Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A6H0XQV6

Protein Details
Accession A0A6H0XQV6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-46DTAKSFWRDWNRPRDFRDPEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045183  Ebi-like  
IPR006594  LisH  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08513  LisH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MTTTNALQSDHVNYLIFRYLQESGHEDTAKSFWRDWNRPRDFRDPESFPFARHVHHRELVTVIQDGLRHDELRARVTKSECLFKWSLVDPGRSGDSADAEINGSRPSSSGKRKSIGTGARQSDDSTAPAVKRPRLSGPDHQINGHREAMDIDGGSSSVEDNEDDTNAVSPAVASDGTGDALTMRYDSVATQTEVANGQIVPVPRLKARSIVLDINKPSSKIFHAAWNPNKSGKSRNTLFVTGESLCRMYQTPDRLNGATHILEHIDEPAVSDDCMVTGMTWHPAGRMLTCAVDTVGPPRDGKQKNTRRVISIGPDVGGTYTHFPTSELLQPPGVALHIEYSPSGEYLMLARTNGDRGVVEIWPAVQSQLVNAPTTQPLAWKLFDHSLSDAAWSGDRQLMVCTHTEHAWSLKLADELSHSTSFTAETIASHNLEERSVVLPPCGEVDITYMNDATHNIDVFFVRPYDQESGQDKMVVVDSTLYDTEAYLKARKTFPLDWSFVTFVAQPARETIPEQTIRNYGPARLLATVAENGGCRLFELGRDSNGLICKPLFNQDGYTLKMSYGSALAAAWSPNGEYIAIAGTGLVQVWQAAAPDSIESRAVLTWRINKSSPQETEDVRGMDRESSRPVSLTWDSLSQKICFAIDSKVTIIELEDSEEPMDGIQPT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.23
3 0.2
4 0.16
5 0.18
6 0.2
7 0.21
8 0.24
9 0.25
10 0.25
11 0.3
12 0.31
13 0.27
14 0.27
15 0.29
16 0.32
17 0.31
18 0.3
19 0.31
20 0.41
21 0.5
22 0.57
23 0.65
24 0.69
25 0.74
26 0.78
27 0.81
28 0.77
29 0.75
30 0.75
31 0.7
32 0.65
33 0.66
34 0.6
35 0.51
36 0.5
37 0.44
38 0.4
39 0.42
40 0.44
41 0.42
42 0.47
43 0.47
44 0.42
45 0.44
46 0.41
47 0.34
48 0.29
49 0.22
50 0.19
51 0.19
52 0.18
53 0.21
54 0.21
55 0.19
56 0.19
57 0.24
58 0.25
59 0.3
60 0.34
61 0.31
62 0.34
63 0.37
64 0.44
65 0.42
66 0.48
67 0.42
68 0.44
69 0.43
70 0.38
71 0.39
72 0.34
73 0.38
74 0.33
75 0.35
76 0.28
77 0.3
78 0.32
79 0.27
80 0.26
81 0.2
82 0.17
83 0.16
84 0.16
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.09
92 0.09
93 0.14
94 0.22
95 0.32
96 0.4
97 0.45
98 0.49
99 0.51
100 0.55
101 0.58
102 0.57
103 0.55
104 0.55
105 0.53
106 0.51
107 0.5
108 0.47
109 0.41
110 0.34
111 0.27
112 0.2
113 0.19
114 0.18
115 0.23
116 0.27
117 0.29
118 0.32
119 0.34
120 0.39
121 0.42
122 0.48
123 0.52
124 0.56
125 0.6
126 0.58
127 0.57
128 0.56
129 0.53
130 0.51
131 0.44
132 0.34
133 0.25
134 0.25
135 0.24
136 0.18
137 0.15
138 0.11
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.05
160 0.04
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.08
175 0.1
176 0.1
177 0.11
178 0.12
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.11
183 0.08
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.12
189 0.14
190 0.14
191 0.18
192 0.18
193 0.2
194 0.21
195 0.24
196 0.25
197 0.3
198 0.31
199 0.34
200 0.34
201 0.36
202 0.35
203 0.31
204 0.28
205 0.24
206 0.23
207 0.21
208 0.21
209 0.23
210 0.29
211 0.38
212 0.45
213 0.48
214 0.48
215 0.48
216 0.5
217 0.44
218 0.45
219 0.42
220 0.42
221 0.39
222 0.44
223 0.44
224 0.44
225 0.43
226 0.36
227 0.33
228 0.26
229 0.24
230 0.18
231 0.15
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.16
237 0.22
238 0.24
239 0.27
240 0.3
241 0.29
242 0.29
243 0.27
244 0.26
245 0.19
246 0.16
247 0.13
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.09
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.09
282 0.11
283 0.12
284 0.12
285 0.14
286 0.23
287 0.26
288 0.32
289 0.4
290 0.46
291 0.55
292 0.62
293 0.62
294 0.55
295 0.55
296 0.52
297 0.45
298 0.38
299 0.29
300 0.22
301 0.19
302 0.17
303 0.14
304 0.12
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.08
310 0.08
311 0.09
312 0.11
313 0.16
314 0.15
315 0.15
316 0.15
317 0.15
318 0.15
319 0.14
320 0.11
321 0.06
322 0.04
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.08
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.06
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.09
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.11
360 0.11
361 0.12
362 0.12
363 0.09
364 0.11
365 0.13
366 0.14
367 0.13
368 0.15
369 0.17
370 0.18
371 0.18
372 0.16
373 0.15
374 0.14
375 0.14
376 0.12
377 0.09
378 0.09
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.1
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.12
392 0.12
393 0.12
394 0.12
395 0.11
396 0.1
397 0.1
398 0.1
399 0.09
400 0.09
401 0.1
402 0.11
403 0.14
404 0.14
405 0.13
406 0.12
407 0.12
408 0.12
409 0.1
410 0.09
411 0.06
412 0.06
413 0.08
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.12
418 0.11
419 0.11
420 0.11
421 0.1
422 0.1
423 0.11
424 0.12
425 0.1
426 0.09
427 0.1
428 0.11
429 0.09
430 0.08
431 0.06
432 0.08
433 0.1
434 0.1
435 0.1
436 0.09
437 0.09
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.1
447 0.1
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.12
452 0.14
453 0.15
454 0.2
455 0.22
456 0.24
457 0.24
458 0.24
459 0.21
460 0.19
461 0.19
462 0.13
463 0.1
464 0.08
465 0.08
466 0.09
467 0.09
468 0.09
469 0.07
470 0.07
471 0.1
472 0.11
473 0.13
474 0.15
475 0.17
476 0.21
477 0.23
478 0.26
479 0.3
480 0.31
481 0.36
482 0.4
483 0.4
484 0.38
485 0.4
486 0.38
487 0.32
488 0.29
489 0.22
490 0.17
491 0.19
492 0.18
493 0.14
494 0.16
495 0.18
496 0.17
497 0.18
498 0.19
499 0.22
500 0.25
501 0.26
502 0.26
503 0.28
504 0.28
505 0.32
506 0.3
507 0.24
508 0.23
509 0.24
510 0.23
511 0.2
512 0.2
513 0.15
514 0.16
515 0.15
516 0.13
517 0.12
518 0.1
519 0.1
520 0.1
521 0.09
522 0.07
523 0.09
524 0.08
525 0.09
526 0.16
527 0.17
528 0.18
529 0.2
530 0.21
531 0.22
532 0.24
533 0.23
534 0.18
535 0.17
536 0.17
537 0.16
538 0.23
539 0.21
540 0.2
541 0.22
542 0.26
543 0.29
544 0.3
545 0.32
546 0.25
547 0.23
548 0.23
549 0.21
550 0.17
551 0.13
552 0.1
553 0.08
554 0.08
555 0.08
556 0.08
557 0.08
558 0.07
559 0.07
560 0.07
561 0.07
562 0.08
563 0.07
564 0.06
565 0.06
566 0.07
567 0.07
568 0.06
569 0.06
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.04
575 0.04
576 0.04
577 0.05
578 0.05
579 0.06
580 0.07
581 0.07
582 0.08
583 0.09
584 0.1
585 0.1
586 0.1
587 0.1
588 0.11
589 0.12
590 0.14
591 0.18
592 0.26
593 0.3
594 0.35
595 0.35
596 0.4
597 0.45
598 0.52
599 0.5
600 0.46
601 0.45
602 0.43
603 0.46
604 0.45
605 0.4
606 0.32
607 0.3
608 0.26
609 0.28
610 0.28
611 0.26
612 0.28
613 0.31
614 0.31
615 0.3
616 0.29
617 0.31
618 0.31
619 0.3
620 0.26
621 0.29
622 0.3
623 0.34
624 0.37
625 0.3
626 0.3
627 0.28
628 0.26
629 0.2
630 0.2
631 0.21
632 0.21
633 0.22
634 0.22
635 0.22
636 0.21
637 0.2
638 0.19
639 0.17
640 0.14
641 0.15
642 0.15
643 0.15
644 0.15
645 0.15
646 0.14
647 0.11