Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6H0XLD8

Protein Details
Accession A0A6H0XLD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
248-267AEEMRLKKRRERGRGDDDGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
254-259KKRRER
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MAQSLKRKGSPGLEDEADYSNKRTFAEAEPATQDGLENTAIAKTSPSAEPDTADAAATDRAARFAALRARNKEGRKSNLVATKTEAQRQSTDTKQLTALHRKRDIAAHKLLKADTEAAGEDFERKRAWDWTIEESEKWDERLAEKAKRKQNVGFADYRQEAGKVYDRQIERLSKAHGERKEEYDRDKRDAIDRAVKSGGLEIVETESGELIAVDKDGSFYSTADSTQFVQNKPDRAAVDRLVEDIRQAEEMRLKKRRERGRGDDDGDVTYINEKNKQFNQKLARFYNKYTADIRESFERGTAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.39
3 0.37
4 0.33
5 0.28
6 0.27
7 0.24
8 0.24
9 0.23
10 0.23
11 0.23
12 0.24
13 0.32
14 0.31
15 0.31
16 0.32
17 0.32
18 0.3
19 0.26
20 0.22
21 0.13
22 0.13
23 0.1
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.09
28 0.08
29 0.09
30 0.08
31 0.1
32 0.12
33 0.15
34 0.18
35 0.18
36 0.19
37 0.2
38 0.22
39 0.19
40 0.17
41 0.14
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.08
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.13
52 0.21
53 0.27
54 0.34
55 0.38
56 0.45
57 0.52
58 0.55
59 0.6
60 0.6
61 0.59
62 0.59
63 0.57
64 0.57
65 0.57
66 0.54
67 0.46
68 0.43
69 0.44
70 0.4
71 0.43
72 0.39
73 0.34
74 0.35
75 0.37
76 0.37
77 0.33
78 0.38
79 0.32
80 0.31
81 0.31
82 0.34
83 0.38
84 0.43
85 0.45
86 0.45
87 0.48
88 0.48
89 0.47
90 0.48
91 0.47
92 0.42
93 0.46
94 0.42
95 0.41
96 0.42
97 0.4
98 0.34
99 0.3
100 0.25
101 0.16
102 0.12
103 0.11
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.11
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.15
114 0.16
115 0.17
116 0.2
117 0.24
118 0.28
119 0.28
120 0.27
121 0.26
122 0.27
123 0.23
124 0.21
125 0.16
126 0.12
127 0.12
128 0.2
129 0.22
130 0.27
131 0.34
132 0.41
133 0.46
134 0.49
135 0.51
136 0.47
137 0.5
138 0.48
139 0.45
140 0.4
141 0.35
142 0.35
143 0.33
144 0.3
145 0.23
146 0.18
147 0.14
148 0.13
149 0.19
150 0.16
151 0.18
152 0.23
153 0.23
154 0.25
155 0.28
156 0.29
157 0.25
158 0.25
159 0.25
160 0.24
161 0.28
162 0.33
163 0.32
164 0.35
165 0.36
166 0.4
167 0.45
168 0.42
169 0.45
170 0.47
171 0.48
172 0.46
173 0.45
174 0.4
175 0.38
176 0.41
177 0.38
178 0.38
179 0.35
180 0.33
181 0.32
182 0.31
183 0.26
184 0.22
185 0.18
186 0.09
187 0.09
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.12
213 0.17
214 0.21
215 0.2
216 0.27
217 0.31
218 0.34
219 0.35
220 0.38
221 0.33
222 0.33
223 0.38
224 0.33
225 0.33
226 0.29
227 0.29
228 0.25
229 0.24
230 0.2
231 0.17
232 0.15
233 0.13
234 0.13
235 0.13
236 0.19
237 0.25
238 0.33
239 0.4
240 0.44
241 0.5
242 0.59
243 0.67
244 0.7
245 0.74
246 0.75
247 0.77
248 0.81
249 0.77
250 0.72
251 0.63
252 0.54
253 0.44
254 0.35
255 0.26
256 0.2
257 0.2
258 0.17
259 0.23
260 0.23
261 0.31
262 0.39
263 0.49
264 0.48
265 0.55
266 0.63
267 0.63
268 0.7
269 0.71
270 0.73
271 0.67
272 0.68
273 0.69
274 0.62
275 0.59
276 0.54
277 0.51
278 0.47
279 0.45
280 0.45
281 0.41
282 0.4
283 0.37