FuNGI

F4NRN1

Protein Details

Accession

F4NRN1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-23	MSQRSSPRRQRRNKPSYSSSSAS	Hydrophilic
123-149	PYGSNSRKIKSRQQRRLEQRANQSPSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 8.5, mito 8, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR039177 SMG9
Gene Ontology	GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay

Amino Acid Sequences

MSQRSSPRRQRRNKPSYSSSSASGTDIRILSPFNDYLETPAAGSSADQSSSSSPKFGTGRPVVTKDTSSSNGNAGREESTKSINNANVNISKDAIGDECSERRQPAAAGRKLWTDPSALSSTPYGSNSRKIKSRQQRRLEQRANQSPSSTISRNSDTESNAGRALGHTNAPGYKSILLDKPVILGRNTPVNQQDTSGFASDTAHGNPPSVTHVPRIIARSTEQPTPSSPAMLSKDSSHLQDAADTKTSTHTDNLYINQTIPPGQEHLAKLFPSLFRHSTPTAVKLINKTKIQPEAAFKILSDYPGCFVIGVLGRAGTGKSTVLSGLAGSNPFPIGSNASDGLDPTSLHDSAGQKLGIDLFVTPERVILLDTQAILQSSASSQYPSSPDMDIADDNQKLDPSTQTESSKLALFLMSVCHVILLVSDMAPDAELCKLVRNAELVRSKLYHSHRSTAHVSSTHSRNSSQSFNRHRQPTPSTTSSTPNLQSTHSLDVFQPYIVFVYNKCKTDMLIPHGVSGIWKSFRKHFSDTELNAYNLFARTKASKAVHDYELHMQMRTRKHTNEDTLPLQSNRLRSKTLELLSLKLPICNIACLPYQSELSPKCDFSLSLDDLMAMYGGIRTRYDVLIKQLRDVLLEIPRFPAASLESGSGASRSGFVNRQYMVSERDWLRNAVRTWDNILKRDIQADISSVSNLSSSATGGASGSTDFKSSRLHVKSSRSRTFQHDARNE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.92
2	0.9
3	0.88
4	0.85
5	0.77
6	0.69
7	0.62
8	0.53
9	0.46
10	0.38
11	0.3
12	0.27
13	0.24
14	0.22
15	0.19
16	0.19
17	0.18
18	0.2
19	0.2
20	0.17
21	0.18
22	0.18
23	0.2
24	0.22
25	0.22
26	0.17
27	0.16
28	0.15
29	0.13
30	0.13
31	0.12
32	0.11
33	0.11
34	0.11
35	0.12
36	0.16
37	0.22
38	0.22
39	0.21
40	0.19
41	0.25
42	0.28
43	0.28
44	0.34
45	0.34
46	0.41
47	0.45
48	0.49
49	0.47
50	0.47
51	0.46
52	0.39
53	0.39
54	0.35
55	0.32
56	0.3
57	0.32
58	0.33
59	0.32
60	0.31
61	0.27
62	0.27
63	0.25
64	0.27
65	0.24
66	0.24
67	0.27
68	0.28
69	0.31
70	0.32
71	0.34
72	0.33
73	0.36
74	0.36
75	0.36
76	0.35
77	0.3
78	0.26
79	0.23
80	0.22
81	0.17
82	0.15
83	0.14
84	0.17
85	0.18
86	0.21
87	0.24
88	0.23
89	0.23
90	0.23
91	0.23
92	0.29
93	0.36
94	0.38
95	0.39
96	0.41
97	0.44
98	0.44
99	0.44
100	0.36
101	0.28
102	0.23
103	0.24
104	0.25
105	0.21
106	0.21
107	0.2
108	0.21
109	0.21
110	0.22
111	0.22
112	0.22
113	0.3
114	0.35
115	0.39
116	0.45
117	0.49
118	0.57
119	0.63
120	0.72
121	0.74
122	0.78
123	0.83
124	0.86
125	0.91
126	0.89
127	0.86
128	0.86
129	0.85
130	0.81
131	0.72
132	0.63
133	0.53
134	0.48
135	0.46
136	0.37
137	0.3
138	0.28
139	0.31
140	0.31
141	0.33
142	0.32
143	0.28
144	0.3
145	0.3
146	0.27
147	0.24
148	0.22
149	0.19
150	0.16
151	0.17
152	0.14
153	0.13
154	0.12
