FuNGI

Q8SWB1

Protein Details

Accession

Q8SWB1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-35	RTLGIFRVAKKRNSPLRKKLSIIKRLKN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
16-32	AKKRNSPLRKKLSIIKR

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR039762 Nmd2/UPF2
Gene Ontology	GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
KEGG	ecu:ECU02_1120 -

Amino Acid Sequences

MNWEDELRTLGIFRVAKKRNSPLRKKLSIIKRLKNIGPEEVESIKSDLASEDMSKFTSEMVSSLLLGRVQSGDDIKNVVRVTSALVVCNDFVKQLMSELGKAIRRGIHDIEKYWLPAYFFDMQILIQRTAGRDEGKGGLIRDLCNKIDERPRILFLAYLAENHKDEASRVEIGNQSRKIGSLAIDDSSDRLAVAGRSLGIEVRDRGGGFNKIIGVEDEEFRYYTGRTGSLECYDGGLDVREIRSYIIRHSGDAEKLDALSKSIRNANGQREIVSILMQLKLNPNLITSIARILKNMGAVAKKVVTALFKEIYQARNTSHNDVLSNCLLISEMCKFREVSPDEIFALLDHFFKTKNIEAYCVCLNGVGRYFLSNEATSHRIRGSIERIRNCRSSRMDSIYISNCLSSLFSPSQVALCADYRGFFRYFFRKGTFDRNSFLWSCLIRSKATLISMFLHPWVFEDTDFVASLVHLAGVSEHMMKMIVPTIEIMHRHSKYRCVALVRLYSSLLQFESRDSWTHIIDSAFQLEADNVFKCKVVMMLLQKMPVDVQRQYVPAIRAYISEEESLDLRILFSNFCESIGVEASNVGYDDSFDEELDFIRSYA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.39
3	0.46
4	0.53
5	0.63
6	0.67
7	0.75
8	0.81
9	0.81
10	0.85
11	0.85
12	0.83
13	0.82
14	0.82
15	0.81
16	0.81
17	0.79
18	0.78
19	0.78
20	0.77
21	0.75
22	0.68
23	0.65
24	0.58
25	0.51
26	0.47
27	0.42
28	0.39
29	0.33
30	0.3
31	0.23
32	0.19
33	0.17
34	0.13
35	0.12
36	0.13
37	0.13
38	0.13
39	0.14
40	0.15
41	0.15
42	0.14
43	0.13
44	0.13
45	0.11
46	0.1
47	0.11
48	0.11
49	0.11
50	0.12
51	0.13
52	0.12
53	0.11
54	0.12
55	0.1
56	0.1
57	0.12
58	0.13
59	0.13
60	0.14
61	0.17
62	0.16
63	0.2
64	0.2
65	0.18
66	0.16
67	0.14
68	0.16
69	0.2
70	0.21
71	0.18
72	0.19
73	0.2
74	0.19
75	0.2
76	0.17
77	0.11
78	0.1
79	0.1
80	0.09
81	0.09
82	0.13
83	0.13
84	0.14
85	0.16
86	0.2
87	0.22
88	0.23
89	0.24
90	0.23
91	0.25
92	0.29
93	0.31
94	0.35
95	0.35
96	0.36
97	0.37
98	0.36
99	0.35
100	0.31
101	0.28
102	0.2
103	0.18
104	0.21
105	0.2
106	0.18
107	0.17
108	0.17
109	0.15
110	0.2
111	0.23
112	0.19
113	0.17
114	0.18
115	0.19
116	0.21
117	0.23
118	0.19
119	0.16
120	0.18
121	0.18
122	0.2
123	0.21
124	0.19
125	0.2
126	0.21
127	0.22
128	0.25
129	0.26
130	0.24
131	0.25
132	0.25
133	0.27
134	0.34
135	0.37
136	0.37
137	0.36
138	0.38
139	0.36
140	0.35
141	0.3
142	0.21
143	0.22
144	0.17
145	0.16
146	0.16
147	0.17
148	0.17
149	0.17
150	0.18
151	0.13
152	0.13
153	0.14
154	0.15
155	0.15
156	0.15
157	0.18
158	0.21
159	0.25
160	0.32
161	0.3
162	0.29
163	0.26
164	0.27
165	0.24
166	0.21
167	0.19
168	0.14
169	0.14
170	0.13
171	0.14
172	0.13
173	0.13
174	0.12
175	0.11
176	0.07
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.06
185	0.07
186	0.07
187	0.09
188	0.09
189	0.1
190	0.11
191	0.11
192	0.12
193	0.14
194	0.16
195	0.14
196	0.14
197	0.14
198	0.13
199	0.13
200	0.12
201	0.12
202	0.11
203	0.12
204	0.12
205	0.12
206	0.12
207	0.11
208	0.12
209	0.09
210	0.1
211	0.1
212	0.1
213	0.11
214	0.13
215	0.15
216	0.15
217	0.16
218	0.14
219	0.13
220	0.12
221	0.11
222	0.09
223	0.08
224	0.06
225	0.07
226	0.07
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.1
231	0.11
232	0.12
233	0.19
234	0.19
235	0.19
236	0.22
237	0.24
238	0.22
239	0.22
240	0.21
241	0.13
242	0.13
243	0.14
244	0.11
245	0.09
246	0.11
247	0.11
248	0.12
249	0.15
250	0.17
251	0.21
252	0.25
253	0.29
254	0.33
255	0.33
256	0.31
257	0.28
258	0.27
259	0.23
260	0.18
261	0.14
262	0.08
263	0.1
264	0.09
265	0.09
266	0.11
267	0.12
268	0.13
269	0.12
270	0.11
271	0.1
272	0.11
273	0.11
274	0.09
275	0.12
276	0.14
277	0.14
278	0.14
279	0.15
280	0.14
281	0.14
282	0.14
283	0.12
284	0.09
285	0.1
286	0.1
287	0.1
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.08
292	0.08
293	0.11
294	0.11
295	0.1
296	0.12
297	0.14
298	0.15
299	0.16
300	0.16
301	0.14
302	0.21
303	0.23
304	0.25
305	0.25
306	0.24
307	0.23
308	0.22
309	0.24
310	0.17
311	0.15
312	0.11
313	0.09
314	0.08
315	0.07
316	0.08
317	0.09
318	0.11
319	0.12
320	0.13
321	0.14
322	0.15
323	0.23
324	0.25
325	0.26
326	0.25
327	0.26
328	0.25
329	0.25
330	0.24
331	0.15
332	0.14
333	0.09
334	0.08
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.08
339	0.11
340	0.13
341	0.17
342	0.17
343	0.2
344	0.2
345	0.23
346	0.23
347	0.2
348	0.17
349	0.13
350	0.13
351	0.11
352	0.12
353	0.09
354	0.09
355	0.09
356	0.1
357	0.1
358	0.12
359	0.11
360	0.11
361	0.13
362	0.16
363	0.16
364	0.17
365	0.16
366	0.15
367	0.16
368	0.19
369	0.24
370	0.29
371	0.36
372	0.41
373	0.46
374	0.49
375	0.55
376	0.53
377	0.52
378	0.49
379	0.49
380	0.47
381	0.49
382	0.47
383	0.42
384	0.45
385	0.4
386	0.36
387	0.3
388	0.24
389	0.18
390	0.15
391	0.14
392	0.1
393	0.12
394	0.11
395	0.12
396	0.12
397	0.13
398	0.13
399	0.13
400	0.13
401	0.1
402	0.1
403	0.1
404	0.1
405	0.11
406	0.11
407	0.14
408	0.14
409	0.13
410	0.17
411	0.23
412	0.26
413	0.29
414	0.31
415	0.32
416	0.35
417	0.44
418	0.48
419	0.43
420	0.42
421	0.4
422	0.42
423	0.38
424	0.37
425	0.3
426	0.22
427	0.22
428	0.24
429	0.24
430	0.2
431	0.2
432	0.21
433	0.2
434	0.22
435	0.2
436	0.18
437	0.19
438	0.2
439	0.19
440	0.18
441	0.16
442	0.13
443	0.14
444	0.15
445	0.12
446	0.11
447	0.12
448	0.12
449	0.13
450	0.14
451	0.12
452	0.1
453	0.09
454	0.09
455	0.07
456	0.06
457	0.04
458	0.04
459	0.04
460	0.05
461	0.06
462	0.07
463	0.06
464	0.07
465	0.07
466	0.07
467	0.07
468	0.1
469	0.09
470	0.08
471	0.09
472	0.11
473	0.14
474	0.15
475	0.19
476	0.24
477	0.26
478	0.32
479	0.33
480	0.39
481	0.41
482	0.46
483	0.46
484	0.42
485	0.44
486	0.45
487	0.5
488	0.45
489	0.41
490	0.36
491	0.33
492	0.29
493	0.27
494	0.2
495	0.15
496	0.13
497	0.14
498	0.16
499	0.17
500	0.18
501	0.21
502	0.22
503	0.22
504	0.22
505	0.22
506	0.2
507	0.2
508	0.2
509	0.18
510	0.16
511	0.14
512	0.14
513	0.12
514	0.13
515	0.13
516	0.12
517	0.11
518	0.12
519	0.12
520	0.12
521	0.12
522	0.12
523	0.12
524	0.17
525	0.22
526	0.29
527	0.31
528	0.33
529	0.33
530	0.32
531	0.31
532	0.29
533	0.28
534	0.21
535	0.24
536	0.26
537	0.27
538	0.29
539	0.33
540	0.31
541	0.28
542	0.29
543	0.25
544	0.23
545	0.26
546	0.27
547	0.23
548	0.23
549	0.2
550	0.19
551	0.19
552	0.19
553	0.15
554	0.12
555	0.1
556	0.12
557	0.12
558	0.11
559	0.12
560	0.17
561	0.16
562	0.17
563	0.17
564	0.15
565	0.16
566	0.18
567	0.17
568	0.11
569	0.12
570	0.12
571	0.11
572	0.11
573	0.09
574	0.07
575	0.07
576	0.08
577	0.12
578	0.12
579	0.12
580	0.12
581	0.12
582	0.13
583	0.15

Q8SWB1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer