Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6H0XQM0

Protein Details
Accession A0A6H0XQM0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-29VKALSFKGDKEPHKKRKRAAQDDDDSAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-19KEPHKKRKR
200-220RFKPRLKTEKAEKVRAKISRK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13.333, cyto 10, mito_nucl 9.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008999  Actin-crosslinking  
IPR010414  FRG1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF06229  FRG1  
Amino Acid Sequences MVKALSFKGDKEPHKKRKRAAQDDDDSAKQIVPTNPADEEDQEDAWVSADNVSDISGPVFLVLSSEPVSALACDQLGKVFVSKVENMVEGLPESAEPHDVRQVFIATRVTGSEQEFSFKGHQGRYLGCDIKGTLSATREAISPEETFVCTAVEGLPGQFDLHTKRATYVTVDSDKTPPEARGDADMANETTHIRVRMQARFKPRLKTEKAEKVRAKISRKELEDEVGRRLDDDEVKILKRARREGNYHETMLDVKVKGKHDKFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.84
3 0.83
4 0.86
5 0.88
6 0.88
7 0.87
8 0.87
9 0.83
10 0.83
11 0.8
12 0.7
13 0.61
14 0.5
15 0.41
16 0.31
17 0.29
18 0.24
19 0.23
20 0.24
21 0.25
22 0.25
23 0.26
24 0.27
25 0.22
26 0.24
27 0.22
28 0.2
29 0.17
30 0.17
31 0.15
32 0.13
33 0.13
34 0.09
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.06
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.07
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.08
58 0.06
59 0.05
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.07
67 0.09
68 0.11
69 0.12
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.12
75 0.11
76 0.09
77 0.08
78 0.07
79 0.05
80 0.06
81 0.06
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.13
86 0.14
87 0.14
88 0.14
89 0.15
90 0.13
91 0.15
92 0.15
93 0.1
94 0.1
95 0.11
96 0.11
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.11
101 0.13
102 0.13
103 0.14
104 0.15
105 0.16
106 0.17
107 0.16
108 0.18
109 0.18
110 0.19
111 0.2
112 0.22
113 0.2
114 0.18
115 0.18
116 0.15
117 0.14
118 0.15
119 0.13
120 0.1
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.1
128 0.1
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.05
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.09
148 0.12
149 0.13
150 0.13
151 0.15
152 0.15
153 0.16
154 0.17
155 0.16
156 0.18
157 0.21
158 0.22
159 0.22
160 0.22
161 0.23
162 0.22
163 0.21
164 0.17
165 0.17
166 0.17
167 0.16
168 0.17
169 0.18
170 0.17
171 0.16
172 0.16
173 0.14
174 0.12
175 0.12
176 0.09
177 0.09
178 0.11
179 0.11
180 0.1
181 0.15
182 0.21
183 0.28
184 0.35
185 0.4
186 0.47
187 0.56
188 0.6
189 0.63
190 0.66
191 0.68
192 0.67
193 0.7
194 0.71
195 0.72
196 0.75
197 0.77
198 0.73
199 0.69
200 0.71
201 0.7
202 0.67
203 0.64
204 0.66
205 0.64
206 0.63
207 0.62
208 0.56
209 0.54
210 0.54
211 0.48
212 0.43
213 0.37
214 0.34
215 0.29
216 0.29
217 0.27
218 0.23
219 0.23
220 0.24
221 0.26
222 0.27
223 0.31
224 0.35
225 0.35
226 0.39
227 0.45
228 0.48
229 0.53
230 0.59
231 0.63
232 0.68
233 0.7
234 0.63
235 0.55
236 0.46
237 0.4
238 0.35
239 0.32
240 0.23
241 0.22
242 0.27
243 0.32
244 0.41