155	0.13
156	0.14
157	0.15
158	0.16
159	0.15
160	0.15
161	0.15
162	0.18
163	0.19
164	0.2
165	0.21
166	0.2
167	0.21
168	0.21
169	0.22
170	0.19
171	0.18
172	0.18
173	0.25
174	0.26
175	0.26
176	0.28
177	0.29
178	0.29
179	0.28
180	0.27
181	0.21
182	0.23
183	0.2
184	0.16
185	0.13
186	0.13
187	0.13
188	0.14
189	0.13
190	0.15
191	0.14
192	0.15
193	0.15
194	0.14
195	0.19
196	0.2
197	0.19
198	0.18
199	0.2
200	0.21
201	0.24
202	0.26
203	0.22
204	0.21
205	0.21
206	0.26
207	0.27
208	0.3
209	0.28
210	0.27
211	0.27
212	0.31
213	0.29
214	0.23
215	0.2
216	0.21
217	0.23
218	0.23
219	0.22
220	0.18
221	0.22
222	0.22
223	0.24
224	0.2
225	0.17
226	0.16
227	0.18
228	0.19
229	0.17
230	0.19
231	0.17
232	0.16
233	0.18
234	0.2
235	0.17
236	0.17
237	0.16
238	0.16
239	0.18
240	0.2
241	0.2
242	0.19
243	0.19
244	0.18
245	0.17
246	0.15
247	0.14
248	0.12
249	0.11
250	0.12
251	0.15
252	0.15
253	0.17
254	0.18
255	0.17
256	0.17
257	0.17
258	0.18
259	0.17
260	0.21
261	0.21
262	0.2
263	0.25
264	0.25
265	0.27
266	0.27
267	0.26
268	0.25
269	0.25
270	0.26
271	0.28
272	0.34
273	0.36
274	0.36
275	0.35
276	0.36
277	0.39
278	0.39
279	0.35
280	0.33
281	0.31
282	0.31
283	0.28
284	0.24
285	0.23
286	0.21
287	0.19
288	0.15
289	0.11
290	0.1
291	0.11
292	0.11
293	0.08
294	0.07
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.05
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.06
314	0.06
315	0.05
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.06
321	0.07
322	0.07
323	0.09
324	0.09
325	0.1
326	0.09
327	0.09
328	0.09
329	0.08
330	0.07
331	0.07
332	0.09
333	0.09
334	0.09
335	0.12
336	0.12
337	0.13
338	0.15
339	0.13
340	0.11
341	0.11
342	0.11
343	0.08
344	0.07
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.06
352	0.06
353	0.07
354	0.05
355	0.06
356	0.05
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.05
363	0.04
364	0.04
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.07
370	0.09
371	0.1
372	0.12
373	0.11
374	0.11
375	0.11
376	0.12
377	0.11
378	0.11
379	0.13
380	0.12
381	0.12
382	0.12
383	0.11
384	0.1
385	0.11
386	0.1
387	0.1
388	0.13
389	0.16
390	0.17
391	0.18
392	0.18
393	0.19
394	0.18
395	0.15
396	0.12
397	0.09
398	0.08
399	0.07
400	0.07
401	0.07
402	0.06
403	0.06
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.05
419	0.05
420	0.07
421	0.09
422	0.09
423	0.1
424	0.12
425	0.13
426	0.19
427	0.23
428	0.22
429	0.23
430	0.23
431	0.23
432	0.28
433	0.33
434	0.35
435	0.34
436	0.38
437	0.38
438	0.42
439	0.45
440	0.4
441	0.37
442	0.29
443	0.3
444	0.3
445	0.32
446	0.3
447	0.28
448	0.27
449	0.27
450	0.29
451	0.33
452	0.33
453	0.39
454	0.44
455	0.5
456	0.57
457	0.6
458	0.58
459	0.58
460	0.58
461	0.55
462	0.54
463	0.5
464	0.46
465	0.43
466	0.45
467	0.41
468	0.38
469	0.34
470	0.29
471	0.27
472	0.24
473	0.25
474	0.24
475	0.26
476	0.23
477	0.22
478	0.19
479	0.2
480	0.2
481	0.17
482	0.14
483	0.09
484	0.09
485	0.09
486	0.09
487	0.08
488	0.16
489	0.21
490	0.22
491	0.24
492	0.23
493	0.23
494	0.3
495	0.34
496	0.31
497	0.34
498	0.33
499	0.32
500	0.32
501	0.32
502	0.25
503	0.2
504	0.18
505	0.15
506	0.18
507	0.2
508	0.27
509	0.33
510	0.38
511	0.41
512	0.4
513	0.43
514	0.49
515	0.49
516	0.48
517	0.45
518	0.4
519	0.36
520	0.33
521	0.27
522	0.19
523	0.18
524	0.11
525	0.11
526	0.13
527	0.14
528	0.21
529	0.22
530	0.25
531	0.31
532	0.35
533	0.37
534	0.36
535	0.38
536	0.36
537	0.41
538	0.37
539	0.32
540	0.3
541	0.32
542	0.38
543	0.41
544	0.41
545	0.37
546	0.43
547	0.5
548	0.55
549	0.55
550	0.54
551	0.5
552	0.49
553	0.5
554	0.44
555	0.41
556	0.36
557	0.37
558	0.38
559	0.37
560	0.35
561	0.33
562	0.39
563	0.42
564	0.41
565	0.41
566	0.36
567	0.36
568	0.35
569	0.39
570	0.33
571	0.26
572	0.24
573	0.2
574	0.2
575	0.19
576	0.18
577	0.15
578	0.16
579	0.17
580	0.19
581	0.18
582	0.18
583	0.17
584	0.24
585	0.23
586	0.27
587	0.28
588	0.27
589	0.26
590	0.26
591	0.25
592	0.23
593	0.29
594	0.25
595	0.24
596	0.23
597	0.22
598	0.21
599	0.2
600	0.15
601	0.07
602	0.05
603	0.05
604	0.06
605	0.07
606	0.08
607	0.1
608	0.12
609	0.14
610	0.17
611	0.19
612	0.26
613	0.33
614	0.34
615	0.34
616	0.36
617	0.34
618	0.32
619	0.31
620	0.26
621	0.26
622	0.27
623	0.25
624	0.23
625	0.24
626	0.23
627	0.21
628	0.19
629	0.14
630	0.15
631	0.15
632	0.14
633	0.15
634	0.15
635	0.15
636	0.13
637	0.12
638	0.1
639	0.1
640	0.1
641	0.13
642	0.17
643	0.2
644	0.25
645	0.25
646	0.26
647	0.27
648	0.29
649	0.3
650	0.27
651	0.32
652	0.3
653	0.35
654	0.36
655	0.37
656	0.37
657	0.4
658	0.39
659	0.39
660	0.39
661	0.36
662	0.4
663	0.46
664	0.48
665	0.44
666	0.46
667	0.44
668	0.42
669	0.42
670	0.37
671	0.31
672	0.27
673	0.25
674	0.23
675	0.19
676	0.18
677	0.16
678	0.14
679	0.11
680	0.1
681	0.1
682	0.08
683	0.08
684	0.08
685	0.08
686	0.08
687	0.08
688	0.09
689	0.08
690	0.09
691	0.11
692	0.1
693	0.12
694	0.12
695	0.14
696	0.19
697	0.22
698	0.31
699	0.33
700	0.4
701	0.45
702	0.55
703	0.64
704	0.69
705	0.75
706	0.7
707	0.7
708	0.71
709	0.74
710	0.69

F4NRN1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer