:DNA-templated transcription GO:0031440 P:regulation of mRNA 3'-end processing GO:0031564 P:transcription antitermination GO:0006362 P:transcription elongation by RNA polymerase I GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF07744 SPOC PF07500 TFIIS_M
PROSITE	View protein in PROSITE PS51321 TFIIS_CENTRAL
CDD	cd21538 SPOC_TFIIS

Amino Acid Sequences

MCPSHWKAILLPLDQKELSVGKSRSNPPFLTLLVNASIVSVRTRTMGRLCYSVTGAKTGKYYSVYETALVFNFSLILVNYRIRFHGVCLGLTDKQVDSLSTYCCADCDGTEWPKYLVDAATSPAGKAARMAAVPADLYFTSPFSYSASSIVDTHANGLSSTIPITAINPSAVMPSNALYSSITNGMQYQNSTTSLLPSSPDVPLSSKPTKLSKKEKKLKSTLQTPSISAKDKLSHNDVKSVMDTSVVSQEQKRKSLSDSRPLAMSASTATPSIKRTKLSVEPKRAKSVDHTASTSSQSSIDPLRAAFLSHFTATFRDIYEWAKTHKEELGEPLHASIQLDDYNGMAKKVEQALFDTTHILKNGVRVVSDQYKAKFRSLRYNLMDVTNTRLRKRILLSGKQYLDADALVRLSPDELGNEEMKETADRVKRQSLKNAFKPRVETPQIVRDFSKGNSQLVENVSEWGKSTDSRDKHGTITPRISNVDRDGQVSMSSGTSTNITLQRKKKTDTLDDLIASMNGSNAIRDTPIISNEEKKLKPRATTNIAVTSGYGSDYEEQPLSPFDSIASSSDDEPSKKSTVSSLAGNRQNQPHKDSSPIVWKGTVHMPQVGKFVGSATQVGGQWVQPAATWMSILETTMDISGRIPIDRVQSYLHGRTSSGNGVLVVVEFKSTSNVDQPTAVDGLQTLVDYFASRDRCAVIGQHLAAVKDMYLVPAKASTPLPSLLTTIPGDVRIDAHSTRDRLFGLLLLARDFVVARNLGGLISTKPTLSVGTTSTTVNGTVGVTTSTTTSTTASTTVANDKDGSLKRRNGQSATELSTQPKISTDIPSVTTAAVMVLPTLASLSTGAMPQVHSSLTGLLTSISKPTTSTLTSNLLPTLSALPSLASSTTSQTQSYPSTSSSIPQQPLARLDISALSTLLPSLAGVGGMNQTYQDVQTLHNLMTQAGLHLPSQNDTTGNGDVSQMLASLVGNHPVSSHSTPSGEYTYLQPQLHGSDRHADVGDAVQGYTSTYHHTGGHRGDRNEYRGRGGRYRYNGGRGRGEHSRGTNSGYHDRYHGNSGYHR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.39
3	0.34
4	0.29
5	0.28
6	0.3
7	0.29
8	0.3
9	0.39
10	0.47
11	0.52
12	0.57
13	0.55
14	0.49
15	0.51
16	0.46
17	0.42
18	0.35
19	0.3
20	0.24
21	0.24
22	0.2
23	0.17
24	0.17
25	0.13
26	0.13
27	0.11
28	0.1
29	0.13
30	0.14
31	0.18
32	0.23
33	0.29
34	0.3
35	0.33
36	0.33
37	0.34
38	0.35
39	0.35
40	0.31
41	0.31
42	0.29
43	0.28
44	0.29
45	0.27
46	0.28
47	0.26
48	0.27
49	0.25
50	0.3
51	0.29
52	0.27
53	0.27
54	0.26
55	0.24
56	0.23
57	0.18
58	0.12
59	0.12
60	0.11
61	0.1
62	0.08
63	0.1
64	0.11
65	0.16
66	0.18
67	0.19
68	0.2
69	0.23
70	0.23
71	0.23
72	0.29
73	0.26
74	0.25
75	0.26
76	0.29
77	0.26
78	0.27
79	0.26
80	0.18
81	0.19
82	0.19
83	0.17
84	0.16
85	0.17
86	0.18
87	0.18
88	0.19
89	0.16
90	0.16
91	0.17
92	0.15
93	0.13
94	0.14
95	0.19
96	0.22
97	0.24
98	0.25
99	0.25
100	0.24
101	0.24
102	0.23
103	0.17
104	0.15
105	0.14
106	0.15
107	0.18
108	0.18
109	0.18
110	0.19
111	0.18
112	0.16
113	0.16
114	0.16
115	0.14
116	0.14
117	0.15
118	0.12
119	0.13
120	0.13
121	0.12
122	0.13
123	0.1
124	0.11
125	0.11
126	0.11
127	0.12
128	0.12
129	0.13
130	0.12
131	0.14
132	0.13
133	0.14
134	0.15
135	0.15
136	0.15
137	0.16
138	0.16
139	0.14
140	0.16
141	0.15
142	0.14
143	0.12
144	0.13
145	0.12
146	0.1
147	0.11
148	0.09
149	0.08
150	0.07
151	0.09
152	0.1
153	0.11
154	0.1
155	0.1
156	0.1
157	0.12
158	0.13
159	0.12
160	0.11
161	0.1
162	0.12
163	0.12
164	0.12
165	0.11
166	0.11
167	0.12
168	0.14
169	0.13
170	0.12
171	0.13
172	0.15
173	0.15
174	0.16
175	0.16
176	0.16
177	0.17
178	0.18
179	0.17
180	0.17
181	0.17
182	0.16
183	0.15
184	0.15
185	0.16
186	0.14
187	0.15
188	0.14
189	0.16
190	0.19
191	0.26
192	0.28
193	0.29
194	0.32
195	0.41
196	0.48
197	0.55
198	0.63
199	0.66
200	0.73
201	0.81
202	0.86
203	0.86
204	0.87
205	0.87
206	0.85
207	0.84
208	0.8
209	0.78
210	0.7
211	0.62
212	0.59
213	0.53
214	0.48
215	0.4
216	0.35
217	0.33
218	0.35
219	0.37
220	0.39
221	0.42
222	0.4
223	0.44
224	0.42
225	0.39
226	0.36
227	0.33
228	0.25
229	0.19
230	0.17
231	0.13
232	0.17
233	0.16
234	0.16
235	0.19
236	0.27
237	0.31
238	0.35
239	0.35
240	0.32
241	0.36
242	0.45
243	0.48
244	0.5
245	0.5
246	0.47
247	0.47
248	0.45
249	0.4
250	0.3
251	0.23
252	0.15
253	0.11
254	0.1
255	0.1
256	0.1
257	0.11
258	0.15
259	0.21
260	0.22
261	0.22
262	0.24
263	0.3
264	0.38
265	0.48
266	0.54
267	0.58
268	0.65
269	0.68
270	0.74
271	0.68
272	0.6
273	0.56
274	0.56
275	0.51
276	0.45
277	0.43
278	0.37
279	0.38
280	0.39
281	0.34
282	0.24
283	0.19
284	0.15
285	0.16
286	0.15
287	0.14
288	0.13
289	0.12
290	0.13
291	0.11
292	0.12
293	0.1
294	0.11
295	0.13
296	0.12
297	0.13
298	0.12
299	0.13
300	0.14
301	0.14
302	0.12
303	0.11
304	0.12
305	0.14
306	0.18
307	0.19
308	0.2
309	0.23
310	0.23
311	0.23
312	0.24
313	0.24
314	0.21
315	0.24
316	0.25
317	0.22
318	0.22
319	0.2
320	0.18
321	0.17
322	0.16
323	0.11
324	0.09
325	0.08
326	0.08
327	0.08
328	0.07
329	0.11
330	0.11
331	0.11
332	0.09
333	0.09
334	0.12
335	0.17
336	0.19
337	0.16
338	0.18
339	0.21
340	0.23
341	0.23
342	0.22
343	0.18
344	0.18
345	0.18
346	0.16
347	0.14
348	0.15
349	0.18
350	0.16
351	0.15
352	0.15
353	0.19
354	0.23
355	0.26
356	0.26
357	0.24
358	0.31
359	0.32
360	0.36
361	0.36
362	0.33
363	0.41
364	0.44
365	0.5
366	0.47
367	0.49
368	0.45
369	0.42
370	0.42
371	0.31
372	0.32
373	0.29
374	0.28
375	0.25
376	0.28
377	0.27
378	0.3
379	0.32
380	0.35
381	0.38
382	0.43
383	0.48
384	0.51
385	0.51
386	0.48
387	0.45
388	0.37
389	0.28
390	0.21
391	0.15
392	0.08
393	0.08
394	0.06
395	0.06
396	0.05
397	0.05
398	0.06
399	0.05
400	0.05
401	0.06
402	0.08
403	0.09
404	0.09
405	0.09
406	0.09
407	0.09
408	0.09
409	0.08
410	0.13
411	0.17
412	0.2
413	0.23
414	0.31
415	0.37
416	0.4
417	0.49
418	0.52
419	0.56
420	0.63
421	0.7
422	0.66
423	0.61
424	0.63
425	0.57
426	0.56
427	0.51
428	0.44
429	0.37
430	0.42
431	0.42
432	0.39
433	0.36
434	0.29
435	0.27
436	0.24
437	0.29
438	0.21
439	0.2
440	0.19
441	0.19
442	0.21
443	0.2
444	0.21
445	0.14
446	0.14
447	0.13
448	0.12
449	0.13
450	0.1
451	0.1
452	0.09
453	0.13
454	0.19
455	0.2
456	0.24
457	0.27
458	0.28
459	0.3
460	0.33
461	0.34
462	0.3
463	0.34
464	0.32
465	0.3
466	0.31
467	0.3
468	0.28
469	0.25
470	0.26
471	0.21
472	0.21
473	0.19
474	0.17
475	0.16
476	0.15
477	0.13
478	0.07
479	0.07
480	0.06
481	0.06
482	0.07
483	0.07
484	0.09
485	0.14
486	0.17
487	0.24
488	0.29
489	0.37
490	0.39
491	0.42
492	0.44
493	0.44
494	0.47
495	0.47
496	0.45
497	0.39
498	0.36
499	0.34
500	0.29
501	0.23
502	0.17
503	0.1
504	0.06
505	0.05
506	0.05
507	0.04
508	0.04
509	0.05
510	0.05
511	0.05
512	0.07
513	0.07
514	0.08
515	0.11
516	0.11
517	0.14
518	0.17
519	0.23
520	0.22
521	0.25
522	0.31
523	0.32
524	0.34
525	0.36
526	0.39
527	0.39
528	0.42
529	0.41
530	0.37
531	0.34
532	0.31
533	0.26
534	0.2
535	0.14
536	0.11
537	0.08
538	0.05
539	0.06
540	0.07
541	0.08
542	0.07
543	0.07
544	0.07
545	0.08
546	0.08
547	0.07
548	0.07
549	0.06
550	0.06
551	0.07
552	0.08
553	0.09
554	0.09
555	0.09
556	0.12
557	0.13
558	0.13
559	0.14
560	0.16
561	0.15
562	0.14
563	0.14
564	0.13
565	0.16
566	0.17
567	0.2
568	0.21
569	0.27
570	0.32
571	0.34
572	0.35
573	0.38
574	0.42
575	0.4
576	0.41
577	0.38
578	0.34
579	0.36
580	0.35
581	0.31
582	0.34
583	0.35
584	0.3
585	0.27
586	0.26
587	0.24
588	0.28
589	0.28
590	0.2
591	0.22
592	0.22
593	0.22
594	0.24
595	0.21
596	0.16
597	0.13
598	0.12
599	0.1
600	0.09
601	0.09
602	0.07
603	0.09
604	0.09
605	0.1
606	0.1
607	0.08
608	0.08
609	0.08
610	0.07
611	0.05
612	0.07
613	0.07
614	0.06
615	0.06
616	0.05
617	0.06
618	0.06
619	0.06
620	0.06
621	0.05
622	0.05
623	0.06
624	0.06
625	0.05
626	0.05
627	0.07
628	0.07
629	0.07
630	0.07
631	0.09
632	0.14
633	0.14
634	0.15
635	0.14
636	0.17
637	0.21
638	0.24
639	0.23
640	0.19
641	0.2
642	0.2
643	0.21
644	0.19
645	0.16
646	0.13
647	0.11
648	0.11
649	0.1
650	0.09
651	0.07
652	0.05
653	0.04
654	0.04
655	0.04
656	0.06
657	0.07
658	0.08
659	0.12
660	0.13
661	0.14
662	0.14
663	0.15
664	0.15
665	0.15
666	0.14
667	0.09
668	0.08
669	0.08
670	0.07
671	0.07
672	0.05
673	0.04
674	0.04
675	0.05
676	0.05
677	0.09
678	0.11
679	0.11
680	0.12
681	0.13
682	0.13
683	0.14
684	0.15
685	0.13
686	0.14
687	0.14
688	0.16
689	0.17
690	0.16
691	0.16
692	0.14
693	0.11
694	0.09
695	0.09
696	0.08
697	0.08
698	0.08
699	0.08
700	0.1
701	0.1
702	0.11
703	0.12
704	0.12
705	0.13
706	0.14
707	0.15
708	0.14
709	0.16
710	0.14
711	0.16
712	0.14
713	0.13
714	0.12
715	0.12
716	0.12
717	0.1
718	0.11
719	0.09
720	0.12
721	0.11
722	0.15
723	0.18
724	0.2
725	0.21
726	0.22
727	0.21
728	0.19
729	0.18
730	0.15
731	0.13
732	0.13
733	0.12
734	0.11
735	0.11
736	0.1
737	0.1
738	0.09
739	0.08
740	0.08
741	0.08
742	0.07
743	0.08
744	0.08
745	0.07
746	0.08
747	0.08
748	0.07
749	0.09
750	0.1
751	0.09
752	0.09
753	0.1
754	0.1
755	0.1
756	0.1
757	0.09
758	0.11
759	0.13
760	0.12
761	0.13
762	0.13
763	0.12
764	0.1
765	0.1
766	0.07
767	0.06
768	0.06
769	0.06
770	0.06
771	0.06
772	0.07
773	0.07
774	0.07
775	0.08
776	0.08
777	0.09
778	0.09
779	0.1
780	0.1
781	0.1
782	0.11
783	0.16
784	0.16
785	0.16
786	0.16
787	0.15
788	0.22
789	0.26
790	0.31
791	0.33
792	0.38
793	0.43
794	0.5
795	0.54
796	0.49
797	0.48
798	0.48
799	0.45
800	0.45
801	0.42
802	0.36
803	0.34
804	0.35
805	0.32
806	0.27
807	0.23
808	0.21
809	0.19
810	0.22
811	0.23
812	0.21
813	0.23
814	0.24
815	0.23
816	0.2
817	0.18
818	0.14
819	0.11
820	0.09
821	0.06
822	0.05
823	0.04
824	0.04
825	0.04
826	0.04
827	0.04
828	0.04
829	0.04
830	0.05
831	0.06
832	0.06
833	0.07
834	0.07
835	0.08
836	0.09
837	0.09
838	0.09
839	0.08
840	0.08
841	0.09
842	0.09
843	0.09
844	0.08
845	0.08
846	0.09
847	0.09
848	0.11
849	0.1
850	0.1
851	0.1
852	0.12
853	0.15
854	0.16
855	0.18
856	0.2
857	0.23
858	0.24
859	0.25
860	0.24
861	0.2
862	0.17
863	0.17
864	0.16
865	0.11
866	0.11
867	0.09
868	0.09
869	0.09
870	0.1
871	0.09
872	0.08
873	0.09
874	0.13
875	0.17
876	0.18
877	0.18
878	0.18
879	0.22
880	0.23
881	0.24
882	0.23
883	0.2
884	0.21
885	0.21
886	0.22
887	0.26
888	0.31
889	0.3
890	0.32
891	0.34
892	0.35
893	0.37
894	0.39
895	0.31
896	0.24
897	0.23
898	0.21
899	0.19
900	0.16
901	0.14
902	0.11
903	0.1
904	0.1
905	0.09
906	0.06
907	0.05
908	0.05
909	0.05
910	0.05
911	0.04
912	0.06
913	0.07
914	0.07
915	0.08
916	0.07
917	0.08
918	0.08
919	0.09
920	0.1
921	0.1
922	0.11
923	0.16
924	0.18
925	0.18
926	0.19
927	0.2
928	0.17
929	0.18
930	0.16
931	0.12
932	0.12
933	0.13
934	0.11
935	0.14
936	0.15
937	0.16
938	0.17
939	0.17
940	0.16
941	0.16
942	0.19
943	0.17
944	0.17
945	0.16
946	0.15
947	0.14
948	0.14
949	0.12
950	0.09
951	0.07
952	0.06
953	0.06
954	0.08
955	0.09
956	0.13
957	0.13
958	0.13
959	0.13
960	0.14
961	0.21
962	0.21
963	0.23
964	0.21
965	0.22
966	0.23
967	0.26
968	0.28
969	0.23
970	0.21
971	0.22
972	0.27
973	0.32
974	0.31
975	0.28
976	0.27
977	0.3
978	0.36
979	0.34
980	0.3
981	0.31
982	0.32
983	0.35
984	0.34
985	0.29
986	0.24
987	0.23
988	0.23
989	0.16
990	0.14
991	0.11
992	0.11
993	0.11
994	0.12
995	0.11
996	0.13
997	0.14
998	0.16
999	0.2
1000	0.23
1001	0.29
1002	0.35
1003	0.45
1004	0.47
1005	0.47
1006	0.54
1007	0.57
1008	0.62
1009	0.64
1010	0.58
1011	0.56
1012	0.56
1013	0.61
1014	0.6
1015	0.6
1016	0.62
1017	0.61
1018	0.68
1019	0.66
1020	0.68
1021	0.69
1022	0.66
1023	0.68
1024	0.62
1025	0.6
1026	0.59
1027	0.58
1028	0.55
1029	0.53
1030	0.54
1031	0.46
1032	0.48
1033	0.46
1034	0.44
1035	0.49
1036	0.45
1037	0.42
1038	0.39
1039	0.42
1040	0.41
1041	0.43
1042	0.4

F4PCF1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer